Cuantificación local

Cuantifica núcleos, células y partículas sin enviar un solo píxel fuera

La cuantificación local convierte en cifras la lámina que ya tienes delante. La segmentación y la medición se ejecutan en tu propio equipo, así que las imágenes inéditas o de origen clínico nunca salen de la máquina y el resultado aparece en la misma ventana que la imagen.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Por qué cuantificar aquí

Tus píxeles no salen del equipo

La segmentación y la medición se ejecutan en local. Solo se descargan los pesos del modelo, y SlideScope verifica su resumen SHA-256 antes de cargarlos. No se sube nada de la imagen, que es la diferencia decisiva para datos inéditos, material de origen clínico y comités de ética.

Dos motores, ambos explícitos

Usa pesos verificados de aprendizaje profundo InstanSeg para núcleos y células, o un umbral clásico explícito con selección automática de Otsu, detección de polaridad, suavizado y límites de área. Siempre sabes qué motor produjo cada cifra, y el resumen de métodos lo deja registrado.

Pensado para ser reproducible

Cada ejecución se describe con una receta guardada: tipo de objeto, motor, canal, umbrales, límites de área y canales de marcador. Recarga la receta, vuelve a procesar la carpeta y obtendrás el mismo análisis. El resumen de métodos exportado está redactado para pegarlo en un manuscrito.

Qué obtienes

  • Recuento de objetos, con densidad calibrada por milímetro cuadrado siempre que conste el tamaño de píxel
  • Área, perímetro y descriptores de forma de cada objeto
  • Intensidad media en todos los canales, no solo en el usado para segmentar
  • Clasificación opcional de objetos positivos frente a uno o dos canales de marcador
  • Distribuciones de tamaño e intensidad de toda la población de objetos
  • Superposiciones editables, para excluir antes de exportar cualquier objeto mal segmentado

Exportaciones que encajan en flujos reales

  • Tabla CSV de objetos para estadística en R, Python, Prism o una hoja de cálculo
  • Contornos GeoJSON que QuPath y ASAP importan directamente
  • TIFF de máscara etiquetada con la receta incrustada en los metadatos
  • PNG anotado para figuras y presentaciones
  • JSON de resumen para uso programático posterior
  • Un resumen de métodos redactado para pegar en un manuscrito

Cinco minutos, de la imagen a las cifras

  1. Elige la región

    Cuantifica la imagen completa o solo la región seleccionada. Trabajar sobre una región mantiene ágil una lámina de gigapíxeles y centra el análisis en el tejido que de verdad importa.

  2. Elige objetos y motor

    Núcleos, células o partículas. InstanSeg para núcleos y células; umbral clásico para lo demás o cuando necesites una regla totalmente explícita.

  3. Revisa la superposición

    Los resultados aparecen superpuestos sobre la imagen. Recorre la tabla de objetos, revisa los atípicos y excluye lo que la segmentación haya leído mal. Nada es definitivo hasta que tú lo decidas.

  4. Exporta o procesa la carpeta

    Exporta el paquete, o guarda los ajustes como receta y aplica el mismo análisis a una carpeta entera en una sola pasada, con un resumen combinado del lote.

Preguntas frecuentes

¿Mis imágenes salen del equipo?

No. La segmentación y la medición se ejecutan dentro del proceso de SlideScope en tu propio equipo. La única petición de red es una descarga puntual de los pesos del modelo, y SlideScope verifica el resumen SHA-256 tanto del archivo comprimido como del modelo antes de cargar ningún código.

¿Qué motor debo usar?

Usa InstanSeg para núcleos y células en campo claro o fluorescencia: separa objetos en contacto mucho mejor que un umbral. Usa el motor clásico para partículas, para tinciones poco habituales o cuando necesites una regla que puedas describir con exactitud en la sección de métodos.

¿Puedo fiarme de las cifras para publicar?

Trátalas como resultados de investigación que requieren tu control de calidad. SlideScope muestra la segmentación como una superposición editable precisamente para que la revises, y exporta un resumen de métodos que describe cómo se obtuvo cada cifra. Los resultados no están validados para diagnóstico ni para decisiones clínicas.

Solo para investigación. Los resultados exigen control de calidad visual y no están validados para diagnóstico ni para decisiones clínicas.

Cuantifica tus propias láminas esta semana

La prueba de 14 días es de acceso completo, incluida la cuantificación local y el procesamiento por carpetas. Pruébala con las imágenes en las que trabaja tu laboratorio.

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