TIFF piksel boyutunu nerede saklar?
Görüntüleyici bunlardan hangisini bulduğunu bildirir. Hiçbiri yoksa ölçüm yapmadan önce ölçeği kendiniz ayarlayın (nasıl yapılacağını piksel boyutu hesaplayıcısı açıklar).
Bir hastayı veya laboratuvarı tanımlayabilecek alanlar
Tam slayt dosyaları çoğu zaman piksellerden fazlasını taşır: cam etiketinin fotoğrafı (barkod, vaka numarası, bazen bir ad), tüm slaydın makro görüntüsü, tarama tarihi ve saati, tarayıcının seri numarası, kullanıcı adı ve özgün dosya adı. Araç, ana etiketlerde bulduklarını listeler. Bir slaydı kurumunuzun dışında paylaşmadan önce bunları kaldırın: slayt görüntülerinden etiketleri ve hasta verilerini kaldırma sayfasına bakın.
Aynı bilgiler komut satırından
tiffinfo file.tif (libtiff) her dizini yazdırır; exiftool -a -G1 file.tif üretici etiketlerini de ekler; Python’da tifffile.TiffFile(path), .pages[i].tags, .ome_metadata ve .imagej_metadata özelliklerini sunar. SVS için openslide.OpenSlide(path).properties ayrıştırılmış alanları verir (bkz. Python’da SVS dosyalarını okuma).
Bir dosyayı yüklemeden nasıl açar?
Bir dosya seçtiğinizde tarayıcı, bu sayfaya diskinizdeki dosyaya erişim tanıtıcısı verir. Sayfa yalnızca ihtiyaç duyduğu baytları okur: önce TIFF dizinini, ardından görüntünün ekrandaki kısmına ait karoları; bunları da sayfa içinde açık kaynaklı bir TIFF okuyucuyla (geotiff) çözer. Sunucuya hiçbir şey gönderilmez; bu sayede yayımlanmamış veriler ve hasta etiketli slaytlar bilgisayarınızda kalır ve çok gigabaytlık slaytlar hiçbir yere kopyalanmadıkları için saniyeler içinde açılır. Sekmeyi kapattığınızda dosya sayfadan gider.
Sayfa kendi betiklerini slidescope.science’tan ve sitenin gizliliğe saygılı sayfa görüntüleme sayacından yükler; ikisi de görüntünüzü asla görmez. Açık kaynak lisansları: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Sorular
Bir TIFF dosyasının meta verilerini nasıl görebilirim?
Her görüntünün tüm etiketlerini listelemek için dosyayı bu sayfada açın ya da tiffinfo, exiftool veya Python’da tifffile kullanın. Mikroskopi meta verilerinin çoğu ImageDescription etiketinde bulunur (OME-XML, ImageJ veya Aperio alanları).
Bir TIFF’in piksel boyutunu nasıl bulurum?
OME-XML’de PhysicalSizeX’e, Aperio açıklamasında MPP’ye veya XResolution ile birlikte ImageJ birimine bakın. Düz 72 veya 300 dpi çözünürlük bir baskı ayarıdır, mikroskop kalibrasyonu değildir.
Etiketleri dışa aktarabilir miyim?
Evet: tüm etiketleri JSON olarak indirme seçeneği, dosyadaki en fazla 200 görüntünün etiketlerini, uzun diziler kısaltılmış olarak kaydeder.
Dosyam yükleniyor mu?
Hayır. Tarayıcı dosyayı bilgisayarınızda okur; hiçbir yere bir şey gönderilmez.
Bu araç ücretsiz mi?
Evet, ücretsizdir ve hesap gerektirmez. Aynı ekibin geliştirdiği masaüstü mikroskopi uygulaması SlideScope ise ücretsiz bir örnek kitaplığı (tüm araçlarla) ve kendi görüntüleriniz için abonelik sunan ücretli bir uygulamadır.
Bir tarayıcının yapabileceğinden fazlası mı gerekiyor?
SlideScope, aralarında CZI, ND2, LIF, MRXS ve JPEG 2000 SVS’nin de bulunduğu 34 mikroskop ve slayt tarayıcı biçimini Windows ve Mac’te; ölçüm, açıklamalar, hücre sayımı ve tam çözünürlüklü OME-TIFF dışa aktarımıyla açar. Tüm araçları yerleşik örneklerde ücretsiz deneyin; kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Kararınızı verdiniz mi? Hemen abone olun.