Ask Your Slide · từ SlideScope 1.23.0

Đếm tế bào và chấm điểm IHC bằng cách hỏi chính tiêu bản của bạn

Hãy gõ một câu hỏi về ảnh bạn đang mở, chẳng hạn “Trong vùng này, bao nhiêu phần trăm nhân dương tính Ki67?” Một trợ lý AI lập kế hoạch các bước, còn SlideScope chạy các công cụ đếm, chấm điểm IHC và đo của chính nó ngay trên máy tính của bạn. Mọi con số trong câu trả lời đều đến từ một trong các công cụ đó, kèm bằng chứng để kiểm tra và một nút chạy lại các bước mà không cần AI. Chỉ dùng cho nghiên cứu.

Mọi con số đều từ một công cụ chạy trên máy Chế độ No images: ảnh ở lại trên máy tính của bạn Bằng chứng, chạy lại và xuất

Ask Your Slide hoạt động như thế nào

  1. Mở ảnh trong SlideScope trên Windows hoặc macOS: một ảnh toàn tiêu bản, một chồng ảnh đồng tiêu (confocal), một ảnh huỳnh quang hoặc bất kỳ định dạng nào SlideScope mở được.
  2. Hỏi bằng ngôn ngữ thông thường. Nếu câu hỏi chỉ về một khu vực, hãy vẽ một vùng hoặc phóng to đến trường nhìn đó trước. Câu trả lời có thể ở bất kỳ ngôn ngữ nào trong 14 ngôn ngữ.
  3. AI lập kế hoạch; công cụ trên máy làm việc. Trợ lý chọn các bước (đếm nhân, chấm điểm DAB, đo một vùng, tìm điểm nóng), và SlideScope chạy từng bước trên máy tính của bạn. Bạn theo dõi mọi thao tác trên ảnh, và thao tác nào cũng có thể hoàn tác.
  4. Đọc câu trả lời cùng bằng chứng. Câu trả lời trích dẫn chính xác các khung nhìn đã dùng dưới dạng [R1], [R2], v.v.: nhấp vào một trích dẫn để quay lại khung nhìn đó. Evidence liệt kê mọi bước kèm diện tích tính bằng điểm ảnh, mặt phẳng, tham số và kết quả, và câu trả lời cho thấy những gì đã được gửi đi.
  5. Kiểm tra, chạy lại và xuất. Re-run without AI tính lại các bước đó ngay trên máy và kiểm tra rằng các con số giống hệt nhau. Xuất câu trả lời, hồ sơ phân tích và một đoạn Methods, hoặc tạo hình minh họa có thanh tỷ lệ.

Xem bản demo 62 giây được ghi trong SlideScope 1.23 trên các ảnh mẫu công khai (IHC BrdU của EPFL, CC BY 4.0; DAPI/GFP của czitools). Không có âm thanh.

Những câu bạn có thể hỏi, và các công cụ trả lời chúng

Ask Your Slide làm việc với các công cụ của chính SlideScope: đếm nhân, tế bào hoặc hạt (phân đoạn học sâu InstanSeg hoặc phương pháp cổ điển), chấm điểm IHC cho DAB, thống kê theo vùng, phép đo đã hiệu chuẩn, thống kê bão hòa theo kênh, công cụ tìm điểm nóng, đường viền vùng, ghi chú và điều khiển khung nhìn. Một vài ví dụ:

Bạn hỏiCông cụ SlideScope chạyBạn nhận được gì
“Trong vùng này, bao nhiêu phần trăm nhân dương tính Ki67?”Đếm nhân (InstanSeg), rồi chấm điểm IHC cho DABPhần trăm dương tính kèm số nhân đã đếm, và đường viền trên ảnh
“Cho tôi H-score và điểm Allred của vùng tôi đã khoanh.”Đếm nhân, chấm điểm IHC theo định nghĩa tương thích với QuPathH-score, điểm Allred và phần trăm dương tính cho vùng đó
“Tìm ba khu vực dày đặc nhất và chấm điểm Ki67 ở từng khu vực.”Tìm điểm nóng, khoanh vùng, đếm và chấm điểm theo từng vùngBa điểm nóng được khoanh viền, mỗi điểm kèm mật độ trên mỗi mm², một z-score và phần trăm Ki67
“Trường nhìn này có bao nhiêu tế bào, và chúng lớn cỡ nào?”Đếm tế bào (InstanSeg hoặc cổ điển)Số đếm và diện tích đối tượng, xuất được dưới dạng CSV và GeoJSON
“So sánh mật độ DAPI ở hai vùng này.”Thống kê vùng và số đếm nhân cho từng vùngDiện tích, số đếm và mật độ trên mỗi mm² đặt cạnh nhau
“Ở đây kênh nào sáng nhất, và có gì bị bão hòa không?”Thống kê vùng, thống kê bão hòa theo kênhCường độ trung bình theo từng kênh và tỷ lệ bão hòa của mỗi kênh
“Đưa tôi đến khu vực GFP sáng nhất.”Tìm điểm nóng trên kênh GFP, rồi di chuyển khung nhìnKhung nhìn được phóng to đến khu vực đó, với vùng được khoanh viền
“Diện tích vùng này là bao nhiêu µm², và bao nhiêu phần trong đó dương tính DAB?”Phép đo đã hiệu chuẩn, thống kê vùngDiện tích tính bằng µm² và phần trăm diện tích dương tính DAB
“Chuyển đến mặt phẳng Z 12 và đếm nhân.”Di chuyển khung nhìn (Z), đếm nhânSố đếm trên mặt phẳng đó, với mặt phẳng được ghi lại trong bằng chứng
“Thêm một ghi chú với các con số này.”Thêm ghi chúMột ghi chú trên tiêu bản, luôn đi cùng ảnh

Hiện tại Ask Your Slide trả lời về ảnh đang mở. Để so sánh các nghiệm thức trên nhiều ảnh, hãy dùng Experiments trong SlideScope Plus: một công thức đếm cho mọi ảnh, được so sánh bằng kiểm định thống kê phù hợp. Việc hỏi về toàn bộ một thí nghiệm đã được lên kế hoạch cho sau này.

Mọi con số đều đến từ một công cụ

Các mô hình AI đa năng không được xây dựng để đếm đối tượng bằng cách nhìn ảnh (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), vì vậy Ask Your Slide không bao giờ để mô hình ước đoán một con số. Trợ lý chỉ quyết định chạy công cụ nào; mọi số đếm, điểm số, diện tích và cường độ trong câu trả lời đều do SlideScope tính trên máy tính của bạn, và bạn có thể kiểm tra từng con số:

  • Trích dẫn đến khung nhìn. Mỗi nhận định trỏ đến khung nhìn mà nó dựa vào ([R1], [R2]). Nhấp vào đó và SlideScope quay lại đúng vị trí, mức phóng và mặt phẳng ấy.
  • Bằng chứng (Evidence). Mọi bước, kèm diện tích đã phân tích tính bằng điểm ảnh, mặt phẳng, các tham số đã dùng và kết quả.
  • Re-run without AI. Tính lại các bước đã ghi ngay trên máy, không có AI tham gia, và kiểm tra rằng các con số ra giống hệt nhau.
  • Những gì đã gửi. Câu trả lời cho thấy chính xác những gì đã rời khỏi máy tính của bạn cho câu hỏi đó.
  • Thấy được và hoàn tác được. Đường viền, ghi chú và thay đổi khung nhìn hiện lên trên ảnh ngay khi diễn ra, và mỗi thao tác đều có thể hoàn tác.
Câu trả lời của SlideScope Ask Your Slide trên một lát cắt nhuộm DAB: 15,4% trong số 577 nhân dương tính DAB, H-score 20,1, Allred 4, 910 nhân dương tính trên mỗi milimét vuông kèm trích dẫn [R1], các nhân đã chấm điểm được viền trên ảnh, và bằng chứng liệt kê bước quantify chạy trên máy với các liên kết đến Re-run without AI, Export và Make figure.
Một câu trả lời thật của Ask Your Slide trong SlideScope 1.23 cho câu hỏi “Ở đây bao nhiêu % nhân dương tính DAB?” (15,4%) trên một lát cắt IHC BrdU của tá tràng chuột (EPFL, CC BY 4.0). Các nhân được viền theo mức DAB, câu trả lời trích dẫn khung nhìn đã dùng là [R1], và bằng chứng cho thấy bước chạy trên máy đã tạo ra từng con số, cùng các nút Re-run without AI, Export và Make figure.

Riêng tư ngay từ thiết kế: chính xác những gì được gửi đi

Phân tích chạy trên máy tính của bạn. Việc lập kế hoạch các bước và viết câu trả lời do một mô hình AI trên đám mây đảm nhận, và một công tắc trong bảng Ask Your Slide, Send view images, quyết định nó có bao giờ nhìn thấy hình ảnh hay không.

Send view imagesNhững gì được gửi đến AI trên đám mâyNhững gì không bao giờ rời khỏi máy tính của bạn
Tắt (“No images”)Câu hỏi của bạn, một số chi tiết kỹ thuật giới hạn (định dạng, kích thước, kênh, kích thước điểm ảnh) và các con số do công cụ trên máy tính raẢnh và tệp
BậtNhư trên, cộng với các khung nhìn AI xem, mỗi khung nhìn được hiển thị trên màn hình của bạn trước, ở dạng nénTệp và mọi phần của ảnh mà AI không xem

Câu hỏi và ảnh của bạn không được dùng để huấn luyện mô hình AI. Ảnh chụp y khoa như CT và MRI bị từ chối. Nhà cung cấp AI và điều khoản đầy đủ có trong thông báo quyền riêng tư, và trang xử lý dữ liệu giải thích những gì phần còn lại của SlideScope lưu trên máy tính của bạn.

Dữ liệu xuất cho sổ ghi chép thí nghiệm, hình minh họa và phần Methods

  • answer.md: câu trả lời kèm các trích dẫn, sẵn sàng dán vào sổ ghi chép thí nghiệm.
  • analysis_record.json: hồ sơ đầy đủ về các bước, tham số và kết quả, cũng chính là hồ sơ mà Re-run without AI sử dụng.
  • Văn bản Methods: một đoạn mô tả những gì đã được đo và đo như thế nào, để chỉnh sửa cho bản thảo.
  • Kết quả Quantify: bảng đối tượng dạng CSV, đường viền dạng GeoJSON (mở được trong QuPath), mặt nạ và một ảnh có chú thích.
  • Make figure: một hình minh họa của khung nhìn với thanh tỷ lệ đã hiệu chuẩn.

Các danh mục kiểm tra báo cáo của cộng đồng QUAREP-LiMi yêu cầu tác giả báo cáo quy trình phân tích ảnh và các chi tiết của hình như thanh tỷ lệ (Schmied et al., Nature Methods 2023). Hồ sơ phân tích và văn bản Methods cung cấp cho bạn các tham số cần báo cáo.

Chấm điểm Ki67 và IHC tự động chính xác đến đâu?

Chấm điểm Ki67 bằng mắt khó tái lập, và đó là lý do chính để giao việc đếm cho một công cụ:

  • Khi International Ki67 in Breast Cancer Working Group gửi cùng 30 ca ung thư vú cho 23 bác sĩ giải phẫu bệnh ở 12 quốc gia, mức đồng thuận (ICC) đạt 0,87 với phương pháp đếm toàn diện (global) và 0,83 với chấm điểm theo điểm nóng (hot-spot), mức không đạt tiêu chí thành công của nghiên cứu. Người đọc không phải lúc nào cũng chọn cùng một điểm nóng trên một tiêu bản (Leung et al., Histopathology 2019).
  • Sáu bác sĩ giải phẫu bệnh chuyên sâu về vú chấm điểm 57 tiêu bản Ki-67 chỉ đạt mức đồng thuận trung bình ở ngưỡng 20% (hệ số 0,44 và 0,48 trong hai vòng), và các tác giả kết luận rằng cần phân tích ảnh kỹ thuật số để cải thiện điều này (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
  • Phân tích ảnh kỹ thuật số nhất quán hơn: bốn thuật toán QuPath do bốn bác sĩ giải phẫu bệnh xây dựng độc lập, theo hướng dẫn của nhóm công tác trên, đồng thuận với một thuật toán tham chiếu ở ICC 0,938 trên 157 ca ung thư vú ER dương tính (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Các nghiên cứu này mô tả việc chấm điểm Ki67 thủ công và tự động nói chung; chúng không kiểm tra SlideScope. Tính năng chấm điểm IHC của SlideScope theo các định nghĩa của QuPath (ngưỡng mật độ quang DAB 0,2, 0,4 và 0,6 cho 1+, 2+ và 3+), và phần định lượng trên máy của nó đã được đối chiếu với QuPath 0.7.0 trên cùng các tiêu bản. Công cụ tìm điểm nóng là một phép tính mật độ đối tượng kèm z-score, không phải một đánh giá chủ quan, nên cùng một vùng và cùng thiết lập sẽ cho ra cùng các điểm nóng.

Cách kiểm tra nhanh một câu trả lời

  1. Nhìn các đường viền trên ảnh: nhân bị bỏ sót, nhân kề nhau bị gộp và mảnh vụn bắt màu đều lộ ra ngay.
  2. Nhấp [R1] để quay lại đúng khung nhìn, phóng to, rồi tự đếm tay một trường nhìn nhỏ để đối chiếu với con số được báo cáo.
  3. Mở Evidence và xác nhận rằng mặt phẳng, diện tích vùng và các tham số đúng là những gì bạn định dùng.
  4. Kiểm tra bão hòa trước khi tin vào cường độ: hãy hỏi kênh nào bị bão hòa trong cùng vùng đó.
  5. Nhấn Re-run without AI và lưu hồ sơ phân tích cùng dữ liệu của bạn.

Ask Your Slide, chatbot đa năng, viết script hay copilot doanh nghiệp

Ask Your SlideTải ảnh lên một chatbot đa năngViết script cho QuPath hoặc FijiCopilot giải phẫu bệnh cho doanh nghiệp
Các con số đến từ đâuCông cụ chạy trên máy của SlideScope, có hiển thị tham sốTừ mô hình, hoặc từ đoạn mã nó viết trong cuộc trò chuyệnScript của bạn, do QuPath hoặc Fiji chạyCác mô hình của nhà cung cấp trên nền tảng của họ
Ảnh đi đâuỞ lại trên máy tính của bạn ở chế độ No images; nếu không, là các khung nhìn nén mà bạn xem trướcĐược tải lên máy chủ của chatbotVẫn nằm trên máy tính của bạnĐược lưu giữ trên nền tảng của nhà cung cấp
Kiểm tra và lặp lại một kết quảBằng chứng cho từng bước; Re-run without AI kiểm tra rằng các con số giống hệt nhauHỏi lại có thể cho ra câu trả lời khácLặp lại được nếu bạn giữ script và các phiên bảnTùy nền tảng
Thiết lậpCài SlideScope và đặt câu hỏiKhông cần, nhưng trước tiên bạn phải xuất một ảnh mà chatbot đọc đượcHọc API viết script và gỡ lỗi mã, kể cả mã do chatbot viết cho bạnHợp đồng với tổ chức và triển khai
Định dạng toàn tiêu bản và kính hiển viCZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM và khoảng 39 định dạngThường chỉ các định dạng ảnh phổ biếnRộng, thông qua Bio-Formats và OpenSlideCác định dạng mà nền tảng đó tiếp nhận
Phù hợp nhất choSố đếm chuẩn, điểm IHC và số liệu theo vùng mà không cần viết mã, kèm hồ sơ để trình bàyMột mô tả nhanh về một bức ảnhQuy trình tùy chỉnh và bộ phân loại đã huấn luyệnCác chương trình nghiên cứu lâm sàng quy mô lớn

QuPath và Fiji miễn phí và vẫn là lựa chọn đúng cho phân tích tùy chỉnh hoặc bằng script; xem cách đếm tế bào trong ImageJ, QuPath hoặc CellProfiler. Để mô tả một khung nhìn bằng lời thay vì đo nó, hãy dùng AI Analysis.

Định dạng và ngôn ngữ

Ask Your Slide làm việc với các ảnh mà SlideScope mở được: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, ảnh toàn tiêu bản DICOM và tổng cộng khoảng 39 định dạng, từ ảnh toàn tiêu bản trường sáng đến ảnh huỳnh quang nhiều kênh có Z, thời gian và scene. Danh sách đầy đủ có trên trang tương thích tệp. Câu trả lời có ở 14 ngôn ngữ, và giao diện ứng dụng có ở 10 ngôn ngữ.

Ai được dùng Ask Your Slide

Ask Your Slide là một phần của SlideScope từ phiên bản 1.23.0 trên Windows và macOS. Tính năng này có trong các gói SlideScope trả phí, trong giới hạn sử dụng AI hợp lý; các gói Plus có giới hạn cao hơn. Hiện tại, việc so sánh các nghiệm thức trên cả một thí nghiệm có trong SlideScope Plus, thông qua Experiments; việc hỏi về toàn bộ một thí nghiệm đã được lên kế hoạch cho sau này. Với một tài khoản SlideScope miễn phí, bạn có thể thử Ask Your Slide trên các tiêu bản mẫu miễn phí, ba câu hỏi mỗi ngày; hỏi về ảnh của chính bạn cần một gói thuê bao. Giá hiện hành có trên trang các gói.

Câu hỏi về Ask Your Slide

ChatGPT có đếm được tế bào trong ảnh hiển vi không?

Tự nó thì không đáng tin cậy. Một chatbot đa năng trả lời dựa trên bức ảnh bạn tải lên, hoặc từ đoạn mã nó viết trong cuộc trò chuyện đó, nên phương pháp có thể thay đổi giữa các cuộc trò chuyện, và một ảnh chụp màn hình không mang theo kích thước điểm ảnh. Một bài trình bày tại hội thảo năm 2024 về chatbot cho phân tích ảnh lưu ý rằng các mô hình ngôn ngữ không được xây dựng để đếm đối tượng trong ảnh. Ask Your Slide hoạt động khác: AI chỉ lập kế hoạch các bước, các công cụ đếm của chính SlideScope tạo ra mọi con số trên máy tính của bạn, và Re-run without AI tính lại chúng.

Ảnh của tôi có bị gửi lên đám mây không?

Không, khi Send view images tắt (No images): ảnh không bao giờ rời khỏi máy tính của bạn, và chỉ câu hỏi của bạn, một số chi tiết kỹ thuật giới hạn (định dạng, kích thước, kênh, kích thước điểm ảnh) và các con số đã tính được gửi đến AI trên đám mây. Khi bật công tắc, các khung nhìn AI xem cũng được gửi đi ở dạng nén, và mỗi khung nhìn được hiển thị trên màn hình của bạn trước. Dữ liệu của bạn không được dùng để huấn luyện mô hình AI.

Ask Your Slide có phải là công cụ chẩn đoán không?

Không. Ask Your Slide chỉ dùng cho nghiên cứu và không phải là chẩn đoán y khoa. Tính năng này từ chối ảnh chụp y khoa như CT và MRI, và câu trả lời của nó báo cáo các phép đo, không phải chẩn đoán hay phân độ.

Chấm điểm Ki67 tự động chính xác đến đâu so với chấm điểm thủ công?

Chấm điểm Ki67 thủ công dao động giữa những người đọc: trong một nghiên cứu quốc tế, 23 bác sĩ giải phẫu bệnh đạt ICC 0,87 với chấm điểm toàn diện và 0,83 với chấm điểm theo điểm nóng. Phân tích ảnh kỹ thuật số nhất quán hơn: bốn thuật toán QuPath được xây dựng độc lập đồng thuận với một tham chiếu ở ICC 0,938. Số đếm tự động vẫn cần được kiểm tra, vì vậy hãy xem các đường viền, so một trường nhìn nhỏ với số đếm tay, và lưu lại hồ sơ bằng chứng.

Ask Your Slide có phải là ứng dụng chấm điểm Ki67 miễn phí không?

Không. Ask Your Slide có trong các gói SlideScope trả phí, trong giới hạn sử dụng AI hợp lý, với giới hạn cao hơn ở Plus. Với một tài khoản miễn phí, bạn có thể hỏi ba câu mỗi ngày về các tiêu bản mẫu tích hợp sẵn, vốn cũng đi kèm mọi công cụ chạy trên máy, và giá hiện hành có trên trang các gói.

Tôi có thể chạy lại hoặc xuất kết quả không?

Có. Re-run without AI tính lại các bước đã ghi trên máy tính của bạn và kiểm tra rằng các con số giống hệt nhau. Export lưu answer.md, analysis_record.json và một đoạn Methods, cùng CSV đối tượng, đường viền GeoJSON, mặt nạ và một ảnh có chú thích, còn Make figure thêm thanh tỷ lệ.

Tính năng này làm việc với những định dạng tệp nào?

Các định dạng SlideScope mở được: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, ảnh toàn tiêu bản DICOM và tổng cộng khoảng 39 định dạng. Ảnh chụp y khoa như CT và MRI bị từ chối.

Nó khác gì so với QuPath hoặc ImageJ?

QuPath và ImageJ miễn phí, viết script được và là công cụ phù hợp cho các quy trình tùy chỉnh và bộ phân loại đã huấn luyện. Ask Your Slide dành cho các câu hỏi chuẩn (số đếm, phần trăm dương tính, H-score, Allred, thống kê vùng, điểm nóng) mà không cần viết script, ngay trong trình xem nơi ảnh đã được mở. Tính năng chấm điểm IHC của nó dùng định nghĩa tương thích với QuPath, và đường viền GeoJSON của nó mở được trong QuPath.

Ask Your Slide có hoạt động ngoại tuyến không?

Việc hỏi cần kết nối internet, vì một AI trên đám mây lập kế hoạch các bước và viết câu trả lời. Bản thân việc đếm, chấm điểm và đo đều chạy trên máy tính của bạn.

Tôi có thể hỏi về toàn bộ một thí nghiệm không?

Hiện chưa thể hỏi như vậy: Ask Your Slide trả lời về ảnh đang mở. Để so sánh các nghiệm thức trên nhiều ảnh ngay hôm nay, hãy dùng Experiments trong SlideScope Plus, tính năng chạy một công thức đếm trên mọi ảnh và so sánh các nghiệm thức bằng kiểm định thống kê phù hợp. Việc đặt câu hỏi về toàn bộ một thí nghiệm đã được lên kế hoạch cho Plus sau này.

Nguồn

Trả lời nhanh

Phù hợp nhất: nhà nghiên cứu, đơn vị dịch vụ chung (core facility) và sinh viên cần số đếm chuẩn, điểm Ki67 hoặc IHC và phép đo theo vùng từ ảnh hiển vi và ảnh tiêu bản mà không phải viết script, kèm một hồ sơ để trình bày.

Điểm mạnh chính: mọi con số đều từ một công cụ chạy trên máy, trích dẫn dẫn về đúng khung nhìn, Re-run without AI, chế độ No images, dữ liệu xuất cho sổ ghi chép thí nghiệm và phần Methods, khoảng 39 định dạng và câu trả lời ở 14 ngôn ngữ.

Hạn chế quan trọng: chỉ dùng cho nghiên cứu, không phải chẩn đoán; tính năng trả lời về ảnh đang mở, và việc hỏi cần kết nối internet.

Xem xét lần cuối: 6 tháng 11 năm 2026.

Hỏi chính tiêu bản của bạn

Tải xuống SlideScope, khám phá thư viện mẫu miễn phí, và đăng ký gói thuê bao (PayPal hoặc thẻ, thanh toán khi đăng ký, hủy bất cứ lúc nào trong tài khoản) để dùng Ask Your Slide trên ảnh của chính bạn từ phiên bản 1.23.0.

Tải xuống SlideScope