SlideScope פותח קובצי CZI של Zeiss באופן מקורי ב-macOS 14 ואילך, במחשבי Mac עם Apple Silicon ועם Intel: כל סצנה, ערוץ, מישור Z ונקודת זמן, עם גודל הפיקסל שהקובץ שומר. הוא מייצא את הסצנה שאתם צופים בה, או את כל הסצנות, לקובץ OME-TIFF אחד. ZEN lite, המציג החינמי של ZEISS, פועל רק ב-Windows. עובדים ב-Windows? ראו איך לפתוח קובצי CZI ב-Windows וב-Mac.
קובץ CZI יכול להכיל כמה סצנות: הבארות של צלחת, אזורי אריחים או אזורי הסריקה של שקופית. SlideScope מציג כל סצנה בנפרד או את כולן יחד, ומייצא ל-OME-TIFF את הסצנה שאתם צופים בה או את כל הסצנות. הסרטון והצעדים שלמטה משתמשים בקובץ דוגמה ציבורי עם שתי סצנות.
קובץ CZI יכול להכיל כמה סצנות: בארות של צלחת, אזורי אריחים או אזורי סריקה. הנה איך לצפות בכל אחת מהן, ולייצא אותן כ-OME-TIFF.
קובץ CZI עם שתי סצנות, שנפתח ישירות. בלי המרה. הבקרה Scene עוברת מסצנה אחת לבאה. סצנה 2 היא באר D7. סצנה 1 היא באר D6. ה-XY Overview ממקם כל סצנה במקום שבו היא צולמה. שתי הבארות האלה נמצאות במרחק 9 mm זו מזו.
השתמשו ב-Blend channels into one view כדי למזג את הערוצים לתצוגה אחת. כבו ערוץ כדי לראות מה הוא תורם. התקרבו. פס קנה המידה נשאר מכויל. Details מציג את גודל הפיקסל, הערוצים והגדרות הרכישה.
כדי לייצא, בחרו File ואז Export Current Image as TIFF. כשאתם צופים בסצנה אחת, רק הסצנה הזו מיוצאת. לפני שהייצוא מתחיל, אתם רואים את גודל הפיקסל, הערוצים והדחיסה שייכתבו. כדי לייצא את כל הסצנות, הפעילו קודם את XY Overview. כל הסצנות נכנסות לקובץ OME-TIFF אחד. כל סצנה היא תמונה נפרדת בתוכו.
פתחו את התוצאה. שתי הסצנות נמצאות שם, כתמונה 1 וכתמונה 2. גודל הפיקסל ושמות הערוצים עברו.
חשבון חינמי מאפשר לפתוח ולצפות בתמונות מקומיות לפני כל תקופת ניסיון. ייצוא דורש את תקופת הניסיון של 3 ימים או מנוי. סריקה גדולה באריחים מיוצאת ברזולוציית הסקירה שלה, לא בסריקה המלאה. זו אותה אפליקציה ב-macOS וב-Windows. הצילומים האלה הופקו ב-Windows.
בחרו File › Open File… (Ctrl+O ב-Windows, ⌘O ב-Mac) או גררו את קובץ ה-.czi אל החלון. הסצנה הראשונה מופיעה מיד. שום דבר לא מומר והקובץ לא מועלה.
בקובץ עם כמה סצנות מופיעה מתחת לתמונה הבקרה Scene. השתמשו ב-− וב-+ או הקלידו מספר. כל סצנה שומרת על הגודל שלה ועל השם שלה מהקובץ, למשל באר (D6, D7) או אזור אריחים.
לחצו על XY Overview ליד הבקרה Scene, או בחרו View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). כל סצנה מצוירת במקום שבו היא צולמה, כולל הרווחים. לחצו על סצנה כדי לבחור בה ולחצו לחיצה כפולה כדי לפתוח אותה. סצנות שרחוקות זו מזו, כמו בארות במרחק 9 mm, מופיעות תחילה כאריחים קטנים: עשו זום כדי לראות אותן.
ב-Display, סמנו Blend channels into one view לקבלת הרכב צבעוני, או כבו ערוצים בודדים. Details מציג את גודל הפיקסל, הממדים, הסצנה הנוכחית והגודל שלה. בהירות, ניגודיות וצבעים משנים רק את מה שאתם רואים, לעולם לא את הפיקסלים השמורים.
בחרו File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). בחרו תיקייה ושם; SlideScope מציע שם שמסתיים ב-.ome.tif.
כשסצנה בודדת מוצגת על המסך, רק היא מיוצאת, עם שם כמו sample_scene-2.ome.tif. כדי לייצא את כל הסצנות, הפעילו קודם את XY Overview: כל הסצנות נכנסות לקובץ OME-TIFF אחד, כל אחת כתמונה נפרדת בגודל שלה. לפני שנכתב משהו, חלון אישור מציג את הגודל, גודל הפיקסל, הערוצים והדחיסה.
לחצו על Open Exported TIFF כשהייצוא מסתיים. SlideScope מציג כל סצנה מיוצאת כתמונה; עוברים ביניהן בעזרת הבקרה Image. קוראי OME-TIFF שתומכים בכמה תמונות בקובץ, כמו Bio-Formats ב-Fiji, מציגים אותן כסדרות נפרדות.
Windows 10 או 11, או macOS 14 ואילך ב-Apple Silicon או ב-Intel. גלו את ספריית הדוגמאות המובנית בחינם, עם כל הכלים. כדי לפתוח את התמונות שלכם נדרש מנוי. המנוי עולה $35.00 לחודש וכולל ייצוא.
אפשר לעבור בין סצנות כשיש להן אותו סוג פיקסל ואותם ערוצים, מישורי Z ונקודות זמן. אם לא, SlideScope מציג את הסצנה הראשונה ומסביר למה ב-Details. אם זה לא מה שציפיתם, שלחו לנו את הקובץ.
צבעי הערוצים נלקחים מהקובץ כשהוא שומר אותם. שנו אותם ב-Display › Channel colour…; הייצוא שומר את הצבעים שהגדרתם.
סריקה גדולה באריחים מיוצאת ברזולוציית הסקירה שלה, וחלון האישור מציין זאת לפני שנכתב משהו. הסריקה ברזולוציה מלאה נשארת זמינה לצפייה ב-SlideScope.
על הדוגמאות המובנות כל כלי עובד בחינם, כולל ייצוא. ייצוא התמונות שלכם דורש מנוי.
הדוגמה בסרטון ובצילומי המסך: S2_3x3_CH2.czi מנתוני הדוגמה של czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), שתי סצנות של פסיפס 3 × 3 עם DAPI ו-EGFP. אין נתוני לקוחות.
במבחן הפורמטים שפרסמנו, שהורץ ב-2026-09-18, כל 48 מתוך 48 קובצי ה-CZI נפתחו, עם עד 8 ערוצים, 56 מישורי Z ו-10 נקודות זמן; הגדול שבהם היה 4.5 GB. זהו מבחן שלנו של רכיבי הטעינה שבגרסה המופצת, שפורסם יחד עם הנתונים הגולמיים שלו, ולא הסמכה עצמאית, וקובצי הדוגמה אינם כוללים כל וריאנט של CZI שנמצא בשימוש. קובצי הבדיקה הציבוריים כוללים צלחות בארות ואזורי אריחים מרובי סצנות, אבל לא קובצי CZI מרובי סצנות מסורק שקופיות, ולכן המקרה הזה מכוסה פחות. ראו את מבחן הפורמטים ואת מדריך התאימות.
| כלי | מתאים ל | כדאי לזכור |
|---|---|---|
| SlideScope | פתיחה, סקירה, מדידה וייצוא של קובצי CZI ב-Mac, לצד ND2, SVS ופורמטים אחרים. | כלי צפייה וסקירה. בלי סקריפטים או צינורות ניתוח מותאמים אישית. |
| Fiji / ImageJ עם Bio-Formats | ניתוח חינמי בקוד פתוח עם תוספים ומאקרו; קורא CZI ב-macOS. | פלטפורמת ניתוח; כל סצנה מיובאת כסדרה דרך חלון ייבוא. |
| QuPath | ניתוח חינמי של שקופיות מלאות; קורא CZI דרך Bio-Formats. | בנוי סביב פרויקטים של ניתוח שקופיות ולא סביב סקירה מהירה של ערימות רב-ממדיות. |
| ZEISS ZEN lite | המציג החינמי של היצרן, הקרוב ביותר לתוכנת הרכישה. | Windows בלבד, ולכן אינו אפשרות ב-Mac בלי Windows. |
כן. SlideScope פותח קובצי CZI באופן מקורי ב-macOS 14 ואילך, במחשבי Mac עם Apple Silicon ועם Intel, כולל קבצים עם כמה סצנות, ערוצים, מישורי Z ונקודות זמן. גם Fiji עם Bio-Formats פותח CZI ב-Mac. ZEN lite, המציג החינמי של ZEISS, הוא אפליקציה ל-Windows.
השתמשו בבקרה Scene שמתחת לתמונה כדי לעבור מסצנה לסצנה, או הפעילו את XY Overview כדי לראות כל סצנה במיקום שבו צולמה. כל סצנה שומרת על הגודל ועל השם שלה.
כן. File › Export Current Image as TIFF מייצא את הסצנה שעל המסך, או את כל הסצנות כש-XY Overview פועל. כל סצנה הופכת לתמונה נפרדת בתוך קובץ OME-TIFF אחד, עם דחיסה ללא אובדן, גודל פיקסל ושמות ערוצים. ייצוא הקבצים שלכם דורש מנוי; את הדוגמאות המובנות אפשר לייצא בחינם.
לא. SlideScope הוא מוצר עצמאי ואינו קשור ל-ZEISS. שמות המוצרים מתארים רק תאימות לפורמטי קבצים וכוונת השוואה.
SlideScope אינו קשור ל-ZEISS. השמות ZEISS, ZEN ו-CZI מוזכרים כדי לתאר תאימות קבצים. SlideScope מיועד למחקר, לחינוך ולסקירה, לא לאבחון.
בחרו ב-SlideScope כשאתם רוצים אפליקציה מקורית אחת למחשב, ב-Mac או ב-PC עם Windows, שפותחת שקופיות וקובצי מיקרוסקופיה מיצרנים רבים (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM ועוד), מודדת ביחידות מכוילות וסופרת גרעינים ותאים בלי לכתוב קוד, כשכל קובץ נשאר במחשב שלכם.
זוהי אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית: כל כלי עובד על הדוגמאות המובנות, והתמונות שלכם דורשות מנוי (PayPal או כרטיס). אם אתם פותחים רק פורמט של יצרן אחד ב-Windows, ייתכן שהמציג החינמי של אותו יצרן הוא כל מה שאתם צריכים; לניתוח מבוסס סקריפטים, QuPath ו-Fiji הם חינמיים וקוד פתוח.
גלו את ספריית הדוגמאות המובנית בחינם, עם כל הכלים. כדי לפתוח את התמונות שלכם נדרש מנוי. המנוי עולה $35.00 לחודש, בחיוב ברגע ההרשמה (PayPal או כרטיס). אפשר לבטל בכל עת מהחשבון.