Ask Your Slide · החל מ-SlideScope 1.23.0

ספרו תאים ונקדו IHC באמצעות שאלה לשקופית שלכם

הקלידו שאלה על התמונה הפתוחה, למשל “איזה אחוז מהגרעינים באזור הזה חיובי ל-Ki67?” עוזר בינה מלאכותית מתכנן את השלבים, ו-SlideScope מריץ במחשב שלכם את כלי הספירה, ניקוד ה-IHC והמדידה שלו עצמו. כל מספר בתשובה מגיע מאחד הכלים האלה, עם הראיות לבדיקתו וכפתור שמריץ את השלבים מחדש בלי בינה מלאכותית. לשימוש מחקרי בלבד.

כל מספר מכלי מקומי מצב No images: התמונה נשארת במחשב שלכם ראיות, הרצה חוזרת וייצוא

איך Ask Your Slide עובד

  1. פתחו את התמונה ב-SlideScope ב-Windows או ב-macOS: שקופית מלאה, ערימה קונפוקלית, תמונת פלואורסצנציה או כל אחד מהפורמטים ש-SlideScope פותח.
  2. שאלו בשפה פשוטה. אם השאלה נוגעת לאזור אחד, סמנו אזור או עשו זום לשדה קודם. התשובות מתקבלות בכל אחת מ-14 שפות.
  3. הבינה המלאכותית מתכננת; הכלים המקומיים עושים את העבודה. העוזר בוחר את השלבים (ספירת גרעינים, ניקוד DAB, מדידת אזור, איתור מוקדים חמים), ו-SlideScope מריץ כל אחד מהם במחשב שלכם. אתם רואים כל פעולה על התמונה, ואפשר לבטל כל אחת מהן.
  4. קראו את התשובה עם הראיות שלה. התשובה מצטטת את התצוגות המדויקות שבהן השתמשה כ-[R1], ‏[R2] וכן הלאה: לחצו על אחת מהן כדי לחזור לאותה תצוגה. ‏Evidence מפרט כל שלב עם השטח בפיקסלים, המישור, הפרמטרים והתוצאות, והתשובה מציגה מה נשלח.
  5. בדקו, הריצו מחדש וייצאו. ‏Re-run without AI מחשב מחדש את אותם שלבים מקומית ובודק שהמספרים זהים. ייצאו את התשובה, את רשומת הניתוח ופסקת שיטות, או הכינו איור עם פס קנה מידה.

צפו בהדגמה של 62 שניות שהוקלטה ב-SlideScope 1.23 על תמונות דוגמה ציבוריות (EPFL BrdU IHC, ‏CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). ללא קול.

שאלות שאפשר לשאול, והכלים שעונים עליהן

Ask Your Slide עובד עם הכלים של SlideScope עצמו: ספירת גרעינים, תאים או חלקיקים (בסגמנטציית למידה עמוקה של InstanSeg או בשיטה קלאסית), ניקוד IHC ל-DAB, סטטיסטיקה לפי אזור, מדידות מכוילות, סטטיסטיקת רוויה של ערוצים, איתור מוקדים חמים, קווי מתאר של אזורים, הערות ובקרות תצוגה. כמה דוגמאות:

אתם שואליםהכלים ש-SlideScope מריץמה מקבלים
“איזה אחוז מהגרעינים באזור הזה חיובי ל-Ki67?”ספירת גרעינים (InstanSeg), ואחריה ניקוד IHC ל-DABאחוז החיוביים עם מספר הגרעינים שנספרו, וקווי מתאר על התמונה
“תן לי את ה-H-score ואת ציון ה-Allred לאזור שסימנתי.”ספירת גרעינים, ניקוד IHC עם הגדרות תואמות QuPathH-score, ציון Allred ואחוז חיוביים לאותו אזור
“מצא את שלושת האזורים הצפופים ביותר ונקד Ki67 בכל אחד מהם.”איתור מוקדים חמים, סימון קווי מתאר לאזורים, ספירה וניקוד לכל אזורשלושה מוקדים חמים מסומנים, לכל אחד צפיפות למ"מ², ציון z ואחוז Ki67
“כמה תאים יש בשדה הזה, ומה גודלם?”ספירת תאים (InstanSeg או קלאסית)ספירה ושטחי אובייקטים, לייצוא כ-CSV וכ-GeoJSON
“השווה את צפיפות ה-DAPI בשני האזורים האלה.”סטטיסטיקה לפי אזור וספירת גרעינים לכל אזורשטח, ספירה וצפיפות למ"מ² זה לצד זה
“איזה ערוץ הכי בהיר כאן, ויש משהו רווי?”סטטיסטיקה לפי אזור, סטטיסטיקת רוויה של ערוציםעוצמה ממוצעת לכל ערוץ והחלק הרווי בכל אחד
“קח אותי לאזור ה-GFP הבהיר ביותר.”איתור מוקדים חמים בערוץ ה-GFP, ואז הזזת התצוגההתצוגה בזום על אותו אזור, עם קו מתאר סביבו
“מה שטח האזור הזה ב-µm², וכמה ממנו חיובי ל-DAB?”מדידה מכוילת, סטטיסטיקה לפי אזורשטח ב-µm² ואחוז השטח החיובי ל-DAB
“עבור למישור Z מספר 12 וספור את הגרעינים.”הזזת התצוגה (Z), ספירת גרעיניםהספירה במישור הזה, כשהמישור מתועד בראיות
“הוסף הערה עם המספרים האלה.”הוספת הערההערה על השקופית שנשארת עם התמונה

כרגע Ask Your Slide עונה על התמונה הפתוחה. כדי להשוות טיפולים על פני תמונות רבות, השתמשו בניסויים ב-SlideScope Plus: מתכון ספירה אחד על כל תמונה, בהשוואה עם המבחן הסטטיסטי המתאים. שאלות על ניסוי שלם מתוכננות בהמשך.

כל מספר מגיע מכלי

מודלים כלליים של בינה מלאכותית לא נבנו כדי לספור אובייקטים מתוך הסתכלות בתמונה (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), ולכן Ask Your Slide לעולם לא נותן למודל להעריך מספר. העוזר רק מחליט אילו כלים להריץ; כל ספירה, ציון, שטח ועוצמה בתשובה מחושבים על ידי SlideScope במחשב שלכם, ואפשר לבדוק כל אחד מהם:

  • ציטוטים של תצוגות. כל קביעה מפנה לתצוגה שממנה הגיעה ([R1], ‏[R2]). לחצו עליה ו-SlideScope יחזור בדיוק לאותו מיקום, זום ומישור.
  • ראיות (Evidence). כל שלב, עם השטח שנותח בפיקסלים, המישור, הפרמטרים שבהם השתמשו והתוצאות.
  • Re-run without AI. מחשב מחדש את השלבים המתועדים מקומית, בלי שום מעורבות של בינה מלאכותית, ובודק שהמספרים יוצאים זהים.
  • מה נשלח. התשובה מציגה בדיוק מה יצא מהמחשב שלכם עבור השאלה הזו.
  • גלוי וניתן לביטול. קווי מתאר, הערות ושינויי תצוגה מופיעים על התמונה תוך כדי, ואפשר לבטל כל אחד מהם.
תשובה של SlideScope Ask Your Slide על חתך צבוע ב-DAB: ‏15.4% מתוך 577 גרעינים חיוביים ל-DAB, ‏H-score ‏20.1, ‏Allred ‏4, ‏910 גרעינים חיוביים למילימטר רבוע עם ציטוט [R1], הגרעינים שנוקדו מסומנים בקווי מתאר על התמונה, והראיות מפרטות את שלב הכימות המקומי עם קישורים ל-Re-run without AI, ל-Export ול-Make figure.
תשובה אמיתית של Ask Your Slide ב-SlideScope 1.23 לשאלה “איזה אחוז מהגרעינים כאן חיובי ל-DAB?” (15.4%) על חתך IHC של BrdU מתריסריון של עכבר (EPFL, ‏CC BY 4.0). הגרעינים מסומנים בקווי מתאר לפי דרגת ה-DAB שלהם, התשובה מצטטת את התצוגה שבה השתמשה כ-[R1], והראיות מציגות את השלב המקומי שהפיק כל מספר, עם Re-run without AI, ‏Export ו-Make figure.

פרטיות מובנית: מה בדיוק נשלח

הניתוח רץ במחשב שלכם. את תכנון השלבים ואת כתיבת התשובה עושה מודל בינה מלאכותית בענן, ומתג בחלונית Ask Your Slide, ‏Send view images, קובע אם הוא רואה תמונה בכלל.

Send view imagesמה נשלח לבינה המלאכותית בענןמה לעולם לא יוצא מהמחשב שלכם
כבוי (“No images”)השאלה שלכם, פרטים טכניים מוגבלים (פורמט, ממדים, ערוצים, גודל פיקסל) והמספרים שהכלים המקומיים חישבוהתמונה והקובץ
מופעלאותו הדבר, ובנוסף התצוגות שהבינה המלאכותית מסתכלת עליהן, כל אחת מוצגת קודם על המסך שלכם, דחוסההקובץ וכל חלק בתמונה שהבינה המלאכותית לא מסתכלת עליו

השאלות והתמונות שלכם אינן משמשות לאימון מודלים של בינה מלאכותית. סריקות רפואיות כמו CT ו-MRI נדחות. ספק הבינה המלאכותית והתנאים המלאים מופיעים בהודעת הפרטיות, ודף הטיפול בנתונים מסביר מה שאר SlideScope שומר במחשב שלכם.

ייצוא למחברת המעבדה, לאיור ולפרק השיטות

  • answer.md: התשובה עם הציטוטים שלה, מוכנה להדבקה במחברת מעבדה.
  • analysis_record.json: התיעוד המלא של השלבים, הפרמטרים והתוצאות, אותה רשומה ש-Re-run without AI משתמש בה.
  • טקסט שיטות: פסקה שמתארת מה נמדד ואיך, להתאמה לכתב יד.
  • תוצרי Quantify: טבלת האובייקטים כ-CSV, קווי מתאר כ-GeoJSON (הם נפתחים ב-QuPath), מסכות ותמונה מסומנת.
  • Make figure: איור של התצוגה עם פס קנה מידה מכויל.

רשימות התיוג לדיווח של קהילת QUAREP-LiMi מבקשות מכותבים לדווח על תהליכי ניתוח תמונה ועל פרטי איורים כמו פסי קנה מידה (Schmied et al., Nature Methods 2023). הרשומה וטקסט השיטות נותנים לכם את הפרמטרים לדווח עליהם.

כמה מדויק ניקוד Ki67 ו-IHC אוטומטי?

קשה לשחזר ניקוד Ki67 בעין, וזו הסיבה העיקרית לתת לכלי לספור:

  • כש-International Ki67 in Breast Cancer Working Group שלחה את אותם 30 מקרי סרטן שד ל-23 פתולוגים ב-12 מדינות, ההסכמה (ICC) הייתה 0.87 בשיטת הספירה הגלובלית ו-0.83 בניקוד מוקדים חמים, שלא עמד בקריטריון ההצלחה של המחקר. הקוראים לא תמיד בחרו את אותו מוקד חם בשקופית (Leung et al., Histopathology 2019).
  • שישה פתולוגים מומחים לשד שניקדו 57 שקופיות Ki-67 הגיעו להסכמה בינונית בלבד בסף של 20% (מקדמים של 0.44 ו-0.48 בשני סבבים), והכותבים הסיקו שנדרש ניתוח תמונה דיגיטלי כדי לשפר אותה (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
  • ניתוח תמונה דיגיטלי עקבי יותר: ארבעה אלגוריתמים ב-QuPath שבנו ארבעה פתולוגים באופן עצמאי, לפי ההנחיות של קבוצת העבודה, הסכימו עם אלגוריתם ייחוס ב-ICC של 0.938 על 157 מקרי סרטן שד חיוביים לקולטן אסטרוגן (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

המחקרים האלה מתארים ניקוד Ki67 ידני ואוטומטי באופן כללי; הם לא בדקו את SlideScope. ניקוד ה-IHC של SlideScope עוקב אחר ההגדרות של QuPath (ספי צפיפות אופטית של DAB של 0.2, ‏0.4 ו-0.6 עבור 1+, ‏2+ ו-3+), והכימות המקומי שלו נבדק מול QuPath 0.7.0 על אותן שקופיות. איתור המוקדים החמים הוא חישוב של צפיפות אובייקטים עם ציון z, לא שיקול דעת, כך שאותו אזור ואותן הגדרות נותנים את אותם מוקדים חמים.

איך לבדוק תשובה בעצמכם

  1. הסתכלו על קווי המתאר על התמונה: גרעינים שהוחמצו, שכנים שאוחדו ופסולת צבועה בולטים במבט אחד.
  2. לחצו על [R1] כדי לחזור לתצוגה המדויקת, עשו זום, וספרו שדה קטן ביד מול המספר המדווח.
  3. פתחו את Evidence וודאו שהמישור, שטח האזור והפרמטרים הם אלה שהתכוונתם אליהם.
  4. בדקו רוויה לפני שאתם סומכים על עוצמות: שאלו אילו ערוצים רוויים באותו אזור.
  5. לחצו על Re-run without AI ושמרו את רשומת הניתוח יחד עם הנתונים שלכם.

Ask Your Slide, צ'אטבוט כללי, כתיבת סקריפטים או קופיילוט ארגוני

Ask Your Slideהעלאת תמונה לצ'אטבוט כלליכתיבת סקריפטים ל-QuPath או ל-Fijiקופיילוטים ארגוניים לפתולוגיה
מאיפה המספרים מגיעיםמהכלים המקומיים של SlideScope, עם הפרמטרים גלוייםמהמודל, או מקוד שהוא כותב במהלך השיחהמהסקריפט שלכם, שרץ ב-QuPath או ב-Fijiמהמודלים של הספק, במערכת שלו
לאן התמונה הולכתנשארת במחשב שלכם במצב No images; אחרת נשלחות תצוגות דחוסות שאתם רואים קודםמועלית לשרתים של הצ'אטבוטנשאר במחשב שלכםמוחזקת במערכת של הספק
בדיקה ושחזור של תוצאהראיות לכל שלב; ‏Re-run without AI בודק שהמספרים זהיםשאלה חוזרת עשויה לתת תשובה אחרתניתן לשחזור אם שומרים את הסקריפט ואת הגרסאותתלוי בספק
הקמהמתקינים את SlideScope ושואליםאין, אבל קודם מייצאים תמונה שהצ'אטבוט יכול לקרואלימוד ממשק הסקריפטים וניפוי באגים בקוד, כולל קוד שצ'אטבוט כותב בשבילכםחוזה מוסדי ופריסה
פורמטים של שקופיות מלאות ומיקרוסקופיםCZI,‏ ND2,‏ SVS,‏ NDPI,‏ MRXS,‏ OME-TIFF,‏ DICOM וכ-39 פורמטיםבדרך כלל רק פורמטי תמונה נפוציםרחב, דרך Bio-Formats ו-OpenSlideהפורמטים שמערכת הספק קולטת
הכי מתאים לספירות סטנדרטיות, ציוני IHC וערכים לפי אזור בלי קוד, עם תיעוד שאפשר להציגתיאור מהיר של תמונהצינורות עיבוד מותאמים ומסווגים מאומניםתוכניות מחקר קליני גדולות

QuPath ו-Fiji חינמיים ונשארים הבחירה הנכונה לניתוח מותאם אישית או מבוסס סקריפטים; ראו איך לספור תאים ב-ImageJ, ב-QuPath או ב-CellProfiler. כדי לתאר תצוגה במילים במקום למדוד אותה, השתמשו ב-AI Analysis.

פורמטים ושפות

Ask Your Slide עובד על התמונות ש-SlideScope פותח: תמונות שקופית מלאה ב-CZI,‏ ND2,‏ SVS,‏ NDPI,‏ MRXS,‏ OME-TIFF ו-DICOM, וכ-39 פורמטים בסך הכול, משקופיות מלאות בשדה בהיר ועד פלואורסצנציה רב-ערוצית עם Z, זמן וסצנות. הרשימה המלאה נמצאת בדף תאימות הקבצים. התשובות מתקבלות ב-14 שפות, וממשק האפליקציה זמין ב-10.

מי מקבל את Ask Your Slide

Ask Your Slide הוא חלק מ-SlideScope החל מגרסה 1.23.0 ב-Windows וב-macOS. הוא כלול בתוכניות SlideScope בתשלום במסגרת מגבלות של שימוש הוגן ב-AI; בתוכניות Plus המגבלות גבוהות יותר. השוואת טיפולים על פני ניסוי זמינה כבר היום ב-SlideScope Plus, דרך ניסויים; שאלות על ניסוי שלם מתוכננות בהמשך. עם חשבון SlideScope חינמי אפשר לנסות את Ask Your Slide על שקופיות הדוגמה החינמיות, שלוש שאלות ביום; שאלות על התמונות שלכם דורשות מנוי. המחירים העדכניים מופיעים בדף התוכניות.

שאלות על Ask Your Slide

האם ChatGPT יכול לספור תאים בתמונת מיקרוסקופיה?

לא באופן אמין בעצמו. צ'אטבוט כללי עונה מתוך התמונה שאתם מעלים, או מתוך קוד שהוא כותב באותה שיחה, כך שהשיטה עלולה להשתנות משיחה לשיחה, וצילום מסך לא נושא את גודל הפיקסל. הרצאה בסדנה משנת 2024 על צ'אטבוטים לניתוח תמונה מציינת שמודלי שפה לא נבנו כדי לספור אובייקטים בתמונות. ‏Ask Your Slide עובד אחרת: הבינה המלאכותית רק מתכננת את השלבים, כלי הספירה של SlideScope עצמו מפיקים כל מספר במחשב שלכם, ו-Re-run without AI מחשב אותם מחדש.

האם התמונות שלי נשלחות לענן?

לא כש-Send view images כבוי (No images): התמונה לעולם לא יוצאת מהמחשב שלכם, ולבינה המלאכותית בענן נשלחים רק השאלה שלכם, פרטים טכניים מוגבלים (פורמט, ממדים, ערוצים, גודל פיקסל) והמספרים שחושבו. כשהמתג מופעל, נשלחות גם התצוגות שהבינה המלאכותית מסתכלת עליהן, דחוסות, וכל אחת מהן מוצגת קודם על המסך שלכם. הנתונים שלכם אינם משמשים לאימון מודלים של בינה מלאכותית.

האם Ask Your Slide הוא כלי אבחון?

לא. Ask Your Slide מיועד לשימוש מחקרי בלבד ואינו אבחנה רפואית. הוא מסרב לסריקות רפואיות כמו CT ו-MRI, והתשובות שלו מדווחות מדידות, לא אבחנות או דירוגים.

כמה מדויק ניקוד Ki67 אוטומטי בהשוואה לניקוד ידני?

ניקוד Ki67 ידני משתנה בין קוראים: במחקר בינלאומי, 23 פתולוגים הגיעו ל-ICC של 0.87 בניקוד גלובלי ו-0.83 בניקוד מוקדים חמים. ניתוח תמונה דיגיטלי עקבי יותר: ארבעה אלגוריתמים ב-QuPath שנבנו באופן עצמאי הסכימו עם ייחוס ב-ICC של 0.938. ספירות אוטומטיות עדיין דורשות בדיקה, לכן הסתכלו על קווי המתאר, השוו שדה קטן לספירה ידנית ושמרו את רשומת הראיות.

האם Ask Your Slide הוא אפליקציה חינמית לניקוד Ki67?

לא. Ask Your Slide כלול בתוכניות SlideScope בתשלום במסגרת מגבלות של שימוש הוגן ב-AI, עם מגבלות גבוהות יותר ב-Plus. עם חשבון חינמי אפשר לשאול שלוש שאלות ביום על שקופיות הדוגמה המובנות, שמגיעות גם עם כל כלי מקומי, והמחירים העדכניים מופיעים בדף התוכניות.

אפשר להריץ מחדש או לייצא את התוצאה?

כן. ‏Re-run without AI מחשב מחדש את השלבים המתועדים במחשב שלכם ובודק שהמספרים זהים. הייצוא שומר answer.md,‏ analysis_record.json ופסקת שיטות, ובנוסף את טבלת האובייקטים ב-CSV, קווי מתאר ב-GeoJSON, מסכות ותמונה מסומנת, ו-Make figure מוסיף פס קנה מידה.

על אילו פורמטי קבצים זה עובד?

על הפורמטים ש-SlideScope פותח: תמונות שקופית מלאה ב-CZI,‏ ND2,‏ SVS,‏ NDPI,‏ MRXS,‏ OME-TIFF ו-DICOM, וכ-39 פורמטים בסך הכול. סריקות רפואיות כמו CT ו-MRI נדחות.

במה זה שונה מ-QuPath או מ-ImageJ?

QuPath ו-ImageJ חינמיים, ניתנים לתכנות בסקריפטים, והם הכלים הנכונים לצינורות עיבוד מותאמים ולמסווגים מאומנים. ‏Ask Your Slide מיועד לשאלות הסטנדרטיות (ספירות, אחוז חיוביים, H-score,‏ Allred, סטטיסטיקה לפי אזור, מוקדים חמים) בלי לכתוב סקריפט, בתוך המציג שבו התמונה כבר פתוחה. ניקוד ה-IHC שלו משתמש בהגדרות תואמות QuPath, וקווי המתאר שלו ב-GeoJSON נפתחים ב-QuPath.

האם Ask Your Slide עובד במצב לא מקוון?

שאילת שאלות דורשת חיבור לאינטרנט, כי בינה מלאכותית בענן מתכננת את השלבים וכותבת את התשובה. הספירה, הניקוד והמדידה עצמם רצים במחשב שלכם.

אפשר לשאול על ניסוי שלם?

עדיין לא בשאלה: Ask Your Slide עונה על התמונה הפתוחה. כדי להשוות טיפולים על פני תמונות רבות כבר היום, השתמשו בניסויים ב-SlideScope Plus, שמריצים מתכון ספירה אחד על כל תמונה ומשווים טיפולים עם המבחן הסטטיסטי המתאים. שאלות על ניסוי שלם מתוכננות ל-Plus בהמשך.

מקורות

תשובות מהירות

מתאים במיוחד ל: חוקרים, יחידות ליבה וסטודנטים שצריכים ספירות סטנדרטיות, ציוני Ki67 או IHC ומדידות של אזורים מתמונות מיקרוסקופיה ושקופיות בלי לכתוב סקריפטים, עם תיעוד שאפשר להציג.

יתרונות מרכזיים: כל מספר מכלי מקומי, ציטוטים שמחזירים לתצוגה המדויקת, Re-run without AI, מצב No images, ייצוא למחברת ולפרק השיטות, כ-39 פורמטים ו-14 שפות תשובה.

מגבלה חשובה: לשימוש מחקרי בלבד, לא אבחנה; הוא עונה על התמונה הפתוחה, ושאילת שאלות דורשת חיבור לאינטרנט.

נבדק לאחרונה: 6 בנובמבר 2026.

שאלו את השקופיות שלכם

הורידו את SlideScope, גלו את ספריית הדוגמאות החינמית, והירשמו למנוי (PayPal או כרטיס, בחיוב ברגע ההרשמה, ביטול בכל עת מהחשבון) כדי להשתמש ב-Ask Your Slide על התמונות שלכם החל מגרסה 1.23.0.

הורדת SlideScope