Convertir TIFF de 16 bits sin perder la imagen
PNG y JPEG, tal como se usan en la web, tienen 8 bits por canal, así que una imagen de microscopio de 16 bits debe asignarse a 256 niveles. Un conversor que asigna todo el rango 0–65 535 deja casi negra una imagen de cámara típica, que usa unos pocos miles de niveles. Aquí el rango de cada canal parte de sus percentiles 0,1–99,9 (Contraste automático); escribe un mínimo y un máximo para aplicar la misma asignación a varias imágenes y que sigan siendo comparables, o elige Rango completo. Conserva el TIFF original para medir: una exportación a 8 bits cambia las intensidades, y PNG y JPEG no guardan el tamaño de píxel.
Qué puedes exportar
- Un plano o todos: páginas, planos Z y puntos temporales, cada uno guardado como un archivo independiente.
- Composición o canales por separado: una superposición en color de los canales que dejes activados, o cada canal como imagen en escala de grises independiente.
- Imágenes de portaobjetos completos: elige un nivel de la pirámide de hasta 16 384 píxeles por lado (los navegadores no pueden manejar imágenes más grandes). Para exportar a resolución completa, convierte a OME-TIFF en el escritorio (cómo hacerlo).
- PNG no tiene pérdida; JPEG ocupa menos, con la calidad que elijas.
La misma conversión en Fiji o desde la línea de comandos
Fiji: Image › Adjust › Brightness/Contrast, Apply, luego Image › Type › 8-bit (o RGB Color para composiciones) y File › Save As › PNG. ImageMagick: magick input.tif -auto-level -depth 8 output.png (añade [0] tras el nombre de entrada para convertir solo la primera página). Python: lee con tifffile.imread, reescala a 0–255 con numpy y escribe con imageio.
Lo que no abre
- SVS con JPEG 2000 (compresión Aperio 33003/33005), JPEG XR y JPEG XL no pueden decodificarse en un navegador sin WebAssembly, que esta página no carga.
- Formatos no basados en TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR y DICOM necesitan un lector de escritorio. NDPI se parece a TIFF, pero guarda cada nivel como un único JPEG enorme, demasiado grande para una pestaña del navegador.
- OME-TIFF con varias series: muestra la primera serie.
- Sin mediciones, anotaciones ni análisis: es un visor.
Para esos formatos, y para medir, anotar y contar células en tus propias imágenes, SlideScope abre 34 formatos de microscopio y de escáner de portaobjetos en Windows y Mac. SlideScope, la aplicación de microscopía de escritorio creada por el mismo equipo, es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita (todas las herramientas) y una suscripción para tus propias imágenes. Alternativas gratuitas: Fiji (Bio-Formats) y QuPath.
Cómo abre un archivo sin subirlo
Cuando eliges un archivo, el navegador le da a esta página un identificador que apunta a él en tu disco. La página lee solo los bytes que necesita: primero el directorio TIFF y luego las teselas de la parte de la imagen que está en pantalla, y las decodifica en la página con un lector TIFF de código abierto (geotiff). No se envía nada a ningún servidor, así que los datos no publicados y los portaobjetos con etiquetas de pacientes se quedan en tu ordenador, y los portaobjetos de varios gigabytes se abren en segundos porque nunca se copian a ninguna parte. Cierra la pestaña y el archivo desaparece de la página.
La página carga sus propios scripts desde slidescope.science y el contador de visitas del sitio, respetuoso con la privacidad; ninguno de los dos ve nunca tu imagen. Licencias de código abierto: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Preguntas
¿Cómo convierto un TIFF a JPG sin subirlo?
Ábrelo en esta página, elige JPEG y haz clic en Convertir: el navegador convierte el archivo en tu ordenador y guarda el resultado, sin enviar nada a un servidor.
¿Por qué mi TIFF de 16 bits se vuelve negro al convertirlo?
El conversor asignó todo el rango de 16 bits a 8 bits, así que los datos reales ocupan solo los niveles más oscuros. Usa aquí Contraste automático, o fija el rango de visualización en Fiji antes de convertir.
¿Puedo convertir todas las páginas de un TIFF multipágina?
Sí: marca la opción de convertir todas las páginas; cada página se guarda como un PNG o JPEG independiente.
¿Puedo convertir un portaobjetos SVS a JPG?
Sí, en cualquier nivel de la pirámide de hasta 16 384 píxeles por lado; la resolución completa de un portaobjetos entero es demasiado grande para un único JPEG en un navegador.
¿Este conversor es gratuito?
Sí, es gratuita y no necesita cuenta. SlideScope, la aplicación de microscopía de escritorio creada por el mismo equipo, es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita (todas las herramientas) y una suscripción para tus propias imágenes.
¿Necesitas más de lo que puede hacer un navegador?
SlideScope abre 34 formatos de microscopio y de escáner de portaobjetos en Windows y Mac, entre ellos CZI, ND2, LIF, MRXS y SVS con JPEG 2000, con mediciones, anotaciones, recuento de células y exportación a OME-TIFF a resolución completa. Prueba gratis todas las herramientas con las muestras integradas; para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción. ¿Ya lo tienes claro? Suscríbete ahora.