การวัดเชิงปริมาณบนเครื่อง

นับนิวเคลียส เซลล์ และอนุภาค โดยไม่มีพิกเซลใดออกจากเครื่อง

การวัดเชิงปริมาณบนเครื่องเปลี่ยนสไลด์ที่คุณกำลังดูอยู่ให้เป็นตัวเลข การแบ่งส่วนและการวัดทำงานบนคอมพิวเตอร์ของคุณเอง ภาพที่ยังไม่เผยแพร่และภาพจากผู้ป่วยจึงไม่เคยออกจากเครื่อง และผลลัพธ์ปรากฏในหน้าต่างเดียวกับภาพ

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

ทำไมต้องวัดที่นี่

พิกเซลของคุณอยู่ที่เครื่องคุณ

การแบ่งส่วนและการวัดทำงานภายในเครื่อง สิ่งที่ดาวน์โหลดมีเพียงค่าน้ำหนักของโมเดล และ SlideScope ตรวจสอบค่าย่อย SHA-256 ก่อนโหลดเสมอ ไม่มีส่วนใดของภาพถูกอัปโหลด ซึ่งเป็นความต่างที่สำคัญสำหรับข้อมูลที่ยังไม่ตีพิมพ์ ตัวอย่างจากผู้ป่วย และการพิจารณาของคณะกรรมการจริยธรรม

สองเอนจิน ตรวจสอบที่มาได้ทั้งคู่

ใช้ค่าน้ำหนักการเรียนรู้เชิงลึก InstanSeg ที่ผ่านการตรวจสอบสำหรับนิวเคลียสและเซลล์ หรือใช้การกำหนดค่าขีดแบ่งแบบดั้งเดิมที่ระบุได้ชัดเจน พร้อมการเลือกค่าอัตโนมัติแบบ Otsu การตรวจขั้ว การปรับเรียบ และขอบเขตพื้นที่ คุณรู้เสมอว่าตัวเลขใดมาจากเอนจินใด และสรุปวิธีการก็บันทึกไว้

ออกแบบมาให้ทำซ้ำได้

ทุกการประมวลผลอธิบายด้วยสูตรที่บันทึกไว้ ได้แก่ ชนิดวัตถุ เอนจิน แชนเนล ค่าขีดแบ่ง ขอบเขตพื้นที่ และแชนเนลตัวบ่งชี้ โหลดสูตรกลับมา รันโฟลเดอร์ซ้ำ ก็ได้ผลวิเคราะห์เดิม สรุปวิธีการที่ส่งออกเขียนไว้ให้วางลงในต้นฉบับบทความได้ทันที

สิ่งที่ได้ออกมา

  • จำนวนวัตถุ พร้อมความหนาแน่นที่ปรับเทียบต่อตารางมิลลิเมตรทุกที่ที่มีการบันทึกขนาดพิกเซล
  • พื้นที่ เส้นรอบรูป และตัวบ่งชี้รูปทรงของวัตถุแต่ละชิ้น
  • ความเข้มเฉลี่ยในทุกแชนเนล ไม่ใช่เฉพาะแชนเนลที่ใช้แบ่งส่วน
  • การจำแนกวัตถุที่เป็นบวกต่อตัวบ่งชี้ เทียบกับแชนเนลตัวบ่งชี้หนึ่งหรือสองแชนเนล ตามต้องการ
  • การกระจายของขนาดและความเข้มทั่วทั้งประชากรวัตถุ
  • ชั้นซ้อนที่แก้ไขได้ จึงคัดวัตถุที่การแบ่งส่วนอ่านผิดออกก่อนส่งออกได้

การส่งออกที่เข้ากับงานจริง

  • ตารางวัตถุ CSV สำหรับสถิติใน R, Python, Prism หรือสเปรดชีต
  • เส้นขอบ GeoJSON ที่ QuPath และ ASAP นำเข้าได้โดยตรง
  • mask TIFF ที่ติดป้ายกำกับ พร้อมฝังสูตรไว้ในเมทาดาทาของไฟล์
  • PNG พร้อมคำอธิบายสำหรับรูปประกอบและสไลด์นำเสนอ
  • JSON สรุปสำหรับนำไปใช้เชิงโปรแกรมต่อ
  • สรุปวิธีการแบบเป็นข้อความ พร้อมวางลงในต้นฉบับบทความ

ห้านาทีจากภาพสู่ตัวเลข

  1. เลือกบริเวณ

    วัดทั้งภาพหรือเฉพาะบริเวณที่คุณเลือก การทำงานบนบริเวณช่วยให้สไลด์ระดับกิกะพิกเซลยังลื่นไหล และทำให้การวิเคราะห์อยู่กับเนื้อเยื่อที่คุณสนใจจริง ๆ

  2. เลือกวัตถุและเอนจิน

    นิวเคลียส เซลล์ หรืออนุภาค ใช้ InstanSeg สำหรับนิวเคลียสและเซลล์ ใช้การกำหนดค่าขีดแบ่งแบบดั้งเดิมสำหรับกรณีอื่นหรือเมื่อคุณต้องการกฎที่ระบุได้ชัดเจนทั้งหมด

  3. ตรวจชั้นซ้อน

    ผลลัพธ์แสดงเป็นชั้นซ้อนบนภาพ เลื่อนดูตารางวัตถุ ตรวจค่าผิดปกติ และคัดสิ่งที่การแบ่งส่วนอ่านผิดออก ไม่มีอะไรถือเป็นที่สิ้นสุดจนกว่าคุณจะยืนยัน

  4. ส่งออกหรือรันทั้งโฟลเดอร์

    ส่งออกชุดผลลัพธ์ หรือบันทึกการตั้งค่าเป็นสูตรแล้วรันการวิเคราะห์เดียวกันกับทั้งโฟลเดอร์ในรอบเดียว พร้อมสรุปผลรวมของชุดงาน

คำถามที่พบบ่อย

ข้อมูลภาพของฉันออกจากคอมพิวเตอร์หรือไม่

ไม่ การแบ่งส่วนและการวัดทำงานในโปรเซสของ SlideScope บนเครื่องของคุณเอง คำขอผ่านเครือข่ายมีเพียงการดาวน์โหลดค่าน้ำหนักโมเดลครั้งเดียว และ SlideScope ตรวจสอบค่าย่อย SHA-256 ของทั้งไฟล์บีบอัดและตัวโมเดลก่อนโหลดโค้ดใด ๆ

ควรใช้เอนจินไหน

ใช้ InstanSeg สำหรับนิวเคลียสและเซลล์ทั้งในสนามสว่างและฟลูออเรสเซนซ์ เพราะแยกวัตถุที่ติดกันได้ดีกว่าการใช้ค่าขีดแบ่งมาก ส่วนเอนจินแบบดั้งเดิมเหมาะกับอนุภาค การย้อมที่ไม่ปกติ หรือเมื่อคุณต้องการกฎที่เขียนระบุได้ตรง ๆ ในหัวข้อวิธีการ

เชื่อถือตัวเลขเหล่านี้เพื่อการตีพิมพ์ได้ไหม

ให้ถือเป็นผลงานวิจัยที่ต้องผ่านการควบคุมคุณภาพโดยคุณเอง SlideScope แสดงการแบ่งส่วนเป็นชั้นซ้อนที่แก้ไขได้ก็เพื่อให้คุณตรวจสอบ และยังส่งออกสรุปวิธีการที่อธิบายว่าตัวเลขแต่ละค่าได้มาอย่างไร ผลลัพธ์ไม่ได้ผ่านการรับรองสำหรับการวินิจฉัยหรือการตัดสินใจทางคลินิก

ใช้เพื่อการวิจัยเท่านั้น ผลลัพธ์ต้องผ่านการควบคุมคุณภาพด้วยสายตา และไม่ได้ผ่านการรับรองสำหรับการวินิจฉัยหรือการตัดสินใจทางคลินิก

วัดสไลด์ของคุณเองในสัปดาห์นี้

ช่วงทดลอง 14 วันเป็นการเข้าถึงเต็มรูปแบบ รวมถึงการวัดเชิงปริมาณบนเครื่องและการรันทั้งโฟลเดอร์ ลองกับภาพที่ห้องปฏิบัติการของคุณใช้งานจริง

เริ่มทดลองใช้