Conta le cellule e valuta l’IHC facendo domande al tuo vetrino
Scrivi una domanda sull’immagine aperta, per esempio “Che percentuale di nuclei è Ki67-positiva in questa regione?”. Un assistente IA pianifica i passaggi e SlideScope esegue sul tuo computer i propri strumenti di conteggio, punteggio IHC e misura. Ogni numero della risposta proviene da uno di questi strumenti, con le prove per verificarlo e un pulsante che ripete i passaggi senza IA. Solo per uso di ricerca.
Ogni numero da uno strumento localeModalità “Nessuna immagine”: l’immagine resta sul tuo computerProve, ricalcolo ed esportazione
Come funziona Ask Your Slide
Apri l’immagine in SlideScope su Windows o macOS: un vetrino intero, uno stack confocale, un’immagine in fluorescenza o uno qualsiasi dei formati che SlideScope apre.
Chiedi in linguaggio semplice. Se la domanda riguarda un’area precisa, disegna prima una regione o ingrandisci il campo. Le risposte arrivano in 14 lingue.
L’IA pianifica, gli strumenti locali lavorano. L’assistente sceglie i passaggi (contare i nuclei, valutare il DAB, misurare una regione, trovare gli hotspot) e SlideScope li esegue uno per uno sul tuo computer. Vedi ogni azione sull’immagine e puoi annullarla.
Leggi la risposta con le sue prove. La risposta cita le viste esatte che ha usato come [R1], [R2] e così via: fai clic su una per tornare a quella vista. Le prove elencano ogni passaggio con l’area in pixel, il piano, i parametri e i risultati, e la risposta mostra che cosa è stato inviato.
Verifica, ricalcola ed esporta. Ricalcola senza IA ripete in locale gli stessi passaggi e controlla che i numeri siano identici. Esporta la risposta, il registro dell’analisi e un paragrafo per i Metodi, oppure crea una figura con barra di scala.
Guarda una demo di 62 secondi registrata in SlideScope 1.23 su immagini di esempio pubbliche (IHC BrdU dell’EPFL, CC BY 4.0; DAPI/GFP di czitools). Senza audio.
Le domande che puoi fare e gli strumenti che rispondono
Ask Your Slide lavora con gli strumenti di SlideScope: conteggio di nuclei, cellule o particelle (segmentazione deep learning InstanSeg o metodo classico), punteggio IHC per il DAB, statistiche di regione, misure calibrate, statistiche di saturazione dei canali, ricerca degli hotspot, contorni delle regioni, note e controlli della vista. Alcuni esempi:
Chiedi
Strumenti eseguiti da SlideScope
Che cosa ottieni
“Che percentuale di nuclei è Ki67-positiva in questa regione?”
Conteggio dei nuclei (InstanSeg), poi punteggio IHC per il DAB
La percentuale di positivi con il numero di nuclei contati e i contorni sull’immagine
“Dammi l’H-score e il punteggio di Allred dell’area che ho delineato.”
Conteggio dei nuclei, punteggio IHC con definizioni compatibili con QuPath
H-score, punteggio di Allred e percentuale di positivi per quella regione
“Trova le tre aree più affollate e valuta il Ki67 in ciascuna.”
Ricerca degli hotspot, contorni delle regioni, conteggio e punteggio per regione
Tre hotspot delineati, ciascuno con densità per mm², z-score e percentuale di Ki67
“Quante cellule ci sono in questo campo e quanto sono grandi?”
Conteggio delle cellule (InstanSeg o metodo classico)
Un conteggio e le aree degli oggetti, esportabili in CSV e GeoJSON
“Confronta la densità DAPI in queste due regioni.”
Statistiche di regione e conteggio dei nuclei per ogni regione
Area, conteggio e densità per mm² a confronto
“Quale canale è il più luminoso qui, e c’è qualcosa di saturo?”
Statistiche di regione, statistiche di saturazione dei canali
Intensità media per canale e frazione satura di ciascuno
“Portami all’area GFP più luminosa.”
Ricerca degli hotspot sul canale GFP, poi spostamento della vista
La vista ingrandita su quell’area, con la regione delineata
“Qual è l’area di questa regione in µm² e quanta parte è DAB-positiva?”
Misura calibrata, statistiche di regione
Area in µm² e percentuale dell’area DAB-positiva
“Vai al piano Z 12 e conta i nuclei.”
Spostamento della vista (Z), conteggio dei nuclei
Il conteggio su quel piano, con il piano registrato nelle prove
“Aggiungi una nota con questi numeri.”
Aggiunta di una nota
Una nota sul vetrino che resta con l’immagine
Oggi Ask Your Slide risponde sull’immagine aperta. Per confrontare i trattamenti su molte immagini, usa gli esperimenti di SlideScope Plus: una sola ricetta di conteggio su ogni immagine, confrontata con il test statistico giusto. Le domande su un intero esperimento sono previste in futuro.
Ogni numero viene da uno strumento
I modelli di IA generalisti non sono stati progettati per contare oggetti guardando un’immagine (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), perciò Ask Your Slide non lascia mai che il modello stimi un numero. L’assistente decide solo quali strumenti eseguire; ogni conteggio, punteggio, area e intensità nella risposta è calcolato da SlideScope sul tuo computer, e puoi verificarli uno per uno:
Citazioni delle viste. Ogni affermazione rimanda alla vista da cui proviene ([R1], [R2]). Fai clic e SlideScope torna esattamente a quella posizione, a quell’ingrandimento e a quel piano.
Prove. Ogni passaggio, con l’area analizzata in pixel, il piano, i parametri usati e i risultati.
Ricalcola senza IA. Ripete in locale i passaggi registrati, senza alcuna IA, e controlla che i numeri risultino identici.
Che cosa è stato inviato. La risposta mostra esattamente che cosa ha lasciato il tuo computer per quella domanda.
Visibile e annullabile. Contorni, note e cambi di vista compaiono sull’immagine man mano che avvengono, e ognuno può essere annullato.
Una vera risposta di Ask Your Slide in SlideScope 1.23 alla domanda “Che % di nuclei è DAB-positiva qui?” (15,4%) su una sezione di duodeno di topo in IHC per BrdU (EPFL, CC BY 4.0). I nuclei sono delineati in base al grado DAB, la risposta cita la vista usata come [R1] e le prove mostrano il passaggio locale che ha prodotto ogni numero, con Ricalcola senza IA, Esporta e Crea figura.
Privacy by design: che cosa viene inviato, esattamente
L’analisi viene eseguita sul tuo computer. La pianificazione dei passaggi e la stesura della risposta sono affidate a un modello di IA nel cloud, e un interruttore nel pannello di Ask Your Slide, Invia immagini delle viste, decide se il modello vedrà mai un’immagine.
Invia immagini delle viste
Che cosa viene inviato all’IA nel cloud
Che cosa non lascia mai il tuo computer
Disattivato (“Nessuna immagine”)
La tua domanda, pochi dettagli tecnici (formato, dimensioni, canali, dimensione del pixel) e i numeri calcolati dagli strumenti locali
L’immagine e il file
Attivato
Le stesse informazioni, più le viste che l’IA esamina, ciascuna mostrata prima sul tuo schermo, compressa
Il file e ogni parte dell’immagine che l’IA non esamina
Le tue domande e le tue immagini non vengono usate per addestrare modelli di IA. Le immagini mediche come TC e risonanza magnetica vengono rifiutate. Il fornitore di IA e le condizioni complete sono nell’informativa sulla privacy, e la pagina sulla gestione dei dati spiega che cosa il resto di SlideScope conserva sul tuo computer.
Esportazioni per quaderno di laboratorio, figure e Metodi
answer.md: la risposta con le citazioni, pronta da incollare in un quaderno di laboratorio.
analysis_record.json: il registro completo di passaggi, parametri e risultati, lo stesso che usa Ricalcola senza IA.
Testo per i Metodi: un paragrafo che descrive che cosa è stato misurato e come, da adattare per un manoscritto.
Output di Quantify: la tabella degli oggetti in CSV, i contorni in GeoJSON (si aprono in QuPath), le maschere e un’immagine annotata.
Crea figura: una figura della vista con barra di scala calibrata.
Le checklist di rendicontazione della comunità QUAREP-LiMi chiedono agli autori di riportare i flussi di lavoro di analisi delle immagini e i dettagli delle figure, come le barre di scala (Schmied et al., Nature Methods 2023). Il registro e il testo per i Metodi ti forniscono i parametri da riportare.
Quanto è accurato il punteggio automatico di Ki67 e IHC?
Valutare il Ki67 a occhio è difficile da riprodurre, ed è il motivo principale per affidare il conteggio a uno strumento:
Quando l’International Ki67 in Breast Cancer Working Group ha inviato gli stessi 30 carcinomi mammari a 23 patologi di 12 Paesi, la concordanza (ICC) è stata di 0,87 con il metodo di conteggio globale e di 0,83 con la valutazione per hot-spot, che non ha raggiunto il criterio di successo dello studio. I lettori non sceglievano sempre lo stesso hot-spot su un vetrino (Leung et al., Histopathology 2019).
Sei patologi specializzati in patologia mammaria, valutando 57 vetrini per Ki-67, hanno raggiunto solo una concordanza moderata al cut-off del 20% (coefficienti di 0,44 e 0,48 in due round), e gli autori hanno concluso che per migliorarla serve l’analisi digitale delle immagini (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
L’analisi digitale delle immagini è più coerente: quattro algoritmi QuPath sviluppati in modo indipendente da quattro patologi, seguendo le linee guida del gruppo di lavoro, hanno concordato con un algoritmo di riferimento con un ICC di 0,938 su 157 carcinomi mammari ER-positivi (Boyaci et al., Biomolecules 2021).
Questi studi descrivono la valutazione manuale e automatica del Ki67 in generale; non hanno testato SlideScope. Il punteggio IHC di SlideScope segue le definizioni di QuPath (soglie di densità ottica DAB di 0,2; 0,4 e 0,6 per 1+, 2+ e 3+) e la sua quantificazione locale è stata confrontata con QuPath 0.7.0 sugli stessi vetrini. La ricerca degli hotspot è un calcolo della densità degli oggetti con uno z-score, non un giudizio: la stessa regione con le stesse impostazioni dà gli stessi hotspot.
Come verificare una risposta a campione
Guarda i contorni sull’immagine: nuclei mancati, vicini fusi e detriti colorati saltano subito all’occhio.
Fai clic su [R1] per tornare alla vista esatta, ingrandisci e conta a mano un piccolo campo da confrontare con il numero riportato.
Apri il pannello Evidenze e conferma che piano, area della regione e parametri siano quelli che intendevi.
Controlla la saturazione prima di fidarti delle intensità: chiedi quali canali sono saturi nella stessa regione.
Premi Ricalcola senza IA e conserva il registro dell’analisi insieme ai tuoi dati.
Ask Your Slide, un chatbot generico, gli script o un copilota aziendale
Ask Your Slide
Caricare un’immagine in un chatbot generico
Scrivere script per QuPath o Fiji
Copiloti aziendali per la patologia
Da dove vengono i numeri
Dagli strumenti locali di SlideScope, con i parametri in vista
Dal modello, o dal codice che scrive durante la chat
Dal tuo script, eseguito da QuPath o Fiji
Dai modelli del fornitore, sui suoi sistemi
Dove va l’immagine
Resta sul tuo computer in modalità “Nessuna immagine”; altrimenti viste compresse che vedi prima tu
Caricata sui server del chatbot
Resta sul tuo computer
Conservata sui sistemi del fornitore
Verificare e ripetere un risultato
Prove per ogni passaggio; Ricalcola senza IA controlla che i numeri siano identici
Ripetere la domanda può dare una risposta diversa
Ripetibile se conservi lo script e le versioni
Dipende dal fornitore
Configurazione
Installa SlideScope e chiedi
Nessuna, ma prima devi esportare un’immagine che il chatbot sappia leggere
Imparare l’API di scripting e fare il debug del codice, compreso quello che scrive un chatbot per te
Un contratto istituzionale e un’implementazione
Formati whole slide e da microscopio
CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM e circa 39 formati
Di solito solo i formati immagine comuni
Ampi, tramite Bio-Formats e OpenSlide
I formati che il sistema del fornitore accetta
Ideale per
Conteggi standard, punteggi IHC e valori per regione senza codice, con un registro da mostrare
Una descrizione rapida di un’immagine
Pipeline personalizzate e classificatori addestrati
Ask Your Slide funziona sulle immagini che SlideScope apre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, immagini whole slide DICOM e circa 39 formati in tutto, dai vetrini interi in campo chiaro alla fluorescenza multicanale con Z, tempo e scene. L’elenco completo è nella pagina sulla compatibilità dei file. Le risposte sono disponibili in 14 lingue e l’interfaccia dell’app in 10.
Chi può usare Ask Your Slide
Ask Your Slide fa parte di SlideScope dalla versione 1.23.0 su Windows e macOS. È incluso nei piani SlideScope a pagamento entro limiti di uso ragionevole dell’IA; i piani Plus hanno limiti più alti. Il confronto dei trattamenti su un intero esperimento è già disponibile in SlideScope Plus, tramite gli esperimenti; le domande su un intero esperimento sono previste in futuro. Con un account SlideScope gratuito puoi provare Ask Your Slide sui vetrini di esempio gratuiti, con tre domande al giorno; per fare domande sulle tue immagini serve un abbonamento. I prezzi attuali sono nella pagina dei piani.
Domande su Ask Your Slide
ChatGPT può contare le cellule in un’immagine di microscopia?
Non in modo affidabile da solo. Un chatbot generico risponde a partire dall’immagine che carichi, o dal codice che scrive in quella chat, quindi il metodo può cambiare da una chat all’altra, e uno screenshot non porta con sé la dimensione del pixel. Un intervento del 2024 a un workshop sui chatbot per l’analisi delle immagini osserva che i modelli linguistici non sono stati progettati per contare oggetti nelle immagini. Ask Your Slide funziona diversamente: l’IA si limita a pianificare i passaggi, gli strumenti di conteggio di SlideScope producono ogni numero sul tuo computer e Ricalcola senza IA li ricalcola.
Le mie immagini vengono inviate al cloud?
Non con Invia immagini delle viste disattivato (“Nessuna immagine”): l’immagine non lascia mai il tuo computer, e all’IA nel cloud vengono inviati solo la tua domanda, pochi dettagli tecnici (formato, dimensioni, canali, dimensione del pixel) e i numeri calcolati. Con l’interruttore attivo vengono inviate anche le viste che l’IA esamina, compresse, e ciascuna viene prima mostrata sul tuo schermo. I tuoi dati non vengono usati per addestrare modelli di IA.
Ask Your Slide è uno strumento diagnostico?
No. Ask Your Slide è solo per uso di ricerca e non è una diagnosi medica. Rifiuta le immagini mediche come TC e risonanza magnetica, e le sue risposte riportano misure, non diagnosi né gradi.
Quanto è accurato il punteggio automatico del Ki67 rispetto a quello manuale?
La valutazione manuale del Ki67 varia da un lettore all’altro: in uno studio internazionale, 23 patologi hanno raggiunto un ICC di 0,87 con la valutazione globale e di 0,83 con quella per hot-spot. L’analisi digitale delle immagini è più coerente: quattro algoritmi QuPath sviluppati in modo indipendente hanno concordato con un riferimento con un ICC di 0,938. I conteggi automatici vanno comunque verificati: guarda i contorni, confronta un piccolo campo con un conteggio a mano e conserva il registro delle prove.
Ask Your Slide è un’app gratuita per il punteggio del Ki67?
No. Ask Your Slide è incluso nei piani SlideScope a pagamento entro limiti di uso ragionevole dell’IA, con limiti più alti in Plus. Con un account gratuito puoi fare tre domande al giorno sui vetrini di esempio integrati, che includono anche tutti gli strumenti locali; i prezzi attuali sono nella pagina dei piani.
Posso ricalcolare o esportare il risultato?
Sì. Ricalcola senza IA ripete sul tuo computer i passaggi registrati e controlla che i numeri siano identici. L’esportazione salva answer.md, analysis_record.json e un paragrafo per i Metodi, oltre al CSV degli oggetti, ai contorni GeoJSON, alle maschere e a un’immagine annotata, e Crea figura aggiunge una barra di scala.
Con quali formati di file funziona?
Con i formati che SlideScope apre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, immagini whole slide DICOM e circa 39 formati in tutto. Le immagini mediche come TC e risonanza magnetica vengono rifiutate.
In che cosa è diverso da QuPath o ImageJ?
QuPath e ImageJ sono gratuiti, programmabili con script e gli strumenti giusti per pipeline personalizzate e classificatori addestrati. Ask Your Slide è pensato per le domande standard (conteggi, percentuale di positivi, H-score, Allred, statistiche di regione, hotspot) senza scrivere uno script, dentro il visualizzatore in cui l’immagine è già aperta. Il suo punteggio IHC usa definizioni compatibili con QuPath e i suoi contorni GeoJSON si aprono in QuPath.
Ask Your Slide funziona offline?
Per fare domande serve una connessione a Internet, perché un’IA nel cloud pianifica i passaggi e scrive la risposta. Conteggio, punteggio e misure vengono invece eseguiti sul tuo computer.
Posso fare domande su un intero esperimento?
Non ancora tramite domande: Ask Your Slide risponde sull’immagine aperta. Per confrontare già oggi i trattamenti su molte immagini, usa gli esperimenti di SlideScope Plus, che eseguono una sola ricetta di conteggio su ogni immagine e confrontano i trattamenti con il test statistico giusto. Le domande su un intero esperimento sono previste in Plus in futuro.
Ideale per: ricercatori, facility e studenti che hanno bisogno di conteggi standard, punteggi Ki67 o IHC e misure di regione da immagini di microscopia e di vetrini senza scrivere script, con un registro da mostrare.
Punti di forza: ogni numero da uno strumento locale, citazioni che riportano alla vista esatta, Ricalcola senza IA, una modalità “Nessuna immagine”, esportazioni per il quaderno di laboratorio e i Metodi, circa 39 formati e risposte in 14 lingue.
Limite importante: solo per uso di ricerca, non è una diagnosi; risponde sull’immagine aperta e per fare domande serve una connessione a Internet.
Ultima revisione: 6 novembre 2026.
Fai domande ai tuoi vetrini
Scarica SlideScope, esplora la libreria di esempi gratuita e abbonati (PayPal o carta, addebito al momento dell’abbonamento, disdici quando vuoi dal tuo account) per usare Ask Your Slide sulle tue immagini dalla versione 1.23.0.