איפה TIFF שומר את גודל הפיקסל
המציג מדווח איזה מאלה הוא מצא. אם אף אחד מהם לא קיים, הגדירו את קנה המידה בעצמכם (מחשבון גודל הפיקסל מסביר איך) לפני שאתם מודדים.
שדות שעלולים לזהות מטופל או מעבדה
קובצי שקופית מלאה נושאים לעיתים קרובות יותר מפיקסלים: צילום של תווית הזכוכית (ברקוד, מספר מקרה, לפעמים שם), תמונת מאקרו של השקופית כולה, תאריך ושעת הסריקה, המספר הסידורי של הסורק, שם המשתמש ושם הקובץ המקורי. הכלי מציג את אלה שהוא מוצא בתגים הראשיים. לפני שמשתפים שקופית מחוץ למוסד, הסירו אותם: ראו איך להסיר תוויות ונתוני מטופלים מתמונות שקופית.
אותו מידע משורת הפקודה
tiffinfo file.tif (libtiff) מדפיס כל ספרייה (directory) בקובץ; exiftool -a -G1 file.tif מוסיף תגי יצרן; ב-Python, tifffile.TiffFile(path) חושף את .pages[i].tags, .ome_metadata ו-.imagej_metadata. ל-SVS, openslide.OpenSlide(path).properties מחזיר את השדות המפוענחים (ראו קריאת קובצי SVS ב-Python).
איך הוא פותח קובץ בלי להעלות אותו
כשאתם בוחרים קובץ, הדפדפן מעביר לדף הזה גישה אליו בדיסק שלכם. הדף קורא רק את הבתים שהוא צריך: קודם את ספריית ה-TIFF, ואז את האריחים של החלק בתמונה שמופיע על המסך, ומפענח אותם בתוך הדף בעזרת קורא TIFF בקוד פתוח (geotiff). שום דבר לא נשלח לשרת, כך שנתונים שלא פורסמו ושקופיות עם תוויות מטופלים נשארים במחשב שלכם, ושקופיות של כמה ג'יגה-בייט נפתחות בתוך שניות כי הן אף פעם לא מועתקות לשום מקום. סגרו את הלשונית והקובץ נעלם מהדף.
הדף טוען את הסקריפטים שלו מ-slidescope.science ואת מונה צפיות הדף של האתר, שמכבד את הפרטיות; אף אחד מהם לא רואה את התמונה שלכם. רישיונות קוד פתוח: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
שאלות
איך רואים את המטא-נתונים של קובץ TIFF?
פתחו אותו בדף הזה כדי להציג את כל התגים של כל תמונה, או השתמשו ב-tiffinfo, exiftool או tifffile ב-Python. התג ImageDescription מכיל את רוב המטא-נתונים של מיקרוסקופיה (שדות OME-XML, ImageJ או Aperio).
איך מוצאים את גודל הפיקסל של TIFF?
חפשו את PhysicalSizeX ב-OME-XML, את MPP בתיאור של Aperio, או את היחידה של ImageJ יחד עם XResolution. רזולוציה פשוטה של 72 או 300 dpi היא הגדרת הדפסה, לא כיול של מיקרוסקופ.
אפשר לייצא את התגים?
כן: הכפתור "הורדת כל התגים כ-JSON" שומר את התגים של עד 200 תמונות בקובץ, כשמערכים ארוכים מקוצרים.
האם הקובץ שלי מועלה?
לא. הדפדפן קורא את הקובץ במחשב שלכם; שום דבר לא נשלח לשום מקום.
האם הכלי הזה חינמי?
כן, הוא חינמי ולא דורש חשבון. SlideScope, אפליקציית המיקרוסקופיה למחשב של אותו צוות, היא אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית (כל הכלים) ומנוי לתמונות שלכם.
צריכים יותר ממה שדפדפן יכול לעשות?
SlideScope פותח 34 פורמטים של מיקרוסקופים וסורקי שקופיות ב-Windows וב-Mac, ביניהם CZI, ND2, LIF, MRXS ו-SVS בדחיסת JPEG 2000, עם מדידה, הערות, ספירת תאים וייצוא OME-TIFF ברזולוציה מלאה. נסו כל כלי בחינם על הדוגמאות המובנות; כדי לפתוח את התמונות שלכם נדרש מנוי. כבר החלטתם? הירשמו למנוי עכשיו.