כלי חינמי

מציג SVS מקוון

פתחו שקופית Aperio SVS מהמחשב שלכם, הזיזו והתקרבו לאורך כל הפירמידה, צפו בתמונה הממוזערת, בתווית ובתמונת המאקרו, וקראו את ה-MPP, את הגדלת הסריקה ואת שאר המטא-נתונים של השקופית. רק האריחים שעל המסך נקראים, כך ששקופיות של כמה ג'יגה-בייט נפתחות בתוך שניות, ושום דבר לא מועלה.

מציג SVS מקוון

גררו לכאן שקופית Aperio SVS

נקרא על ידי הדפדפן שלכם, במחשב שלכם. שום דבר לא מועלה.

מה יש בתוך קובץ SVS

קובץ SVS הוא TIFF שמכיל כמה תמונות: הסריקה ברזולוציה מלאה (באריחים, בדרך כלל בדחיסת JPEG), תמונה ממוזערת, שתיים או שלוש רמות ברזולוציה מופחתת, צילום של תווית השקופית ותמונת מאקרו בהגדלה נמוכה של הזכוכית כולה. התיאור של התמונה הראשונה מכיל את פרטי הסריקה, כולל MPP (מיקרומטרים לפיקסל, כ-0.25 בסריקה של 40× ו-0.5 ב-20×) ו-AppMag. המציג קורא את כולם: הפירמידה מניעה את הזום, ה-MPP את סרגל קנה המידה, והתווית והמאקרו נפתחים בכפתורים שליד התמונה.

קובצי SVS בדחיסת JPEG 2000

חלק מסורקי Aperio דוחסים שקופיות ב-JPEG 2000 (דחיסת TIFF מסוג 33003 או 33005). דפדפנים לא יכולים לפענח JPEG 2000 בלי WebAssembly, ולכן הדף הזה אומר זאת במפורש במקום להציג תמונה ריקה. ‏Aperio ImageScope (ב-Windows),‏ QuPath ו-SlideScope פותחים אותם. כדי לבדוק קובץ מראש, פתחו אותו במציג המטא-נתונים של TIFF ובדקו את השדה Compression.

תמונת התווית ונתוני מטופלים

תמונת התווית היא צילום של מדבקת הנייר שעל הזכוכית, והיא עשויה להציג ברקוד, מספר מקרה או שם של מטופל. צפייה בה כאן משאירה אותה במחשב שלכם; שיתוף הקובץ לא. לפני ששולחים שקופית אל מחוץ למוסד, ראו איך להסיר תוויות ונתוני מטופלים.

מה הוא לא פותח

  • SVS בדחיסת JPEG 2000 (דחיסת Aperio מסוג 33003/33005), וכן JPEG XR ו-JPEG XL, אינם ניתנים לפענוח בדפדפן בלי WebAssembly, והדף הזה אינו טוען אותו.
  • לא מבוססים על TIFF: CZI,‏ ND2,‏ LIF,‏ MRXS,‏ VSI,‏ IMS,‏ OIB/OIR ו-DICOM דורשים קורא למחשב. NDPI דומה ל-TIFF, אבל שומר כל רמה כ-JPEG ענק אחד, גדול מדי ללשונית דפדפן.
  • OME-TIFF עם כמה סדרות מציג את הסדרה הראשונה.
  • אין מדידות, הערות או ניתוח: זהו מציג.

לפורמטים האלה, ולמדידה, הוספת הערות וספירת תאים בתמונות שלכם, SlideScope פותח 34 פורמטים של מיקרוסקופים וסורקי שקופיות ב-Windows וב-Mac. SlideScope, אפליקציית המיקרוסקופיה למחשב של אותו צוות, היא אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית (כל הכלים) ומנוי לתמונות שלכם. חלופות חינמיות: Fiji (Bio-Formats) ו-QuPath.

איך הוא פותח קובץ בלי להעלות אותו

כשאתם בוחרים קובץ, הדפדפן מעביר לדף הזה גישה אליו בדיסק שלכם. הדף קורא רק את הבתים שהוא צריך: קודם את ספריית ה-TIFF, ואז את האריחים של החלק בתמונה שמופיע על המסך, ומפענח אותם בתוך הדף בעזרת קורא TIFF בקוד פתוח (geotiff). שום דבר לא נשלח לשרת, כך שנתונים שלא פורסמו ושקופיות עם תוויות מטופלים נשארים במחשב שלכם, ושקופיות של כמה ג'יגה-בייט נפתחות בתוך שניות כי הן אף פעם לא מועתקות לשום מקום. סגרו את הלשונית והקובץ נעלם מהדף.

הדף טוען את הסקריפטים שלו מ-slidescope.science ואת מונה צפיות הדף של האתר, שמכבד את הפרטיות; אף אחד מהם לא רואה את התמונה שלכם. רישיונות קוד פתוח: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

שאלות

איך אפשר לפתוח קובץ SVS באופן מקוון?

פתחו אותו בדף הזה: הדפדפן קורא את השקופית מהדיסק שלכם ומציג אותה עם זום, תמונה ממוזערת, תווית ומאקרו, ופרטי הסריקה. שום דבר לא מועלה.

למה קובץ ה-SVS שלי לא נפתח?

כנראה שהוא דחוס ב-JPEG 2000 (דחיסה 33003 או 33005), שדפדפנים לא יכולים לפענח. פתחו אותו במקום זאת ב-Aperio ImageScope,‏ QuPath או SlideScope.

עד איזה גודל של קובץ SVS הוא יכול לפתוח?

כל גודל שהדפדפן יכול לגשת אליו: רק האריחים שעל המסך נקראים, כך ששקופית של 3 GB נפתחת בערך באותה מהירות כמו שקופית קטנה.

האם הוא מציג את תווית השקופית?

כן, כתמונה נפרדת. זכרו שתוויות עשויות לשאת מידע על מטופלים.

האם מציג ה-SVS הזה חינמי?

כן, הוא חינמי ולא דורש חשבון. SlideScope, אפליקציית המיקרוסקופיה למחשב של אותו צוות, היא אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית (כל הכלים) ומנוי לתמונות שלכם.

צריכים יותר ממה שדפדפן יכול לעשות?

SlideScope פותח 34 פורמטים של מיקרוסקופים וסורקי שקופיות ב-Windows וב-Mac, ביניהם CZI,‏ ND2,‏ LIF,‏ MRXS ו-SVS בדחיסת JPEG 2000, עם מדידה, הערות, ספירת תאים וייצוא OME-TIFF ברזולוציה מלאה. נסו כל כלי בחינם על הדוגמאות המובנות; כדי לפתוח את התמונות שלכם נדרש מנוי. כבר החלטתם? הירשמו למנוי עכשיו.

הורדת SlideScope