macOS’ta CZI

CZI dosyaları Mac’te nasıl açılır

SlideScope, Zeiss CZI dosyalarını macOS 14 veya sonrasında, Apple Silicon ve Intel Mac’lerde yerel olarak açar: dosyanın kaydettiği piksel boyutuyla her sahne, kanal, Z düzlemi ve zaman noktası. Görüntülediğiniz sahneyi veya tüm sahneleri tek bir OME-TIFF dosyasına aktarır. Ücretsiz ZEISS görüntüleyicisi ZEN lite yalnızca Windows’ta çalışır. Windows mu kullanıyorsunuz? Bkz. CZI dosyaları Windows ve Mac’te nasıl açılır.

Sahneler, kanallar, Z ve zamanOME-TIFF dışa aktarmaApple Silicon ve Intel

SlideScope’u Mac’inize edinin

  1. Mac’inize uyan macOS sürümünü indirin: Apple Silicon (M serisi) veya Intel. İndirme sayfası doğru olanı önerir.
  2. DMG’yi açın ve SlideScope’u Applications klasörüne sürükleyin. macOS kurulum kılavuzu, macOS ilk açılışı onaylamanızı isterse ne yapacağınız dahil her adımı ekran görüntüleriyle gösterir.
  3. Yerleşik kitaplıktan bir örnek veya kendi slaytınızı açın. Yerleşik örnek kitaplığını tüm araçlarla ücretsiz keşfedin. Kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Abonelik yalnızca ödeme sırasında onu seçtiğinizde başlar.

Çok sahneli CZI dosyaları: her sahneyi görüntüleyin ve OME-TIFF olarak dışa aktarın

Bir CZI birkaç sahne içerebilir: bir plakanın kuyucukları, karo bölgeleri veya bir slaytın tarama bölgeleri. SlideScope her sahneyi tek başına veya hepsini birlikte gösterir ve görüntülediğiniz sahneyi ya da tüm sahneleri OME-TIFF’e aktarır. Video ve aşağıdaki adımlar, herkese açık, iki sahneli bir örnek dosya kullanır.

İş akışının tamamını izleyin (1 dk 41 sn)

İki sahneli bir CZI’yi açma, sahneler arasında geçiş, XY Overview, kanallar, Details, bir sahneyi ve tüm sahneleri dışa aktarma ve OME-TIFF’i yeniden açma. Anlatım İngilizce; altyazılar sitenin tüm dillerinde. Windows’ta SlideScope 1.8.56 ile oluşturuldu; macOS sürümünde aynı denetimler bulunur. Kayıttan sonra güncellendi: kendi görüntülerinizi açmak ve dışa aktarmak artık abonelik gerektirir. Yerleşik örnekler tüm araçlarla ücretsiz kalır.
Döküm

Bir CZI dosyası birkaç sahne içerebilir: bir plakanın kuyucukları, karo bölgeleri veya tarama bölgeleri. Her birini nasıl görüntüleyeceğinizi ve OME-TIFF olarak nasıl dışa aktaracağınızı burada görebilirsiniz.

İki sahneli bir CZI, doğrudan açıldı. Dönüştürme yok. Scene denetimi bir sahneden diğerine geçer. Sahne 2, D7 kuyucuğu. Sahne 1, D6 kuyucuğu. XY Overview her sahneyi kaydedildiği yere yerleştirir. Bu iki kuyucuk arasında 9 mm var.

Kanalları tek bir görünümde birleştirin. Bir kanalın katkısını görmek için onu kapatın. Yakınlaştırın. Ölçek çubuğu kalibre kalır. Details; piksel boyutunu, kanalları ve edinim ayarlarını listeler.

Dışa aktarmak için File’ı, ardından Export Current Image as TIFF’i seçin. Tek bir sahneyi görüntülerken yalnızca o sahne dışa aktarılır. İşlem başlamadan önce yazılacak piksel boyutunu, kanalları ve sıkıştırmayı görürsünüz. Tüm sahneleri dışa aktarmak için önce XY Overview’ı açın. Tüm sahneler tek bir OME-TIFF dosyasına gider. Her sahne, dosyanın içinde ayrı bir görüntüdür.

Sonucu açın. İki sahne de görüntü 1 ve görüntü 2 olarak orada. Piksel boyutu ve kanal adları korundu.

Ücretsiz bir hesap, herhangi bir denemeden önce yerel görüntüleri açıp görüntülemenizi sağlar. Dışa aktarma için 3 günlük deneme veya abonelik gerekir. Büyük bir karo tarama, tam tarama çözünürlüğünde değil, genel bakış çözünürlüğünde dışa aktarılır. macOS ve Windows’ta aynı uygulamadır. Bu görüntüler Windows’ta oluşturuldu.

1. adım

CZI dosyasını açın

File › Open File… komutunu seçin (Windows’ta Ctrl+O, Mac’te ⌘O) veya .czi dosyasını pencereye sürükleyin. İlk sahne hemen görünür. Hiçbir şey dönüştürülmez ve dosya yüklenmez.

2. adım

Sahneler arasında geçiş yapın

Birkaç sahne içeren bir dosyada görüntünün altında bir Scene denetimi görünür. − ve + düğmelerini kullanın veya bir numara yazın. Her sahne kendi boyutunu ve dosyadaki adını korur; örneğin bir kuyucuk (D6, D7) veya bir karo bölgesi.

SlideScope, bir CZI dosyasının 2 sahnesinden 2.’sini gösteriyor; görüntünün altındaki Scene denetimi 2 of 2 konumunda.
3. adım

Tüm sahneleri XY Overview’da görün

Scene denetiminin yanındaki XY Overview düğmesine tıklayın veya View › XY Overview komutunu seçin (Ctrl+Shift+X). Her sahne, aradaki boşluklar dahil, kaydedildiği yere çizilir. Seçmek için bir sahneye tıklayın, açmak için çift tıklayın. 9 mm aralıklı kuyucuklar gibi birbirinden uzak sahneler küçük karolar olarak başlar: görmek için yakınlaştırın.

XY Overview, örneğin D6 ve D7 olarak etiketlenmiş iki sahnesini, aralarında 9 mm bulunan kayıtlı konumlarında gösteriyor.
4. adım

Kanalları, piksel boyutunu ve meta verileri kontrol edin

Display içinde renkli bir bileşik görüntü için Blend channels into one view seçeneğini işaretleyin veya tek tek kanalları kapatın. Details; piksel boyutunu, boyutları, geçerli sahneyi ve onun boyutunu listeler. Parlaklık, kontrast ve renkler yalnızca gördüğünüzü değiştirir, depolanan pikselleri asla değiştirmez.

Details paneli; 100 nm piksel boyutunu, iki kanalı, iki XY konumunu ve geçerli sahneyi, 2 sahneden 1.’sini (D6) listeliyor.
5. adım

File › Export Current Image as TIFF komutunu seçin

File › Export Current Image as TIFF… komutunu seçin (Ctrl+Shift+C). Bir klasör ve ad belirleyin; SlideScope .ome.tif ile biten bir ad önerir.

File menüsü açık; Export Current Image as TIFF vurgulanmış.
6. adım

Bir sahneyi veya tüm sahneleri dışa aktarın

Ekranda tek bir sahne varken yalnızca o sahne, sample_scene-2.ome.tif gibi bir adla dışa aktarılır. Tüm sahneleri dışa aktarmak için önce XY Overview’ı açın: tüm sahneler tek bir OME-TIFF dosyasına, her biri kendi boyutunda ayrı bir görüntü olarak gider. Herhangi bir şey yazılmadan önce bir onay penceresi boyutu, piksel boyutunu, kanalları ve sıkıştırmayı gösterir.

2. sahne (D7) için dışa aktarma onayı: tek başına, tam çözünürlükte, 0,1 µm piksel boyutunu, kanal adlarını ve renklerini kaydeden kayıpsız bir OME-TIFF olarak dışa aktarılıyor.
7. adım

Sonucu açın

Dışa aktarma bittiğinde Open Exported TIFF düğmesine tıklayın. SlideScope dışa aktarılan her sahneyi bir görüntü olarak gösterir; aralarında Image denetimiyle geçiş yapın. Fiji’deki Bio-Formats gibi dosya başına birden fazla görüntüyü destekleyen OME-TIFF okuyucuları bunları ayrı seriler olarak listeler.

Dışa aktarılan OME-TIFF SlideScope’ta yeniden açılmış; 2 görüntüden 2.’si, 20 µm’lik ölçek çubuğu bozulmadan gösteriliyor.

Dışa aktarılan OME-TIFF neleri içerir?

  • Tek bir dosya. Ekrandaki sahneyi dışa aktarmak tek bir görüntü yazar; XY Overview’dan dışa aktarmak ise her sahneyi aynı dosyanın içinde, her biri kendi boyutunda ayrı bir görüntü olarak yazar. Sahne başına bir dosya oluşturmaz.
  • Pikseller kayıpsız sıkıştırmayla (Deflate) değiştirilmeden yazılır. Parlaklık, kontrast ve gama görüntüleme ayarlarıdır ve dışa aktarmaya uygulanmaz.
  • Mikrometre cinsinden piksel boyutu, Z yığını varsa Z adımı, CZI’de kayıtlı kanal adları ve görüntüleyicide o anda ayarlı kanal renkleri. Piksel boyutu kayıtlı olmayan bir dosya piksel boyutu olmadan dışa aktarılır; SlideScope kalibrasyon uydurmaz.
  • Çözünürlük: belleğe sığan sahneler tam çözünürlükte dışa aktarılır. Slayt tarayıcı bölgesi gibi büyük bir karo tarama, genel bakış çözünürlüğünde dışa aktarılır. Onay penceresi oranı belirtir (örneğin 1:8) ve kayıtlı piksel boyutu buna göre ölçeklenir. Tam çözünürlüklü tarama SlideScope’ta bölge bölge görüntülenebilir kalır.
  • Genişliği veya yüksekliği 4.096 pikseli aşan tek bir dışa aktarılmış görüntü, düşük çözünürlüklü piramit düzeyleri de alır. Birkaç görüntü içeren bir dosya almaz. 2 GiB’ın üzerindeki dosyalar BigTIFF olarak yazılır.
  • Kopyalanmayanlar: CZI edinim meta verilerinin geri kalanı ve tabla koordinatları olarak sahne konumları. Arşiv dosyası olarak orijinal CZI’yi saklayın.
XY Overview’dan dışa aktarma onayı: dosya 2 sahne içeriyor ve her biri OME-TIFF’te kendi boyutunda, kayıpsız sıkıştırmayla, her görüntünün kendi piksel boyutu, kanal adları ve renkleriyle ayrı bir görüntü olarak yazılıyor.

Gerekenler

Windows 10 veya 11 ya da Apple Silicon veya Intel üzerinde macOS 14 veya sonrası. Yerleşik örnek kitaplığını tüm araçlarla ücretsiz keşfedin. Kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Abonelik aylık $35.00 tutarındadır ve dışa aktarmayı içerir.

Bir şey yanlış görünüyorsa

Yalnızca bir sahne görünüyor

Sahneler aynı piksel türünü ve aynı kanalları, Z düzlemlerini ve zaman noktalarını paylaştıklarında adım adım geçilebilir hâle gelir. Paylaşmıyorlarsa SlideScope ilk sahneyi gösterir ve nedenini Details içinde açıklar. Beklediğiniz bu değilse dosyayı bize gönderin.

Renkler ZEN’dekinden farklı

Kanal renkleri, dosya bunları kaydediyorsa dosyadan gelir. Renkleri Display › Channel colour… ile değiştirin; dışa aktarma sizin ayarladığınız renkleri kaydeder.

Dışa aktarılan dosya taramadan küçük

Büyük bir karo tarama genel bakış çözünürlüğünde dışa aktarılır ve onay penceresi herhangi bir şey yazılmadan önce bunu belirtir. Tam çözünürlüklü tarama SlideScope’ta görüntülenebilir kalır.

Dışa aktarma abone olmanızı istiyor

Yerleşik örneklerde dışa aktarma dahil her araç ücretsiz çalışır. Kendi görüntülerinizi dışa aktarmak için abonelik gerekir.

Video ve ekran görüntülerindeki örnek: czitools örnek verilerinden S2_3x3_CH2.czi (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0); DAPI ve EGFP içeren 3 × 3’lük bir mozaiğin iki sahnesi. Müşteri verisi yoktur.

CZI desteği ne kadar iyi test edildi?

2026-09-18’de yürütülen ve yayımladığımız biçim testimizde 48 CZI dosyasının 48’i de açıldı; dosyalarda en fazla 8 kanal, 56 Z düzlemi ve 10 zaman noktası vardı; en büyüğü 4,5 GB’tı. Bu, ürünle gelen okuyucuların ham verileriyle birlikte yayımlanmış kendi testimizdir, bağımsız bir sertifika değildir; örnek dosyalar da kullanımdaki tüm CZI varyantlarını kapsamaz. Herkese açık test dosyaları çok sahneli kuyucuk plakalarını ve karo bölgelerini içerir ancak çok sahneli slayt tarayıcı CZI’si içermez; bu nedenle bu durum daha az kapsanmıştır. Bkz. biçim karşılaştırma testi ve uyumluluk başvurusu.

Mac’te CZI açmanın diğer yolları

AraçUygun olduğu kullanımAkılda tutun
SlideScopeND2, SVS ve diğer biçimlerin yanı sıra Mac’te CZI dosyalarını açma, inceleme, ölçme ve dışa aktarma.Bir görüntüleyici ve inceleme aracı. Betik veya özel analiz iş hatları yok.
Bio-Formats ile Fiji / ImageJEklentiler ve makrolarla ücretsiz, açık kaynak analiz; macOS’ta CZI okur.Bir analiz platformu; her sahne bir içe aktarma iletişim kutusu üzerinden seri olarak içe aktarılır.
QuPathÜcretsiz tam slayt analizi; CZI’yi Bio-Formats üzerinden okur.Çok boyutlu yığınların hızlı incelemesinden çok slayt analizi projeleri etrafında tasarlanmıştır.
ZEISS ZEN liteÜreticinin ücretsiz görüntüleyicisi; edinim yazılımına en yakın olanı.Yalnızca Windows; bu nedenle Windows olmayan bir Mac’te seçenek değildir.

Sorular

CZI dosyalarını Mac’te açabilir miyim?

Evet. SlideScope, birkaç sahne, kanal, Z düzlemi ve zaman noktası içeren dosyalar dahil CZI dosyalarını macOS 14 veya sonrasında, Apple Silicon ve Intel Mac’lerde yerel olarak açar. Bio-Formats ile Fiji de Mac’te CZI açar. Ücretsiz ZEISS görüntüleyicisi ZEN lite bir Windows uygulamasıdır.

Bir CZI dosyasının tüm sahnelerini nasıl görürüm?

Sahneden sahneye geçmek için görüntünün altındaki Scene denetimini kullanın ya da her sahneyi kayıtlı konumunda görmek için XY Overview’ı açın. Her sahne kendi boyutunu ve adını korur.

Bir CZI sahnesini OME-TIFF’e aktarabilir miyim?

Evet. File › Export Current Image as TIFF, ekrandaki sahneyi veya XY Overview açıkken tüm sahneleri dışa aktarır. Her sahne, kayıpsız sıkıştırma, piksel boyutu ve kanal adlarıyla tek bir OME-TIFF dosyasının içinde ayrı bir görüntü olur. Kendi dosyalarınızı dışa aktarmak için abonelik gerekir; yerleşik örnekler ücretsiz dışa aktarılır.

SlideScope’un ZEISS ile bir bağlantısı var mı?

Hayır. SlideScope bağımsızdır ve ZEISS ile bağlantılı değildir. Ürün adları yalnızca dosya biçimini ve karşılaştırma amacını açıklamak için kullanılmıştır.

Bağımsızlık

SlideScope’un ZEISS ile bir bağlantısı yoktur. ZEISS, ZEN ve CZI, dosya uyumluluğunu açıklamak için anılmıştır. SlideScope tanı için değil, araştırma, eğitim ve inceleme içindir.

SlideScope ne zaman doğru seçimdir?

Mac veya Windows bilgisayarda, birçok üreticinin slaytlarını ve mikroskopi dosyalarını (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM ve daha fazlası) açan, kalibre edilmiş birimlerle ölçen ve kod yazmadan çekirdek ve hücre sayan tek bir yerel masaüstü uygulaması istiyorsanız ve her dosyanın kendi bilgisayarınızda kalmasını istiyorsanız SlideScope’u seçin.

Ücretsiz örnek kitaplığı olan ücretli bir uygulamadır: her araç yerleşik örneklerde çalışır, kendi görüntüleriniz için ise abonelik gerekir (PayPal veya kart). Windows’ta yalnızca tek bir üreticinin biçimini açıyorsanız o üreticinin ücretsiz görüntüleyicisi ihtiyacınızı karşılayabilir; betikle analiz için QuPath ve Fiji ücretsiz ve açık kaynaktır.

Kendi CZI dosyanızda deneyin

Yerleşik örnek kitaplığını tüm araçlarla ücretsiz keşfedin. Kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Abonelik aylık $35.00 tutarındadır ve abone olduğunuzda faturalandırılır (PayPal veya kart). Hesabınızdan istediğiniz zaman iptal edebilirsiniz.

Mac için indirin