Mở tệp ZEISS CZI trong SlideScope trên Windows hoặc macOS mà không cần chuyển đổi trước. Xem các kênh và chiều dữ liệu đã lưu. Việc xem cục bộ không tải ảnh lên máy chủ.
Một tệp CZI có thể chứa nhiều cảnh: các giếng của một đĩa, các vùng ghép ô, hoặc các vùng quét của một tiêu bản. SlideScope hiển thị từng cảnh riêng hoặc tất cả cùng lúc, và xuất cảnh bạn đang xem hoặc mọi cảnh sang OME-TIFF. Video và các bước dưới đây dùng một tệp mẫu công khai có hai cảnh.
Một tệp CZI có thể chứa nhiều cảnh: giếng của đĩa, vùng ghép ô hoặc vùng quét. Sau đây là cách xem từng cảnh và xuất chúng thành OME-TIFF.
Một CZI có hai cảnh, mở trực tiếp. Không chuyển đổi. Điều khiển Scene chuyển từ cảnh này sang cảnh tiếp theo. Cảnh 2 là giếng D7. Cảnh 1 là giếng D6. XY Overview đặt mỗi cảnh tại vị trí nó được ghi. Hai giếng này cách nhau 9 mm.
Tổ hợp các kênh vào một khung nhìn. Tắt một kênh để thấy phần đóng góp của nó. Phóng to. Thanh tỷ lệ vẫn được hiệu chuẩn. Details liệt kê kích thước pixel, các kênh và thiết lập thu nhận.
Để xuất, chọn File, rồi Export Current Image as TIFF. Khi bạn xem một cảnh, chỉ cảnh đó được xuất. Trước khi bắt đầu, bạn thấy kích thước pixel, kênh và kiểu nén sẽ ghi. Để xuất mọi cảnh, hãy bật XY Overview trước. Mọi cảnh vào một tệp OME-TIFF. Mỗi cảnh là một ảnh riêng trong đó.
Mở kết quả. Cả hai cảnh đều có, là ảnh 1 và ảnh 2. Kích thước pixel và tên kênh được giữ nguyên.
Tài khoản miễn phí cho phép mở và xem ảnh trên máy trước khi dùng thử. Việc xuất cần bản dùng thử 3 ngày hoặc gói thuê bao. Bản quét ghép ô lớn được xuất ở độ phân giải tổng quan, không phải toàn bộ. Cùng một ứng dụng trên macOS và Windows. Đoạn phim này kết xuất trên Windows.
Chọn File › Open File… (Ctrl+O trên Windows, ⌘O trên Mac) hoặc kéo tệp .czi vào cửa sổ. Cảnh đầu tiên hiện ra ngay. Không có gì bị chuyển đổi và tệp không được tải lên.
Tệp có nhiều cảnh sẽ hiển thị điều khiển Scene bên dưới ảnh. Dùng − và + hoặc nhập số. Mỗi cảnh giữ kích thước riêng và tên của nó trong tệp, chẳng hạn một giếng (D6, D7) hoặc một vùng ghép ô.
Nhấp XY Overview cạnh điều khiển Scene, hoặc chọn View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Mỗi cảnh được vẽ tại vị trí nó được ghi, kể cả khoảng trống giữa các cảnh. Nhấp vào một cảnh để chọn và nhấp đúp để mở. Các cảnh nằm cách xa nhau, như các giếng cách nhau 9 mm, ban đầu hiện thành ô nhỏ: hãy phóng to để xem.
Trong Display, đánh dấu Blend channels into one view để có ảnh tổ hợp màu, hoặc tắt từng kênh. Details liệt kê kích thước pixel, các chiều, cảnh hiện tại và kích thước của nó. Độ sáng, độ tương phản và màu chỉ thay đổi những gì bạn thấy, không bao giờ thay đổi pixel đã lưu.
Chọn File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Chọn thư mục và tên tệp; SlideScope gợi ý một tên kết thúc bằng .ome.tif.
Khi màn hình đang hiển thị một cảnh, chỉ cảnh đó được xuất, với tên như sample_scene-2.ome.tif. Để xuất mọi cảnh, hãy bật XY Overview trước: tất cả các cảnh được ghi vào một tệp OME-TIFF, mỗi cảnh là một ảnh riêng với kích thước riêng. Trước khi ghi bất cứ thứ gì, một hộp xác nhận hiển thị kích thước, kích thước pixel, các kênh và kiểu nén.
Nhấp Open Exported TIFF khi quá trình xuất hoàn tất. SlideScope hiển thị mỗi cảnh đã xuất thành một ảnh; duyệt qua chúng bằng điều khiển Image. Các trình đọc OME-TIFF hỗ trợ nhiều ảnh trong một tệp, như Bio-Formats trong Fiji, liệt kê chúng thành các series riêng.
Windows 10 hoặc 11, hoặc macOS 14 trở lên trên Apple Silicon hoặc Intel. Khám phá miễn phí thư viện mẫu tích hợp, với mọi công cụ. Mở ảnh của riêng bạn với bản dùng thử miễn phí 3 ngày. Việc xuất cần bản dùng thử 3 ngày hoặc gói thuê bao (25,00 US$ mỗi tháng sau khi hết dùng thử).
Các cảnh có thể duyệt lần lượt khi chúng có cùng kiểu pixel và cùng các kênh, mặt phẳng Z và thời điểm. Nếu không, SlideScope hiển thị cảnh đầu tiên và nêu lý do trong Details. Nếu điều đó không như bạn mong đợi, hãy gửi tệp cho chúng tôi.
Màu kênh lấy từ tệp nếu tệp có ghi. Thay đổi màu trong Display › Channel colour…; tệp xuất sẽ ghi các màu bạn đặt.
Bản quét ghép ô lớn được xuất ở độ phân giải tổng quan, và hộp xác nhận sẽ nói rõ điều này trước khi ghi bất cứ thứ gì. Bản quét độ phân giải đầy đủ vẫn xem được trong SlideScope.
Việc xem hoạt động với tài khoản miễn phí. Việc xuất cần bản dùng thử miễn phí hoặc gói thuê bao.
Mẫu trong video và ảnh chụp màn hình: S2_3x3_CH2.czi từ dữ liệu mẫu của czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), hai cảnh của một ảnh ghép 3 × 3 với DAPI và EGFP. Không có dữ liệu khách hàng.
| Công cụ | Chi phí | Nền tảng | Phù hợp nhất cho |
|---|---|---|---|
| ZEISS ZEN lite | Miễn phí (cần ZEISS ID để tải xuống) | Windows | Trình xem chính hãng, gần với phần mềm thu nhận ảnh nhất |
| Fiji / ImageJ với Bio-Formats | Miễn phí, mã nguồn mở | Windows, macOS, Linux | Phân tích bằng plugin và macro; mỗi scene được nhập thành một series |
| QuPath | Miễn phí, mã nguồn mở | Windows, macOS, Linux | Dự án phân tích ảnh toàn tiêu bản và viết script |
| SlideScope | Ảnh mẫu miễn phí với mọi công cụ, 3 ngày dùng thử miễn phí để mở ảnh của bạn, sau đó thuê bao từ $25/tháng | Windows 10+, macOS 14+ (Apple silicon và Intel) | Xem, đo đạc và chú thích CZI cùng với CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM và TIFF, tệp luôn được giữ trên máy tính của bạn |
Bạn có thể mở tệp ZEISS CZI bằng ZEN lite, trình xem miễn phí của ZEISS dành cho Windows; bằng Fiji hoặc QuPath, miễn phí và đọc CZI qua Bio-Formats trên Windows, Mac và Linux; hoặc bằng SlideScope, trình xem trên máy tính dành cho Windows và Mac, có bản dùng thử miễn phí. Trên máy Mac dùng Apple silicon, Bio-Formats không đọc được tệp CZI nén JPEG-XR. Các bước dưới đây sử dụng SlideScope.
Nguồn: So sánh trình xem ảnh toàn tiêu bản (WSI): nền tảng và giá, mỗi mục kèm liên kết nguồn (tiếng Anh).
Xem thêm: ZEISS ZEN lite: tải ở đâu, có dùng được trên Mac không và các lựa chọn thay thế (tiếng Anh).
Tài liệu của QuPath cho biết Bio-Formats hiện chưa hỗ trợ nén JPEG-XR trên Apple silicon, trong khi nhiều tệp CZI được nén JPEG-XR. Cách khắc phục được đề xuất là chuyển đổi tệp trên một máy tính khác hoặc chuyển sang bản QuPath dành cho Intel. SlideScope không dùng Bio-Formats cho CZI: ứng dụng đọc CZI bằng bộ giải mã JPEG XR tích hợp sẵn của riêng mình trong cả bản Windows lẫn bản Mac.
Nguồn: Tài liệu QuPath: các định dạng ảnh được hỗ trợ (tiếng Anh).
Hãy đánh giá SlideScope khi cần một ứng dụng máy tính vừa mở được nhiều định dạng hiển vi vừa định lượng các đối tượng thông thường ngay trên máy của bạn. Giữ công cụ gốc khi cần điều khiển kính hiển vi, xử lý ảnh có thể lập trình, quy trình phân tích viết bằng mã hoặc quản lý ảnh cấp tổ chức.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Xử lý mở rộng, macro, plugin, tập lệnh, phân đoạn, phân tích bệnh học và quy trình khoa học Python.
OMERO: Kho ảnh tập trung, phân quyền, cộng tác và quản lý dữ liệu cấp tổ chức.
Có. ZEN lite (Windows) và Fiji hoặc QuPath với Bio-Formats đều miễn phí. SlideScope được tải xuống miễn phí, thư viện mẫu tích hợp miễn phí với mọi công cụ, còn ảnh của chính bạn được mở bằng 3 ngày dùng thử miễn phí (cần PayPal hoặc thẻ); sau thời gian dùng thử, bạn tiếp tục sử dụng theo gói thuê bao.
Dùng macOS 14 trở lên. Chọn bản Apple Silicon hoặc Intel phù hợp với Mac và sao chép tệp vào bộ nhớ cục bộ trước khi mở.
Kiểm tra tệp đã sao chép xong. Nếu vẫn lỗi, hãy gửi phiên bản ứng dụng, định dạng tệp và thông báo lỗi cho bộ phận hỗ trợ để được kiểm tra.
Dành cho phòng thí nghiệm nghiên cứu, cơ sở kính hiển vi, giảng viên, sinh viên và nhóm đánh giá hình ảnh bệnh học.
Đọc tài liệu gốc của định dạng.
SlideScope độc lập và không liên kết với Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari hoặc OMERO. Tên sản phẩm chỉ được dùng để so sánh khách quan.
Khám phá toàn bộ tiêu bản, các kênh huỳnh quang và chồng ảnh trong một không gian làm việc tập trung trên Windows và macOS.
Có tệp không mở được hoặc định dạng chưa có trong danh sách? Báo tệp hoặc định dạng