SlideScope нативно відкриває файли Zeiss CZI в macOS 14 або новішій версії на Mac з Apple Silicon та Intel: кожну сцену, канал, Z-площину й часову точку, з розміром пікселя, записаним у файлі. Програма експортує сцену, яку ви переглядаєте, або всі сцени в один файл OME-TIFF. ZEN lite, безкоштовний переглядач ZEISS, працює лише у Windows. Користуєтеся Windows? Див. як відкрити файли CZI у Windows і на Mac.
Сцени, канали, Z і часЕкспорт в OME-TIFFApple Silicon та Intel
Встановіть SlideScope на свій Mac
Завантажте збірку для macOS, що відповідає вашому Mac: Apple Silicon (серія M) або Intel. Сторінка завантаження порекомендує потрібну.
Відкрийте DMG і перетягніть SlideScope до папки Applications. У посібнику зі встановлення на macOS кожен крок показано на знімках екрана, зокрема що робити, якщо macOS попросить підтвердити перше відкриття.
Відкрийте зразок із вбудованої бібліотеки або власний слайд. Вбудовану бібліотеку зразків можна безкоштовно досліджувати з усіма інструментами. Щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата. Передплата починається лише тоді, коли ви оберете її під час оформлення замовлення.
Багатосценні файли CZI: перегляд усіх сцен і експорт в OME-TIFF
CZI може містити кілька сцен: лунки планшета, ділянки мозаїки або ділянки сканування слайда. SlideScope показує кожну сцену окремо або всі разом і експортує в OME-TIFF сцену, яку ви переглядаєте, або всі сцени. У відео та кроках нижче використано публічний зразок із двома сценами.
Подивіться весь робочий процес (1 хв 41 с)
Відкриття CZI із двома сценами, перехід між сценами, XY Overview, канали, Details, експорт однієї сцени та всіх сцен і повторне відкриття OME-TIFF. Озвучення англійською; субтитри всіма мовами сайту. Записано в SlideScope 1.8.56 у Windows; збірка для macOS має ті самі елементи керування. Оновлено після запису: щоб відкривати й експортувати власні зображення, тепер потрібна передплата. Вбудовані зразки залишаються безкоштовними з усіма інструментами.Транскрипт
Файл CZI може містити кілька сцен: лунки планшета, ділянки мозаїки або ділянки сканування. Ось як переглянути кожну з них і експортувати їх як OME-TIFF.
CZI із двома сценами, відкритий напряму. Без конвертування. Елемент керування Scene переходить від однієї сцени до наступної. Сцена 2 — це лунка D7. Сцена 1 — лунка D6. XY Overview розміщує кожну сцену там, де її було записано. Ці дві лунки розташовані на відстані 9 mm одна від одної.
Змішайте канали в одне зображення (Blend channels into one view). Вимкніть канал, щоб побачити, що він додає. Збільшіть масштаб. Масштабна лінійка залишається каліброваною. Details показує розмір пікселя, канали й параметри отримання зображення.
Щоб експортувати, виберіть File, а потім Export Current Image as TIFF. Поки ви переглядаєте одну сцену, експортується лише вона. Перед початком ви бачите розмір пікселя, канали та стиснення, які буде записано. Щоб експортувати всі сцени, спершу ввімкніть XY Overview. Усі сцени потрапляють в один файл OME-TIFF. Кожна сцена — окреме зображення в ньому.
Відкрийте результат. Обидві сцени на місці, як зображення 1 і зображення 2. Розмір пікселя й назви каналів збереглися.
Безкоштовний обліковий запис дає змогу відкривати й переглядати локальні зображення ще до будь-якого пробного періоду. Для експорту потрібен 3-денний пробний період або передплата. Велике мозаїчне сканування експортується з роздільною здатністю огляду, а не як повне сканування. Це та сама програма в macOS і Windows. Це відео записано у Windows.
Крок 1
Відкрийте файл CZI
Виберіть File › Open File… (Ctrl+O у Windows, ⌘O на Mac) або перетягніть файл .czi у вікно. Перша сцена з’являється одразу. Нічого не конвертується, і файл не завантажується на сервер.
Крок 2
Переходьте між сценами
Для файлу з кількома сценами під зображенням з’являється елемент керування Scene. Використовуйте − і + або введіть номер. Кожна сцена зберігає власний розмір і назву з файлу, наприклад лунку (D6, D7) або ділянку мозаїки.
Крок 3
Перегляньте всі сцени в XY Overview
Натисніть XY Overview поруч з елементом керування Scene або виберіть View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Кожну сцену показано там, де її було записано, разом із проміжками. Клацніть сцену, щоб вибрати її, і двічі клацніть, щоб відкрити. Сцени, що розташовані далеко одна від одної, як-от лунки на відстані 9 mm, спочатку мають вигляд маленьких плиток: збільште масштаб, щоб їх побачити.
Крок 4
Перевірте канали, розмір пікселя й метадані
У Display позначте Blend channels into one view, щоб отримати кольорове композитне зображення, або вимкніть окремі канали. Details показує розмір пікселя, розміри, поточну сцену та її розмір. Яскравість, контраст і кольори змінюють лише те, що ви бачите, і ніколи — збережені пікселі.
Крок 5
Виберіть File › Export Current Image as TIFF
Виберіть File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Укажіть папку й назву; SlideScope пропонує назву із закінченням .ome.tif.
Крок 6
Експортуйте одну сцену або всі сцени
Поки на екрані одна сцена, експортується лише вона, з назвою на кшталт sample_scene-2.ome.tif. Щоб експортувати всі сцени, спершу ввімкніть XY Overview: усі сцени потрапляють в один файл OME-TIFF, кожна як окреме зображення власного розміру. Перш ніж щось буде записано, вікно підтвердження показує розмір, розмір пікселя, канали та стиснення.
Крок 7
Відкрийте результат
Коли експорт завершиться, натисніть Open Exported TIFF. SlideScope показує кожну експортовану сцену як окреме зображення; переходьте між ними за допомогою елемента керування Image. Програми для читання OME-TIFF, що підтримують кілька зображень в одному файлі, як-от Bio-Formats у Fiji, показують їх як окремі серії.
Що містить експортований OME-TIFF
Один файл. Експорт сцени на екрані записує одне зображення; експорт з XY Overview записує кожну сцену як окреме зображення всередині того самого файлу, кожне власного розміру. Окремий файл для кожної сцени не створюється.
Пікселі записуються без змін, зі стисненням без втрат (Deflate). Яскравість, контраст і гамма — це параметри відображення, і до експорту вони не застосовуються.
Розмір пікселя в мікрометрах, крок Z, якщо є Z-стек, назви каналів, записані в CZI, і кольори каналів, налаштовані зараз у переглядачі. Файл без записаного розміру пікселя експортується без нього; SlideScope не вигадує калібрування.
Роздільна здатність: сцени, що вміщуються в пам’ять, експортуються в повній роздільній здатності. Велике мозаїчне сканування, наприклад ділянка зі слайд-сканера, експортується з роздільною здатністю огляду. Вікно підтвердження вказує співвідношення, наприклад 1:8, і записаний розмір пікселя масштабується відповідно. Сканування в повній роздільній здатності можна й далі переглядати в SlideScope ділянку за ділянкою.
Окреме експортоване зображення, ширше або вище за 4,096 пікселів, також отримує пірамідальні рівні зниженої роздільної здатності. Файл з кількома зображеннями їх не отримує. Файли понад 2 GiB записуються як BigTIFF.
Не копіюються: решта метаданих отримання зображення з CZI та позиції сцен як координати столика. Зберігайте оригінальний CZI як архівний файл.
Що вам потрібно
Windows 10 або 11 чи macOS 14 або новіша на Apple Silicon або Intel. Вбудовану бібліотеку зразків можна безкоштовно досліджувати з усіма інструментами. Щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата. Передплата коштує $35.00 на місяць і включає експорт.
Якщо щось виглядає не так
Видно лише одну сцену
Між сценами можна переходити, якщо вони мають однаковий тип пікселів і ті самі канали, Z-площини та часові точки. Якщо ні, SlideScope показує першу сцену й пояснює причину в Details. Якщо ви очікували іншого, надішліть нам файл.
Кольори відрізняються від ZEN
Кольори каналів беруться з файлу, якщо він їх записує. Змінити їх можна в Display › Channel colour…; експорт записує кольори, які ви задали.
Експорт менший за сканування
Велике мозаїчне сканування експортується з роздільною здатністю огляду, і вікно підтвердження повідомляє про це, перш ніж щось буде записано. Сканування в повній роздільній здатності можна й далі переглядати в SlideScope.
Під час експорту пропонується оформити передплату
На вбудованих зразках усі інструменти працюють безкоштовно, включно з експортом. Для експорту власних зображень потрібна передплата.
Зразок у відео та на знімках екрана: S2_3x3_CH2.czi зі зразкових даних czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), дві сцени мозаїки 3 × 3 з DAPI та EGFP. Жодних даних клієнтів.
Наскільки ретельно протестовано підтримку CZI
У нашому опублікованому тесті форматів, проведеному 2026-09-18, відкрилися всі 48 із 48 файлів CZI, з кількістю каналів до 8, Z-площин до 56 і часових точок до 10; найбільший файл мав 4.5 GB. Це наш власний тест завантажувачів у поточній версії програми, опублікований разом із необробленими даними, а не незалежна сертифікація, і зразки не охоплюють усіх варіантів CZI, що використовуються. Публічні тестові файли включають багатосценні планшети з лунками та ділянки мозаїки, але не багатосценні CZI зі слайд-сканерів, тож цей випадок охоплено менше. Див. порівняльний тест форматів і довідник із сумісності.
Інші способи відкрити CZI на Mac
Інструмент
Підходить для
Що варто врахувати
SlideScope
Відкриття, перегляд, вимірювання й експорт файлів CZI на Mac, поряд з ND2, SVS та іншими форматами.
Інструмент для перегляду. Без скриптів і власних конвеєрів аналізу.
Fiji / ImageJ з Bio-Formats
Безкоштовний аналіз з відкритим кодом, з плагінами й макросами; читає CZI в macOS.
Платформа для аналізу; кожна сцена імпортується як серія через діалогове вікно імпорту.
QuPath
Безкоштовний аналіз повних слайдів; читає CZI через Bio-Formats.
Побудований навколо проєктів аналізу слайдів, а не швидкого перегляду багатовимірних стеків.
ZEISS ZEN lite
Безкоштовний переглядач виробника, найближчий до програми отримання зображень.
Лише Windows, тож на Mac без Windows це не варіант.
Запитання
Чи можна відкрити файли CZI на Mac?
Так. SlideScope нативно відкриває файли CZI в macOS 14 або новішій версії на Mac з Apple Silicon та Intel, зокрема файли з кількома сценами, каналами, Z-площинами та часовими точками. Fiji з Bio-Formats також відкриває CZI на Mac. ZEN lite, безкоштовний переглядач ZEISS, — програма для Windows.
Як переглянути всі сцени файлу CZI?
Використовуйте елемент керування Scene під зображенням, щоб переходити від сцени до сцени, або ввімкніть XY Overview, щоб побачити всі сцени в записаних позиціях. Кожна сцена зберігає власний розмір і назву.
Чи можна експортувати сцену CZI в OME-TIFF?
Так. File › Export Current Image as TIFF експортує сцену на екрані або всі сцени, якщо ввімкнено XY Overview. Кожна сцена стає окремим зображенням в одному файлі OME-TIFF, зі стисненням без втрат, розміром пікселя й назвами каналів. Для експорту власних файлів потрібна передплата; вбудовані зразки експортуються безкоштовно.
Чи пов’язаний SlideScope із ZEISS?
Ні. SlideScope — незалежний продукт і не пов’язаний із ZEISS. Назви продуктів використано лише для опису формату файлів і порівняння.
SlideScope не пов’язаний із ZEISS. ZEISS, ZEN і CZI названо для опису сумісності файлів. SlideScope призначений для досліджень, навчання та перегляду, а не для діагностики.
Коли SlideScope — правильний вибір
Обирайте SlideScope, якщо вам потрібна одна нативна настільна програма для Mac або ПК з Windows, яка відкриває слайди й мікроскопічні файли багатьох виробників (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM та інші), вимірює в каліброваних одиницях і підраховує ядра та клітини без написання коду, а всі файли залишаються на вашому комп’ютері.
Це платна програма з безкоштовною бібліотекою зразків: на вбудованих зразках працюють усі інструменти, а для ваших власних зображень потрібна передплата (PayPal або картка). Якщо ви відкриваєте формат лише одного виробника у Windows, вам може вистачити безкоштовного переглядача цього виробника; для аналізу за допомогою скриптів QuPath і Fiji безкоштовні та мають відкритий код.
Спробуйте на власному файлі CZI
Вбудовану бібліотеку зразків можна безкоштовно досліджувати з усіма інструментами. Щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата. Передплата коштує $35.00 на місяць, оплата стягується під час оформлення (PayPal або картка). Скасування в будь-який момент у вашому обліковому записі.
