Kuantifikasi lokal

Hitung inti, sel, dan partikel tanpa satu piksel pun keluar

Kuantifikasi lokal mengubah preparat yang sedang Anda lihat menjadi angka. Segmentasi dan pengukuran berjalan di komputer Anda sendiri, sehingga citra yang belum dipublikasikan maupun berasal dari pasien tidak pernah meninggalkan mesin, dan hasilnya muncul di jendela yang sama dengan citranya.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Mengapa mengukur di sini

Piksel Anda tetap di mesin Anda

Segmentasi dan pengukuran berjalan lokal. Yang diunduh hanya bobot model, dan SlideScope memverifikasi digest SHA-256-nya sebelum memuatnya. Tidak ada bagian citra yang diunggah, dan justru itulah pembeda yang penting untuk data belum terbit, material dari pasien, serta telaah komite etik.

Dua mesin, keduanya eksplisit

Gunakan bobot deep learning InstanSeg terverifikasi untuk inti dan sel, atau ambang klasik yang eksplisit dengan pemilihan otomatis Otsu, deteksi polaritas, penghalusan, dan batas luas. Anda selalu tahu mesin mana yang menghasilkan suatu angka, dan ringkasan metode mencatatnya.

Dirancang agar dapat direproduksi

Setiap proses dijelaskan oleh resep tersimpan: jenis objek, mesin, kanal, ambang, batas luas, kanal penanda. Muat ulang resepnya, jalankan lagi foldernya, dan Anda memperoleh analisis yang sama. Ringkasan metode yang diekspor ditulis agar bisa ditempel ke naskah.

Apa yang dihasilkan

  • Jumlah objek, dengan densitas terkalibrasi per milimeter persegi di mana pun ukuran piksel tercatat
  • Luas, keliling, dan deskriptor bentuk untuk setiap objek
  • Intensitas rata-rata di semua kanal, bukan hanya kanal segmentasi
  • Klasifikasi opsional objek positif penanda terhadap satu atau dua kanal penanda
  • Distribusi ukuran dan intensitas di seluruh populasi objek
  • Hamparan yang dapat disunting, sehingga objek yang salah tersegmentasi bisa dikecualikan sebelum ekspor

Ekspor yang cocok untuk alur kerja nyata

  • Tabel objek CSV untuk statistik di R, Python, Prism, atau lembar sebar
  • Kontur GeoJSON yang langsung diimpor QuPath dan ASAP
  • Mask TIFF berlabel dengan resep tertanam di metadata berkas
  • PNG beranotasi untuk gambar dan presentasi
  • JSON ringkasan untuk pemakaian programatik selanjutnya
  • Ringkasan metode tertulis yang siap ditempel ke naskah

Lima menit dari citra ke angka

  1. Pilih wilayahnya

    Kuantifikasi seluruh citra atau hanya wilayah yang Anda pilih. Bekerja pada satu wilayah menjaga preparat gigapiksel tetap gesit dan membuat analisis tetap pada jaringan yang benar-benar Anda pedulikan.

  2. Tentukan objek dan mesin

    Inti, sel, atau partikel. InstanSeg untuk inti dan sel; ambang klasik untuk selainnya atau saat Anda butuh aturan yang sepenuhnya eksplisit.

  3. Periksa hamparannya

    Hasil muncul sebagai hamparan di atas citra. Telusuri tabel objek, tinjau pencilan, dan kecualikan apa pun yang salah dibaca segmentasi. Tidak ada yang final sampai Anda memutuskannya.

  4. Ekspor atau jalankan folder sekaligus

    Ekspor paketnya, atau simpan pengaturan sebagai resep dan jalankan analisis yang sama atas satu folder penuh dalam sekali proses, lengkap dengan ringkasan batch gabungan.

Pertanyaan umum

Apakah citra saya keluar dari komputer?

Tidak. Segmentasi dan pengukuran berjalan dalam proses SlideScope di mesin Anda sendiri. Satu-satunya permintaan jaringan adalah unduhan bobot model sekali saja, dan SlideScope memverifikasi digest SHA-256 arsip maupun modelnya sebelum memuat kode apa pun.

Mesin mana yang sebaiknya saya pakai?

Pakai InstanSeg untuk inti dan sel pada medan terang maupun fluoresensi: ia memisahkan objek yang bersinggungan jauh lebih baik daripada ambang. Pakai mesin klasik untuk partikel, untuk pewarnaan tak lazim, atau kapan pun Anda butuh aturan yang bisa dinyatakan persis di bagian metode.

Bisakah angkanya dipercaya untuk publikasi?

Perlakukan sebagai luaran riset yang membutuhkan kendali mutu dari Anda. SlideScope menampilkan segmentasi sebagai hamparan yang dapat disunting justru agar Anda bisa memeriksanya, dan mengekspor ringkasan metode yang menjelaskan bagaimana tiap angka dihasilkan. Hasilnya tidak divalidasi untuk diagnosis atau pengambilan keputusan klinis.

Hanya untuk penggunaan riset. Hasil memerlukan kendali mutu visual dan tidak divalidasi untuk diagnosis atau pengambilan keputusan klinis.

Kuantifikasi preparat Anda sendiri minggu ini

Uji coba 14 hari memberi akses penuh, termasuk kuantifikasi lokal dan proses batch per folder. Cobalah pada citra yang benar-benar sedang dikerjakan laboratorium Anda.

Mulai uji coba