核对、重新计算和导出。“不使用 AI 重新计算”会在本地重新执行相同的步骤,并检查数字是否完全一致。您可以导出回答、分析记录和一段方法文字,或制作带比例尺的插图。
观看一段 62 秒的演示,录制于 SlideScope 1.23,使用公开示例图像(EPFL BrdU IHC,CC BY 4.0;czitools DAPI/GFP)。无声音。
您可以提出的问题,以及回答这些问题的工具
Ask Your Slide 使用 SlideScope 自己的工具:细胞核、细胞或颗粒计数(InstanSeg 深度学习分割或经典方法)、DAB 的 IHC 评分、区域统计、校准测量、通道饱和度统计、热点查找、区域轮廓、笔记以及视图控制。以下是几个示例:
您的提问
SlideScope 运行的工具
您能得到什么
“这个区域中 Ki67 阳性的细胞核占百分之多少?”
计数细胞核(InstanSeg),然后进行 DAB 的 IHC 评分
阳性百分比及所计数的细胞核数量,并在图像上显示轮廓
“给出我圈出区域的 H-score 和 Allred 评分。”
计数细胞核,采用与 QuPath 兼容的定义进行 IHC 评分
该区域的 H-score、Allred 评分和阳性百分比
“找出细胞最密集的三个区域,并分别进行 Ki67 评分。”
热点查找、圈出区域、逐区域计数和评分
三个已圈出的热点,每个都给出每 mm² 密度、z 分数和 Ki67 百分比
“这个视野里有多少个细胞,它们有多大?”
计数细胞(InstanSeg 或经典方法)
计数结果和对象面积,可导出为 CSV 和 GeoJSON
“比较这两个区域的 DAPI 密度。”
每个区域的区域统计和细胞核计数
面积、计数和每 mm² 密度并排对比
“这里哪个通道最亮,有没有饱和?”
区域统计、通道饱和度统计
每个通道的平均强度及各自的饱和比例
“带我去 GFP 最亮的区域。”
在 GFP 通道上查找热点,然后移动视图
视图缩放到该区域,并圈出该区域
“这个区域的面积是多少 µm²,其中 DAB 阳性的部分占多少?”
校准测量、区域统计
以 µm² 表示的面积和 DAB 阳性面积百分比
“转到第 12 个 Z 平面并计数细胞核。”
移动视图(Z)、计数细胞核
该平面上的计数结果,所用平面记录在依据中
“用这些数字添加一条笔记。”
添加笔记
一条随图像保存的切片笔记
目前 Ask Your Slide 只回答关于当前打开图像的问题。若要在多张图像之间比较不同处理,请使用 SlideScope Plus 中的实验功能:用同一个计数配方处理每张图像,并用合适的统计检验进行比较。针对整个实验提问的功能计划稍后推出。
每个数字都来自工具
通用 AI 模型并不是为通过看图来计数对象而构建的(Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024),因此 Ask Your Slide 从不让模型估计数字。助手只决定运行哪些工具;回答中的每个计数、评分、面积和强度都由 SlideScope 在您的电脑上计算得出,而且每一项您都可以核对:
SlideScope 1.23 中 Ask Your Slide 的一个真实回答,问题是“这里 DAB 阳性的细胞核占百分之多少?”(15.4%),图像为小鼠十二指肠的 BrdU IHC 切片(EPFL,CC BY 4.0)。细胞核按 DAB 分级勾勒轮廓,回答以 [R1] 引用所用视图,依据则显示产生每个数字的本地步骤,并提供“不使用 AI 重新计算”、“导出”和“制作插图”。
隐私优先的设计:究竟发送了什么
分析在您的电脑上运行。规划步骤和撰写回答由云端 AI 模型完成,而 Ask Your Slide 面板中的发送视图图像开关决定它是否会看到任何图片。
发送视图图像
发送给云端 AI 的内容
永远不会离开您电脑的内容
关闭(“不含图像”)
您的问题、有限的技术信息(格式、尺寸、通道、像素尺寸),以及本地工具计算出的数字
图像和文件
开启
同上,另加 AI 查看的视图;每个视图都会先在您的屏幕上显示,并经过压缩
文件,以及 AI 未查看的图像其余部分
您的问题和图像不会被用于训练 AI 模型。CT、MRI 等医学影像会被拒绝。AI 提供商和完整条款见隐私声明,数据处理页面则说明了 SlideScope 的其他部分会在您的电脑上保留哪些内容。
可用于实验记录、插图和方法部分的导出
answer.md:带引用的回答,可直接粘贴到实验记录本中。
analysis_record.json:步骤、参数和结果的完整记录,也就是“不使用 AI 重新计算”所用的同一份记录。
Ask Your Slide 适用于 SlideScope 能打开的图像:CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM 全切片图像等,共约 39 种格式,涵盖从明场全切片到带 Z 轴、时间序列和多场景的多通道荧光图像。完整列表见文件兼容性页面。回答支持 14 种语言,应用界面支持 10 种语言。
谁可以使用 Ask Your Slide
从 1.23.0 版起,Ask Your Slide 成为 Windows 和 macOS 版 SlideScope 的一部分。它包含在付费 SlideScope 方案中,在合理使用的 AI 限额内使用;Plus 方案的限额更高。目前,跨整个实验比较不同处理可通过 SlideScope Plus 的实验功能完成;针对整个实验提问的功能计划稍后推出。使用免费 SlideScope 账户,您可以在免费示例切片上试用 Ask Your Slide,每天三个问题;对您自己的图像提问需要订阅。当前价格请见方案页面。
关于 Ask Your Slide 的常见问题
ChatGPT 能计数显微镜图像中的细胞吗?
单靠它本身并不可靠。通用聊天机器人根据您上传的图片或它在该对话中编写的代码作答,因此方法可能每次对话都不同,而且截图不带像素尺寸。2024 年一场关于聊天机器人用于图像分析的研讨会报告指出,语言模型并不是为计数图像中的对象而构建的。Ask Your Slide 的工作方式不同:AI 只负责规划步骤,每个数字都由 SlideScope 自己的计数工具在您的电脑上得出,“不使用 AI 重新计算”还会重新计算这些数字。
我的图像会被发送到云端吗?
关闭“发送视图图像”(不含图像)时不会:图像绝不会离开您的电脑,只有您的问题、有限的技术信息(格式、尺寸、通道、像素尺寸)和计算出的数字会发送给云端 AI。打开该开关后,AI 查看的视图也会以压缩形式发送,并且每个视图都会先在您的屏幕上显示。您的数据不会被用于训练 AI 模型。
Ask Your Slide 是诊断工具吗?
不是。Ask Your Slide 仅供科研使用,不构成医学诊断。它会拒绝处理 CT、MRI 等医学影像,其回答报告的是测量结果,而不是诊断或分级。