เครื่องมือฟรี

โปรแกรมดูเมทาดาทา TIFF

แสดงรายการทุกแท็กของทุกภาพในไฟล์ TIFF อ่านคำอธิบาย OME-XML, ImageJ หรือ Aperio SVS ตรวจสอบขนาดพิกเซลที่ไฟล์บันทึกไว้ และค้นหาฟิลด์ที่อาจระบุตัวผู้ป่วยหรือห้องแล็บได้ก่อนที่คุณจะแชร์ไฟล์ เบราว์เซอร์ของคุณเป็นผู้อ่านไฟล์ และไฟล์จะไม่ถูกอัปโหลดเลย

โปรแกรมดูเมทาดาทา TIFF

วางไฟล์ TIFF, OME-TIFF หรือ SVS ที่นี่

เบราว์เซอร์ของคุณอ่านไฟล์บนคอมพิวเตอร์ของคุณ ไม่มีการอัปโหลดใด ๆ

TIFF เก็บขนาดพิกเซลไว้ที่ใด

ไฟล์ตำแหน่งของขนาดพิกเซล
OME-TIFFPhysicalSizeX และ PhysicalSizeXUnit บนองค์ประกอบ Pixels ของ OME-XML (ใน ImageDescription)
Aperio SVSMPP = 0.4990 ใน ImageDescription ของภาพแรก (µm ต่อพิกเซล)
ImageJ / Fiji TIFFunit=micron ใน ImageDescription โดยมีจำนวนพิกเซลต่อหน่วยอยู่ใน XResolution
TIFF ธรรมดาXResolution พร้อม ResolutionUnit (2 = นิ้ว, 3 = cm) ซอฟต์แวร์ของกล้องมักเขียนค่า 72 หรือ 300 dpi ซึ่งเป็นการตั้งค่าสำหรับการพิมพ์ ไม่ใช่การปรับเทียบ

โปรแกรมดูจะรายงานว่าพบข้อมูลใดในข้างต้น หากไม่มีเลย ให้ตั้งสเกลด้วยตัวเอง (เครื่องคำนวณขนาดพิกเซล อธิบายวิธีการ) ก่อนทำการวัด

ฟิลด์ที่อาจระบุตัวผู้ป่วยหรือห้องแล็บได้

ไฟล์สไลด์ทั้งแผ่นมักมีมากกว่าพิกเซล: ภาพถ่ายของป้ายบนแผ่นกระจก (บาร์โค้ด หมายเลขเคส บางครั้งมีชื่อ) ภาพมาโครของสไลด์ทั้งแผ่น วันที่และเวลาที่สแกน หมายเลขเครื่องของเครื่องสแกน ชื่อผู้ใช้ และชื่อไฟล์ต้นฉบับ เครื่องมือนี้แสดงรายการข้อมูลเหล่านี้ที่พบในแท็กหลัก ก่อนแชร์สไลด์ออกนอกสถาบันของคุณ ให้ลบข้อมูลเหล่านี้ออก: ดูวิธีลบป้ายสไลด์และข้อมูลผู้ป่วยออกจากภาพสไลด์

ข้อมูลเดียวกันจากบรรทัดคำสั่ง

tiffinfo file.tif (libtiff) พิมพ์ทุกไดเรกทอรี exiftool -a -G1 file.tif เพิ่มแท็กของผู้ผลิต ใน Python tifffile.TiffFile(path) ให้ .pages[i].tags, .ome_metadata และ .imagej_metadata สำหรับ SVS openslide.OpenSlide(path).properties ให้ฟิลด์ที่แยกวิเคราะห์แล้ว (ดูการอ่านไฟล์ SVS ใน Python)

วิธีที่เครื่องมือเปิดไฟล์โดยไม่ต้องอัปโหลด

เมื่อคุณเลือกไฟล์ เบราว์เซอร์จะส่งตัวอ้างอิงไปยังไฟล์บนดิสก์ของคุณให้หน้านี้ หน้านี้จะอ่านเฉพาะไบต์ที่ต้องใช้ คือไดเรกทอรีของ TIFF ก่อน แล้วจึงอ่านไทล์ของส่วนภาพที่อยู่บนหน้าจอ และถอดรหัสในหน้าเว็บด้วยโปรแกรมอ่าน TIFF แบบโอเพนซอร์ส (geotiff) ไม่มีการส่งข้อมูลใดไปยังเซิร์ฟเวอร์ ข้อมูลที่ยังไม่เผยแพร่และสไลด์ที่มีป้ายข้อมูลผู้ป่วยจึงอยู่บนคอมพิวเตอร์ของคุณ และสไลด์ขนาดหลายกิกะไบต์ก็เปิดได้ในไม่กี่วินาทีเพราะไม่ถูกคัดลอกไปที่ใดเลย ปิดแท็บแล้วไฟล์ก็จะหายไปจากหน้านี้

หน้านี้โหลดสคริปต์ของตัวเองจาก slidescope.science และตัวนับการเข้าชมหน้าที่เคารพความเป็นส่วนตัวของเว็บไซต์ ทั้งสองส่วนไม่เคยเห็นภาพของคุณ สัญญาอนุญาตโอเพนซอร์ส: image-tools-vendor.LICENSE.txt

คำถาม

จะดูเมทาดาทาของไฟล์ TIFF ได้อย่างไร?

เปิดไฟล์ในหน้านี้เพื่อแสดงรายการทุกแท็กของทุกภาพ หรือใช้ tiffinfo, exiftool หรือ tifffile ใน Python แท็ก ImageDescription เก็บเมทาดาทากล้องจุลทรรศน์ส่วนใหญ่ (ฟิลด์ OME-XML, ImageJ หรือ Aperio)

จะหาขนาดพิกเซลของ TIFF ได้อย่างไร?

มองหา PhysicalSizeX ใน OME-XML, MPP ในคำอธิบายของ Aperio หรือหน่วยของ ImageJ ร่วมกับ XResolution ความละเอียด 72 หรือ 300 dpi ธรรมดาเป็นการตั้งค่าสำหรับการพิมพ์ ไม่ใช่การปรับเทียบกล้องจุลทรรศน์

ส่งออกแท็กได้หรือไม่?

ได้ ปุ่ม ดาวน์โหลดแท็กทั้งหมดเป็น JSON จะบันทึกแท็กของภาพในไฟล์ได้สูงสุด 200 ภาพ โดยย่ออาร์เรย์ที่ยาวให้สั้นลง

ไฟล์ของฉันถูกอัปโหลดหรือไม่?

ไม่ เบราว์เซอร์อ่านไฟล์บนคอมพิวเตอร์ของคุณ ไม่มีสิ่งใดถูกส่งไปที่ใด

เครื่องมือนี้ฟรีหรือไม่?

ใช่ ใช้ฟรีและไม่ต้องมีบัญชี ส่วน SlideScope แอปกล้องจุลทรรศน์บนเดสก์ท็อปจากทีมเดียวกัน เป็นแอปแบบชำระเงินที่มีคลังภาพตัวอย่างฟรี (ใช้ได้ทุกเครื่องมือ) และต้องสมัครสมาชิกสำหรับภาพของคุณเอง

ต้องการมากกว่าที่เบราว์เซอร์ทำได้หรือไม่?

SlideScope เปิดไฟล์จากกล้องจุลทรรศน์และเครื่องสแกนสไลด์ได้ 34 รูปแบบบน Windows และ Mac รวมถึง CZI, ND2, LIF, MRXS และ SVS แบบ JPEG 2000 พร้อมการวัด คำอธิบายประกอบ การนับเซลล์ และการส่งออก OME-TIFF แบบความละเอียดเต็ม ลองใช้ทุกเครื่องมือฟรีกับภาพตัวอย่างในตัว ส่วนการเปิดภาพของคุณเองต้องใช้การสมัครสมาชิก ตัดสินใจแล้ว? สมัครสมาชิกเลย

ดาวน์โหลด SlideScope