Windows 또는 macOS용 SlideScope에서 사전 변환 없이 ZEISS CZI 파일을 여세요. 파일에 저장된 채널과 이미지 차원을 확인할 수 있습니다. 로컬 보기는 이미지를 업로드하지 않습니다.
CZI 파일에는 플레이트의 웰, 타일 영역, 슬라이드의 스캔 영역 등 여러 장면이 들어 있을 수 있습니다. SlideScope는 각 장면을 따로 또는 모두 함께 표시하고, 보고 있는 장면이나 모든 장면을 OME-TIFF로 내보냅니다. 아래 동영상과 단계에서는 공개된 2장면 샘플 파일을 사용합니다.
CZI 파일에는 여러 장면이 담길 수 있습니다: 웰, 타일 영역, 스캔 영역. 각 장면을 보고 OME-TIFF로 내보내는 방법입니다.
2장면 CZI를 바로 엽니다. 변환 없음. Scene 컨트롤로 장면을 하나씩 넘깁니다. 장면 2는 웰 D7, 장면 1은 웰 D6입니다. XY Overview는 각 장면을 기록된 위치에 배치합니다. 이 두 웰은 9 mm 떨어져 있습니다.
채널을 하나의 보기로 합성합니다. 채널을 꺼서 그 채널의 기여를 확인합니다. 확대해도 스케일 바는 교정된 상태입니다. Details에 픽셀 크기, 채널, 획득 설정이 나옵니다.
내보내려면 File › Export Current Image as TIFF 선택. 한 장면을 보는 동안에는 그 장면만 내보냅니다. 시작 전에 기록할 픽셀 크기, 채널, 압축 방식을 보여 줍니다. 모든 장면을 내보내려면 먼저 XY Overview를 켜세요. 모든 장면이 한 OME-TIFF에 들어가고, 장면마다 별도 이미지입니다.
결과를 엽니다. 두 장면이 이미지 1과 이미지 2로 들어 있습니다. 픽셀 크기와 채널 이름이 그대로 전달되었습니다.
무료 계정으로 체험 전에 로컬 이미지를 열어 볼 수 있습니다. 내보내기에는 3일 체험 또는 구독이 필요합니다. 대형 타일 스캔은 전체가 아닌 개요 해상도로 내보냅니다. macOS와 Windows에서 같은 앱입니다. 영상은 Windows에서 렌더링.
File › Open File…을 선택하거나(Windows에서는 Ctrl+O, Mac에서는 ⌘O) .czi 파일을 창으로 끌어다 놓습니다. 첫 번째 장면이 바로 표시됩니다. 아무것도 변환되지 않으며 파일이 업로드되지도 않습니다.
여러 장면이 있는 파일은 이미지 아래에 Scene 컨트롤을 표시합니다. −와 +를 사용하거나 번호를 입력하세요. 각 장면은 고유한 크기와 파일에 기록된 이름(예: 웰 D6, D7 또는 타일 영역)을 유지합니다.
Scene 컨트롤 옆의 XY Overview를 클릭하거나 View › XY Overview(Ctrl+Shift+X)를 선택합니다. 각 장면은 기록된 위치에 사이의 간격까지 그대로 그려집니다. 장면을 클릭하면 선택되고, 더블클릭하면 열립니다. 9 mm 떨어진 웰처럼 멀리 떨어진 장면은 처음에 작은 타일로 보이므로 확대해서 확인하세요.
Display에서 Blend channels into one view를 선택하면 컬러 합성 이미지가 되며, 개별 채널을 끌 수도 있습니다. Details에는 픽셀 크기, 차원, 현재 장면과 그 크기가 표시됩니다. 밝기, 대비, 색상은 보이는 모습만 바꾸며 저장된 픽셀은 절대 바꾸지 않습니다.
File › Export Current Image as TIFF…(Ctrl+Shift+C)를 선택합니다. 폴더와 이름을 지정하세요. SlideScope는 .ome.tif로 끝나는 이름을 제안합니다.
화면에 한 장면만 표시되어 있으면 그 장면만 sample_scene-2.ome.tif 같은 이름으로 내보내집니다. 모든 장면을 내보내려면 먼저 XY Overview를 켜세요. 모든 장면이 하나의 OME-TIFF 파일에 들어가며, 각 장면은 고유한 크기의 개별 이미지가 됩니다. 기록하기 전에 크기, 픽셀 크기, 채널, 압축 방식을 보여 주는 확인 창이 표시됩니다.
내보내기가 끝나면 Open Exported TIFF를 클릭합니다. SlideScope는 내보낸 각 장면을 하나의 이미지로 표시하며, Image 컨트롤로 하나씩 넘겨 볼 수 있습니다. Fiji의 Bio-Formats처럼 파일당 여러 이미지를 지원하는 OME-TIFF 리더에서는 이들이 별도의 시리즈로 나열됩니다.
Windows 10 또는 11, 또는 Apple Silicon이나 Intel 기반 macOS 14 이상. 내장 샘플 라이브러리는 모든 도구와 함께 무료로 둘러볼 수 있습니다. 내 이미지는 3일 무료 체험으로 열 수 있습니다. 내보내기에는 3일 체험 또는 구독이 필요합니다(체험 후 월 US$25.00).
장면은 픽셀 유형이 같고 채널, Z 평면, 시점이 같을 때 넘겨 볼 수 있습니다. 그렇지 않으면 SlideScope는 첫 번째 장면을 표시하고 Details에 그 이유를 알려 줍니다. 예상과 다르다면 파일을 보내 주세요.
채널 색상은 파일에 기록되어 있으면 파일에서 가져옵니다. Display › Channel colour…에서 변경할 수 있으며, 내보낸 파일에는 설정한 색상이 기록됩니다.
대형 타일 스캔은 개요 해상도로 내보내며, 기록하기 전에 확인 창에서 이를 알려 줍니다. 전체 해상도 스캔은 SlideScope에서 계속 볼 수 있습니다.
보기는 무료 계정으로 가능합니다. 내보내기에는 무료 체험 또는 구독이 필요합니다.
동영상과 스크린샷의 샘플: czitools 샘플 데이터의 S2_3x3_CH2.czi(Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), DAPI와 EGFP가 포함된 3 × 3 모자이크의 두 장면입니다. 고객 데이터는 포함되어 있지 않습니다.
| 도구 | 비용 | 지원 플랫폼 | 추천 용도 |
|---|---|---|---|
| ZEISS ZEN lite | 무료(다운로드하려면 ZEISS ID 필요) | Windows | 제조사 자체 뷰어로, 이미지 획득 소프트웨어와 가장 가까움 |
| Fiji / ImageJ와 Bio-Formats | 무료, 오픈 소스 | Windows, macOS, Linux | 플러그인과 매크로를 활용한 분석, 각 씬은 하나의 시리즈로 가져옴 |
| QuPath | 무료, 오픈 소스 | Windows, macOS, Linux | 전체 슬라이드 이미지 분석 프로젝트 및 스크립팅 |
| SlideScope | 샘플은 모든 도구와 함께 무료, 내 이미지는 3일 무료 체험, 이후 월 $25부터 구독 | Windows 10+, macOS 14+(Apple 실리콘 및 Intel) | CZI 보기·측정·주석 작업(CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM, TIFF도 함께 지원), 파일은 내 컴퓨터에 그대로 보관 |
ZEISS CZI 파일은 ZEISS의 Windows용 무료 뷰어인 ZEN lite, Bio-Formats를 통해 Windows, Mac, Linux에서 CZI를 읽는 무료 도구 Fiji 또는 QuPath, 또는 무료 체험을 제공하는 Windows 및 Mac용 데스크톱 뷰어 SlideScope로 열 수 있습니다. Apple 실리콘 Mac에서는 Bio-Formats가 JPEG-XR로 압축된 CZI 파일을 읽지 못합니다. 아래 단계는 SlideScope를 기준으로 설명합니다.
QuPath 문서에 따르면 Bio-Formats는 현재 Apple 실리콘에서 JPEG-XR 압축을 지원하지 않으며, 많은 CZI 파일이 JPEG-XR로 압축되어 있습니다. 문서에서 제시하는 해결 방법은 다른 컴퓨터에서 파일을 변환하거나 Intel 빌드의 QuPath로 바꾸는 것입니다. SlideScope는 CZI를 읽을 때 Bio-Formats를 사용하지 않고, Windows 빌드와 Mac 빌드 모두 자체 내장한 JPEG XR 디코더로 CZI를 읽습니다.
여러 현미경 파일 형식을 열고 표준 객체를 내 컴퓨터에서 정량할 하나의 데스크톱 앱이 필요하다면 SlideScope를 검토하세요. 현미경 제어, 프로그래밍 가능한 이미지 처리, 스크립트 기반 분석 파이프라인, 기관용 이미지 관리가 필요하면 해당 전문 도구가 적합합니다.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: 확장 가능한 처리, 매크로, 플러그인, 스크립트, 분할, 병리 분석, 과학용 Python 워크플로.
OMERO: 중앙 이미지 저장소, 권한, 협업, 기관 수준 데이터 관리.
네. ZEN lite(Windows)와 Bio-Formats를 사용하는 Fiji 또는 QuPath는 무료입니다. SlideScope는 무료로 다운로드할 수 있으며, 내장 샘플 라이브러리는 모든 도구와 함께 무료로 둘러볼 수 있습니다. 내 이미지는 3일 무료 체험(PayPal 또는 카드 필요)으로 열 수 있습니다. 체험 기간이 끝나면 구독으로 이용합니다.
macOS 14 이상을 사용하세요. Mac에 맞는 Apple Silicon 또는 Intel 버전을 선택하고 파일을 로컬 저장소에 복사한 뒤 여세요.
파일 복사가 완료되었는지 확인하세요. 문제가 계속되면 앱 버전, 파일 형식, 오류 메시지를 지원팀에 알려주세요.
연구실, 현미경 코어 시설, 교육자, 학생 및 병리 영상 검토 팀을 위해 설계되었습니다.
원본 형식 문서를 확인하세요.
SlideScope는 독립 제품이며 Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari, OMERO와 제휴하지 않습니다. 제품명은 객관적 비교 목적으로만 사용합니다.
Windows와 macOS에서 전체 슬라이드, 형광 채널, 이미지 스택을 하나의 집중된 작업 공간에서 살펴보세요.
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