मौजूदा संगतता मैट्रिक्स
यह मैट्रिक्स SlideScope ऐप्लिकेशन की मौजूदा रूटिंग और रीडर के व्यवहार से बना है। इसे शुरुआती जाँच के संदर्भ के रूप में इस्तेमाल करें, फिर अपनी टीम द्वारा इस्तेमाल किए जाने वाले ठीक उसी माइक्रोस्कोप, स्कैनर, सॉफ़्टवेयर संस्करण और कंप्रेशन सेटिंग्स की प्रतिनिधि फ़ाइलें परखें।
| फ़ॉर्मैट परिवार | स्वीकार किए गए एक्सटेंशन | रीडर का व्यवहार | महत्वपूर्ण जाँचें |
|---|---|---|---|
| ZEISS CZI | .czi |
time, Z, channel, Y और X डायमेंशन को सामान्य रूप देता है; उपलब्ध होने पर अधिग्रहण मेटाडेटा और स्थानिक कैलिब्रेशन पढ़ता है। एक जैसे पिक्सेल टाइप और ऐक्सिस वाले सीन अलग-अलग, क्रम से देखे जा सकने वाले सीन बन जाते हैं, हर एक अपने आकार में, और XY Overview उन्हें एक साथ दिखाता है। स्क्रीन पर दिख रहे सीन को, या हर सीन को, OME-TIFF में एक्सपोर्ट करता है। | सीन, मोज़ेक, असामान्य सब-ब्लॉक लेआउट और बहुत बड़े अधिग्रहण परखें। |
| Nikon ND2 | .nd2 |
time, Z, channels और इमेज आकार को मैप करता है। कई स्टेज पोज़िशन अपने कंट्रोल वाले अलग position ऐक्सिस होते हैं, और XY Overview उन्हें उनके दर्ज स्टेज निर्देशांकों पर रखता है। | position/time की व्याख्या, RGB लेआउट, मेटाडेटा और ठीक-ठीक NIS-Elements पीढ़ी की पुष्टि करें। |
| Aperio SVS | .svs |
TIFF-आधारित होल स्लाइड पिरामिड लेवल पढ़ता है और मेमोरी की सीमाओं के भीतर संभालने योग्य डिस्प्ले लेवल चुनता है। | JPEG/JPEG 2000 कोडेक, पिरामिड की अखंडता, स्कैनर मेटाडेटा और वांछित रिज़ॉल्यूशन लेवल जाँचें। |
| TIFF और OME-TIFF | .tif, .tiff |
जहाँ उपलब्ध हों, नामित ऐक्सिस इस्तेमाल करता है, जिनमें time, Z, channel, Y और X शामिल हैं। मौजूद होने पर OME-TIFF और ImageJ मेटाडेटा और स्थानिक स्केल पहचानता है। साधारण मल्टी-पेज TIFF का हर पेज खोला जा सकता है। | TIFF एक लचीला कंटेनर है। कंप्रेशन, BigTIFF आकार, पिरामिड, ऐक्सिस और मेटाडेटा का संरक्षण जाँचें। |
| वेंडर स्कैनर स्लाइड | .ndpi, .mrxs, .scn, .bif, .vms, .vmu, .svslide, .qptiff, .avs |
OpenSlide बैकएंड के ज़रिए स्कैनर का अपना इमेज पिरामिड पढ़ता है और स्क्रीन पर दिख रहे क्षेत्र से मेल खाता लेवल लोड करता है। स्केल बार, माप और एनोटेशन हर ज़ूम लेवल पर स्कैनर के माइक्रॉन कैलिब्रेशन का उपयोग करते हैं। 1.10.0 से JPEG XR से कंप्रेस्ड NDPI स्लाइड खुलती हैं, और वे Leica SCN और Ventana BIF स्लाइड भी खुलती हैं जिन्हें OpenSlide नहीं पढ़ सकता। 1.20.0 से NDP.view में बनाए गए एनोटेशन (.ndpi के बगल में रखी .ndpa फ़ाइल) स्लाइड के ऊपर दिखते हैं और आपके माप में कॉपी किए जा सकते हैं। |
MRXS, VMS और VMU पिक्सेल डेटा को इंडेक्स फ़ाइल के बगल में एक साथी फ़ोल्डर में रखते हैं, इसलिए ये केवल लोकल स्टोरेज से खुलते हैं और रिमोट लिंक के लिए अस्वीकार कर दिए जाते हैं। जिन BIF स्लाइड को OpenSlide नहीं पढ़ सकता, उनमें टाइलों के जोड़ अभी स्टिच नहीं किए जाते। प्रतिनिधि स्लाइड पर पिरामिड की अखंडता और वेंडर मेटाडेटा जाँचें। |
| Hamamatsu NDPIS (1.10.0 से) | .ndpis |
Hamamatsu फ़्लोरेसेंस सेट उनके असली चैनल नामों और रंगों के साथ खोलता है, और माप स्कैनर के कैलिब्रेशन से µm में होते हैं। | किसी प्रतिनिधि सेट पर चैनल नाम, रंग और कैलिब्रेशन की स्कैनर सॉफ़्टवेयर से पुष्टि करें। |
| Olympus/Evident VSI (1.10.0 से) | .vsi |
cellSens की होल स्लाइड और फ़्लोरेसेंस इमेज खोलता है, जिनमें कई स्कैन क्षेत्रों वाली स्लाइड भी शामिल हैं। हर स्कैन क्षेत्र अपने पिक्सेल आकार पर मापा जाता है, और Details पैनल दर्ज मेटाडेटा दिखाता है, जैसे ऑब्जेक्टिव, असली चैनल नाम और रंग, और अधिग्रहण की तारीख़। | आपकी टीम जिस cellSens संस्करण का उपयोग करती है, उसकी कई-क्षेत्र वाली स्लाइड और फ़्लोरेसेंस स्कैन परखें। |
| Olympus FluoView (1.10.0 से) | .oib, .oif, .oir |
FluoView कॉन्फ़ोकल फ़ाइलें असली चैनल नामों और रंगों, µm में फ़ोकल प्लेन, और असली सेकंड में टाइम पॉइंट के साथ खोलता है। Details पैनल दर्ज सेटिंग्स दिखाता है, जैसे ऑब्जेक्टिव, लेज़र, डिटेक्टर और गेन, और पिनहोल। | किसी प्रतिनिधि अधिग्रहण पर चैनल, Z और time की व्याख्या की FluoView से पुष्टि करें। |
| Zeiss ZVI और LSM (1.10.0 से) | .zvi, .lsm |
AxioVision ZVI फ़ाइलें और LSM 510 से LSM 980 तक की LSM कॉन्फ़ोकल फ़ाइलें असली चैनल नामों और रंगों तथा µm में फ़ोकल प्लेन के साथ खोलता है। Details पैनल दर्ज सेटिंग्स दिखाता है, जैसे ऑब्जेक्टिव, एक्सपोज़र, लेज़र, डिटेक्टर और पिनहोल। | आपकी टीम जिस भी AxioVision या ZEN पीढ़ी की फ़ाइलें संग्रहित करती है, हर एक की फ़ाइलें परखें। |
| Leica LIF, LOF और XLEF | .lif, .lof, .xlef, .xlif, .xlcf |
LAS X फ़ाइलें खोलता है; LOF फ़ाइलें और अपने XLIF और XLCF हिस्सों वाले XLEF प्रोजेक्ट 1.10.0 से खुलते हैं, और उसी रिलीज़ में LIF सपोर्ट को और गहरा किया गया। टाइल स्कैन और मल्टी-पोज़िशन अधिग्रहण ऐसी पोज़िशन के रूप में खुलते हैं जिन्हें आप एक-एक करके देख सकते हैं या XY Overview में एक साथ देख सकते हैं, उनके दर्ज स्टेज निर्देशांकों पर रखी हुई। | XLEF प्रोजेक्ट की संदर्भित फ़ाइलें साथ रखें, और किसी प्रतिनिधि टाइल स्कैन पर स्टेज प्लेसमेंट जाँचें। |
| DeltaVision (1.10.0 से) | .dv, .r3d |
DeltaVision फ़ाइलें खोलता है, जिनमें डीकन्वॉल्व की गई D3D इमेज भी शामिल हैं, चैनल, µm में फ़ोकल प्लेन और सेकंड में टाइम पॉइंट के साथ। Details पैनल दर्ज सेटिंग्स दिखाता है, जैसे ऑब्जेक्टिव, एक्सपोज़र और फ़िल्टर। | अगर आगे के काम में रॉ और डीकन्वॉल्व की गई दोनों फ़ाइलें इस्तेमाल होती हैं, तो उसी अधिग्रहण की दोनों की तुलना करें। |
| MetaMorph (1.10.0 से) | .stk, .nd, MetaSeries .tif |
STK स्टैक, MetaSeries TIFF फ़ाइलें और मल्टी-डायमेंशनल अधिग्रहण वाले .nd सेट खोलता है। एक .nd सेट एक ही इमेज के रूप में खुलता है: उसकी वेवलेंथ चैनल बन जाती हैं, उसके टाइम पॉइंट एक टाइम सीरीज़, और उसकी स्टेज पोज़िशन एक-एक करके या XY Overview में एक साथ देखी जा सकती हैं। |
.nd सेट जिन TIFF या STK फ़ाइलों को सूचीबद्ध करता है, उन्हें उसके बगल में ही रखें। |
| OME-Zarr (1.10.0 से) | .zarr फ़ोल्डर |
OME-NGFF 0.4 और 0.5 इमेज खोलता है, जिनमें हर वेल और फ़ील्ड वाली HCS प्लेट, और अपने OME-XML मेटाडेटा वाला bioformats2raw आउटपुट भी शामिल हैं। प्लेट के वेल एक-एक करके या XY Overview में एक साथ देखे जा सकते हैं। | केवल लोकल फ़ोल्डर: OME-Zarr को रिमोट https लिंक से नहीं खोला जा सकता। |
| रोज़मर्रा की इमेज (1.10.0 से) | .png, .jpg, .jpeg, .jpe, .jfif, .jp2, .j2k, .bmp, .gif, .webp |
PNG, JPEG, JPEG 2000, BMP, GIF और WebP इमेज उसी व्यूअर में खोलता है जिसमें माइक्रोस्कोपी फ़ाइलें। | µm में माप पर भरोसा करने से पहले जाँचें कि फ़ाइल में कैलिब्रेशन दर्ज है या नहीं। |
| Philips iSyntax (1.20.0 से) | .isyntax |
Philips iSyntax होल स्लाइड स्कैन उनके पिरामिड, पिक्सेल आकार, लेबल और मैक्रो इमेज के साथ खोलता है। SlideScope डिकोड किए गए पिक्सेल दिखाता है: Philips की अपनी शार्पनिंग, कंट्रास्ट एन्हांसमेंट और कलर प्रोफ़ाइल लागू नहीं होते, और Details पैनल यह बताता है। | अगर सटीक रूप-रंग मायने रखता है, तो किसी प्रतिनिधि स्लाइड की तुलना Philips व्यूअर से करें। क्षतिग्रस्त या अधूरी (truncated) फ़ाइल आंशिक रूप से खोलने के बजाय अस्वीकार कर दी जाती है। |
| KFBio KFB (1.20.0 से) | .kfb |
KFBio ब्राइटफ़ील्ड होल स्लाइड स्कैन उनके पिरामिड और पिक्सेल आकार के साथ खोलता है। क्षतिग्रस्त टाइल अगले मोटे (coarser) लेवल से बनाई जाती है, और SlideScope यह बताता है। | KFBF फ़्लोरेसेंस स्लाइड नहीं खुलतीं। जिन क्षेत्रों को स्कैनर ने इमेज नहीं किया, वे सफ़ेद दिखते हैं। |
| ICS/IDS (1.20.0 से) | .ics, .ids |
Image Cytometry Standard इमेज खोलता है, जैसे SVI Huygens और DIPlib का आउटपुट: संस्करण 1 के .ics/.ids जोड़े और संस्करण 2 की एकल फ़ाइलें, gzip से कंप्रेस्ड डेटा सहित, उनके स्केल और ऐक्सिस के साथ। पिक्सेल Bio-Formats से मेल खाते हैं, Huygens फ़ाइलों के लिए उसके ओरिएंटेशन सहित। |
.ids फ़ाइल को उसके .ics हेडर के बगल में रखें। कैलेंडर वाली .ics फ़ाइल पहचान ली जाती है और इमेज के रूप में नहीं खोली जाती। |
| Gatan DM3 और DM4 (1.20.0 से) | .dm3, .dm4 |
Gatan Digital Micrograph इमेज उनके कैलिब्रेशन और माइक्रोस्कोप मेटाडेटा के साथ खोलता है। EELS और EDS स्पेक्ट्रम इमेज में Energy स्लाइडर से ऊर्जा के अनुसार आगे बढ़ा जाता है, और डिफ़्रैक्शन पैटर्न और FFT को माप के बजाय nm⁻¹ में रेसिप्रोकल स्केल बार मिलता है। | 1D स्पेक्ट्रा और 4D-STEM डेटासेट नहीं खुलते। |
| Olympus SIS (1.20.0 से) | .sis, SIS-टैग वाली .tif |
Olympus analySIS इमेज उनके पिक्सेल आकार और दर्ज मेटाडेटा के साथ खोलता है। | .sis एक Symbian इंस्टॉलर एक्सटेंशन भी है, इसलिए केवल वही फ़ाइलें खुलती हैं जो वास्तव में TIFF इमेज हैं। |
| मानक DICOM | .dcm, .dicom |
मानक सिंगल- और मल्टी-फ़्रेम डेटासेट संभालता है, time, Z, channels, frames और चुने हुए मेटाडेटा को मैप करते हुए। टाइल्ड होल स्लाइड DICOM को नेटिव टाइल एक्सेस वाले एक अलग पिरामिड पाथ से पढ़ा जाता है। | ट्रांसफ़र सिंटैक्स/कोडेक, SOP क्लास, डी-आइडेंटिफ़िकेशन नीति और रिसर्च-उपयोग की आवश्यकताओं की पुष्टि करें। |