相容性參考

SlideScope 的顯微影像檔案相容性

SlideScope 為 CZI、ND2、SVS、TIFF 與 DICOM 系列以及廠商全玻片格式提供專屬的桌面讀取器；自 1.10.0 版起，也能開啟 Olympus/Evident VSI、OIB 與 OIR、Zeiss ZVI 與 LSM、Leica LOF 與 XLEF、DeltaVision、MetaMorph、Hamamatsu NDPIS、OME-Zarr 以及日常影像檔案；自 1.20.0 版起，則能開啟 Philips iSyntax、KFBio KFB、ICS/IDS、Gatan DM3/DM4 與 Olympus SIS。本頁將「接受某個副檔名」與決定特定檔案是否適用的維度、中繼資料、壓縮及工作流程細節區分開來說明。

想看實測結果而不只是宣稱？我們開啟了 792 個真實的顯微影像與全玻片檔案，並公開了每一項結果，包括失敗的案例。

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逐一列出各格式的限制 Windows 與 macOS 最後審閱：2026 年 10 月 16 日

目前的相容性矩陣

此矩陣依據目前 SlideScope 應用程式的格式導向與讀取器行為整理而成。請將它當作初步篩選的參考，再用您團隊實際使用的顯微鏡、掃描器、軟體版本與壓縮設定所產生的代表性檔案進行測試。

格式系列 接受的副檔名 讀取器行為 重要檢查項目
ZEISS CZI .czi 將時間、Z、通道、Y 與 X 維度標準化；在檔案提供時讀取擷取中繼資料與空間校正。共用相同像素類型與軸的場景會成為可逐一切換的獨立場景，各自保有原本大小，XY Overview 則可將它們一併顯示。可將畫面上的場景或所有場景匯出為 OME-TIFF。 請測試場景、拼接影像、不常見的子區塊配置與超大型擷取資料。
Nikon ND2 .nd2 對應時間、Z、通道與影像大小。多個載台位置會成為獨立的位置軸，並有專屬的控制項，XY Overview 則依其記錄的載台座標排列它們。 請確認位置／時間的解讀、RGB 配置、中繼資料，以及確切的 NIS-Elements 世代。
Aperio SVS .svs 讀取以 TIFF 為基礎的全玻片金字塔層級，並在記憶體限制下選擇可處理的顯示層級。 請檢查 JPEG/JPEG 2000 編解碼器、金字塔完整性、掃描器中繼資料，以及所需的解析度層級。
TIFF 與 OME-TIFF .tif, .tiff 在可取得時使用具名的軸，包括時間、Z、通道、Y 與 X。可辨識 OME-TIFF 與 ImageJ 中繼資料，以及存在時的空間比例。一般多頁 TIFF 的每一頁都可以瀏覽。 TIFF 是一種彈性很高的容器格式。請確認壓縮方式、BigTIFF 大小、金字塔、軸，以及中繼資料是否完整保留。
廠商掃描器玻片 .ndpi、.mrxs、.scn、.bif、.vms、.vmu、.svslide、.qptiff、.avs 透過 OpenSlide 後端讀取掃描器本身的影像金字塔，並載入與畫面區域相符的層級。比例尺、量測與標註在每個縮放層級都使用掃描器的微米校正。自 1.10.0 版起，以 JPEG XR 壓縮的 NDPI 玻片可以開啟，OpenSlide 無法讀取的 Leica SCN 與 Ventana BIF 玻片也能開啟。自 1.20.0 版起，在 NDP.view 中繪製的標註（.ndpi 旁的 .ndpa 檔案）會顯示在玻片上，並可複製到您的量測中。 MRXS、VMS 與 VMU 將像素資料存放在索引檔旁的伴隨資料夾中，因此只能從本機儲存空間開啟，且無法透過遠端連結開啟。對於 OpenSlide 無法讀取的 BIF 玻片，圖塊接縫目前尚未拼接。請在代表性玻片上檢查金字塔完整性與廠商中繼資料。
Hamamatsu NDPIS（自 1.10.0 版起） .ndpis 開啟 Hamamatsu 螢光影像組，保留其真實的通道名稱與顏色，並依掃描器的校正以 µm 進行量測。 請在一組代表性影像上，對照掃描器軟體確認通道名稱、顏色與校正。
Olympus/Evident VSI（自 1.10.0 版起） .vsi 開啟 cellSens 全玻片與螢光影像，包括含有多個掃描區域的玻片。每個掃描區域都以其各自的像素尺寸量測，Details 面板會顯示所記錄的中繼資料，例如物鏡、真實的通道名稱與顏色，以及擷取日期。 請測試您團隊所用 cellSens 版本產生的多區域玻片與螢光掃描影像。
Olympus FluoView（自 1.10.0 版起） .oib、.oif、.oir 開啟 FluoView 共軛焦檔案，保留真實的通道名稱與顏色、以 µm 表示的焦平面，以及以實際秒數表示的時間點。Details 面板會顯示所記錄的設定，例如物鏡、雷射、偵測器與增益，以及針孔。 請在一筆代表性擷取資料上，對照 FluoView 確認通道、Z 與時間的解讀。
Zeiss ZVI 與 LSM（自 1.10.0 版起） .zvi, .lsm 開啟 AxioVision ZVI 檔案，以及從 LSM 510 到 LSM 980 的 LSM 共軛焦檔案，保留真實的通道名稱與顏色，以及以 µm 表示的焦平面。Details 面板會顯示所記錄的設定，例如物鏡、曝光、雷射、偵測器與針孔。 請測試您團隊所存檔的每一代 AxioVision 或 ZEN 產生的檔案。
Leica LIF、LOF 與 XLEF .lif、.lof、.xlef、.xlif、.xlcf 開啟 LAS X 檔案；自 1.10.0 版起可開啟 LOF 檔案，以及包含 XLIF 與 XLCF 部分的 XLEF 專案，LIF 支援也在同一版本中進一步強化。拼接掃描與多位置擷取會以位置的形式開啟，您可以逐一切換，或在 XY Overview 中依其記錄的載台座標一併檢視。 請讓 XLEF 專案所參照的檔案保持在一起，並在一筆代表性拼接掃描上檢查載台位置。
DeltaVision（自 1.10.0 版起） .dv、.r3d 開啟 DeltaVision 檔案（包括經去卷積的 D3D 影像），保留通道、以 µm 表示的焦平面，以及以秒表示的時間點。Details 面板會顯示所記錄的設定，例如物鏡、曝光與濾鏡。 如果後續流程同時使用原始檔與去卷積檔，請比較同一筆擷取資料的兩種檔案。
MetaMorph（自 1.10.0 版起） .stk、.nd、MetaSeries .tif 開啟 STK 堆疊、MetaSeries TIFF 檔案，以及多維擷取的 .nd 組合。一個 .nd 組合會以單一影像開啟：其波長成為通道，時間點成為時間序列，載台位置則可逐一切換，或在 XY Overview 中一併檢視。 請將 .nd 組合所列出的 TIFF 或 STK 檔案放在它旁邊。
OME-Zarr（自 1.10.0 版起） .zarr 資料夾 開啟 OME-NGFF 0.4 與 0.5 影像，包括含有每個孔與視野的 HCS 培養盤，以及附 OME-XML 中繼資料的 bioformats2raw 輸出。培養盤的孔可逐一切換，或在 XY Overview 中一併檢視。 僅限本機資料夾：OME-Zarr 無法從遠端 https 連結開啟。
日常影像（自 1.10.0 版起） .png、.jpg、.jpeg、.jpe、.jfif、.jp2、.j2k、.bmp、.gif、.webp 在與顯微影像檔案相同的檢視器中開啟 PNG、JPEG、JPEG 2000、BMP、GIF 與 WebP 影像。 在依賴以 µm 表示的量測之前，請確認檔案是否記錄了校正資訊。
Philips iSyntax（自 1.20.0 版起） .isyntax 開啟 Philips iSyntax 全玻片掃描影像，包含其金字塔、像素尺寸、標籤與巨觀影像。SlideScope 顯示的是解碼後的像素：不會套用 Philips 自家的銳利化、對比增強與色彩設定檔，Details 面板也會註明這一點。 如果確切的外觀很重要，請將代表性玻片與 Philips 檢視器比較。損壞或不完整的檔案會被拒絕，而不會只開啟一部分。
KFBio KFB（自 1.20.0 版起） .kfb 開啟 KFBio 明視野全玻片掃描影像，包含其金字塔與像素尺寸。損壞的圖塊會以下一個較低解析度的層級繪製，SlideScope 也會註明這一點。 KFBF 螢光玻片無法開啟。掃描器未成像的區域會顯示為白色。
ICS/IDS（自 1.20.0 版起） .ics、.ids 開啟 Image Cytometry Standard 影像，例如 SVI Huygens 與 DIPlib 的輸出：版本 1 的 .ics/.ids 檔案組，以及版本 2 的單一檔案（包括 gzip 壓縮的資料），並保留其比例與軸。像素與 Bio-Formats 一致，包括其對 Huygens 檔案的方向處理。 請將 .ids 檔案放在其 .ics 標頭檔旁。行事曆用的 .ics 檔案會被辨識出來，不會被當作影像開啟。
Gatan DM3 與 DM4（自 1.20.0 版起） .dm3, .dm4 開啟 Gatan Digital Micrograph 影像，包含其校正與顯微鏡中繼資料。EELS 與 EDS 能譜影像可透過 Energy 滑桿逐一切換能量，繞射圖樣與 FFT 則會顯示以 nm⁻¹ 為單位的倒空間比例尺，而非量測功能。 1D 能譜與 4D-STEM 資料集無法開啟。
Olympus SIS（自 1.20.0 版起） .sis、帶有 SIS 標記的 .tif 開啟 Olympus analySIS 影像，包含其像素尺寸與所記錄的中繼資料。 .sis 也是 Symbian 安裝檔的副檔名，因此只有真正是 TIFF 影像的檔案才會開啟。
標準 DICOM .dcm、.dicom 處理標準的單幀與多幀資料集，對應時間、Z、通道、幀與選定的中繼資料。圖塊式全玻片 DICOM 則透過另一條具備原生圖塊存取的金字塔路徑讀取。 請確認傳輸語法／編解碼器、SOP 類別、去識別化政策與研究用途要求。

各格式細節與權威參考資料

CZI：多維審閱，但不代表獲得 ZEISS 認證

CZI 可以包含多個場景、通道、Z 平面、時間點、擷取中繼資料與圖塊式子區塊。SlideScope 會讀取常用的審閱維度與中繼資料，並可逐一切換檔案中的場景，或在 XY Overview 中一併顯示。像素類型或軸與第一個場景不同的場景無法切換：此時會顯示第一個場景，並附上說明原因的提示。匯出功能會寫出採用無損壓縮、包含像素尺寸與通道名稱的 OME-TIFF；從 XY Overview 匯出時，每個場景會以獨立影像的形式放入同一個檔案，大型拼接掃描則以其全覽解析度匯出。每個匯出的場景都保留其擷取時的像素尺寸（已在 SlideScope 1.8.57 中修正；較早的版本可能會對大小不同的非拼接場景給出錯誤的校正）。CZI 系列涵蓋範圍很廣，因此實際用檔案測試很重要；多場景 CZI 指南會一步步示範場景與匯出。ZEISS 在官方 CZI 影像檔案格式頁面上說明了此格式及其應用生態系。該參考資料定義的是來源格式，並不代表對 SlideScope 的背書或認證。

ND2：時間、Z、通道與位置

SlideScope 會將 ND2 的主要軸對應到其檢視器的維度模型。自 1.8.41 版起，多位置擷取會將其位置保留在獨立的軸上，而不是併入時間軸，XY Overview 也會依記錄的載台座標放置每個位置。載台方向僅在有限的儀器上經過驗證，因此在團隊將其標準化之前，請先檢查一筆代表性的多位置實驗。Nikon 官方的 NIS-Elements 軟體資源說明了 Nikon 自家生態系中的免費獨立檢視器、多維資料集檢視與 TIFF 匯出。

SVS：全玻片金字塔與壓縮

SVS 檔案是以 TIFF 為基礎、具有金字塔層級與 Aperio 中繼資料的全玻片影像。SlideScope 會選擇能在顯示細節與可用記憶體之間取得平衡的層級。開放原始碼的 OpenSlide 專案記錄了 Aperio 格式結構，包括圖塊式影像、金字塔層級、附屬影像與中繼資料屬性。

TIFF 與 OME-TIFF：是一種容器，而非單一固定的配置

副檔名為 .tif 的檔案可能是一般的 2D 影像、RGB 影像、ImageJ 堆疊、OME-TIFF 資料集、BigTIFF，或採用不同壓縮的金字塔式影像。SlideScope 的讀取器會在存在時辨識 OME 與 ImageJ 中繼資料，但不應將每種變體視為完全相同。OME-TIFF 規格說明了 TIFF 平面與 OME-XML 中繼資料如何編碼維度與金字塔。

DICOM：標準幀與圖塊式全玻片金字塔

目前公開的 Windows 與 macOS 安裝程式支援一般的單幀與多幀 DICOM，供研究審閱使用，包括螢光 Z 堆疊與縮時擷取。帶有 VL Whole Slide Microscopy Image Storage SOP 類別的檔案會透過另一條直接使用 DICOM 金字塔與圖塊結構的全玻片路徑讀取，因此圖塊式 WSI DICOM 無需轉檔即可開啟。壓縮的傳輸語法則透過內建的 GDCM、openjpeg 與 imagecodecs 外掛程式解碼。SlideScope 並非 PACS，也不以經過驗證的診斷工作站自居。DICOM 標準委員會的 Supplement 145 定義了全玻片顯微影像物件，也有助於說明為什麼 WSI 屬於獨立的相容性類別。

1.10.0 版新增的儀器格式：Details 面板顯示的內容

SlideScope 1.10.0 新增的每種格式都可在 Windows 與 macOS 上開啟，並在 Details 面板中顯示其中繼資料。視檔案所記錄的內容而定，包括物鏡（名稱、放大倍率、數值孔徑與浸潤介質）、雷射與光源、偵測器與增益、曝光、濾鏡、針孔、真實的通道名稱與通道顏色、擷取日期、以實際秒數表示的時間點、以 µm 表示的焦平面、培養盤的孔與視野，以及已儲存的顯示範圍。拼接掃描與多位置的載台位置會以位置的形式開啟，XY Overview 則依其記錄的載台座標排列。逐步指南：VSI、OIB 與 OIR、ZVI、LSM、LOF 與 XLEF、DeltaVision、MetaMorph STK 與 ND、OME-Zarr，以及 NDPIS。

1.20.0 版新增的格式

SlideScope 1.20.0 新增了 Philips iSyntax 與 KFBio KFB 全玻片掃描影像、ICS/IDS 影像、Gatan DM3 與 DM4 電子顯微影像，以及 Olympus SIS 影像，每一種都保留其比例與所記錄的中繼資料；上方矩陣列出了每種格式能開啟與無法開啟的內容。逐步指南：iSyntax、KFB、ICS 與 IDS、DM3 與 DM4，以及 SIS。

為什麼受支援的副檔名仍可能開啟失敗

檔案不完整或被重新命名

下載不完整、複製中斷，或被改名為受支援副檔名的檔案，可能不包含有效的格式標頭或完整的像素資料。

編解碼器或壓縮變體

全玻片 TIFF、SVS 與 DICOM 檔案可能依賴 JPEG、JPEG 2000 或其他編解碼器。不常見的傳輸語法或缺少內建的編解碼器都可能導致無法解碼。

不常見的維度配置

廠商檔案可能以不同方式編碼場景、位置、照明、視角、圖塊或軸。讀取器也許能開啟檔案，但對特殊配置的對應方式可能與預期不同。

記憶體與金字塔限制

超大型影像需要有效的較低解析度層級，或足以容納所選平面的記憶體。請測試日常使用中最大的檔案，而不只是一個小範例。

實用的導入前測試

  1. 從您團隊實際使用的每一款顯微鏡或掃描器型號中挑選檔案。
  2. 包含一個小檔案、一個典型檔案、日常使用中最大的檔案，以及一個較舊的存檔檔案。
  3. 確認通道顏色、時間點、Z 平面、位置、金字塔細節與空間校正。
  4. 將關鍵中繼資料與擷取軟體或另一個可信賴的讀取器進行比較。
  5. 測試 TIFF 匯出，並確認後續工作流程預期的維度與中繼資料。
  6. 記錄應用程式版本、作業系統、硬體、來源軟體與結果。

這樣能留下實驗室日後可以審閱的證據，也比假設所有副檔名相同的檔案都一模一樣更可靠。

支援與不支援的格式

NDPI、MRXS、SCN、BIF、VMS、VMU、SVSLIDE、QPTIFF 與 AVS 掃描器玻片透過 OpenSlide 後端支援，Leica LIF 有專屬的讀取器；VSI、OIB、OIF、OIR、ZVI、LSM、LOF、XLEF、DeltaVision、MetaMorph、NDPIS、OME-Zarr 與日常影像檔案自 1.10.0 版起支援，Philips iSyntax、KFBio KFB、ICS/IDS、Gatan DM3/DM4 與 Olympus SIS 則自 1.20.0 版起支援；以上全部都列在上方的相容性矩陣中。包含受支援檔案的 .zip 也能開啟：SlideScope 會顯示其中的內容，將其解壓縮到壓縮檔旁邊並開啟。SlideScope 無法開啟 SQRAY SDPC、Motic MDSX、UNIC TMAP、Leica LEI、SlideBook SLD 或 MRC 檔案、KFBio KFBF 螢光玻片、Gatan 1D 能譜或 4D-STEM 資料集、來自遠端 https 連結的 OME-Zarr、NIfTI，或一般影片格式。請勿將這些檔案改名為受支援的副檔名。如果其中某種格式對您的工作流程很重要，請在購買前連絡客服，並告知格式名稱與擷取軟體。

對於仍開啟失敗的受支援檔案，應用程式內的客服流程可以附上非敏感的玻片脈絡資訊。除非您的組織已核准此類分享，否則請勿傳送可識別病患身分的資料或專有檔案。

相容性常見問題

SlideScope 可以開啟哪些顯微影像副檔名？

目前的 SlideScope 版本會將 .czi、.nd2、.svs、.tif、.tiff、.dcm、.dicom、.lif，以及全玻片掃描器格式 .ndpi、.mrxs、.scn、.bif、.vms、.vmu、.svslide、.qptiff 與 .avs 導向專屬的讀取器。自 1.10.0 版起，也能開啟 .vsi、.oib、.oif、.oir、.zvi、.lsm、.lof、.xlef、.xlif、.xlcf、.dv、.r3d、.stk、.nd 與 .ndpis 檔案、本機儲存空間中的 OME-Zarr 資料夾，以及日常的 .png、.jpg、.jpeg、.jpe、.jfif、.jp2、.j2k、.bmp、.gif 與 .webp 影像。自 1.20.0 版起，還能開啟 Philips .isyntax 與 KFBio .kfb 玻片、.ics 與 .ids 影像、Gatan .dm3 與 .dm4 檔案，以及 Olympus .sis 影像；NDP.view 的 .ndpa 標註檔會隨其 NDPI 玻片一起開啟，玻片的 .zip 壓縮檔則會在 SlideScope 將其解壓縮到壓縮檔旁邊後開啟。相容性仍可能因廠商子格式、壓縮方式、檔案完整性與內嵌中繼資料而有所不同。

SlideScope 可以開啟 OME-TIFF 檔案嗎？

TIFF 讀取器會辨識 OME-TIFF 中繼資料，並在檔案提供時對應具名的時間、Z、通道、Y 與 X 軸。請測試具代表性的壓縮、BigTIFF 與金字塔變體。

支援某個副檔名，就保證每個檔案都能開啟嗎？

不保證。損壞、傳輸不完整、不常見的編解碼器、廠商變體與不常見的維度配置，仍可能影響相容性。

SlideScope 是診斷用的 DICOM 檢視器嗎？

我們不做任何診斷用途的宣稱。SlideScope 的預期用途是研究、教學與審閱工作流程；臨床使用需要機構自行進行驗證與法規評估。

測試您團隊實際使用的檔案

安裝正確的 Windows 或 Mac 版本，然後驗證具代表性的 CZI、ND2、SVS、TIFF 與 DICOM 資料集。

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