轉換 16 位元 TIFF 而不失去畫面
網頁上使用的 PNG 與 JPEG 每個通道只有 8 位元,因此 16 位元顯微影像必須對應到 256 個灰階。轉換器若對應完整的 0–65,535 範圍,只用到數千個灰階的典型相機影像就會變得幾乎全黑。在這裡,每個通道的範圍預設為其第 0.1 至第 99.9 百分位數(自動對比);輸入最小值與最大值,即可對多張影像套用相同的對應,讓它們保持可比較,或選擇「完整範圍」。量測時請保留原始 TIFF:8 位元匯出會改變強度值,而且 PNG 與 JPEG 不會保存像素尺寸。
可匯出的內容
- 單一平面或全部平面:頁面、Z 平面與時間點,每一個都儲存為獨立檔案。
- 合成或分離通道:將您保持開啟的通道疊合成彩色影像,或將每個通道各自儲存為灰階影像。
- 全玻片影像:選擇每邊最多 16,384 像素的金字塔層級(瀏覽器無法容納更大的影像)。若要以完整解析度匯出,請改在桌面上轉換為 OME-TIFF(作法)。
- PNG 為無損格式;JPEG 檔案較小,品質依您的設定而定。
在 Fiji 或命令列中進行相同的轉換
Fiji:Image › Adjust › Brightness/Contrast,按 Apply,接著 Image › Type › 8-bit(合成影像則選 RGB Color),再 File › Save As › PNG。ImageMagick:magick input.tif -auto-level -depth 8 output.png(若只要第一頁,請在輸入檔名後加上 [0])。Python:以 tifffile.imread 讀取,用 numpy 重新縮放到 0–255,再以 imageio 寫出。
無法開啟的檔案
- JPEG 2000 SVS(Aperio 壓縮 33003/33005)、JPEG XR 與 JPEG XL 若沒有 WebAssembly 便無法在瀏覽器中解碼,而本頁不會載入 WebAssembly。
- 非 TIFF 格式:CZI、ND2、LIF、MRXS、VSI、IMS、OIB/OIR 與 DICOM 需要桌面讀取程式。NDPI 類似 TIFF,但每個層級都儲存為一張巨大的 JPEG,對瀏覽器分頁來說太大。
- 含多個系列的 OME-TIFF 只會顯示第一個系列。
- 不提供量測、標註或分析:這只是一個檢視器。
若要開啟這些格式,或在您自己的影像上進行量測、標註與細胞計數,SlideScope 可在 Windows 與 Mac 上開啟 34 種顯微鏡與玻片掃描器格式。SlideScope 是同一團隊開發的桌面顯微影像應用程式,為付費應用程式,附有免費範例庫(所有工具皆可使用),開啟您自己的影像則需要訂閱。免費替代方案:Fiji(Bio-Formats)與 QuPath。
如何在不上傳的情況下開啟檔案
當您選擇檔案時,瀏覽器會將該檔案在您磁碟上的控制代碼交給此頁面。頁面只讀取所需的位元組:先讀取 TIFF 目錄,再讀取螢幕上顯示之影像區域的圖塊,並使用開源 TIFF 讀取器(geotiff)在頁面中解碼。不會傳送任何內容到伺服器,因此未發表的資料與帶有病患標籤的切片都會留在您的電腦上;多 GB 的切片也能在數秒內開啟,因為它們從未被複製到任何地方。關閉分頁後,檔案就會從頁面中消失。
此頁面從 slidescope.science 載入自己的腳本,以及本網站尊重隱私的頁面瀏覽計數器;兩者都不會看到您的影像。開源授權:image-tools-vendor.LICENSE.txt。
常見問題
如何在不上傳的情況下將 TIFF 轉換為 JPG?
在本頁開啟檔案,選擇 JPEG 並按下「轉換」:瀏覽器會在您的電腦上轉換檔案並儲存結果,不會傳送任何內容到伺服器。
為什麼我的 16 位元 TIFF 轉換後變成全黑?
轉換器將完整的 16 位元範圍對應到 8 位元,因此實際資料只佔據最暗的幾個灰階。請在這裡使用自動對比,或在 Fiji 中先設定顯示範圍再轉換。
我可以轉換多頁 TIFF 的每一頁嗎?
可以:勾選「轉換全部頁面」,每一頁都會儲存為獨立的 PNG 或 JPEG。
我可以將 SVS 切片轉換為 JPG 嗎?
可以,可選擇每邊最多 16,384 像素的任一金字塔層級;整張切片的完整解析度太大,無法在瀏覽器中存成單一 JPEG。
這個轉換器是免費的嗎?
是的,它是免費的,而且不需要帳戶。SlideScope 是同一團隊開發的桌面顯微影像應用程式,為付費應用程式,附有免費範例庫(所有工具皆可使用),開啟您自己的影像則需要訂閱。
需要瀏覽器做不到的功能嗎?
SlideScope 可在 Windows 與 Mac 上開啟 34 種顯微鏡與玻片掃描器格式,包括 CZI、ND2、LIF、MRXS 與 JPEG 2000 SVS,並提供量測、標註、細胞計數與全解析度 OME-TIFF 匯出。可在內建範例上免費試用所有工具;開啟您自己的影像需要訂閱。已經決定了嗎?立即訂閱。
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