SlideScope leren

Van geïnstalleerd naar echte resultaten

Elke handleiding hieronder is een taak die iemand echt moet afronden, met een eerlijke tijdsindicatie en drie stappen. Begin bij het startpad als SlideScope nieuw voor u is, of ga meteen naar het werk dat voor u ligt.

Proef startenDownload en proefperiode
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Begin hier

Ongeveer tien minuten, eenmalig. Doe ze op volgorde en de rest van deze pagina valt op zijn plek.

  1. Installeren en activeren

    Download de ondertekende build voor Windows of macOS en meld u aan met het account dat u voor de proefperiode of het abonnement gebruikte. Activering is aan het apparaat gebonden en één abonnement dekt twee apparaten, dus uw laptop en uw werkstation kunnen allebei aangemeld blijven.

  2. Uw eerste coupe openen

    Sleep een CZI-, ND2-, SVS-, NDPI-, DICOM- of TIFF-bestand op het venster. Er is geen importstap en geen conversie: SlideScope leest de scannerpiramide rechtstreeks, dus een gigapixelcoupe opent op een gewone laptop.

  3. De weg vinden

    Scrollen om te zoomen, slepen om te verplaatsen, en met de overzichtsnavigator springt u over de coupe zonder uw plek kwijt te raken. Kijk vroeg in het metadatapaneel: de pixelgrootte die daar staat maakt elke latere meting gekalibreerd in plaats van bij benadering.

Handleidingen per taak

Kies degene die past bij wat u vandaag probeert te doen.

Celkernen tellen in een fluorescentiebeeld

6 min
  1. Open het beeld en selecteer het gebied dat geteld moet worden. Een gebied kwantificeren in plaats van een hele coupe houdt de run snel en het resultaat op het weefsel waar het u om gaat.
  2. Kies in het kwantificatiepaneel Celkernen, neem InstanSeg als engine en zet het segmentatiekanaal op uw DAPI of kernkleuring. Laat de geavanceerde instellingen bij de eerste run met rust.
  3. Voer het uit en lees de overlay vóór het getal. Klik op elk object dat er verkeerd uitziet en sluit het uit, en exporteer daarna de CSV en de methodesamenvatting samen.

Een structuur in micrometers meten

4 min
  1. Controleer of het metadatapaneel een pixelgrootte toont. Heeft de scanner die vastgelegd, dan komen metingen in echte micrometers; zo niet, kalibreer handmatig voordat u iets meet.
  2. Kies het meetgereedschap en trek over de structuur. Afstanden en oppervlakken worden op volledige coupeleresolutie berekend, niet op het zoomniveau waarop u toevallig kijkt.
  3. Sla de meting op zodat die aan de coupe verbonden blijft, en exporteer later de tabel als CSV of de gebieden als GeoJSON wanneer u ze elders nodig hebt.

HE vergelijken met de bijbehorende IHC

5 min
  1. Open de eerste coupe en daarna de tweede ernaast. Beide vensters blijven op hetzelfde stuk weefsel bij dezelfde vergroting.
  2. De schaal wordt in micrometers gelijkgetrokken en niet via de zoomfactor, dus scans met verschillende resoluties komen echt overeen. Verschuif of zoom één venster en het andere volgt.
  3. Annoteer in het venster waar dat logisch is. Notities blijven bij hun eigen coupe en bij uw account, zodat de volgende beoordelaar ze ziet.

Een hele map in één run kwantificeren

8 min
  1. Krijg eerst één beeld goed. Stel objecttype, engine, kanaal en oppervlaktegrenzen af op één representatief beeld tot de overlay klopt.
  2. Sla die instellingen op als recept en geef het een naam die u over drie maanden herkent.
  3. Kies de mapbatch, wijs de map aan en laat het lopen. U krijgt exports per beeld plus een gecombineerde batchsamenvatting als CSV, waarbij elk beeld met identieke instellingen is geanalyseerd.

Precies de weergave delen die u ziet

3 min
  1. Ga naar het beeldveld dat de ander moet zien, op de zoom en het vlak waarop u wilt dat hij het ziet.
  2. Maak een gedeelde weergavelink. Die draagt de coupe plus positie, zoom en vlak, zodat niemand door een gigapixelscan hoeft te zoeken.
  3. Verstuur hem. Wie SlideScope geïnstalleerd heeft, opent hem met één klik via het slidescope://-schema; wie niet, ziet eerst op de website waar de link naar wijst.

Naslag

Houd dit open in een tabblad terwijl u werkt.

Kwantificerenondersteunde bestandsindelingenVertrouwen en gegevensContactReleaseopmerkingen

Veelgestelde vragen

Ik ben hier helemaal nieuw in. Waar begin ik?

Werk de drie startstappen op volgorde af en doe daarna de meethandleiding. Die vier dingen dekken het meeste van wat een nieuwe gebruiker in de eerste week nodig heeft. De telhandleiding is daarna de moeite waard, ook als u denkt nog geen kwantificatie nodig te hebben, want het is de snelste manier om te begrijpen hoe SlideScope met kalibratie omgaat.

Moet ik leren programmeren?

Nee. Niets op deze pagina vraagt om een script, macro, plug-in of Python-omgeving. Kwantificatie draait op opgeslagen recepten in plaats van code: dat is de ruil, minder flexibel dan een programmeerbaar platform, veel sneller naar een resultaat.

Hoe train ik de rest van mijn lab?

Stuur ze een gedeelde weergavelink naar een echte coupe uit uw eigen werk, samen met deze pagina. Iets vertrouwds openen werkt beter dan een kunstmatig oefenbestand, en de link zorgt dat ze hetzelfde beeldveld zien als u en niet een andere hoek van de scan.

Leer het op uw eigen beelden

De proefperiode van 14 dagen geeft volledige toegang. Werk deze handleidingen door met de coupes waar uw lab echt mee te maken heeft, niet met een voorbeeldbestand.

Proef starten
ondersteunde bestandsindelingenReleaseopmerkingenAlternatievenVertrouwen en gegevens