Ask Your Slide · ab SlideScope 1.23.0

Zellen zählen und IHC scoren: Fragen Sie einfach Ihr Präparat

Stellen Sie eine Frage zum geöffneten Bild, etwa „Wie viel Prozent der Zellkerne sind in dieser Region Ki67-positiv?“ Ein KI-Assistent plant die Schritte, und SlideScope führt seine eigenen Werkzeuge zum Zählen, für das IHC-Scoring und zum Messen auf Ihrem Computer aus. Jede Zahl in der Antwort stammt aus einem dieser Werkzeuge, mit Belegen zur Überprüfung und einer Schaltfläche, die die Schritte ohne KI erneut ausführt. Nur für Forschungszwecke.

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Jede Zahl aus einem lokalen Werkzeug Modus „No images“: Das Bild bleibt auf Ihrem Computer Belege, erneute Ausführung und Export

So funktioniert Ask Your Slide

Öffnen Sie das Bild in SlideScope unter Windows oder macOS: ein ganzes Präparat, einen konfokalen Stapel, ein Fluoreszenzbild oder eine Datei in einem der anderen Formate, die SlideScope öffnet.
Fragen Sie in Alltagssprache. Wenn es um einen bestimmten Bereich geht, zeichnen Sie zuerst eine Region ein oder zoomen Sie auf das Feld. Antworten gibt es in 14 Sprachen.
Die KI plant, lokale Werkzeuge erledigen die Arbeit. Der Assistent wählt die Schritte (Zellkerne zählen, DAB scoren, eine Region messen, Hotspots finden), und SlideScope führt jeden davon auf Ihrem Computer aus. Sie verfolgen jede Aktion auf dem Bild, und jede lässt sich rückgängig machen.
Lesen Sie die Antwort mit ihren Belegen. Die Antwort verweist mit [R1], [R2] usw. auf die genauen Ansichten, die sie verwendet hat; ein Klick darauf führt Sie zu dieser Ansicht zurück. Die Belege führen jeden Schritt mit Fläche in Pixeln, Ebene, Parametern und Ergebnissen auf, und die Antwort zeigt, was gesendet wurde.
Prüfen, erneut ausführen und exportieren. Re-run without AI berechnet dieselben Schritte lokal neu und prüft, ob die Zahlen identisch sind. Exportieren Sie die Antwort, das Analyseprotokoll und einen Absatz für den Methodenteil, oder erstellen Sie eine Abbildung mit Maßstabsbalken.

Sehen Sie sich eine 62-sekündige Demo an, aufgenommen in SlideScope 1.23 mit öffentlichen Beispielbildern (EPFL BrdU IHC, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). Ohne Ton.

Fragen, die Sie stellen können, und die Werkzeuge, die sie beantworten

Ask Your Slide arbeitet mit den eigenen Werkzeugen von SlideScope: Zählen von Zellkernen, Zellen oder Partikeln (Deep-Learning-Segmentierung mit InstanSeg oder ein klassisches Verfahren), IHC-Scoring für DAB, Regionsstatistiken, kalibrierte Messungen, Statistiken zur Kanalsättigung, eine Hotspot-Suche, Regionsumrisse, Notizen und Ansichtssteuerung. Einige Beispiele:

Ihre Frage	Werkzeuge, die SlideScope ausführt	Was Sie erhalten
„Wie viel Prozent der Zellkerne sind in dieser Region Ki67-positiv?“	Zellkerne zählen (InstanSeg), dann IHC-Scoring für DAB	Positivanteil mit der Zahl der gezählten Zellkerne und Umrissen auf dem Bild
„Wie hoch sind H-Score und Allred-Score in dem Bereich, den ich umrandet habe?“	Zellkerne zählen, IHC-Scoring mit QuPath-kompatiblen Definitionen	H-Score, Allred-Score und Positivanteil für diese Region
„Finde die drei dichtesten Bereiche und bestimme jeweils den Ki67-Anteil.“	Hotspot-Suche, Regionen umranden, Zählen und Scoring pro Region	Drei umrandete Hotspots, jeweils mit Dichte pro mm², einem z-Score und einem Ki67-Anteil in Prozent
„Wie viele Zellen sind in diesem Feld, und wie groß sind sie?“	Zellen zählen (InstanSeg oder klassisch)	Eine Anzahl und Objektflächen, exportierbar als CSV und GeoJSON
„Vergleiche die DAPI-Dichte in diesen beiden Regionen.“	Regionsstatistiken und Zellkernzählungen für jede Region	Fläche, Anzahl und Dichte pro mm² nebeneinander
„Welcher Kanal ist hier am hellsten, und ist etwas gesättigt?“	Regionsstatistiken, Statistiken zur Kanalsättigung	Mittlere Intensität pro Kanal und jeweils der gesättigte Anteil
„Bring mich zum hellsten GFP-Bereich.“	Hotspot-Suche im GFP-Kanal, dann die Ansicht verschieben	Die Ansicht auf diesen Bereich gezoomt, mit umrandeter Region
„Wie groß ist diese Region in µm², und welcher Anteil davon ist DAB-positiv?“	Kalibrierte Messung, Regionsstatistiken	Fläche in µm² und DAB-positiver Flächenanteil in Prozent
„Geh zur Z-Ebene 12 und zähle die Zellkerne.“	Ansicht verschieben (Z), Zellkerne zählen	Die Anzahl auf dieser Ebene, wobei die Ebene in den Belegen festgehalten wird
„Füge eine Notiz mit diesen Zahlen hinzu.“	Notiz hinzufügen	Eine Notiz auf dem Präparat, die beim Bild bleibt

Derzeit beantwortet Ask Your Slide Fragen zum geöffneten Bild. Um Behandlungen über viele Bilder hinweg zu vergleichen, nutzen Sie Experimente in SlideScope Plus: ein Zählrezept für jedes Bild, verglichen mit dem passenden statistischen Test. Fragen zu einem ganzen Experiment sind für später geplant.

Jede Zahl stammt aus einem Werkzeug

Allgemeine KI-Modelle wurden nicht dafür entwickelt, Objekte durch Betrachten eines Bildes zu zählen (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024). Deshalb lässt Ask Your Slide das Modell nie eine Zahl schätzen. Der Assistent entscheidet nur, welche Werkzeuge laufen; jede Anzahl, jeder Score, jede Fläche und jede Intensität in der Antwort wird von SlideScope auf Ihrem Computer berechnet, und Sie können jede davon prüfen:

Verweise auf Ansichten. Jede Aussage verweist auf die Ansicht, aus der sie stammt ([R1], [R2]). Ein Klick darauf, und SlideScope kehrt genau zu dieser Position, Zoomstufe und Ebene zurück.
Belege. Jeder Schritt mit der analysierten Fläche in Pixeln, der Ebene, den verwendeten Parametern und den Ergebnissen.
Re-run without AI. Berechnet die protokollierten Schritte lokal neu, ganz ohne KI, und prüft, ob die Zahlen identisch herauskommen.
Was gesendet wurde. Die Antwort zeigt genau, was für diese Frage Ihren Computer verlassen hat.
Sichtbar und rückgängig zu machen. Umrisse, Notizen und Änderungen der Ansicht erscheinen in Echtzeit auf dem Bild, und jede davon lässt sich rückgängig machen.

Antwort von SlideScope Ask Your Slide auf einem DAB-gefärbten Schnitt: 15,4 % von 577 Zellkernen DAB-positiv, H-Score 20,1, Allred 4, 910 positive Zellkerne pro Quadratmillimeter mit einem Verweis [R1], die bewerteten Zellkerne auf dem Bild umrandet und die Belege mit dem lokalen Quantify-Schritt und Links zu Re-run without AI, Export und Make figure. — Eine echte Antwort von Ask Your Slide in SlideScope 1.23 auf „What % of nuclei are DAB-positive here?“ (15,4 %) an einem BrdU-IHC-Schnitt des Mausduodenums (EPFL, CC BY 4.0). Die Zellkerne sind nach ihrem DAB-Grad umrandet, die Antwort verweist mit [R1] auf die verwendete Ansicht, und die Belege zeigen den lokalen Schritt, aus dem jede Zahl stammt, mit Re-run without AI, Export und Make figure.

Datenschutz von Grund auf: Was genau gesendet wird

Die Analyse läuft auf Ihrem Computer. Das Planen der Schritte und das Formulieren der Antwort übernimmt ein KI-Modell in der Cloud, und ein Schalter im Ask-Your-Slide-Panel, Send view images, entscheidet, ob es überhaupt ein Bild zu sehen bekommt.

Send view images	Was an die Cloud-KI gesendet wird	Was Ihren Computer nie verlässt
Aus („No images“)	Ihre Frage, begrenzte technische Angaben (Format, Abmessungen, Kanäle, Pixelgröße) und die von den lokalen Werkzeugen berechneten Zahlen	Das Bild und die Datei
An	Dasselbe, dazu die Ansichten, die sich die KI ansieht, komprimiert und jeweils zuerst auf Ihrem Bildschirm angezeigt	Die Datei und jeder Teil des Bildes, den sich die KI nicht ansieht

Ihre Fragen und Bilder werden nicht zum Training von KI-Modellen verwendet. Medizinische Aufnahmen wie CT und MRT werden abgelehnt. Den KI-Anbieter und die vollständigen Bedingungen finden Sie in der Datenschutzerklärung, und die Seite zur Datenverarbeitung erklärt, was das übrige SlideScope auf Ihrem Computer behält.

Exporte für Laborbuch, Abbildung und Methodenteil

answer.md: die Antwort mit ihren Verweisen, bereit zum Einfügen in ein Laborbuch.
analysis_record.json: das vollständige Protokoll der Schritte, Parameter und Ergebnisse, dasselbe Protokoll, das Re-run without AI verwendet.
Methodentext: ein Absatz, der beschreibt, was wie gemessen wurde, zum Anpassen für ein Manuskript.
Quantify-Ausgaben: die Objekttabelle als CSV, Umrisse als GeoJSON (sie lassen sich in QuPath öffnen), Masken und ein annotiertes Bild.
Make figure: eine Abbildung der Ansicht mit kalibriertem Maßstabsbalken.

Checklisten der QUAREP-LiMi-Community für Publikationen verlangen, dass Autorinnen und Autoren Bildanalyse-Workflows und Details von Abbildungen wie Maßstabsbalken angeben (Schmied et al., Nature Methods 2023). Protokoll und Methodentext liefern Ihnen die anzugebenden Parameter.

Wie genau ist automatisiertes Ki67- und IHC-Scoring?

Ki67 nach Augenmaß zu bewerten ist schwer reproduzierbar, und das ist der wichtigste Grund, das Zählen einem Werkzeug zu überlassen:

Als die International Ki67 in Breast Cancer Working Group dieselben 30 Mammakarzinome an 23 Pathologinnen und Pathologen in 12 Ländern schickte, lag die Übereinstimmung (ICC) bei 0,87 mit der globalen Zählmethode und bei 0,83 mit dem Hotspot-Scoring, das damit das Erfolgskriterium der Studie verfehlte. Nicht alle wählten auf einem Präparat denselben Hotspot (Leung et al., Histopathology 2019).
Sechs auf Mammapathologie spezialisierte Pathologinnen und Pathologen, die 57 Ki-67-Präparate bewerteten, erreichten beim Cut-off von 20 % nur eine mäßige Übereinstimmung (Koeffizienten von 0,44 und 0,48 in zwei Runden), und die Autoren folgerten, dass digitale Bildanalyse nötig ist, um sie zu verbessern (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Digitale Bildanalyse ist konsistenter: Vier QuPath-Algorithmen, die vier Pathologinnen und Pathologen unabhängig voneinander nach der Leitlinie der Arbeitsgruppe erstellt hatten, stimmten bei 157 ER-positiven Mammakarzinomen mit einem ICC von 0,938 mit einem Referenzalgorithmus überein (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Diese Studien beschreiben manuelles und automatisiertes Ki67-Scoring im Allgemeinen; SlideScope haben sie nicht getestet. Das IHC-Scoring von SlideScope folgt den Definitionen von QuPath (DAB-Cut-offs der optischen Dichte von 0,2; 0,4 und 0,6 für 1+, 2+ und 3+), und seine lokale Quantifizierung wurde an denselben Präparaten mit QuPath 0.7.0 abgeglichen. Die Hotspot-Suche ist eine Berechnung der Objektdichte mit einem z-Score, keine Ermessensentscheidung: Dieselbe Region mit denselben Einstellungen ergibt dieselben Hotspots.

So prüfen Sie eine Antwort stichprobenartig

Sehen Sie sich die Umrisse auf dem Bild an: Übersehene Zellkerne, verschmolzene Nachbarn und gefärbter Detritus fallen sofort auf.
Klicken Sie auf [R1], um genau zur Ansicht zurückzukehren, zoomen Sie hinein und zählen Sie ein kleines Feld von Hand, um es mit der angegebenen Zahl zu vergleichen.
Öffnen Sie die Belege und bestätigen Sie, dass Ebene, Regionsfläche und Parameter die gewünschten sind.
Prüfen Sie die Sättigung, bevor Sie Intensitäten vertrauen: Fragen Sie, welche Kanäle in derselben Region gesättigt sind.
Klicken Sie auf Re-run without AI und bewahren Sie das Analyseprotokoll bei Ihren Daten auf.

Ask Your Slide, ein allgemeiner Chatbot, Skripte oder ein Enterprise-Copilot

	Ask Your Slide	Ein Bild in einen allgemeinen Chatbot hochladen	QuPath- oder Fiji-Skripte schreiben	Pathologie-Copiloten für Unternehmen
Woher die Zahlen kommen	Aus den lokalen Werkzeugen von SlideScope, mit angezeigten Parametern	Aus dem Modell oder aus Code, den es im Chat schreibt	Aus Ihrem Skript, ausgeführt von QuPath oder Fiji	Aus den Modellen des Anbieters auf dessen Plattform
Wohin das Bild geht	Bleibt im Modus „No images“ auf Ihrem Computer; sonst komprimierte Ansichten, die Sie zuerst sehen	Wird auf die Server des Chatbots hochgeladen	Bleibt auf Ihrem Computer	Liegt auf der Plattform des Anbieters
Ein Ergebnis prüfen und wiederholen	Belege für jeden Schritt; Re-run without AI prüft, ob die Zahlen identisch sind	Eine erneute Frage kann eine andere Antwort liefern	Wiederholbar, wenn Sie Skript und Versionen aufbewahren	Hängt von der Plattform ab
Einrichtung	SlideScope installieren und fragen	Keine, aber Sie exportieren zuerst ein Bild, das der Chatbot lesen kann	Die Skript-API lernen und den Code debuggen, auch Code, den ein Chatbot für Sie schreibt	Ein Vertrag mit der Einrichtung und eine Bereitstellung
Whole-Slide- und Mikroskopformate	CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM und rund 39 Formate	Meist nur gängige Bildformate	Breit, über Bio-Formats und OpenSlide	Die Formate, die die Plattform einliest
Am besten geeignet für	Standardzählungen, IHC-Scores und Regionswerte ohne Code, mit einem Protokoll als Nachweis	Eine schnelle Beschreibung eines Bildes	Eigene Pipelines und trainierte Klassifikatoren	Große klinische Forschungsprogramme

QuPath und Fiji sind kostenlos und bleiben die richtige Wahl für individuelle oder skriptgesteuerte Analysen; siehe Zellen zählen in ImageJ, QuPath oder CellProfiler. Um eine Ansicht in Worten zu beschreiben statt sie zu messen, nutzen Sie AI Analysis.

Formate und Sprachen

Ask Your Slide arbeitet mit den Bildern, die SlideScope öffnet: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM-Whole-Slide-Bilder und insgesamt rund 39 Formate, von Hellfeld-Präparaten bis zur Mehrkanal-Fluoreszenz mit Z, Zeit und Szenen. Die vollständige Liste finden Sie auf der Seite zur Dateikompatibilität. Antworten gibt es in 14 Sprachen, die Oberfläche der App in 10.

Wer Ask Your Slide erhält

Ask Your Slide ist ab Version 1.23.0 Teil von SlideScope unter Windows und macOS. Es ist in den kostenpflichtigen SlideScope-Plänen enthalten, im Rahmen von Fair-Use-Grenzen für KI; Plus-Pläne haben höhere Grenzen. Behandlungen über ein ganzes Experiment hinweg vergleichen Sie heute mit der Funktion Experimente in SlideScope Plus; Fragen zu einem ganzen Experiment sind für später geplant. Mit einem kostenlosen SlideScope-Konto können Sie Ask Your Slide an den kostenlosen Beispielpräparaten ausprobieren, mit drei Fragen pro Tag; für Fragen zu Ihren eigenen Bildern brauchen Sie ein Abonnement. Die aktuellen Preise finden Sie auf der Seite Pläne & Preise.

Fragen zu Ask Your Slide

Kann ChatGPT Zellen in einem Mikroskopiebild zählen?

Allein nicht zuverlässig. Ein allgemeiner Chatbot antwortet anhand des hochgeladenen Bildes oder mit Code, den er in diesem Chat schreibt; die Methode kann sich also von Chat zu Chat ändern, und ein Screenshot enthält keine Pixelgröße. Ein Workshop-Vortrag von 2024 über Chatbots für die Bildanalyse hält fest, dass Sprachmodelle nicht dafür gebaut wurden, Objekte in Bildern zu zählen. Ask Your Slide arbeitet anders: Die KI plant nur die Schritte, die eigenen Zählwerkzeuge von SlideScope liefern jede Zahl auf Ihrem Computer, und Re-run without AI berechnet sie neu.

Werden meine Bilder in die Cloud gesendet?

Nicht, wenn Send view images ausgeschaltet ist (No images): Das Bild verlässt Ihren Computer nie, und nur Ihre Frage, begrenzte technische Angaben (Format, Abmessungen, Kanäle, Pixelgröße) und die berechneten Zahlen gehen an die Cloud-KI. Ist der Schalter an, werden zusätzlich die Ansichten gesendet, die sich die KI ansieht, komprimiert und jeweils zuerst auf Ihrem Bildschirm angezeigt. Ihre Daten werden nicht zum Training von KI-Modellen verwendet.

Ist Ask Your Slide ein Diagnosewerkzeug?

Nein. Ask Your Slide ist nur für Forschungszwecke bestimmt und stellt keine medizinische Diagnose. Es lehnt medizinische Aufnahmen wie CT und MRT ab, und seine Antworten berichten Messwerte, keine Diagnosen oder Grading-Ergebnisse.

Wie genau ist automatisiertes Ki67-Scoring im Vergleich zum manuellen Scoring?

Manuelles Ki67-Scoring schwankt zwischen Beurteilenden: In einer internationalen Studie erreichten 23 Pathologinnen und Pathologen einen ICC von 0,87 mit globalem Scoring und 0,83 mit Hotspot-Scoring. Digitale Bildanalyse ist konsistenter: Vier unabhängig erstellte QuPath-Algorithmen stimmten mit einem ICC von 0,938 mit einer Referenz überein. Auch automatisierte Zählungen müssen geprüft werden: Sehen Sie sich die Umrisse an, vergleichen Sie ein kleines Feld mit einer Handzählung und bewahren Sie das Belegprotokoll auf.

Ist Ask Your Slide eine kostenlose App für Ki67-Scoring?

Nein. Ask Your Slide ist in den kostenpflichtigen SlideScope-Plänen enthalten, im Rahmen von Fair-Use-Grenzen für KI, mit höheren Grenzen in Plus. Mit einem kostenlosen Konto können Sie drei Fragen pro Tag zu den mitgelieferten Beispielpräparaten stellen, die außerdem alle lokalen Werkzeuge enthalten; die aktuellen Preise finden Sie auf der Seite Pläne & Preise.

Kann ich das Ergebnis erneut ausführen oder exportieren?

Ja. Re-run without AI berechnet die protokollierten Schritte auf Ihrem Computer neu und prüft, ob die Zahlen identisch sind. Export speichert answer.md, analysis_record.json und einen Absatz für den Methodenteil, dazu die Objekt-CSV, GeoJSON-Umrisse, Masken und ein annotiertes Bild, und Make figure fügt einen Maßstabsbalken hinzu.

Mit welchen Dateiformaten funktioniert es?

Mit den Formaten, die SlideScope öffnet: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM-Whole-Slide-Bilder und insgesamt rund 39 Formate. Medizinische Aufnahmen wie CT und MRT werden abgelehnt.

Worin unterscheidet sich das von QuPath oder ImageJ?

QuPath und ImageJ sind kostenlos, skriptfähig und die richtigen Werkzeuge für eigene Pipelines und trainierte Klassifikatoren. Ask Your Slide ist für die Standardfragen gedacht (Anzahlen, Positivanteil, H-Score, Allred, Regionsstatistiken, Hotspots), ohne ein Skript zu schreiben, direkt im Viewer, in dem das Bild schon geöffnet ist. Sein IHC-Scoring verwendet QuPath-kompatible Definitionen, und seine GeoJSON-Umrisse lassen sich in QuPath öffnen.

Funktioniert Ask Your Slide offline?

Zum Fragen brauchen Sie eine Internetverbindung, weil eine Cloud-KI die Schritte plant und die Antwort formuliert. Das Zählen, Scoren und Messen selbst läuft auf Ihrem Computer.

Kann ich Fragen zu einem ganzen Experiment stellen?

Per Frage noch nicht: Ask Your Slide beantwortet Fragen zum geöffneten Bild. Um heute Behandlungen über viele Bilder hinweg zu vergleichen, nutzen Sie Experimente in SlideScope Plus: Es wendet ein Zählrezept auf jedes Bild an und vergleicht die Behandlungen mit dem passenden statistischen Test. Fragen zu einem ganzen Experiment sind für Plus später geplant.

Quellen

Kurz beantwortet

Am besten geeignet für: Forschende, Core Facilities und Studierende, die Standardzählungen, Ki67- oder IHC-Scores und Regionsmessungen aus Mikroskopie- und Präparatbildern brauchen, ohne Skripte zu schreiben, und mit einem Protokoll als Nachweis.

Wesentliche Stärken: jede Zahl aus einem lokalen Werkzeug, Verweise zurück auf die genaue Ansicht, Re-run without AI, ein Modus „No images“, Exporte für Laborbuch und Methodenteil, rund 39 Formate und Antworten in 14 Sprachen.

Wichtige Einschränkung: nur für Forschungszwecke, keine Diagnose; es beantwortet Fragen zum geöffneten Bild, und zum Fragen ist eine Internetverbindung nötig.

Zuletzt geprüft: 6. November 2026.

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