macOS에서 CZI

Mac에서 CZI 파일 여는 방법

SlideScope는 macOS 14 이상의 Apple Silicon 및 Intel Mac에서 Zeiss CZI 파일을 네이티브로 엽니다. 모든 장면, 채널, Z 평면, 시점을 파일에 기록된 픽셀 크기와 함께 보여 줍니다. 보고 있는 장면 또는 모든 장면을 OME-TIFF 파일 하나로 내보낼 수 있습니다. ZEISS의 무료 뷰어인 ZEN lite는 Windows에서만 실행됩니다. Windows를 사용하시나요? Windows 및 Mac에서 CZI 파일 여는 방법을 참고하세요.

장면, 채널, Z, 시간OME-TIFF 내보내기Apple Silicon 및 Intel

Mac에 SlideScope 설치하기

  1. Mac에 맞는 macOS 빌드를 다운로드하세요: Apple Silicon(M 시리즈) 또는 Intel. 다운로드 페이지에서 알맞은 빌드를 추천해 드립니다.
  2. DMG를 열고 SlideScope를 Applications로 끌어다 놓으세요. macOS 설치 가이드에서 macOS가 처음 열 때 확인을 요청하는 경우의 대처법을 포함해 모든 단계를 스크린샷과 함께 보여 드립니다.
  3. 내장 라이브러리의 샘플이나 내 슬라이드를 엽니다. 내장 샘플 라이브러리는 모든 도구와 함께 무료로 살펴볼 수 있습니다. 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 구독은 결제 단계에서 직접 선택할 때만 시작됩니다.

다중 장면 CZI 파일: 모든 장면을 보고 OME-TIFF로 내보내기

CZI에는 플레이트의 웰, 타일 영역, 슬라이드의 스캔 영역 같은 여러 장면이 들어 있을 수 있습니다. SlideScope는 각 장면을 따로 또는 모두 함께 보여 주며, 보고 있는 장면이나 모든 장면을 OME-TIFF로 내보냅니다. 아래 영상과 단계에서는 장면이 두 개인 공개 샘플 파일을 사용합니다.

전체 워크플로 보기(1분 41초)

장면이 두 개인 CZI 열기, 장면 전환, XY Overview, 채널, Details, 장면 하나와 모든 장면 내보내기, OME-TIFF 다시 열기. 내레이션은 영어이며 자막은 사이트의 모든 언어로 제공됩니다. Windows의 SlideScope 1.8.56로 렌더링했으며, macOS 빌드도 컨트롤이 같습니다. 녹화 이후 변경된 내용: 이제 내 이미지를 열고 내보내려면 구독이 필요합니다. 내장 샘플은 모든 도구와 함께 계속 무료입니다.
대본

CZI 파일에는 플레이트의 웰, 타일 영역, 스캔 영역 같은 여러 장면이 들어 있을 수 있습니다. 각 장면을 보고 OME-TIFF로 내보내는 방법을 소개합니다.

장면이 두 개인 CZI를 바로 엽니다. 변환은 없습니다. Scene 컨트롤로 장면을 하나씩 넘깁니다. 장면 2는 웰 D7입니다. 장면 1은 웰 D6입니다. XY Overview는 각 장면을 기록된 위치에 배치합니다. 이 두 웰은 9 mm 떨어져 있습니다.

채널을 하나의 보기로 합칩니다. 채널 하나를 꺼서 어떤 역할을 하는지 확인합니다. 확대합니다. 스케일 바는 교정된 상태를 유지합니다. Details에는 픽셀 크기, 채널, 획득 설정이 나열됩니다.

내보내려면 File을 선택한 다음 Export Current Image as TIFF를 선택합니다. 장면 하나를 보고 있을 때는 그 장면만 내보내집니다. 시작하기 전에 저장될 픽셀 크기, 채널, 압축 방식을 확인할 수 있습니다. 모든 장면을 내보내려면 먼저 XY Overview를 켭니다. 모든 장면이 OME-TIFF 파일 하나에 들어갑니다. 각 장면은 그 안에서 별도 이미지가 됩니다.

결과를 엽니다. 두 장면이 이미지 1과 이미지 2로 들어 있습니다. 픽셀 크기와 채널 이름도 그대로 넘어왔습니다.

무료 계정으로 체험 전에도 로컬 이미지를 열어 볼 수 있습니다. 내보내기에는 3일 체험이나 구독이 필요합니다. 대형 타일 스캔은 전체 스캔이 아니라 개요 해상도로 내보내집니다. macOS와 Windows에서 같은 앱입니다. 이 영상은 Windows에서 렌더링했습니다.

1단계

CZI 파일 열기

File › Open File…을 선택하거나(Windows는 Ctrl+O, Mac은 ⌘O) .czi 파일을 창으로 끌어다 놓으세요. 첫 번째 장면이 바로 나타납니다. 변환되는 것은 없으며 파일은 업로드되지 않습니다.

2단계

장면 넘겨 보기

장면이 여러 개인 파일은 이미지 아래에 Scene 컨트롤이 표시됩니다. −와 +를 사용하거나 번호를 입력하세요. 각 장면은 고유한 크기와 파일에 기록된 이름(웰 D6, D7이나 타일 영역 등)을 유지합니다.

이미지 아래의 Scene 컨트롤이 2 of 2로 설정된, CZI 파일의 장면 2/2를 표시한 SlideScope.
3단계

XY Overview로 모든 장면 보기

Scene 컨트롤 옆의 XY Overview를 클릭하거나 View › XY Overview(Ctrl+Shift+X)를 선택하세요. 모든 장면이 사이의 빈 공간까지 포함해 기록된 위치에 그려집니다. 장면을 클릭하면 선택되고, 더블클릭하면 열립니다. 9 mm 떨어진 웰처럼 멀리 떨어진 장면은 처음에 작은 타일로 보이므로 확대해서 보세요.

샘플의 두 장면이 D6, D7로 표시되어 9 mm 떨어진 기록 위치에 나타난 XY Overview.
4단계

채널, 픽셀 크기, 메타데이터 확인하기

Display에서 컬러 합성을 보려면 Blend channels into one view를 체크하거나, 개별 채널을 끄세요. Details에는 픽셀 크기, 차원, 현재 장면과 그 크기가 나열됩니다. 밝기, 대비, 색상은 화면에 보이는 것만 바꾸며 저장된 픽셀은 절대 바꾸지 않습니다.

픽셀 크기 100 nm, 채널 2개, XY 위치 2개, 현재 장면 1/2(D6)을 나열한 Details 패널.
5단계

File › Export Current Image as TIFF 선택하기

File › Export Current Image as TIFF…(Ctrl+Shift+C)를 선택하세요. 폴더와 이름을 고르면 되며, SlideScope는 .ome.tif로 끝나는 이름을 제안합니다.

Export Current Image as TIFF가 강조 표시된 File 메뉴.
6단계

장면 하나 또는 모든 장면 내보내기

화면에 장면 하나가 표시된 동안에는 그 장면만 sample_scene-2.ome.tif 같은 이름으로 내보내집니다. 모든 장면을 내보내려면 먼저 XY Overview를 켜세요. 모든 장면이 OME-TIFF 파일 하나에 각각 고유한 크기의 별도 이미지로 들어갑니다. 저장하기 전에 크기, 픽셀 크기, 채널, 압축 방식을 보여 주는 확인 창이 나타납니다.

장면 2(D7)의 내보내기 확인 창: 전체 해상도로 단독 내보내기, 픽셀 크기 0.1 µm와 채널 이름, 색상을 기록한 무손실 OME-TIFF.
7단계

결과 열기

내보내기가 끝나면 Open Exported TIFF를 클릭하세요. SlideScope는 내보낸 각 장면을 이미지 하나로 표시하며, Image 컨트롤로 차례로 넘겨 볼 수 있습니다. Fiji의 Bio-Formats처럼 파일 하나에 여러 이미지를 지원하는 OME-TIFF 리더에서는 각각 별도 시리즈로 나열됩니다.

SlideScope에서 다시 연 내보낸 OME-TIFF. 20 µm 스케일 바가 그대로 있는 이미지 2/2를 표시.

내보낸 OME-TIFF에 들어 있는 것

  • 파일 하나. 화면의 장면을 내보내면 이미지 하나가 저장되고, XY Overview에서 내보내면 모든 장면이 같은 파일 안에 각각 고유한 크기의 별도 이미지로 저장됩니다. 장면마다 파일을 하나씩 만들지는 않습니다.
  • 픽셀은 무손실 압축(Deflate)으로 변경 없이 저장됩니다. 밝기, 대비, 감마는 표시 설정이며 내보내기에 적용되지 않습니다.
  • 마이크로미터 단위 픽셀 크기, Z 스택이 있으면 Z 간격, CZI에 기록된 채널 이름, 뷰어에서 현재 설정된 채널 색상. 픽셀 크기가 기록되지 않은 파일은 픽셀 크기 없이 내보내지며, SlideScope는 교정 정보를 지어내지 않습니다.
  • 해상도: 메모리에 들어가는 장면은 전체 해상도로 내보내집니다. 슬라이드 스캐너 영역 같은 대형 타일 스캔은 개요 해상도로 내보내집니다. 확인 창에 1:8 같은 비율이 표시되며, 기록된 픽셀 크기도 그에 맞게 조정됩니다. 전체 해상도 스캔은 SlideScope에서 영역별로 계속 볼 수 있습니다.
  • 내보낸 이미지가 하나이고 너비나 높이가 4,096픽셀을 넘으면 해상도를 낮춘 피라미드 레벨도 함께 저장됩니다. 이미지가 여러 개인 파일은 그렇지 않습니다. 2 GiB를 넘는 파일은 BigTIFF로 저장됩니다.
  • 복사되지 않는 것: 나머지 CZI 획득 메타데이터, 그리고 스테이지 좌표로서의 장면 위치. 원본 CZI를 보관용 파일로 유지하세요.
XY Overview에서의 내보내기 확인 창: 파일에 장면 2개가 있으며 각 장면은 OME-TIFF 안에 고유한 크기, 무손실 압축, 각 이미지의 픽셀 크기, 채널 이름과 색상을 갖춘 별도 이미지로 저장됨.

필요한 것

Windows 10 또는 11, 또는 Apple Silicon이나 Intel의 macOS 14 이상. 내장 샘플 라이브러리는 모든 도구와 함께 무료로 살펴볼 수 있습니다. 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 구독료는 월 $35.00이며 내보내기가 포함됩니다.

무언가 이상해 보인다면

장면이 하나만 나타납니다

장면들이 픽셀 유형과 채널, Z 평면, 시점이 같을 때 넘겨 볼 수 있습니다. 그렇지 않으면 SlideScope는 첫 번째 장면을 보여 주고 Details에 이유를 표시합니다. 예상과 다르다면 파일을 보내 주세요.

색상이 ZEN과 다릅니다

채널 색상은 파일에 기록되어 있으면 파일에서 가져옵니다. Display › Channel colour…에서 바꿀 수 있으며, 내보내기에는 설정한 색상이 기록됩니다.

내보낸 결과가 스캔보다 작습니다

대형 타일 스캔은 개요 해상도로 내보내지며, 저장하기 전에 확인 창에서 이를 알려 줍니다. 전체 해상도 스캔은 SlideScope에서 계속 볼 수 있습니다.

내보내기 시 구독을 요청합니다

내장 샘플에서는 내보내기를 포함한 모든 도구가 무료로 작동합니다. 내 이미지를 내보내려면 구독이 필요합니다.

영상과 스크린샷의 샘플: czitools 샘플 데이터의 S2_3x3_CH2.czi(Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), DAPI와 EGFP로 구성된 3 × 3 모자이크의 장면 두 개. 고객 데이터는 사용하지 않았습니다.

CZI 지원은 얼마나 테스트되었나요

2026-09-18에 실시한 공개 형식 테스트에서 CZI 파일 48개가 모두 열렸으며, 최대 8개 채널, 56개 Z 평면, 10개 시점을 포함했고 가장 큰 파일은 4.5 GB였습니다. 이는 출시된 로더에 대한 자체 테스트로, 원시 데이터와 함께 공개했으며 독립적인 인증이 아닙니다. 또한 샘플 파일이 사용 중인 모든 CZI 변형을 대표하지는 않습니다. 공개 테스트 파일에는 다중 장면 웰 플레이트와 타일 영역은 있지만 다중 장면 슬라이드 스캐너 CZI는 없어서, 그 경우는 검증 범위가 더 좁습니다. 형식 벤치마크와 호환성 참고 자료를 확인하세요.

Mac에서 CZI를 여는 다른 방법

도구적합한 용도유의할 점
SlideScopeMac에서 ND2, SVS 및 기타 형식과 함께 CZI 파일을 열고, 검토하고, 측정하고, 내보내기.뷰어 겸 검토 도구입니다. 스크립트나 사용자 정의 분석 파이프라인은 없습니다.
Fiji / ImageJ와 Bio-Formats플러그인과 매크로를 갖춘 무료 오픈 소스 분석 도구, macOS에서 CZI 읽기 가능.분석 플랫폼으로, 각 장면을 가져오기 대화상자를 통해 시리즈로 가져옵니다.
QuPath무료 전체 슬라이드 분석 도구, Bio-Formats를 통해 CZI 읽기.다차원 스택의 빠른 검토보다는 슬라이드 분석 프로젝트 중심으로 설계됨.
ZEISS ZEN lite제조사의 무료 뷰어로, 획득 소프트웨어와 가장 가까움.Windows 전용이므로 Windows가 없는 Mac에서는 선택지가 아님.

질문

Mac에서 CZI 파일을 열 수 있나요?

네. SlideScope는 macOS 14 이상의 Apple Silicon 및 Intel Mac에서, 여러 장면, 채널, Z 평면, 시점이 있는 파일을 포함해 CZI 파일을 네이티브로 엽니다. Bio-Formats를 사용하는 Fiji로도 Mac에서 CZI를 열 수 있습니다. ZEISS의 무료 뷰어인 ZEN lite는 Windows 애플리케이션입니다.

CZI 파일의 모든 장면을 보려면 어떻게 하나요?

이미지 아래의 Scene 컨트롤로 장면을 하나씩 넘기거나, XY Overview를 켜서 모든 장면을 기록된 위치에서 보세요. 각 장면은 고유한 크기와 이름을 유지합니다.

CZI 장면을 OME-TIFF로 내보낼 수 있나요?

네. File › Export Current Image as TIFF는 화면의 장면을, XY Overview가 켜져 있으면 모든 장면을 내보냅니다. 각 장면은 OME-TIFF 파일 하나 안에서 무손실 압축, 픽셀 크기, 채널 이름과 함께 별도 이미지가 됩니다. 내 파일을 내보내려면 구독이 필요하며, 내장 샘플은 무료로 내보낼 수 있습니다.

SlideScope는 ZEISS와 제휴 관계인가요?

아니요. SlideScope는 독립적인 제품이며 ZEISS와 제휴 관계가 없습니다. 제품명은 파일 형식과 비교 의도를 설명하기 위해서만 사용됩니다.

독립성

SlideScope는 ZEISS와 제휴 관계가 없습니다. ZEISS, ZEN, CZI는 파일 호환성을 설명하기 위해 언급합니다. SlideScope는 연구, 교육, 검토용이며 진단용이 아닙니다.

SlideScope가 적합한 경우

Mac이나 Windows PC에서 여러 제조사의 슬라이드와 현미경 파일(SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM 등)을 열고, 교정된 단위로 측정하며, 코드 없이 핵과 세포를 계수하는 네이티브 데스크톱 앱 하나를 원하고, 모든 파일을 내 컴퓨터에 두고 싶다면 SlideScope를 선택하세요.

SlideScope는 무료 샘플 라이브러리가 포함된 유료 앱입니다. 내장 샘플에서는 모든 도구를 사용할 수 있고, 내 이미지를 열려면 구독(PayPal 또는 카드)이 필요합니다. Windows에서 한 제조사의 형식만 연다면 그 제조사의 무료 뷰어로 충분할 수 있으며, 스크립트 기반 분석에는 무료 오픈 소스인 QuPath와 Fiji가 있습니다.

내 CZI 파일로 사용해 보기

내장 샘플 라이브러리는 모든 도구와 함께 무료로 살펴볼 수 있습니다. 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 구독료는 월 $35.00이며 구독 시 결제됩니다(PayPal 또는 카드). 계정에서 언제든지 취소할 수 있습니다.

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