SlideScope abre archivos CZI de Zeiss de forma nativa en macOS 14 o posterior, en Mac con Apple Silicon e Intel: todas las escenas, canales, planos Z y puntos temporales, con el tamaño de píxel que registra el archivo. Exporta la escena que estás viendo, o todas las escenas, a un único archivo OME-TIFF. ZEN lite, el visor gratuito de ZEISS, solo funciona en Windows. ¿Usas Windows? Consulta cómo abrir archivos CZI en Windows y Mac.
Escenas, canales, Z y tiempoExportación a OME-TIFFApple Silicon e Intel
Instala SlideScope en tu Mac
Descarga la versión para macOS que corresponda a tu Mac: Apple Silicon (serie M) o Intel. La página de descarga te recomienda la adecuada.
Abre el DMG y arrastra SlideScope a Aplicaciones. La guía de instalación en macOS muestra cada paso con capturas de pantalla, incluido qué hacer si macOS te pide confirmar la primera apertura.
Abre una muestra de la biblioteca integrada, o tu propio portaobjetos. Explora gratis la biblioteca de muestras integrada, con todas las herramientas. Para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción. La suscripción solo empieza cuando la eliges al pagar.
Archivos CZI multiescena: ver todas las escenas y exportar a OME-TIFF
Un CZI puede contener varias escenas: los pocillos de una placa, regiones de mosaico o las regiones de escaneo de un portaobjetos. SlideScope muestra cada escena por separado o todas juntas, y exporta a OME-TIFF la escena que estás viendo o todas las escenas. El vídeo y los pasos de abajo usan un archivo de muestra público con dos escenas.
Mira el flujo de trabajo completo (1 min 41 s)
Abrir un CZI de dos escenas, cambiar de escena, XY Overview, canales, Details, exportar una escena y todas las escenas, y volver a abrir el OME-TIFF. Narración en inglés; subtítulos en todos los idiomas del sitio. Grabado con SlideScope 1.8.56 en Windows; la versión para macOS tiene los mismos controles. Actualizado desde la grabación: abrir y exportar tus propias imágenes ahora requiere una suscripción. Las muestras integradas siguen siendo gratuitas con todas las herramientas.Transcripción
Un archivo CZI puede contener varias escenas: pocillos de una placa, regiones de mosaico o regiones de escaneo. Así puedes ver cada una y exportarlas como OME-TIFF.
Un CZI con dos escenas, abierto directamente. Sin conversión. El control Scene pasa de una escena a la siguiente. La escena 2 es el pocillo D7. La escena 1 es el pocillo D6. XY Overview coloca cada escena donde se registró. Estos dos pocillos están a 9 mm de distancia.
Combina los canales en una sola vista. Desactiva un canal para ver qué aporta. Acerca el zoom. La barra de escala sigue calibrada. Details muestra el tamaño de píxel, los canales y los ajustes de adquisición.
Para exportar, elige File y luego Export Current Image as TIFF. Mientras ves una escena, solo se exporta esa escena. Antes de empezar, ves el tamaño de píxel, los canales y la compresión que se van a escribir. Para exportar todas las escenas, activa antes XY Overview. Todas las escenas van a un único archivo OME-TIFF. Cada escena es una imagen propia dentro de él.
Abre el resultado. Ahí están las dos escenas, como imagen 1 e imagen 2. El tamaño de píxel y los nombres de los canales se han conservado.
Una cuenta gratuita te permite abrir y ver imágenes locales antes de cualquier prueba. La exportación requiere la prueba de 3 días o una suscripción. Un escaneo grande en mosaico se exporta a su resolución de vista general, no a la del escaneo completo. Es la misma aplicación en macOS y Windows. Este vídeo se grabó en Windows.
Paso 1
Abre el archivo CZI
Elige File › Open File… (Ctrl+O en Windows, ⌘O en un Mac) o arrastra el archivo .czi a la ventana. La primera escena aparece enseguida. No se convierte nada y el archivo no se sube.
Paso 2
Recorre las escenas
Un archivo con varias escenas muestra un control Scene debajo de la imagen. Usa − y + o escribe un número. Cada escena conserva su propio tamaño y el nombre que tiene en el archivo, como un pocillo (D6, D7) o una región de mosaico.
Paso 3
Ve todas las escenas en XY Overview
Haz clic en XY Overview junto al control Scene, o elige View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Cada escena se dibuja donde se registró, con los huecos incluidos. Haz clic en una escena para seleccionarla y doble clic para abrirla. Las escenas muy separadas, como pocillos a 9 mm de distancia, aparecen al principio como mosaicos pequeños: acerca el zoom para verlas.
Paso 4
Revisa los canales, el tamaño de píxel y los metadatos
En Display, marca Blend channels into one view para obtener un compuesto en color, o desactiva canales concretos. Details muestra el tamaño de píxel, las dimensiones, la escena actual y su tamaño. El brillo, el contraste y los colores solo cambian lo que ves, nunca los píxeles almacenados.
Paso 5
Elige File › Export Current Image as TIFF
Elige File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Selecciona una carpeta y un nombre; SlideScope sugiere uno que termina en .ome.tif.
Paso 6
Exporta una escena o todas
Mientras hay una sola escena en pantalla, solo se exporta esa escena, con un nombre como sample_scene-2.ome.tif. Para exportar todas las escenas, activa antes XY Overview: todas las escenas van a un único archivo OME-TIFF, cada una como imagen propia con su propio tamaño. Antes de escribir nada, una confirmación muestra el tamaño, el tamaño de píxel, los canales y la compresión.
Paso 7
Abre el resultado
Haz clic en Open Exported TIFF cuando termine la exportación. SlideScope muestra cada escena exportada como una imagen; recórrelas con el control Image. Los lectores de OME-TIFF que admiten varias imágenes por archivo, como Bio-Formats en Fiji, las muestran como series independientes.
Qué contiene el OME-TIFF exportado
Un solo archivo. Exportar la escena en pantalla escribe una imagen; exportar desde XY Overview escribe cada escena como una imagen independiente dentro del mismo archivo, cada una con su propio tamaño. No crea un archivo por escena.
Los píxeles se escriben sin cambios, con compresión sin pérdidas (Deflate). El brillo, el contraste y la gamma son ajustes de visualización y no se aplican a la exportación.
El tamaño de píxel en micrómetros, el paso Z cuando hay una pila Z, los nombres de canal registrados en el CZI y los colores de canal configurados en ese momento en el visor. Un archivo sin tamaño de píxel registrado se exporta sin él; SlideScope no se inventa una calibración.
Resolución: las escenas que caben en memoria se exportan a resolución completa. Un escaneo grande en mosaico, como una región de un escáner de portaobjetos, se exporta a su resolución de vista general. La confirmación indica la proporción, por ejemplo 1:8, y el tamaño de píxel registrado se escala en consecuencia. El escaneo a resolución completa sigue pudiendo verse región a región en SlideScope.
Una sola imagen exportada de más de 4096 píxeles de ancho o alto recibe además niveles piramidales de resolución reducida. Un archivo con varias imágenes no. Los archivos de más de 2 GiB se escriben como BigTIFF.
No se copian: el resto de los metadatos de adquisición del CZI ni las posiciones de las escenas como coordenadas de platina. Conserva el CZI original como archivo de referencia.
Qué necesitas
Windows 10 u 11, o macOS 14 o posterior en Apple Silicon o Intel. Explora gratis la biblioteca de muestras integrada, con todas las herramientas. Para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción. La suscripción cuesta $35.00 al mes e incluye la exportación.
Si algo no se ve bien
Solo aparece una escena
Las escenas se pueden recorrer cuando comparten tipo de píxel y los mismos canales, planos Z y puntos temporales. Si no es así, SlideScope muestra la primera escena y explica el motivo en Details. Si no es lo que esperas, envíanos el archivo.
Los colores no coinciden con los de ZEN
Los colores de canal se toman del archivo cuando este los registra. Cámbialos en Display › Channel colour…; la exportación registra los colores que elijas.
La exportación es más pequeña que el escaneo
Un escaneo grande en mosaico se exporta a su resolución de vista general, y la confirmación lo indica antes de escribir nada. El escaneo a resolución completa sigue pudiendo verse en SlideScope.
La exportación te pide suscribirte
Con las muestras integradas todas las herramientas funcionan gratis, exportación incluida. Exportar tus propias imágenes requiere una suscripción.
Muestra del vídeo y de las capturas: S2_3x3_CH2.czi de los datos de muestra de czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), dos escenas de un mosaico de 3 × 3 con DAPI y EGFP. Sin datos de clientes.
Hasta qué punto está probada la compatibilidad con CZI
En nuestra prueba de formatos publicada, realizada el 2026-09-18, se abrieron los 48 de 48 archivos CZI, con hasta 8 canales, 56 planos Z y 10 puntos temporales; el mayor ocupaba 4,5 GB. Es nuestra propia prueba de los lectores que distribuimos, publicada con sus datos brutos, no una certificación independiente, y los archivos de muestra no cubren todas las variantes de CZI en uso. Los archivos de prueba públicos incluyen placas de pocillos multiescena y regiones de mosaico, pero ningún CZI multiescena de escáner de portaobjetos, así que ese caso tiene menos cobertura. Consulta el benchmark de formatos y la referencia de compatibilidad.
Otras formas de abrir CZI en un Mac
Herramienta
Ideal para
Ten en cuenta
SlideScope
Abrir, revisar, medir y exportar archivos CZI en un Mac, junto con ND2, SVS y otros formatos.
Un visor y herramienta de revisión. Sin scripts ni pipelines de análisis personalizados.
Fiji / ImageJ con Bio-Formats
Análisis gratuito y de código abierto con plugins y macros; lee CZI en macOS.
Una plataforma de análisis; cada escena se importa como una serie mediante un diálogo de importación.
QuPath
Análisis gratuito de portaobjetos completos; lee CZI mediante Bio-Formats.
Pensado para proyectos de análisis de portaobjetos más que para revisar rápidamente pilas multidimensionales.
ZEISS ZEN lite
El visor gratuito del fabricante, el más cercano al software de adquisición.
Solo Windows, así que no es una opción en un Mac sin Windows.
Preguntas
¿Puedo abrir archivos CZI en un Mac?
Sí. SlideScope abre archivos CZI de forma nativa en macOS 14 o posterior, en Mac con Apple Silicon e Intel, incluidos archivos con varias escenas, canales, planos Z y puntos temporales. Fiji con Bio-Formats también abre CZI en un Mac. ZEN lite, el visor gratuito de ZEISS, es una aplicación de Windows.
¿Cómo veo todas las escenas de un archivo CZI?
Usa el control Scene debajo de la imagen para pasar de una escena a otra, o activa XY Overview para ver todas las escenas en su posición registrada. Cada escena conserva su propio tamaño y nombre.
¿Puedo exportar una escena de CZI a OME-TIFF?
Sí. File › Export Current Image as TIFF exporta la escena en pantalla, o todas las escenas cuando XY Overview está activado. Cada escena se convierte en una imagen propia dentro de un único archivo OME-TIFF, con compresión sin pérdidas, tamaño de píxel y nombres de canal. Exportar tus propios archivos requiere una suscripción; las muestras integradas se exportan gratis.
¿Está SlideScope afiliado a ZEISS?
No. SlideScope es independiente y no está afiliado a ZEISS. Los nombres de producto solo describen búsquedas de formato de archivo y de comparación.
SlideScope no está afiliado a ZEISS. ZEISS, ZEN y CZI se mencionan para describir la compatibilidad de archivos. SlideScope es para investigación, docencia y revisión, no para diagnóstico.
Cuándo SlideScope es la opción adecuada
Elige SlideScope si quieres una única aplicación de escritorio nativa, en un Mac o en un PC con Windows, que abra portaobjetos y archivos de microscopía de muchos fabricantes (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM y más), mida en unidades calibradas y cuente núcleos y células sin escribir código, con todos los archivos guardados en tu propio ordenador.
Es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita: todas las herramientas funcionan con las muestras integradas, y para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción (PayPal o tarjeta). Si solo abres el formato de un fabricante en Windows, puede que el visor gratuito de ese fabricante sea todo lo que necesitas; para análisis con scripts, QuPath y Fiji son gratuitos y de código abierto.
Pruébalo con tu propio archivo CZI
Explora gratis la biblioteca de muestras integrada, con todas las herramientas. Para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción. La suscripción cuesta $35.00 al mes y se cobra al suscribirte (PayPal o tarjeta). Cancela cuando quieras desde tu cuenta.
