SVS 檔案裡有什麼
SVS 檔案是一個包含多張影像的 TIFF:全解析度掃描影像(以圖塊儲存,通常為 JPEG 壓縮)、一張縮圖、兩到三個降低解析度的層級、一張玻片標籤照片,以及整片玻璃的低倍率巨觀影像。第一張影像的描述中記錄了掃描細節,包括 MPP(每像素微米數,40× 掃描約為 0.25,20× 約為 0.5)與 AppMag。此檢視器會讀取上述全部內容:金字塔用於縮放,MPP 用於比例尺,標籤與巨觀影像則可透過影像旁的按鈕開啟。
將 Aperio SVS 玻片拖放到這裡
由您電腦上的瀏覽器讀取。不會上傳任何內容。
SVS 檔案是一個包含多張影像的 TIFF:全解析度掃描影像(以圖塊儲存,通常為 JPEG 壓縮)、一張縮圖、兩到三個降低解析度的層級、一張玻片標籤照片,以及整片玻璃的低倍率巨觀影像。第一張影像的描述中記錄了掃描細節,包括 MPP(每像素微米數,40× 掃描約為 0.25,20× 約為 0.5)與 AppMag。此檢視器會讀取上述全部內容:金字塔用於縮放,MPP 用於比例尺,標籤與巨觀影像則可透過影像旁的按鈕開啟。
部分 Aperio 掃描器會以 JPEG 2000 壓縮玻片(TIFF 壓縮代碼 33003 或 33005)。瀏覽器若沒有 WebAssembly 便無法解碼 JPEG 2000,因此本頁會直接說明這一點,而不是顯示一張空白影像。Aperio ImageScope(Windows)、QuPath 與 SlideScope 都能開啟這類檔案。若要先檢查檔案,請在 TIFF 中繼資料檢視器中開啟並查看 Compression 欄位。
標籤影像是玻璃上紙本標籤的照片,可能顯示條碼、病例編號或病患姓名。在這裡檢視時,影像會留在您的電腦上;但分享檔案時則不然。將玻片傳送到機構外部之前,請參閱如何移除標籤與病患資料。
若要開啟這些格式,或在您自己的影像上進行量測、標註與細胞計數,SlideScope 可在 Windows 與 Mac 上開啟 34 種顯微鏡與玻片掃描器格式。SlideScope 是同一團隊開發的桌面顯微影像應用程式,為付費應用程式,附有免費範例庫(所有工具皆可使用),開啟您自己的影像則需要訂閱。免費替代方案:Fiji(Bio-Formats)與 QuPath。
當您選擇檔案時,瀏覽器會將該檔案在您磁碟上的控制代碼交給此頁面。頁面只讀取所需的位元組:先讀取 TIFF 目錄,再讀取螢幕上顯示之影像區域的圖塊,並使用開源 TIFF 讀取器(geotiff)在頁面中解碼。不會傳送任何內容到伺服器,因此未發表的資料與帶有病患標籤的切片都會留在您的電腦上;多 GB 的切片也能在數秒內開啟,因為它們從未被複製到任何地方。關閉分頁後,檔案就會從頁面中消失。
此頁面從 slidescope.science 載入自己的腳本,以及本網站尊重隱私的頁面瀏覽計數器;兩者都不會看到您的影像。開源授權:image-tools-vendor.LICENSE.txt。
在本頁開啟即可:瀏覽器會從您的磁碟讀取玻片,並顯示可縮放的影像、縮圖、標籤與巨觀影像,以及掃描細節。不會上傳任何內容。
它很可能是以 JPEG 2000 壓縮(壓縮代碼 33003 或 33005),瀏覽器無法解碼。請改用 Aperio ImageScope、QuPath 或 SlideScope 開啟。
只要瀏覽器能定址的大小都可以:只會讀取畫面上的圖塊,因此 3 GB 的玻片開啟速度和小檔案差不多。
會,以獨立影像呈現。請留意標籤可能帶有病患資訊。
是的,它是免費的,而且不需要帳戶。SlideScope 是同一團隊開發的桌面顯微影像應用程式,為付費應用程式,附有免費範例庫(所有工具皆可使用),開啟您自己的影像則需要訂閱。
SlideScope 可在 Windows 與 Mac 上開啟 34 種顯微鏡與玻片掃描器格式,包括 CZI、ND2、LIF、MRXS 與 JPEG 2000 SVS,並提供量測、標註、細胞計數與全解析度 OME-TIFF 匯出。可在內建範例上免費試用所有工具;開啟您自己的影像需要訂閱。已經決定了嗎?立即訂閱。