Isi sebuah berkas SVS
Berkas SVS adalah TIFF yang berisi beberapa citra: hasil pemindaian resolusi penuh (dalam tile, biasanya dikompresi JPEG), thumbnail, dua atau tiga level resolusi yang lebih rendah, foto label slide, dan citra makro perbesaran rendah dari seluruh kaca. Deskripsi citra pertama memuat detail pemindaian, termasuk MPP (mikrometer per piksel, sekitar 0,25 untuk pemindaian 40× dan 0,5 untuk 20×) dan AppMag. Penampil ini membaca semuanya: piramida menggerakkan zoom, MPP menentukan skala batang, sedangkan label dan makro dibuka dengan tombol di samping citra.
Berkas SVS JPEG 2000
Sebagian pemindai Aperio mengompresi slide dengan JPEG 2000 (kompresi TIFF 33003 atau 33005). Browser tidak dapat mendekode JPEG 2000 tanpa WebAssembly, sehingga halaman ini memberi tahu hal tersebut alih-alih menampilkan citra kosong. Aperio ImageScope (Windows), QuPath, dan SlideScope dapat membukanya. Untuk memeriksa berkas terlebih dahulu, buka di penampil metadata TIFF dan lihat bagian Compression.
Citra label dan data pasien
Citra label adalah foto label kertas pada kaca dan dapat memperlihatkan barcode, nomor kasus, atau nama pasien. Melihatnya di sini membuatnya tetap berada di komputer Anda; membagikan berkasnya tidak. Lihat cara menghapus label dan data pasien sebelum mengirim slide ke luar institusi Anda.
Yang tidak dapat dibukanya
- SVS JPEG 2000 (kompresi Aperio 33003/33005), JPEG XR, dan JPEG XL tidak dapat didekode di browser tanpa WebAssembly, yang tidak dimuat oleh halaman ini.
- Tidak berbasis TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR, dan DICOM memerlukan pembaca desktop. NDPI mirip TIFF, tetapi menyimpan setiap level sebagai satu JPEG raksasa, terlalu besar untuk tab browser.
- OME-TIFF dengan beberapa seri menampilkan seri pertama.
- Tanpa pengukuran, anotasi, atau analisis: ini hanya penampil.
Untuk format-format tersebut, serta untuk mengukur, membuat anotasi, dan menghitung sel pada citra Anda sendiri, SlideScope membuka 34 format mikroskop dan pemindai slide di Windows dan Mac. SlideScope, aplikasi mikroskopi desktop buatan tim yang sama, adalah aplikasi berbayar dengan pustaka sampel gratis (semua alat) dan langganan untuk citra Anda sendiri. Alternatif gratis: Fiji (Bio-Formats) dan QuPath.
Cara alat ini membuka berkas tanpa mengunggahnya
Saat Anda memilih berkas, browser memberi halaman ini akses ke berkas tersebut di disk Anda. Halaman hanya membaca byte yang diperlukan: direktori TIFF terlebih dahulu, lalu tile untuk bagian citra yang tampil di layar, dan mendekodenya di halaman dengan pembaca TIFF open source (geotiff). Tidak ada yang dikirim ke server, sehingga data yang belum dipublikasikan dan slide berlabel pasien tetap berada di komputer Anda, dan slide berukuran beberapa gigabyte terbuka dalam hitungan detik karena tidak pernah disalin ke mana pun. Tutup tab, dan berkas pun hilang dari halaman.
Halaman ini memuat skripnya sendiri dari slidescope.science serta penghitung tampilan halaman situs yang menghormati privasi; keduanya tidak pernah melihat citra Anda. Lisensi open source: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Pertanyaan
Bagaimana cara membuka berkas SVS secara online?
Buka di halaman ini: browser membaca slide dari disk Anda dan menampilkannya dengan zoom, thumbnail, label dan makro, serta detail pemindaian. Tidak ada yang diunggah.
Mengapa berkas SVS saya tidak terbuka?
Kemungkinan berkas tersebut dikompresi dengan JPEG 2000 (kompresi 33003 atau 33005), yang tidak dapat didekode oleh browser. Sebagai gantinya, buka di Aperio ImageScope, QuPath, atau SlideScope.
Seberapa besar berkas SVS yang dapat dibuka?
Ukuran berapa pun yang dapat dijangkau browser: hanya tile yang tampil di layar yang dibaca, sehingga slide 3 GB terbuka hampir secepat slide kecil.
Apakah label slide ditampilkan?
Ya, sebagai citra terpisah. Perlu diingat bahwa label dapat memuat informasi pasien.
Apakah penampil SVS ini gratis?
Ya, alat ini gratis dan tidak memerlukan akun. SlideScope, aplikasi mikroskopi desktop buatan tim yang sama, adalah aplikasi berbayar dengan pustaka sampel gratis (semua alat) dan langganan untuk citra Anda sendiri.
Butuh lebih dari yang bisa dilakukan browser?
SlideScope membuka 34 format mikroskop dan pemindai slide di Windows dan Mac, di antaranya CZI, ND2, LIF, MRXS, dan SVS JPEG 2000, lengkap dengan pengukuran, anotasi, penghitungan sel, dan ekspor OME-TIFF resolusi penuh. Coba semua alat secara gratis pada sampel bawaan; membuka citra Anda sendiri memerlukan langganan. Sudah memutuskan? Berlangganan sekarang.