Aprenda o SlideScope

Da instalação a resultados reais

Cada guia abaixo é uma tarefa que alguém precisa mesmo terminar, com uma estimativa de tempo honesta e três passos. Comece pelo caminho inicial se o SlideScope for novo para você, ou vá direto ao trabalho que está na sua frente.

Iniciar testeDownload e teste
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Comece por aqui

Cerca de dez minutos, uma vez só. Faça na ordem e todo o resto desta página fará sentido.

  1. Instale e ative

    Baixe a build assinada para Windows ou macOS e entre com a conta que você usou no teste ou na assinatura. A ativação fica vinculada à máquina, e uma assinatura cobre dois dispositivos, então seu notebook e sua estação de trabalho podem ficar conectados ao mesmo tempo.

  2. Abra sua primeira lâmina

    Arraste um arquivo CZI, ND2, SVS, NDPI, DICOM ou TIFF para a janela. Não há etapa de importação nem conversão: o SlideScope lê a pirâmide do scanner direto, então uma lâmina de gigapixels abre em um notebook comum.

  3. Se localize

    Role para aproximar, arraste para deslocar e use o navegador de visão geral para pular pela lâmina sem perder o ponto. Olhe cedo o painel de metadados: o tamanho de pixel registrado ali é o que faz cada medição seguinte ser calibrada, e não aproximada.

Guias por tarefa

Escolha o que corresponde ao que você está tentando fazer hoje.

Contar núcleos em uma imagem de fluorescência

6 min
  1. Abra a imagem e selecione a região que quer contar. Quantificar uma região em vez da lâmina inteira mantém a execução rápida e deixa o resultado sobre o tecido que interessa a você.
  2. No painel de quantificação escolha Núcleos, selecione o InstanSeg como motor e defina o canal de segmentação para seu DAPI ou coloração nuclear. Deixe as configurações avançadas quietas na primeira execução.
  3. Rode e leia a sobreposição antes do número. Clique em qualquer objeto que pareça errado e exclua; depois exporte juntos o CSV e o resumo de métodos.

Medir uma estrutura em micrômetros

4 min
  1. Confirme que o painel de metadados mostra um tamanho de pixel. Se o scanner registrou, as medições saem em micrômetros reais; se não, calibre manualmente antes de medir qualquer coisa.
  2. Escolha a ferramenta de medição e trace sobre a estrutura. Distâncias e áreas são calculadas na resolução total da lâmina, não no nível de zoom em que você está olhando.
  3. Salve a medição para ficar ligada à lâmina e exporte depois a tabela em CSV ou as regiões em GeoJSON quando precisar delas em outro lugar.

Comparar HE com sua IHQ

5 min
  1. Abra a primeira lâmina e depois a segunda ao lado. Os dois painéis travam na mesma região do tecido com a mesma ampliação.
  2. A escala é igualada em micrômetros e não pelo fator de zoom, então digitalizações em resoluções diferentes realmente correspondem. Desloque ou aproxime um painel e o outro acompanha.
  3. Anote no painel que fizer sentido. As notas ficam presas à própria lâmina e à sua conta, então o próximo revisor as vê.

Quantificar uma pasta inteira de uma vez

8 min
  1. Acerte primeiro em uma imagem. Ajuste tipo de objeto, motor, canal e limites de área em uma única imagem representativa até a sobreposição ficar correta.
  2. Salve essas configurações como receita e dê um nome que você reconheça daqui a três meses.
  3. Escolha o lote por pasta, aponte para o diretório e deixe rodar. Você recebe exportações por imagem e um CSV de resumo do lote, com todas as imagens analisadas com configurações idênticas.

Compartilhar a vista exata que você está vendo

3 min
  1. Vá até o campo de visão que você quer que a outra pessoa veja, no zoom e no plano em que quer que ela veja.
  2. Crie um link de vista compartilhada. Ele leva a lâmina junto com posição, zoom e plano, então ela não vai ter que caçar numa digitalização de gigapixels.
  3. Envie. Quem tiver o SlideScope instalado abre com um clique pelo esquema slidescope://; quem não tiver vê primeiro no site para onde o link aponta.

Referência

Deixe isto aberto em uma aba enquanto trabalha.

Quantificarformatos de arquivo compatíveisConfiança e dadosContatoNotas de versão

Perguntas frequentes

Sou totalmente novo nisso. Por onde começo?

Faça os três passos iniciais na ordem e depois o guia de medição. Essas quatro coisas cobrem quase tudo o que um usuário novo precisa na primeira semana. O guia de contagem vale a pena em seguida mesmo que você ainda não ache que precisa de quantificação, porque é o jeito mais rápido de entender como o SlideScope trata calibração.

Preciso aprender a programar?

Não. Nada nesta página exige script, macro, plugin ou ambiente Python. A quantificação é conduzida por receitas salvas em vez de código: menos flexível que uma plataforma programável, muito mais rápida para chegar a um resultado.

Como treino o resto do meu laboratório?

Mande um link de vista compartilhada apontando para uma lâmina real do seu próprio trabalho, junto com esta página. Abrir algo familiar funciona melhor que um arquivo de tutorial artificial, e o link garante que vejam o mesmo campo de visão que você, não outro canto da digitalização.

Aprenda nas suas próprias imagens

O teste de 14 dias é de acesso completo. Percorra estes guias com as lâminas que seu laboratório realmente lida, não com um arquivo de exemplo.

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formatos de arquivo compatíveisNotas de versãoAlternativasConfiança e dados