온라인 SVS 뷰어

SVS 파일 안에 들어 있는 것

SVS 파일은 여러 이미지가 담긴 TIFF입니다. 전체 해상도 스캔(타일 구조, 보통 JPEG 압축), 썸네일, 두세 개의 저해상도 레벨, 슬라이드 라벨 사진, 그리고 유리 슬라이드 전체를 저배율로 찍은 매크로 이미지가 들어 있습니다. 첫 번째 이미지의 설명에는 MPP(픽셀당 마이크로미터, 40× 스캔은 약 0.25, 20×는 약 0.5)와 AppMag를 비롯한 스캔 정보가 담겨 있습니다. 뷰어는 이 모두를 읽습니다. 피라미드는 확대/축소에, MPP는 스케일 바에 쓰이며, 라벨과 매크로는 이미지 옆의 버튼으로 열립니다.

JPEG 2000 SVS 파일

일부 Aperio 스캐너는 슬라이드를 JPEG 2000(TIFF 압축 33003 또는 33005)으로 압축합니다. 브라우저는 WebAssembly 없이 JPEG 2000을 디코딩할 수 없으므로, 이 페이지는 빈 이미지를 보여주는 대신 그 사실을 알려줍니다. Aperio ImageScope(Windows), QuPath, SlideScope는 이런 파일을 열 수 있습니다. 파일을 먼저 확인하려면 TIFF 메타데이터 뷰어에서 열고 Compression 항목을 보세요.

라벨 이미지와 환자 데이터

라벨 이미지는 유리 슬라이드에 붙은 종이 라벨의 사진이며, 바코드, 증례 번호 또는 환자 이름이 보일 수 있습니다. 여기서 보는 것은 내 컴퓨터 안에서만 이루어지지만, 파일을 공유하면 그렇지 않습니다. 슬라이드를 기관 외부로 보내기 전에 라벨과 환자 데이터를 제거하는 방법을 참고하세요.

열 수 없는 파일

• JPEG 2000 SVS(Aperio 압축 33003/33005), JPEG XR, JPEG XL은 WebAssembly 없이 브라우저에서 디코딩할 수 없으며, 이 페이지는 WebAssembly를 불러오지 않습니다.
• TIFF 기반이 아닌 형식: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR, DICOM은 데스크톱 리더가 필요합니다. NDPI는 TIFF와 비슷하지만 각 레벨을 하나의 거대한 JPEG로 저장하므로 브라우저 탭에서 다루기에는 너무 큽니다.
• 여러 시리즈가 있는 OME-TIFF는 첫 번째 시리즈를 표시합니다.
• 측정, 주석, 분석 기능은 없습니다. 뷰어입니다.

이러한 형식을 열거나 내 이미지에서 측정, 주석, 세포 계수를 하려면 SlideScope가 Windows와 Mac에서 34가지 현미경 및 슬라이드 스캐너 형식을 엽니다. 같은 팀이 만든 데스크톱 현미경 앱 SlideScope는 무료 샘플 라이브러리(모든 도구 포함)가 있는 유료 앱이며, 내 이미지를 열려면 구독이 필요합니다. 무료 대안: Fiji(Bio-Formats)와 QuPath.

업로드 없이 파일을 여는 방법

파일을 선택하면 브라우저가 디스크에 있는 그 파일의 핸들을 이 페이지에 넘겨줍니다. 페이지는 필요한 바이트만 읽습니다. 먼저 TIFF 디렉터리를 읽고, 이어서 화면에 보이는 이미지 영역의 타일을 읽어, 오픈 소스 TIFF 리더(geotiff)로 페이지 안에서 디코딩합니다. 서버로 전송되는 것이 없으므로 미발표 데이터와 환자 라벨이 있는 슬라이드도 내 컴퓨터에 남고, 수 기가바이트 슬라이드도 어디에도 복사되지 않기 때문에 몇 초 만에 열립니다. 탭을 닫으면 파일은 페이지에서 사라집니다.

이 페이지는 slidescope.science에서 자체 스크립트와 개인정보를 존중하는 사이트 페이지 조회 카운터를 불러오며, 어느 쪽도 이미지를 보지 않습니다. 오픈 소스 라이선스: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

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