SVS dosyasının içinde neler var?
SVS dosyası, birkaç görüntü içeren bir TIFF’tir: tam çözünürlüklü tarama (karolara bölünmüş, genellikle JPEG ile sıkıştırılmış), bir küçük resim, iki veya üç düşük çözünürlüklü düzey, slayt etiketinin bir fotoğrafı ve camın tamamını gösteren düşük büyütmeli bir makro görüntüsü. İlk görüntünün açıklaması, MPP (piksel başına mikrometre; 40× taramada yaklaşık 0,25, 20× taramada 0,5) ve AppMag dahil tarama ayrıntılarını içerir. Görüntüleyici bunların hepsini okur: piramit yakınlaştırmayı, MPP ölçek çubuğunu belirler; etiket ve makro ise görüntünün yanındaki düğmelerle açılır.
JPEG 2000 SVS dosyaları
Bazı Aperio tarayıcılar slaytları JPEG 2000 ile sıkıştırır (TIFF sıkıştırması 33003 veya 33005). Tarayıcılar JPEG 2000’i WebAssembly olmadan çözemez; bu nedenle bu sayfa boş bir görüntü göstermek yerine bunu size bildirir. Aperio ImageScope (Windows), QuPath ve SlideScope bu dosyaları açar. Bir dosyayı önceden kontrol etmek için TIFF meta veri görüntüleyicide açın ve Compression alanına bakın.
Etiket görüntüsü ve hasta verileri
Etiket görüntüsü, camın üzerindeki kâğıt etiketin bir fotoğrafıdır ve barkod, vaka numarası veya hasta adı gösterebilir. Burada görüntülemek onu bilgisayarınızda tutar; dosyayı paylaşmak ise tutmaz. Bir slaytı kurumunuzun dışına göndermeden önce etiketlerin ve hasta verilerinin nasıl kaldırılacağına bakın.
Neleri açmaz?
- JPEG 2000 SVS (Aperio sıkıştırması 33003/33005), JPEG XR ve JPEG XL, WebAssembly olmadan tarayıcıda çözülemez; bu sayfa WebAssembly yüklemez.
- TIFF tabanlı olmayanlar: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR ve DICOM bir masaüstü okuyucu gerektirir. NDPI TIFF benzeridir ancak her düzeyi tek bir dev JPEG olarak saklar; bu, bir tarayıcı sekmesi için fazla büyüktür.
- Birden fazla seri içeren OME-TIFF dosyalarında ilk seri gösterilir.
- Ölçüm, açıklama veya analiz yoktur: bu bir görüntüleyicidir.
Bu biçimler için ve kendi görüntüleriniz üzerinde ölçüm, açıklama ve hücre sayımı için SlideScope, Windows ve Mac’te 34 mikroskop ve slayt tarayıcı biçimini açar. Aynı ekibin geliştirdiği masaüstü mikroskopi uygulaması SlideScope, ücretsiz bir örnek kitaplığı (tüm araçlarla) ve kendi görüntüleriniz için abonelik sunan ücretli bir uygulamadır. Ücretsiz alternatifler: Fiji (Bio-Formats) ve QuPath.
Bir dosyayı yüklemeden nasıl açar?
Bir dosya seçtiğinizde tarayıcı, bu sayfaya diskinizdeki dosyaya erişim tanıtıcısı verir. Sayfa yalnızca ihtiyaç duyduğu baytları okur: önce TIFF dizinini, ardından görüntünün ekrandaki kısmına ait karoları; bunları da sayfa içinde açık kaynaklı bir TIFF okuyucuyla (geotiff) çözer. Sunucuya hiçbir şey gönderilmez; bu sayede yayımlanmamış veriler ve hasta etiketli slaytlar bilgisayarınızda kalır ve çok gigabaytlık slaytlar hiçbir yere kopyalanmadıkları için saniyeler içinde açılır. Sekmeyi kapattığınızda dosya sayfadan gider.
Sayfa kendi betiklerini slidescope.science’tan ve sitenin gizliliğe saygılı sayfa görüntüleme sayacından yükler; ikisi de görüntünüzü asla görmez. Açık kaynak lisansları: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Sorular
SVS dosyasını çevrim içi nasıl açabilirim?
Bu sayfada açın: tarayıcı slaytı diskinizden okur ve yakınlaştırma, küçük resim, etiket ve makro ile tarama ayrıntılarıyla birlikte gösterir. Hiçbir şey yüklenmez.
SVS dosyam neden açılmıyor?
Büyük olasılıkla JPEG 2000 ile sıkıştırılmıştır (sıkıştırma 33003 veya 33005) ve tarayıcılar bunu çözemez. Bunun yerine Aperio ImageScope, QuPath veya SlideScope’ta açın.
Ne kadar büyük bir SVS dosyasını açabilir?
Tarayıcının adresleyebildiği her boyutu: yalnızca ekrandaki karolar okunur, bu nedenle 3 GB’lık bir slayt küçük bir slayt kadar hızlı açılır.
Slayt etiketini gösteriyor mu?
Evet, ayrı bir görüntü olarak. Etiketlerin hasta bilgisi taşıyabileceğini unutmayın.
Bu SVS görüntüleyici ücretsiz mi?
Evet, ücretsizdir ve hesap gerektirmez. Aynı ekibin geliştirdiği masaüstü mikroskopi uygulaması SlideScope ise ücretsiz bir örnek kitaplığı (tüm araçlarla) ve kendi görüntüleriniz için abonelik sunan ücretli bir uygulamadır.
Bir tarayıcının yapabileceğinden fazlası mı gerekiyor?
SlideScope, aralarında CZI, ND2, LIF, MRXS ve JPEG 2000 SVS’nin de bulunduğu 34 mikroskop ve slayt tarayıcı biçimini Windows ve Mac’te; ölçüm, açıklamalar, hücre sayımı ve tam çözünürlüklü OME-TIFF dışa aktarımıyla açar. Tüm araçları yerleşik örneklerde ücretsiz deneyin; kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Kararınızı verdiniz mi? Hemen abone olun.