SlideScope natywnie otwiera pliki Zeiss CZI w macOS 14 lub nowszym, na Macach z Apple Silicon i Intel: każdą scenę, kanał, płaszczyznę Z i punkt czasowy, z rozmiarem piksela zapisanym w pliku. Eksportuje oglądaną scenę albo wszystkie sceny do jednego pliku OME-TIFF. ZEN lite, bezpłatna przeglądarka firmy ZEISS, działa tylko w Windows. Używasz Windows? Zobacz, jak otworzyć pliki CZI na Windows i Macu.
Sceny, kanały, Z i czasEksport do OME-TIFFApple Silicon i Intel
Zainstaluj SlideScope na Macu
Pobierz wersję dla macOS odpowiednią dla Twojego Maca: Apple Silicon (seria M) lub Intel. Strona pobierania poleca właściwą.
Otwórz plik DMG i przeciągnij SlideScope do folderu Aplikacje. Przewodnik instalacji na macOS pokazuje każdy krok na zrzutach ekranu, w tym co zrobić, jeśli macOS poprosi o potwierdzenie pierwszego otwarcia.
Otwórz przykład z wbudowanej biblioteki albo własny preparat. Wbudowaną bibliotekę przykładów możesz przeglądać bezpłatnie, ze wszystkimi narzędziami. Otwieranie własnych obrazów wymaga subskrypcji. Subskrypcja zaczyna się dopiero wtedy, gdy wybierzesz ją przy płatności.
Wieloscenowe pliki CZI: obejrzyj każdą scenę i wyeksportuj OME-TIFF
Plik CZI może zawierać kilka scen: dołki płytki, regiony kafelkowe lub obszary skanowania preparatu. SlideScope pokazuje każdą scenę osobno albo wszystkie razem i eksportuje oglądaną scenę lub wszystkie sceny do OME-TIFF. Film i poniższe kroki wykorzystują publiczny przykładowy plik z dwiema scenami.
Obejrzyj cały proces (1 min 41 s)
Otwieranie pliku CZI z dwiema scenami, przełączanie scen, XY Overview, kanały, Details, eksport jednej sceny i wszystkich scen oraz ponowne otwarcie pliku OME-TIFF. Narracja po angielsku; napisy we wszystkich językach strony. Nagrane w SlideScope 1.8.56 na Windows; wersja dla macOS ma te same elementy sterujące. Zaktualizowano od czasu nagrania: otwieranie i eksport własnych obrazów wymaga teraz subskrypcji. Wbudowane przykłady pozostają bezpłatne ze wszystkimi narzędziami.Transkrypcja
Plik CZI może zawierać kilka scen: dołki płytki, regiony kafelkowe lub obszary skanowania. Oto jak obejrzeć każdą z nich i wyeksportować je jako OME-TIFF.
Plik CZI z dwiema scenami, otwarty bezpośrednio. Bez konwersji. Kontrolka Scene przełącza z jednej sceny na następną. Scena 2 to dołek D7. Scena 1 to dołek D6. XY Overview umieszcza każdą scenę tam, gdzie została zarejestrowana. Te dwa dołki dzieli 9 mm.
Połącz kanały w jeden widok. Wyłącz kanał, aby zobaczyć, co wnosi. Powiększ. Pasek skali pozostaje skalibrowany. Details pokazuje rozmiar piksela, kanały i ustawienia akwizycji.
Aby wyeksportować, wybierz File, a potem Export Current Image as TIFF. Gdy oglądasz jedną scenę, eksportowana jest tylko ta scena. Przed rozpoczęciem widzisz rozmiar piksela, kanały i kompresję, które zostaną zapisane. Aby wyeksportować wszystkie sceny, najpierw włącz XY Overview. Wszystkie sceny trafiają do jednego pliku OME-TIFF. Każda scena jest w nim osobnym obrazem.
Otwórz wynik. Obie sceny są na miejscu, jako obraz 1 i obraz 2. Rozmiar piksela i nazwy kanałów zostały zachowane.
Bezpłatne konto pozwala otwierać i oglądać lokalne obrazy przed rozpoczęciem okresu próbnego. Eksport wymaga 3-dniowego okresu próbnego lub subskrypcji. Duży skan kafelkowy eksportuje się w rozdzielczości podglądu, a nie pełnego skanu. To ta sama aplikacja na macOS i Windows. To nagranie wyrenderowano na Windows.
Krok 1
Otwórz plik CZI
Wybierz File › Open File… (Ctrl+O w Windows, ⌘O na Macu) albo przeciągnij plik .czi do okna. Pierwsza scena pojawia się od razu. Nic nie jest konwertowane, a plik nie jest wysyłany.
Krok 2
Przechodź między scenami
Plik z kilkoma scenami wyświetla pod obrazem kontrolkę Scene. Użyj − i + albo wpisz numer. Każda scena zachowuje własny rozmiar i nazwę z pliku, np. dołek (D6, D7) lub region kafelkowy.
Krok 3
Zobacz wszystkie sceny w XY Overview
Kliknij XY Overview obok kontrolki Scene albo wybierz View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Każda scena jest rysowana tam, gdzie została zarejestrowana, razem z odstępami. Kliknij scenę, aby ją zaznaczyć, i kliknij dwukrotnie, aby ją otworzyć. Sceny położone daleko od siebie, jak dołki odległe o 9 mm, początkowo są małymi kafelkami: powiększ, aby je zobaczyć.
Krok 4
Sprawdź kanały, rozmiar piksela i metadane
W panelu Display zaznacz Blend channels into one view, aby uzyskać kolorowy obraz złożony, albo wyłącz pojedyncze kanały. Details pokazuje rozmiar piksela, wymiary, bieżącą scenę i jej rozmiar. Jasność, kontrast i kolory zmieniają tylko to, co widzisz, nigdy zapisane piksele.
Krok 5
Wybierz File › Export Current Image as TIFF
Wybierz File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Wskaż folder i nazwę; SlideScope proponuje nazwę z końcówką .ome.tif.
Krok 6
Wyeksportuj jedną scenę lub wszystkie sceny
Gdy na ekranie jest pojedyncza scena, eksportowana jest tylko ta scena, pod nazwą taką jak sample_scene-2.ome.tif. Aby wyeksportować wszystkie sceny, najpierw włącz XY Overview: wszystkie sceny trafiają do jednego pliku OME-TIFF, każda jako osobny obraz we własnym rozmiarze. Zanim cokolwiek zostanie zapisane, okno potwierdzenia pokazuje rozmiar, rozmiar piksela, kanały i kompresję.
Krok 7
Otwórz wynik
Gdy eksport się zakończy, kliknij Open Exported TIFF. SlideScope pokazuje każdą wyeksportowaną scenę jako obraz; przechodź między nimi za pomocą kontrolki Image. Czytniki OME-TIFF obsługujące kilka obrazów w jednym pliku, takie jak Bio-Formats w Fiji, wyświetlają je jako osobne serie.
Co zawiera wyeksportowany plik OME-TIFF
Jeden plik. Eksport sceny widocznej na ekranie zapisuje jeden obraz; eksport z XY Overview zapisuje każdą scenę jako osobny obraz w tym samym pliku, każdy we własnym rozmiarze. Nie powstaje osobny plik dla każdej sceny.
Piksele są zapisywane bez zmian, z kompresją bezstratną (Deflate). Jasność, kontrast i gamma to ustawienia wyświetlania i nie są stosowane przy eksporcie.
Rozmiar piksela w mikrometrach, krok Z, jeśli jest stos Z, nazwy kanałów zapisane w pliku CZI i kolory kanałów ustawione aktualnie w przeglądarce. Plik bez zapisanego rozmiaru piksela jest eksportowany bez niego; SlideScope nie wymyśla kalibracji.
Rozdzielczość: sceny mieszczące się w pamięci są eksportowane w pełnej rozdzielczości. Duży skan kafelkowy, np. region ze skanera preparatów, jest eksportowany w rozdzielczości podglądu. Okno potwierdzenia podaje współczynnik, np. 1:8, a zapisany rozmiar piksela jest odpowiednio skalowany. Skan w pełnej rozdzielczości nadal można oglądać w SlideScope, obszar po obszarze.
Pojedynczy wyeksportowany obraz szerszy lub wyższy niż 4096 pikseli otrzymuje też poziomy piramidy o obniżonej rozdzielczości. Plik z kilkoma obrazami ich nie otrzymuje. Pliki większe niż 2 GiB są zapisywane jako BigTIFF.
Nie są kopiowane: pozostałe metadane akwizycji z pliku CZI oraz pozycje scen jako współrzędne stolika. Zachowaj oryginalny plik CZI jako plik archiwalny.
Czego potrzebujesz
Windows 10 lub 11 albo macOS 14 lub nowszy na Apple Silicon lub Intel. Wbudowaną bibliotekę przykładów możesz przeglądać bezpłatnie, ze wszystkimi narzędziami. Otwieranie własnych obrazów wymaga subskrypcji. Subskrypcja kosztuje $35.00 miesięcznie i obejmuje eksport.
Jeśli coś wygląda nie tak
Pojawia się tylko jedna scena
Między scenami można przechodzić, gdy mają ten sam typ pikseli oraz te same kanały, płaszczyzny Z i punkty czasowe. Jeśli tak nie jest, SlideScope pokazuje pierwszą scenę i wyjaśnia przyczynę w panelu Details. Jeśli to nie jest to, czego się spodziewasz, wyślij nam plik.
Kolory różnią się od tych w ZEN
Kolory kanałów pochodzą z pliku, jeśli są w nim zapisane. Zmienisz je w Display › Channel colour…; eksport zapisuje ustawione przez Ciebie kolory.
Eksport jest mniejszy niż skan
Duży skan kafelkowy jest eksportowany w rozdzielczości podglądu, a okno potwierdzenia informuje o tym, zanim cokolwiek zostanie zapisane. Skan w pełnej rozdzielczości nadal można oglądać w SlideScope.
Eksport prosi o subskrypcję
Na wbudowanych przykładach wszystkie narzędzia działają bezpłatnie, łącznie z eksportem. Eksport własnych obrazów wymaga subskrypcji.
Przykład w filmie i na zrzutach ekranu: S2_3x3_CH2.czi z przykładowych danych czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), dwie sceny mozaiki 3 × 3 z DAPI i EGFP. Żadnych danych klientów.
Jak przetestowano obsługę CZI
W naszym opublikowanym teście formatów, przeprowadzonym 2026-09-18, otworzyło się wszystkie 48 z 48 plików CZI, z maksymalnie 8 kanałami, 56 płaszczyznami Z i 10 punktami czasowymi; największy miał 4,5 GB. To nasz własny test wydanych modułów wczytujących, opublikowany wraz z surowymi danymi, a nie niezależna certyfikacja, a przykładowe pliki nie obejmują wszystkich używanych wariantów CZI. Publiczne pliki testowe obejmują wieloscenowe płytki z dołkami i regiony kafelkowe, ale żadnego wieloscenowego pliku CZI ze skanera preparatów, więc ten przypadek jest słabiej pokryty. Zobacz benchmark formatów i zestawienie zgodności.
Inne sposoby otwierania CZI na Macu
Narzędzie
Dobre do
Warto wiedzieć
SlideScope
Otwieranie, przeglądanie, mierzenie i eksport plików CZI na Macu, obok ND2, SVS i innych formatów.
Przeglądarka i narzędzie do przeglądu. Bez skryptów i własnych potoków analizy.
Fiji / ImageJ z Bio-Formats
Bezpłatna analiza open source z wtyczkami i makrami; odczytuje CZI w macOS.
Platforma analityczna; każda scena jest importowana jako seria przez okno importu.
QuPath
Bezpłatna analiza całych preparatów; odczytuje CZI przez Bio-Formats.
Zbudowany wokół projektów analizy preparatów, a nie szybkiego przeglądu wielowymiarowych stosów.
ZEISS ZEN lite
Bezpłatna przeglądarka producenta, najbliższa oprogramowaniu do akwizycji.
Tylko Windows, więc na Macu bez Windows nie wchodzi w grę.
Pytania
Czy mogę otwierać pliki CZI na Macu?
Tak. SlideScope natywnie otwiera pliki CZI w macOS 14 lub nowszym, na Macach z Apple Silicon i Intel, także pliki z kilkoma scenami, kanałami, płaszczyznami Z i punktami czasowymi. Fiji z Bio-Formats również otwiera CZI na Macu. ZEN lite, bezpłatna przeglądarka firmy ZEISS, to aplikacja dla Windows.
Jak zobaczyć wszystkie sceny pliku CZI?
Użyj kontrolki Scene pod obrazem, aby przechodzić od sceny do sceny, albo włącz XY Overview, aby zobaczyć każdą scenę w zarejestrowanym położeniu. Każda scena zachowuje własny rozmiar i nazwę.
Czy mogę wyeksportować scenę CZI do OME-TIFF?
Tak. File › Export Current Image as TIFF eksportuje scenę widoczną na ekranie albo wszystkie sceny, gdy włączony jest XY Overview. Każda scena staje się osobnym obrazem w jednym pliku OME-TIFF, z kompresją bezstratną, rozmiarem piksela i nazwami kanałów. Eksport własnych plików wymaga subskrypcji; wbudowane przykłady eksportuje się bezpłatnie.
Czy SlideScope jest powiązany z firmą ZEISS?
Nie. SlideScope jest niezależny i nie jest powiązany z firmą ZEISS. Nazwy produktów służą wyłącznie do opisania formatów plików i porównań.
SlideScope nie jest powiązany z firmą ZEISS. ZEISS, ZEN i CZI są wymienione w celu opisania zgodności plików. SlideScope służy do badań, edukacji i przeglądu, a nie do diagnozy.
Kiedy SlideScope to dobry wybór
Wybierz SlideScope, jeśli chcesz jednej natywnej aplikacji desktopowej na Maca lub komputer z Windows, która otwiera preparaty i pliki mikroskopowe wielu producentów (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM i inne), mierzy w skalibrowanych jednostkach i liczy jądra oraz komórki bez pisania kodu, a każdy plik pozostaje na Twoim komputerze.
To płatna aplikacja z bezpłatną biblioteką przykładów: wszystkie narzędzia działają na wbudowanych przykładach, a otwieranie własnych obrazów wymaga subskrypcji (PayPal lub karta). Jeśli otwierasz w Windows pliki tylko jednego producenta, bezpłatna przeglądarka tego producenta może Ci wystarczyć; do analizy skryptowej QuPath i Fiji są bezpłatne i open source.
Wypróbuj na własnym pliku CZI
Wbudowaną bibliotekę przykładów możesz przeglądać bezpłatnie, ze wszystkimi narzędziami. Otwieranie własnych obrazów wymaga subskrypcji. Subskrypcja kosztuje $35.00 miesięcznie, płatne w chwili jej wykupienia (PayPal lub karta). Możesz ją anulować w każdej chwili na swoim koncie.
