Công cụ miễn phí

Trình xem siêu dữ liệu TIFF

Liệt kê mọi thẻ của mọi ảnh trong một tệp TIFF, đọc phần mô tả OME-XML, ImageJ hoặc Aperio SVS, kiểm tra kích thước điểm ảnh mà tệp ghi lại, và tìm các trường có thể nhận diện bệnh nhân hoặc phòng thí nghiệm trước khi bạn chia sẻ tệp. Trình duyệt của bạn đọc tệp; tệp không bao giờ được tải lên.

Trình xem siêu dữ liệu TIFF

Thả tệp TIFF, OME-TIFF hoặc SVS vào đây

Được trình duyệt đọc trên máy tính của bạn. Không có gì được tải lên.

Tệp TIFF lưu kích thước điểm ảnh ở đâu

TệpVị trí của kích thước điểm ảnh
OME-TIFFPhysicalSizeX và PhysicalSizeXUnit trên phần tử Pixels của OME-XML (trong ImageDescription)
Aperio SVSMPP = 0.4990 trong ImageDescription của ảnh đầu tiên (µm trên mỗi điểm ảnh)
ImageJ / Fiji TIFFunit=micron trong ImageDescription, với số điểm ảnh trên mỗi đơn vị nằm trong XResolution
TIFF thườngXResolution cùng ResolutionUnit (2 = inch, 3 = cm); phần mềm camera thường ghi 72 hoặc 300 dpi, đó là thiết lập in ấn chứ không phải hiệu chuẩn

Trình xem cho biết nó tìm thấy mục nào trong số này. Nếu không có mục nào, hãy tự đặt tỷ lệ (công cụ tính kích thước điểm ảnh giải thích cách làm) trước khi đo.

Các trường có thể nhận diện bệnh nhân hoặc phòng thí nghiệm

Tệp ảnh toàn tiêu bản thường chứa nhiều thứ hơn điểm ảnh: ảnh chụp nhãn trên lam kính (mã vạch, số ca, đôi khi có cả tên), ảnh macro của toàn bộ tiêu bản, ngày giờ quét, số sê-ri của máy quét, tên người dùng và tên tệp gốc. Công cụ liệt kê những trường như vậy mà nó tìm thấy trong các thẻ chính. Trước khi chia sẻ một tiêu bản ra ngoài cơ sở của bạn, hãy xóa chúng: xem cách xóa nhãn và dữ liệu bệnh nhân khỏi ảnh tiêu bản.

Cùng thông tin đó từ dòng lệnh

tiffinfo file.tif (libtiff) in ra mọi thư mục ảnh; exiftool -a -G1 file.tif bổ sung các thẻ của hãng; trong Python, tifffile.TiffFile(path) cung cấp .pages[i].tags, .ome_metadata và .imagej_metadata. Với SVS, openslide.OpenSlide(path).properties trả về các trường đã được phân tích (xem đọc tệp SVS bằng Python).

Cách công cụ mở tệp mà không tải lên

Khi bạn chọn tệp, trình duyệt trao cho trang này quyền truy cập tệp đó trên ổ đĩa của bạn. Trang chỉ đọc những byte cần thiết: thư mục TIFF trước, rồi các ô ảnh của phần ảnh đang hiển thị trên màn hình, và giải mã chúng ngay trong trang bằng một trình đọc TIFF mã nguồn mở (geotiff). Không có gì được gửi tới máy chủ, nên dữ liệu chưa công bố và tiêu bản có nhãn bệnh nhân vẫn ở trên máy tính của bạn, và tiêu bản nhiều gigabyte mở trong vài giây vì chúng không bao giờ bị sao chép đi đâu. Đóng thẻ là tệp biến mất khỏi trang.

Trang tải các script của chính nó từ slidescope.science và bộ đếm lượt xem trang tôn trọng quyền riêng tư của trang web; không thành phần nào nhìn thấy ảnh của bạn. Giấy phép mã nguồn mở: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

Câu hỏi

Làm sao để xem siêu dữ liệu của tệp TIFF?

Mở tệp trong trang này để liệt kê mọi thẻ của mọi ảnh, hoặc dùng tiffinfo, exiftool hay tifffile trong Python. Thẻ ImageDescription chứa phần lớn siêu dữ liệu hiển vi (các trường OME-XML, ImageJ hoặc Aperio).

Làm sao để tìm kích thước điểm ảnh của tệp TIFF?

Hãy tìm PhysicalSizeX trong OME-XML, MPP trong phần mô tả Aperio, hoặc đơn vị ImageJ cùng XResolution. Độ phân giải 72 hoặc 300 dpi thông thường là thiết lập in ấn, không phải hiệu chuẩn kính hiển vi.

Tôi có xuất được các thẻ không?

Có: nút “Tải xuống tất cả thẻ dưới dạng JSON” lưu các thẻ của tối đa 200 ảnh trong tệp, với các mảng dài được rút gọn.

Tệp của tôi có bị tải lên không?

Không. Trình duyệt đọc tệp trên máy tính của bạn; không có gì được gửi đi đâu cả.

Công cụ này có miễn phí không?

Có, công cụ miễn phí và không cần tài khoản. SlideScope, ứng dụng hiển vi trên máy tính do cùng đội ngũ phát triển, là ứng dụng trả phí có thư viện mẫu miễn phí (với mọi công cụ) và gói thuê bao cho ảnh của riêng bạn.

Cần nhiều hơn những gì trình duyệt làm được?

SlideScope mở 34 định dạng của kính hiển vi và máy quét tiêu bản trên Windows và Mac, trong đó có CZI, ND2, LIF, MRXS và SVS JPEG 2000, với các tính năng đo, chú thích, đếm tế bào và xuất OME-TIFF độ phân giải đầy đủ. Dùng thử miễn phí mọi công cụ trên các mẫu tích hợp; để mở ảnh của riêng bạn, bạn cần một gói thuê bao. Đã quyết định? Đăng ký ngay.

Tải xuống SlideScope