การแปลง TIFF 16 บิตโดยไม่สูญเสียภาพ
PNG และ JPEG ที่ใช้บนเว็บเก็บข้อมูล 8 บิตต่อช่องสัญญาณ ภาพจากกล้องจุลทรรศน์แบบ 16 บิตจึงต้องถูกแมปลงบน 256 ระดับ ตัวแปลงที่แมปช่วงเต็ม 0–65,535 จะทำให้ภาพจากกล้องทั่วไปซึ่งใช้เพียงไม่กี่พันระดับกลายเป็นภาพเกือบดำ ในหน้านี้ ช่วงของแต่ละช่องสัญญาณเริ่มต้นที่เปอร์เซ็นไทล์ที่ 0.1–99.9 (คอนทราสต์อัตโนมัติ) พิมพ์ค่าต่ำสุดและค่าสูงสุดเพื่อใช้การแมปเดียวกันกับหลายภาพให้เปรียบเทียบกันได้ หรือเลือก ช่วงเต็ม เก็บไฟล์ TIFF ต้นฉบับไว้สำหรับการวัด: การส่งออกเป็น 8 บิตจะเปลี่ยนค่าความเข้ม และ PNG กับ JPEG ไม่เก็บขนาดพิกเซลไว้
สิ่งที่คุณส่งออกได้
- ระนาบเดียวหรือทั้งหมด: หน้า ระนาบ Z และจุดเวลา โดยบันทึกแต่ละรายการเป็นไฟล์ของตัวเอง
- ภาพรวมช่องสัญญาณหรือแยกช่องสัญญาณ: ภาพซ้อนสีของช่องสัญญาณที่คุณเปิดไว้ หรือแต่ละช่องสัญญาณเป็นภาพระดับสีเทาแยกกัน
- ภาพสไลด์ทั้งแผ่น: เลือกระดับพีระมิดที่มีขนาดไม่เกิน 16,384 พิกเซลต่อด้าน (เบราว์เซอร์ไม่สามารถรองรับภาพที่ใหญ่กว่านี้) หากต้องการส่งออกที่ความละเอียดเต็ม ให้แปลงเป็น OME-TIFF บนเดสก์ท็อปแทน (วิธีการ)
- PNG ไม่สูญเสียคุณภาพ ส่วน JPEG มีขนาดเล็กกว่า ตามคุณภาพที่คุณตั้งไว้
การแปลงแบบเดียวกันใน Fiji หรือผ่านบรรทัดคำสั่ง
Fiji: Image › Adjust › Brightness/Contrast กด Apply จากนั้น Image › Type › 8-bit (หรือ RGB Color สำหรับภาพรวมช่องสัญญาณ) แล้ว File › Save As › PNG ImageMagick: magick input.tif -auto-level -depth 8 output.png (เติม [0] ต่อท้ายชื่อไฟล์อินพุตเพื่อแปลงเฉพาะหน้าแรก) Python: อ่านด้วย tifffile.imread ปรับสเกลเป็น 0–255 ด้วย numpy แล้วเขียนด้วย imageio
สิ่งที่เปิดไม่ได้
- SVS แบบ JPEG 2000 (การบีบอัดของ Aperio 33003/33005), JPEG XR และ JPEG XL ไม่สามารถถอดรหัสในเบราว์เซอร์ได้หากไม่มี WebAssembly ซึ่งหน้านี้ไม่ได้โหลด
- ไม่ได้อิงกับ TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR และ DICOM ต้องใช้โปรแกรมอ่านบนเดสก์ท็อป NDPI มีลักษณะคล้าย TIFF แต่เก็บแต่ละระดับเป็น JPEG ขนาดใหญ่มากไฟล์เดียว ซึ่งใหญ่เกินกว่าแท็บเบราว์เซอร์จะรับได้
- OME-TIFF ที่มีหลายซีรีส์ จะแสดงเฉพาะซีรีส์แรก
- ไม่มีการวัด คำอธิบายประกอบ หรือการวิเคราะห์: เป็นเพียงโปรแกรมดู
สำหรับรูปแบบไฟล์เหล่านั้น และสำหรับการวัด การใส่คำอธิบายประกอบ และการนับเซลล์บนภาพของคุณเอง SlideScope เปิดไฟล์จากกล้องจุลทรรศน์และเครื่องสแกนสไลด์ได้ 34 รูปแบบบน Windows และ Mac SlideScope แอปกล้องจุลทรรศน์บนเดสก์ท็อปจากทีมเดียวกัน เป็นแอปแบบชำระเงินที่มีคลังภาพตัวอย่างฟรี (ใช้ได้ทุกเครื่องมือ) และต้องสมัครสมาชิกสำหรับภาพของคุณเอง ทางเลือกฟรี: Fiji (Bio-Formats) และ QuPath
วิธีที่เครื่องมือเปิดไฟล์โดยไม่ต้องอัปโหลด
เมื่อคุณเลือกไฟล์ เบราว์เซอร์จะส่งตัวอ้างอิงไปยังไฟล์บนดิสก์ของคุณให้หน้านี้ หน้านี้จะอ่านเฉพาะไบต์ที่ต้องใช้ คือไดเรกทอรีของ TIFF ก่อน แล้วจึงอ่านไทล์ของส่วนภาพที่อยู่บนหน้าจอ และถอดรหัสในหน้าเว็บด้วยโปรแกรมอ่าน TIFF แบบโอเพนซอร์ส (geotiff) ไม่มีการส่งข้อมูลใดไปยังเซิร์ฟเวอร์ ข้อมูลที่ยังไม่เผยแพร่และสไลด์ที่มีป้ายข้อมูลผู้ป่วยจึงอยู่บนคอมพิวเตอร์ของคุณ และสไลด์ขนาดหลายกิกะไบต์ก็เปิดได้ในไม่กี่วินาทีเพราะไม่ถูกคัดลอกไปที่ใดเลย ปิดแท็บแล้วไฟล์ก็จะหายไปจากหน้านี้
หน้านี้โหลดสคริปต์ของตัวเองจาก slidescope.science และตัวนับการเข้าชมหน้าที่เคารพความเป็นส่วนตัวของเว็บไซต์ ทั้งสองส่วนไม่เคยเห็นภาพของคุณ สัญญาอนุญาตโอเพนซอร์ส: image-tools-vendor.LICENSE.txt
คำถาม
จะแปลง TIFF เป็น JPG โดยไม่ต้องอัปโหลดได้อย่างไร?
เปิดไฟล์ในหน้านี้ เลือก JPEG แล้วคลิก แปลง เบราว์เซอร์จะแปลงไฟล์บนคอมพิวเตอร์ของคุณและบันทึกผลลัพธ์ โดยไม่ส่งสิ่งใดไปยังเซิร์ฟเวอร์
ทำไม TIFF 16 บิตของฉันจึงกลายเป็นสีดำเมื่อแปลง?
ตัวแปลงแมปช่วง 16 บิตทั้งหมดลงเป็น 8 บิต ข้อมูลจริงจึงไปอยู่เฉพาะในระดับที่มืดที่สุด ให้ใช้ คอนทราสต์อัตโนมัติ ในหน้านี้ หรือตั้งช่วงการแสดงผลก่อนแปลงใน Fiji
แปลงทุกหน้าของ TIFF หลายหน้าได้หรือไม่?
ได้ ติ๊กช่อง แปลงทั้งหมด … หน้า แล้วแต่ละหน้าจะถูกบันทึกเป็นไฟล์ PNG หรือ JPEG ของตัวเอง
แปลงสไลด์ SVS เป็น JPG ได้หรือไม่?
ได้ ที่ระดับพีระมิดใดก็ได้ที่มีขนาดไม่เกิน 16,384 พิกเซลต่อด้าน ความละเอียดเต็มของสไลด์ทั้งแผ่นใหญ่เกินกว่าจะเป็น JPEG ไฟล์เดียวในเบราว์เซอร์
ตัวแปลงนี้ใช้ฟรีหรือไม่?
ใช่ ใช้ฟรีและไม่ต้องมีบัญชี ส่วน SlideScope แอปกล้องจุลทรรศน์บนเดสก์ท็อปจากทีมเดียวกัน เป็นแอปแบบชำระเงินที่มีคลังภาพตัวอย่างฟรี (ใช้ได้ทุกเครื่องมือ) และต้องสมัครสมาชิกสำหรับภาพของคุณเอง
ต้องการมากกว่าที่เบราว์เซอร์ทำได้หรือไม่?
SlideScope เปิดไฟล์จากกล้องจุลทรรศน์และเครื่องสแกนสไลด์ได้ 34 รูปแบบบน Windows และ Mac รวมถึง CZI, ND2, LIF, MRXS และ SVS แบบ JPEG 2000 พร้อมการวัด คำอธิบายประกอบ การนับเซลล์ และการส่งออก OME-TIFF แบบความละเอียดเต็ม ลองใช้ทุกเครื่องมือฟรีกับภาพตัวอย่างในตัว ส่วนการเปิดภาพของคุณเองต้องใช้การสมัครสมาชิก ตัดสินใจแล้ว? สมัครสมาชิกเลย