열려 있는 이미지에 대해 “이 영역에서 Ki67 양성 핵은 몇 퍼센트인가요?”처럼 질문을 입력하세요. AI 어시스턴트가 단계를 계획하고, SlideScope가 자체 계수, IHC 점수 산정, 측정 도구를 내 컴퓨터에서 실행합니다. 답변의 모든 숫자는 이 도구 중 하나에서 나오며, 확인할 수 있는 근거와 AI 없이 같은 단계를 다시 실행하는 버튼이 함께 제공됩니다. 연구용으로만 사용하세요.
모든 숫자는 로컬 도구에서No images 모드: 이미지는 내 컴퓨터에 남습니다근거, 재실행, 내보내기
Ask Your Slide의 작동 방식
Windows 또는 macOS의 SlideScope에서 이미지를 엽니다. 전체 슬라이드, 공초점 스택, 형광 이미지 등 SlideScope가 지원하는 형식이면 됩니다.
평소 쓰는 말로 질문합니다. 특정 영역에 대한 질문이라면 먼저 영역을 그리거나 해당 시야로 확대하세요. 답변은 14개 언어 중 원하는 언어로 받을 수 있습니다.
AI는 계획하고, 실제 작업은 로컬 도구가 합니다. 어시스턴트가 단계(핵 계수, DAB 점수 산정, 영역 측정, 핫스팟 찾기)를 고르면 SlideScope가 각 단계를 내 컴퓨터에서 실행합니다. 모든 동작이 이미지 위에서 그대로 보이며, 각각 실행 취소할 수 있습니다.
근거와 함께 답변을 읽습니다. 답변은 사용한 화면을 [R1], [R2] 등으로 정확히 인용하며, 인용을 클릭하면 그 화면으로 돌아갑니다. Evidence에는 모든 단계가 픽셀 단위 면적, 평면, 매개변수, 결과와 함께 나열되고, 답변에는 무엇이 전송되었는지 표시됩니다.
확인하고, 다시 실행하고, 내보냅니다. Re-run without AI는 같은 단계를 로컬에서 다시 계산하고 숫자가 동일한지 확인합니다. 답변, 분석 기록, 방법(Methods) 단락을 내보내거나 스케일 바가 있는 그림을 만드세요.
공개 샘플 이미지(EPFL BrdU IHC, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP)로 SlideScope 1.23에서 녹화한 62초 데모를 보세요. 소리는 없습니다.
물어볼 수 있는 질문과 답을 내는 도구
Ask Your Slide는 SlideScope 자체 도구로 작동합니다. 핵, 세포, 입자 계수(InstanSeg 딥러닝 분할 또는 고전적 방법), DAB IHC 점수 산정, 영역 통계, 보정된 측정, 채널 포화 통계, 핫스팟 찾기, 영역 윤곽선, 노트, 화면 제어가 있습니다. 몇 가지 예를 들면 다음과 같습니다.
질문
SlideScope가 실행하는 도구
제공하는 것
“이 영역에서 Ki67 양성 핵은 몇 퍼센트인가요?”
핵 계수(InstanSeg) 후 DAB IHC 점수 산정
계수한 핵 수와 함께 양성 비율, 이미지 위 윤곽선
“내가 표시한 영역의 H-score와 Allred 점수를 알려 주세요.”
핵 계수, QuPath 호환 정의에 따른 IHC 점수 산정
해당 영역의 H-score, Allred 점수, 양성 비율
“가장 밀집된 영역 세 곳을 찾아 각각 Ki67 점수를 매겨 주세요.”
핫스팟 찾기, 영역 윤곽 표시, 영역별 계수와 점수 산정
윤곽이 표시된 핫스팟 3곳과 각각의 mm²당 밀도, z-점수, Ki67 퍼센트
“이 시야에 세포가 몇 개 있고, 크기는 어느 정도인가요?”
세포 계수(InstanSeg 또는 고전적 방법)
개수와 객체 면적, CSV와 GeoJSON으로 내보내기 가능
“이 두 영역의 DAPI 밀도를 비교해 주세요.”
각 영역의 영역 통계와 핵 수
면적, 개수, mm²당 밀도를 나란히 비교
“여기서 가장 밝은 채널은 무엇이고, 포화된 부분이 있나요?”
영역 통계, 채널 포화 통계
채널별 평균 강도와 각 채널의 포화 비율
“GFP가 가장 밝은 영역으로 이동해 주세요.”
GFP 채널에서 핫스팟 찾기 후 화면 이동
해당 영역으로 확대된 화면과 영역 윤곽선
“이 영역의 면적은 몇 µm²이고, 그중 DAB 양성인 부분은 얼마나 되나요?”
보정된 측정, 영역 통계
µm² 단위 면적과 DAB 양성 면적 비율
“Z-평면 12로 이동해서 핵을 세어 주세요.”
화면 이동(Z), 핵 계수
해당 평면의 개수, 근거에 평면이 기록됨
“이 숫자들로 노트를 추가해 주세요.”
노트 추가
이미지와 함께 남는 슬라이드 노트
현재 Ask Your Slide는 열려 있는 이미지에 대해 답합니다. 여러 이미지에 걸쳐 처리군을 비교하려면 SlideScope Plus의 Experiments를 사용하세요. 모든 이미지에 하나의 계수 레시피를 적용하고 적절한 통계 검정으로 비교합니다. 실험 전체에 대해 질문하는 기능은 추후 제공될 예정입니다.
모든 숫자는 도구에서 나옵니다
범용 AI 모델은 그림을 보고 객체 수를 세도록 만들어지지 않았습니다(Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024). 그래서 Ask Your Slide는 모델이 숫자를 추정하도록 두지 않습니다. 어시스턴트는 어떤 도구를 실행할지만 정하고, 답변의 모든 개수, 점수, 면적, 강도는 SlideScope가 내 컴퓨터에서 계산하며, 각각을 직접 확인할 수 있습니다.
화면 인용. 각 진술은 그것이 나온 화면([R1], [R2])을 가리킵니다. 클릭하면 SlideScope가 정확히 그 위치, 배율, 평면으로 돌아갑니다.
근거(Evidence). 모든 단계를 분석한 영역의 픽셀 면적, 평면, 사용한 매개변수, 결과와 함께 보여 줍니다.
Re-run without AI. 기록된 단계를 AI 없이 로컬에서 다시 계산하고, 숫자가 동일하게 나오는지 확인합니다.
전송된 내용. 답변에는 그 질문을 위해 내 컴퓨터에서 나간 내용이 정확히 표시됩니다.
눈에 보이고 되돌릴 수 있음. 윤곽선, 노트, 화면 변경은 일어나는 즉시 이미지 위에 나타나며, 각각 실행 취소할 수 있습니다.
마우스 십이지장의 BrdU IHC 절편(EPFL, CC BY 4.0)에서 “여기서 DAB 양성 핵은 몇 %인가요?”라는 질문에 SlideScope 1.23의 Ask Your Slide가 실제로 내놓은 답변(15.4%)입니다. 핵은 DAB 등급별로 윤곽이 표시되고, 답변은 사용한 화면을 [R1]로 인용하며, 근거에는 모든 숫자를 만든 로컬 단계가 Re-run without AI, Export, Make figure와 함께 표시됩니다.
설계부터 지키는 프라이버시: 정확히 무엇이 전송되나요
분석은 내 컴퓨터에서 실행됩니다. 단계 계획과 답변 작성은 클라우드 AI 모델이 맡으며, Ask Your Slide 패널의 스위치인 Send view images가 AI가 이미지를 볼 수 있는지를 결정합니다.
Send view images
클라우드 AI로 전송되는 것
내 컴퓨터를 절대 떠나지 않는 것
끔(“No images”)
질문, 제한된 기술 정보(형식, 이미지 크기, 채널, 픽셀 크기), 로컬 도구가 계산한 숫자
이미지와 파일
켬
위와 동일, 여기에 AI가 보는 화면이 추가됩니다. 각 화면은 먼저 내 화면에 표시된 뒤 압축되어 전송됩니다
파일, 그리고 AI가 보지 않는 이미지의 모든 부분
질문과 이미지는 AI 모델 학습에 사용되지 않습니다. CT와 MRI 같은 의료 영상은 거부됩니다. AI 제공업체와 전체 약관은 개인정보 처리방침에 있으며, 데이터 처리 페이지에서 SlideScope의 나머지 기능이 내 컴퓨터에 무엇을 보관하는지 설명합니다.
연구 노트, 그림, 방법 섹션을 위한 내보내기
answer.md: 인용이 포함된 답변으로, 실험 노트에 바로 붙여 넣을 수 있습니다.
analysis_record.json: 단계, 매개변수, 결과의 전체 기록으로, Re-run without AI가 사용하는 것과 같은 기록입니다.
방법(Methods) 텍스트: 무엇을 어떻게 측정했는지 설명하는 단락으로, 원고에 맞게 다듬어 쓸 수 있습니다.
QUAREP-LiMi 커뮤니티의 보고 체크리스트는 저자에게 이미지 분석 워크플로와 스케일 바 같은 그림 세부 사항을 보고하도록 요구합니다(Schmied et al., Nature Methods 2023). 분석 기록과 방법 텍스트에 보고할 매개변수가 담겨 있습니다.
Ki67 및 IHC 자동 점수 산정은 얼마나 정확할까요?
육안으로 매긴 Ki67 점수는 재현하기 어렵습니다. 도구에 계수를 맡기는 가장 큰 이유입니다.
International Ki67 in Breast Cancer Working Group이 같은 유방암 30건을 12개국 병리의사 23명에게 보냈을 때, 일치도(ICC)는 전체(global) 계수법에서 0.87, 핫스팟 점수법에서 0.83이었으며 핫스팟 점수법은 연구의 성공 기준에 미달했습니다. 판독자들이 한 슬라이드에서 항상 같은 핫스팟을 고른 것도 아니었습니다(Leung et al., Histopathology 2019).
디지털 이미지 분석은 더 일관됩니다. 병리의사 4명이 작업 그룹의 가이드라인에 따라 각자 독립적으로 만든 QuPath 알고리즘 4개는 ER 양성 유방암 157건에서 기준 알고리즘과 ICC 0.938로 일치했습니다(Boyaci et al., Biomolecules 2021).
이 연구들은 수동 및 자동 Ki67 점수 산정 전반을 다룬 것이며, SlideScope를 시험하지는 않았습니다. SlideScope의 IHC 점수 산정은 QuPath의 정의(1+, 2+, 3+에 대한 DAB 광학 밀도 기준값 0.2, 0.4, 0.6)를 따르며, 로컬 정량 결과는 같은 슬라이드에서 QuPath 0.7.0의 결과와 대조해 확인했습니다. 핫스팟 찾기는 판단이 아니라 z-점수를 이용한 객체 밀도 계산이므로, 같은 영역과 설정이면 같은 핫스팟이 나옵니다.
답변을 직접 검증하는 방법
이미지 위 윤곽선을 보세요. 놓친 핵, 합쳐진 이웃 핵, 염색된 잔해가 한눈에 드러납니다.
[R1]을 클릭해 정확히 그 화면으로 돌아간 뒤 확대해서, 작은 시야를 직접 세어 보고된 숫자와 비교하세요.
Evidence를 열어 평면, 영역 면적, 매개변수가 의도한 대로인지 확인하세요.
강도 값을 믿기 전에 포화 여부를 확인하세요. 같은 영역에서 어떤 채널이 포화되었는지 물어보면 됩니다.
Re-run without AI를 누르고, 분석 기록을 데이터와 함께 보관하세요.
Ask Your Slide, 범용 챗봇, 스크립팅, 엔터프라이즈 코파일럿 비교
Ask Your Slide
범용 챗봇에 이미지 업로드
QuPath 또는 Fiji 스크립트 작성
엔터프라이즈 병리 코파일럿
숫자의 출처
SlideScope의 로컬 도구, 매개변수 표시
모델 자체 또는 채팅 중 모델이 작성한 코드
내 스크립트를 QuPath나 Fiji가 실행
공급업체 플랫폼에서 돌아가는 공급업체의 모델
이미지가 가는 곳
No images 모드에서는 내 컴퓨터에 남음, 그 외에는 먼저 확인한 압축 화면만 전송
챗봇 서버에 업로드됨
내 컴퓨터에만 보관
공급업체 플랫폼에 보관됨
결과 확인과 반복
단계별 근거, Re-run without AI로 숫자가 동일한지 확인
다시 물으면 다른 답이 나올 수 있음
스크립트와 버전을 보관하면 반복 가능
플랫폼에 따라 다름
설정
SlideScope 설치 후 질문
없음. 단, 챗봇이 읽을 수 있는 이미지로 먼저 내보내야 함
스크립팅 API 학습과 코드 디버깅(챗봇이 대신 작성한 코드 포함)
기관 계약과 배포
전체 슬라이드 및 현미경 형식
CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM 등 약 39개 형식
Ask Your Slide는 SlideScope가 여는 이미지에서 작동합니다. CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM 전체 슬라이드 이미지 등 모두 약 39개 형식으로, 명시야 전체 슬라이드부터 Z, 시간, 장면이 있는 다채널 형광 이미지까지 포함합니다. 전체 목록은 파일 호환성 페이지에 있습니다. 답변은 14개 언어로, 앱 인터페이스는 10개 언어로 제공됩니다.
Ask Your Slide를 사용할 수 있는 사람
Ask Your Slide는 Windows와 macOS용 SlideScope 1.23.0 버전부터 포함됩니다. 공정 사용 AI 한도 내에서 SlideScope 유료 요금제에 포함되며, Plus 요금제는 한도가 더 높습니다. 실험 전체에 걸친 처리군 비교는 현재 SlideScope Plus의 Experiments로 할 수 있으며, 실험 전체에 대해 질문하는 기능은 추후 제공될 예정입니다. 무료 SlideScope 계정으로는 무료 샘플 슬라이드에서 하루 세 번 Ask Your Slide를 사용해 볼 수 있으며, 내 이미지에 대해 질문하려면 구독이 필요합니다. 현재 가격은 요금제 페이지에 있습니다.
Ask Your Slide에 관한 질문
ChatGPT로 현미경 이미지의 세포를 셀 수 있나요?
그것만으로는 신뢰하기 어렵습니다. 범용 챗봇은 업로드한 그림이나 그 채팅에서 작성한 코드를 바탕으로 답하므로 채팅마다 방법이 달라질 수 있고, 스크린샷에는 픽셀 크기 정보가 없습니다. 이미지 분석용 챗봇을 다룬 2024년 워크숍 발표에서도 언어 모델은 이미지 속 객체를 세도록 만들어지지 않았다고 지적합니다. Ask Your Slide는 다르게 작동합니다. AI는 단계만 계획하고, 모든 숫자는 SlideScope 자체 계수 도구가 내 컴퓨터에서 산출하며, Re-run without AI로 다시 계산할 수 있습니다.
내 이미지가 클라우드로 전송되나요?
Send view images를 끄면(No images) 전송되지 않습니다. 이미지는 내 컴퓨터를 떠나지 않으며, 질문, 제한된 기술 정보(형식, 이미지 크기, 채널, 픽셀 크기), 계산된 숫자만 클라우드 AI로 전송됩니다. 스위치를 켜면 AI가 보는 화면도 압축되어 전송되며, 각 화면은 먼저 내 화면에 표시됩니다. 내 데이터는 AI 모델 학습에 사용되지 않습니다.
Ask Your Slide는 진단 도구인가요?
아니요. Ask Your Slide는 연구용으로만 사용할 수 있으며 의학적 진단이 아닙니다. CT와 MRI 같은 의료 영상은 거부하며, 답변은 진단이나 등급이 아니라 측정값을 보고합니다.
Ki67 자동 점수 산정은 수동 점수 산정과 비교해 얼마나 정확한가요?
수동 Ki67 점수는 판독자마다 다릅니다. 한 국제 연구에서 병리의사 23명의 ICC는 전체(global) 점수법에서 0.87, 핫스팟 점수법에서 0.83이었습니다. 디지털 이미지 분석은 더 일관됩니다. 독립적으로 만든 QuPath 알고리즘 4개가 기준과 ICC 0.938로 일치했습니다. 그래도 자동 계수는 확인이 필요하므로 윤곽선을 살펴보고, 작은 시야를 직접 센 결과와 비교하고, 근거 기록을 보관하세요.
Ask Your Slide는 무료 Ki67 점수 산정 앱인가요?
아니요. Ask Your Slide는 공정 사용 AI 한도 내에서 SlideScope 유료 요금제에 포함되며, Plus는 한도가 더 높습니다. 무료 계정으로는 내장 샘플 슬라이드에 대해 하루 세 번 질문할 수 있고, 이 샘플 슬라이드에서는 모든 로컬 도구도 사용할 수 있습니다. 현재 가격은 요금제 페이지에 있습니다.
결과를 다시 실행하거나 내보낼 수 있나요?
네. Re-run without AI는 기록된 단계를 내 컴퓨터에서 다시 계산하고 숫자가 동일한지 확인합니다. Export는 answer.md, analysis_record.json, 방법 단락과 함께 객체 CSV, GeoJSON 윤곽선, 마스크, 주석 이미지를 저장하며, Make figure는 스케일 바를 추가합니다.
어떤 파일 형식에서 작동하나요?
SlideScope가 여는 형식에서 작동합니다. CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM 전체 슬라이드 이미지 등 모두 약 39개 형식입니다. CT와 MRI 같은 의료 영상은 거부됩니다.
QuPath나 ImageJ와는 어떻게 다른가요?
QuPath와 ImageJ는 무료이고 스크립트를 쓸 수 있으며, 맞춤형 파이프라인과 학습된 분류기에 적합한 도구입니다. Ask Your Slide는 스크립트를 작성하지 않고, 이미지가 이미 열려 있는 뷰어 안에서 표준적인 질문(개수, 양성 비율, H-score, Allred, 영역 통계, 핫스팟)에 답하기 위한 기능입니다. IHC 점수 산정은 QuPath 호환 정의를 사용하며, GeoJSON 윤곽선은 QuPath에서 열립니다.
Ask Your Slide는 오프라인에서도 작동하나요?
질문하려면 인터넷 연결이 필요합니다. 클라우드 AI가 단계를 계획하고 답변을 작성하기 때문입니다. 계수, 점수 산정, 측정 자체는 내 컴퓨터에서 실행됩니다.
실험 전체에 대해 질문할 수 있나요?
아직 질문으로는 할 수 없습니다. Ask Your Slide는 열려 있는 이미지에 대해 답합니다. 지금 여러 이미지에 걸쳐 처리군을 비교하려면 SlideScope Plus의 Experiments를 사용하세요. 모든 이미지에 하나의 계수 레시피를 실행하고 적절한 통계 검정으로 처리군을 비교합니다. 실험 전체에 대한 질문 기능은 추후 Plus에 추가될 예정입니다.
![DAB 염색 절편에 대한 SlideScope Ask Your Slide 답변: 핵 577개 중 15.4%가 DAB 양성, H-score 20.1, Allred 4, 제곱밀리미터당 양성 핵 910개와 [R1] 인용, 이미지 위에 윤곽이 표시된 점수 산정 대상 핵, 그리고 Re-run without AI, Export, Make figure 링크와 함께 로컬 quantify 단계를 나열한 근거.](/assets/product-ask-your-slide.webp)