O SlideScope abre arquivos Zeiss CZI nativamente no macOS 14 ou posterior, em Macs com Apple Silicon e Intel: todas as cenas, canais, planos Z e pontos de tempo, com o tamanho do pixel registrado no arquivo. Ele exporta a cena que você está vendo, ou todas as cenas, para um único arquivo OME-TIFF. O ZEN lite, o visualizador gratuito da ZEISS, roda apenas no Windows. Está no Windows? Veja como abrir arquivos CZI no Windows e no Mac.
Cenas, canais, Z e tempoExportação para OME-TIFFApple Silicon e Intel
Instale o SlideScope no seu Mac
Baixe a versão para macOS que corresponde ao seu Mac: Apple Silicon (série M) ou Intel. A página de download recomenda a certa.
Abra o DMG e arraste o SlideScope para Applications. O guia de instalação no macOS mostra cada etapa com capturas de tela, inclusive o que fazer se o macOS pedir para você confirmar a primeira abertura.
Abra uma amostra da biblioteca incluída ou a sua própria lâmina. Explore a biblioteca de amostras incluída de graça, com todas as ferramentas. Para abrir suas próprias imagens é preciso uma assinatura. A assinatura só começa quando você a escolhe no checkout.
Arquivos CZI com várias cenas: veja todas as cenas e exporte OME-TIFF
Um CZI pode conter várias cenas: os poços de uma placa, regiões de mosaico ou as regiões de digitalização de uma lâmina. O SlideScope mostra cada cena sozinha ou todas juntas e exporta a cena que você está vendo, ou todas as cenas, para OME-TIFF. O vídeo e as etapas abaixo usam um arquivo de amostra público com duas cenas.
Assista ao fluxo completo (1 min 41 s)
Abrindo um CZI com duas cenas, trocando de cena, XY Overview, canais, Details, exportando uma cena e todas as cenas e reabrindo o OME-TIFF. Narração em inglês; legendas em todos os idiomas do site. Renderizado a partir do SlideScope 1.8.56 no Windows; a versão para macOS tem os mesmos controles. Atualizado desde a gravação: abrir e exportar suas próprias imagens agora exige uma assinatura. As amostras incluídas continuam gratuitas, com todas as ferramentas.Transcrição
Um arquivo CZI pode conter várias cenas: poços de uma placa, regiões de mosaico ou regiões de digitalização. Veja como visualizar cada uma e exportá-las como OME-TIFF.
Um CZI com duas cenas, aberto diretamente. Sem conversão. O controle Scene passa de uma cena para a próxima. A cena 2 é o poço D7. A cena 1 é o poço D6. O XY Overview posiciona cada cena onde ela foi registrada. Estes dois poços ficam a 9 mm um do outro.
Combine os canais em uma única visualização. Desligue um canal para ver o que ele contribui. Aproxime o zoom. A barra de escala continua calibrada. Details lista o tamanho do pixel, os canais e as configurações de aquisição.
Para exportar, escolha File e depois Export Current Image as TIFF. Enquanto você visualiza uma cena, só essa cena é exportada. Antes de começar, você vê o tamanho do pixel, os canais e a compressão que serão gravados. Para exportar todas as cenas, ative o XY Overview primeiro. Todas as cenas vão para um único arquivo OME-TIFF. Cada cena é uma imagem própria dentro dele.
Abra o resultado. As duas cenas estão lá, como imagem 1 e imagem 2. O tamanho do pixel e os nomes dos canais foram preservados.
Uma conta gratuita permite abrir e visualizar imagens locais antes de qualquer teste. A exportação exige o teste de 3 dias ou uma assinatura. Uma digitalização grande em mosaico é exportada na resolução da visão geral, não na digitalização completa. É o mesmo aplicativo no macOS e no Windows. Estas imagens foram renderizadas no Windows.
Passo 1
Abra o arquivo CZI
Escolha File › Open File… (Ctrl+O no Windows, ⌘O no Mac) ou arraste o arquivo .czi para a janela. A primeira cena aparece na hora. Nada é convertido e o arquivo não é enviado.
Passo 2
Percorra as cenas
Um arquivo com várias cenas mostra um controle Scene abaixo da imagem. Use − e + ou digite um número. Cada cena mantém o próprio tamanho e o nome que tem no arquivo, como um poço (D6, D7) ou uma região de mosaico.
Passo 3
Veja todas as cenas no XY Overview
Clique em XY Overview ao lado do controle Scene, ou escolha View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Cada cena é desenhada onde foi registrada, incluindo os espaços entre elas. Clique em uma cena para selecioná-la e clique duas vezes para abri-la. Cenas muito distantes entre si, como poços a 9 mm um do outro, começam como blocos pequenos: aproxime o zoom para vê-las.
Passo 4
Confira os canais, o tamanho do pixel e os metadados
Em Display, marque Blend channels into one view para um composto colorido, ou desligue canais individuais. Details lista o tamanho do pixel, as dimensões, a cena atual e o tamanho dela. Brilho, contraste e cores mudam apenas o que você vê, nunca os pixels armazenados.
Passo 5
Escolha File › Export Current Image as TIFF
Escolha File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Escolha uma pasta e um nome; o SlideScope sugere um que termina em .ome.tif.
Passo 6
Exporte uma cena ou todas as cenas
Enquanto uma única cena está na tela, só essa cena é exportada, com um nome como sample_scene-2.ome.tif. Para exportar todas as cenas, ative o XY Overview primeiro: todas as cenas vão para um único arquivo OME-TIFF, cada uma como uma imagem própria, no próprio tamanho. Antes de qualquer gravação, uma confirmação mostra o tamanho, o tamanho do pixel, os canais e a compressão.
Passo 7
Abra o resultado
Clique em Open Exported TIFF quando a exportação terminar. O SlideScope mostra cada cena exportada como uma imagem; percorra-as com o controle Image. Leitores de OME-TIFF que suportam várias imagens por arquivo, como o Bio-Formats no Fiji, as listam como séries separadas.
O que o OME-TIFF exportado contém
Um único arquivo. Exportar a cena na tela grava uma imagem; exportar a partir do XY Overview grava cada cena como uma imagem separada dentro do mesmo arquivo, cada uma no próprio tamanho. Não é criado um arquivo por cena.
Os pixels são gravados sem alteração, com compressão sem perdas (Deflate). Brilho, contraste e gama são configurações de exibição e não são aplicados à exportação.
O tamanho do pixel em micrômetros, o passo em Z quando há uma pilha Z, os nomes dos canais registrados no CZI e as cores dos canais definidas no momento no visualizador. Um arquivo sem tamanho do pixel registrado é exportado sem ele; o SlideScope não inventa uma calibração.
Resolução: cenas que cabem na memória são exportadas em resolução total. Uma digitalização grande em mosaico, como uma região de scanner de lâminas, é exportada na resolução da visão geral. A confirmação informa a proporção, por exemplo 1:8, e o tamanho do pixel registrado é ajustado de acordo. A digitalização em resolução total continua visível região por região no SlideScope.
Uma única imagem exportada com mais de 4.096 pixels de largura ou altura também recebe níveis de pirâmide em resolução reduzida. Um arquivo com várias imagens não recebe. Arquivos acima de 2 GiB são gravados como BigTIFF.
Não é copiado: o restante dos metadados de aquisição do CZI e as posições das cenas como coordenadas da platina. Guarde o CZI original como arquivo de referência.
O que você precisa
Windows 10 ou 11, ou macOS 14 ou posterior em Apple Silicon ou Intel. Explore a biblioteca de amostras incluída de graça, com todas as ferramentas. Para abrir suas próprias imagens é preciso uma assinatura. A assinatura custa $35.00 por mês e inclui a exportação.
Se algo parecer errado
Só aparece uma cena
As cenas podem ser percorridas quando compartilham o tipo de pixel e os mesmos canais, planos Z e pontos de tempo. Se não for o caso, o SlideScope mostra a primeira cena e explica o motivo em Details. Se não for isso que você espera, envie-nos o arquivo.
As cores são diferentes das do ZEN
As cores dos canais vêm do arquivo, quando ele as registra. Altere-as em Display › Channel colour…; a exportação registra as cores que você definir.
A exportação é menor que a digitalização
Uma digitalização grande em mosaico é exportada na resolução da visão geral, e a confirmação avisa isso antes de qualquer gravação. A digitalização em resolução total continua visível no SlideScope.
A exportação pede que você assine
Com as amostras incluídas, todas as ferramentas funcionam de graça, inclusive a exportação. Exportar suas próprias imagens exige uma assinatura.
Amostra do vídeo e das capturas de tela: S2_3x3_CH2.czi, dos dados de amostra do czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), duas cenas de um mosaico 3 × 3 com DAPI e EGFP. Nenhum dado de cliente.
Como o suporte a CZI é testado
No nosso teste de formatos publicado, executado em 2026-09-18, todos os 48 de 48 arquivos CZI abriram, com até 8 canais, 56 planos Z e 10 pontos de tempo; o maior tinha 4,5 GB. É o nosso próprio teste dos leitores que distribuímos, publicado com os dados brutos, não uma certificação independente, e os arquivos de amostra não cobrem todas as variantes de CZI em uso. Os arquivos de teste públicos incluem placas de poços e regiões de mosaico com várias cenas, mas nenhum CZI de scanner de lâminas com várias cenas, então esse caso tem menos cobertura. Veja o benchmark de formatos e a referência de compatibilidade.
Outras formas de abrir CZI no Mac
Ferramenta
Indicado para
Tenha em mente
SlideScope
Abrir, revisar, medir e exportar arquivos CZI no Mac, junto com ND2, SVS e outros formatos.
Um visualizador e ferramenta de revisão. Sem scripts nem pipelines de análise personalizados.
Fiji / ImageJ com Bio-Formats
Análise gratuita e de código aberto, com plugins e macros; lê CZI no macOS.
Uma plataforma de análise; cada cena é importada como uma série por meio de uma caixa de diálogo de importação.
QuPath
Análise gratuita de lâminas inteiras; lê CZI pelo Bio-Formats.
Construído em torno de projetos de análise de lâminas, e não da revisão rápida de pilhas multidimensionais.
ZEISS ZEN lite
O visualizador gratuito do fabricante, o mais próximo do software de aquisição.
Só para Windows, então não é uma opção em um Mac sem Windows.
Perguntas
Posso abrir arquivos CZI no Mac?
Sim. O SlideScope abre arquivos CZI nativamente no macOS 14 ou posterior, em Macs com Apple Silicon e Intel, inclusive arquivos com várias cenas, canais, planos Z e pontos de tempo. O Fiji com o Bio-Formats também abre CZI no Mac. O ZEN lite, o visualizador gratuito da ZEISS, é um aplicativo para Windows.
Como vejo todas as cenas de um arquivo CZI?
Use o controle Scene abaixo da imagem para passar de uma cena para outra, ou ative o XY Overview para ver todas as cenas na posição registrada. Cada cena mantém o próprio tamanho e nome.
Posso exportar uma cena de CZI para OME-TIFF?
Sim. File › Export Current Image as TIFF exporta a cena na tela, ou todas as cenas quando o XY Overview está ativado. Cada cena vira uma imagem própria dentro de um único arquivo OME-TIFF, com compressão sem perdas, tamanho do pixel e nomes dos canais. Exportar seus próprios arquivos exige uma assinatura; as amostras incluídas são exportadas de graça.
O SlideScope é afiliado à ZEISS?
Não. O SlideScope é independente e não é afiliado à ZEISS. Os nomes de produtos descrevem apenas o formato de arquivo e a intenção de comparação.
O SlideScope não é afiliado à ZEISS. ZEISS, ZEN e CZI são citados para descrever a compatibilidade de arquivos. O SlideScope se destina a pesquisa, educação e revisão, não a diagnóstico.
Quando o SlideScope é a escolha certa
Escolha o SlideScope quando você quiser um único aplicativo nativo para desktop, no Mac ou em um PC com Windows, que abra lâminas e arquivos de microscopia de muitos fabricantes (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM e outros), meça em unidades calibradas e conte núcleos e células sem escrever código, com todos os arquivos mantidos no seu próprio computador.
É um aplicativo pago com uma biblioteca de amostras gratuita: todas as ferramentas funcionam com as amostras incluídas, e suas próprias imagens exigem uma assinatura (PayPal ou cartão). Se você só abre o formato de um fabricante no Windows, o visualizador gratuito desse fabricante pode ser tudo de que você precisa; para análises com scripts, o QuPath e o Fiji são gratuitos e de código aberto.
Experimente com o seu próprio arquivo CZI
Explore a biblioteca de amostras incluída de graça, com todas as ferramentas. Para abrir suas próprias imagens é preciso uma assinatura. A assinatura custa $35.00 por mês, cobrada no momento da assinatura (PayPal ou cartão). Cancele quando quiser pela sua conta.
