이미지를 잃지 않고 16비트 TIFF 변환하기
웹에서 쓰이는 PNG와 JPEG는 채널당 8비트를 담으므로, 16비트 현미경 이미지는 256단계로 매핑해야 합니다. 0–65,535 전체 범위를 매핑하는 변환기는 보통 수천 단계만 사용하는 일반적인 카메라 이미지를 거의 검게 만듭니다. 이 도구에서는 각 채널의 범위가 0.1–99.9번째 백분위수에서 시작합니다(자동 대비). 여러 이미지에 같은 매핑을 적용해 서로 비교할 수 있게 하려면 최솟값과 최댓값을 직접 입력하고, 아니면 전체 범위를 선택하세요. 측정에는 원본 TIFF를 보관하세요. 8비트로 내보내면 강도 값이 바뀌고, PNG와 JPEG에는 픽셀 크기가 담기지 않습니다.
내보낼 수 있는 것
- 평면 하나 또는 전부: 페이지, Z 평면, 시점을 각각 별도 파일로 저장합니다.
- 합성 또는 개별 채널: 켜 둔 채널을 색으로 겹친 이미지, 또는 채널마다 별도의 회색조 이미지.
- 전체 슬라이드 이미지: 한 변이 최대 16,384픽셀인 피라미드 레벨을 선택합니다(브라우저는 그보다 큰 이미지를 담을 수 없습니다). 전체 해상도로 내보내려면 대신 데스크톱에서 OME-TIFF로 변환하세요(방법).
- PNG는 무손실이며, JPEG는 설정한 품질에 따라 더 작습니다.
Fiji나 명령줄에서 같은 변환 하기
Fiji: Image › Adjust › Brightness/Contrast에서 Apply를 누른 다음 Image › Type › 8-bit(합성 이미지는 RGB Color)와 File › Save As › PNG를 선택합니다. ImageMagick: magick input.tif -auto-level -depth 8 output.png(첫 페이지만 변환하려면 입력 파일 이름 뒤에 [0]을 붙입니다). Python: tifffile.imread로 읽고, numpy로 0–255로 재조정한 뒤, imageio로 저장합니다.
열 수 없는 파일
- JPEG 2000 SVS(Aperio 압축 33003/33005), JPEG XR, JPEG XL은 WebAssembly 없이 브라우저에서 디코딩할 수 없으며, 이 페이지는 WebAssembly를 불러오지 않습니다.
- TIFF 기반이 아닌 형식: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR, DICOM은 데스크톱 리더가 필요합니다. NDPI는 TIFF와 비슷하지만 각 레벨을 하나의 거대한 JPEG로 저장하므로 브라우저 탭에서 다루기에는 너무 큽니다.
- 여러 시리즈가 있는 OME-TIFF는 첫 번째 시리즈를 표시합니다.
- 측정, 주석, 분석 기능은 없습니다. 뷰어입니다.
이러한 형식을 열거나 내 이미지에서 측정, 주석, 세포 계수를 하려면 SlideScope가 Windows와 Mac에서 34가지 현미경 및 슬라이드 스캐너 형식을 엽니다. 같은 팀이 만든 데스크톱 현미경 앱 SlideScope는 무료 샘플 라이브러리(모든 도구 포함)가 있는 유료 앱이며, 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 무료 대안: Fiji(Bio-Formats)와 QuPath.
업로드 없이 파일을 여는 방법
파일을 선택하면 브라우저가 디스크에 있는 그 파일의 핸들을 이 페이지에 넘겨줍니다. 페이지는 필요한 바이트만 읽습니다. 먼저 TIFF 디렉터리를 읽고, 이어서 화면에 보이는 이미지 영역의 타일을 읽어, 오픈 소스 TIFF 리더(geotiff)로 페이지 안에서 디코딩합니다. 서버로 전송되는 것이 없으므로 미발표 데이터와 환자 라벨이 있는 슬라이드도 내 컴퓨터에 남고, 수 기가바이트 슬라이드도 어디에도 복사되지 않기 때문에 몇 초 만에 열립니다. 탭을 닫으면 파일은 페이지에서 사라집니다.
이 페이지는 slidescope.science에서 자체 스크립트와 개인정보를 존중하는 사이트 페이지 조회 카운터를 불러오며, 어느 쪽도 이미지를 보지 않습니다. 오픈 소스 라이선스: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
질문
TIFF를 업로드하지 않고 JPG로 변환하려면 어떻게 하나요?
이 페이지에서 파일을 열고 JPEG를 선택한 뒤 변환을 클릭하세요. 브라우저가 내 컴퓨터에서 파일을 변환하고 결과를 저장하며, 서버로는 아무것도 보내지 않습니다.
16비트 TIFF를 변환하면 왜 검게 되나요?
변환기가 16비트 전체 범위를 8비트로 매핑해서 실제 데이터가 가장 어두운 단계에만 몰렸기 때문입니다. 여기서는 자동 대비를 사용하거나, Fiji에서는 변환 전에 표시 범위를 설정하세요.
다중 페이지 TIFF의 모든 페이지를 변환할 수 있나요?
예. 페이지 모두 변환을 체크하면 각 페이지가 별도의 PNG 또는 JPEG로 저장됩니다.
SVS 슬라이드를 JPG로 변환할 수 있나요?
예, 한 변이 최대 16,384픽셀인 피라미드 레벨이라면 어느 레벨이든 가능합니다. 전체 슬라이드의 전체 해상도는 브라우저에서 JPEG 하나로 만들기에는 너무 큽니다.
이 변환기는 무료인가요?
네, 무료이며 계정이 필요 없습니다. 같은 팀이 만든 데스크톱 현미경 앱 SlideScope는 무료 샘플 라이브러리(모든 도구 포함)가 있는 유료 앱이며, 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다.
브라우저로는 부족하신가요?
SlideScope는 Windows와 Mac에서 CZI, ND2, LIF, MRXS, JPEG 2000 SVS를 포함한 34가지 현미경 및 슬라이드 스캐너 형식을 열며, 측정, 주석, 세포 계수, 전체 해상도 OME-TIFF 내보내기를 지원합니다. 내장 샘플에서 모든 도구를 무료로 사용해 보세요. 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 이미 결정하셨나요? 지금 구독하기.
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