Ask Your Slide · с версии SlideScope 1.23.0

Подсчитывайте клетки и оценивайте ИГХ, задавая вопросы своему слайду

Задайте вопрос об открытом изображении, например: «Какой процент ядер в этой области Ki67-положителен?» ИИ-ассистент планирует шаги, а SlideScope выполняет на вашем компьютере собственные инструменты подсчёта, оценки ИГХ и измерений. Каждое число в ответе получено одним из этих инструментов; к нему прилагаются доказательства для проверки и кнопка, которая повторяет шаги без ИИ. Только для исследовательских целей.

Скачать SlideScope Посмотреть планы

Каждое число — от локального инструмента Режим «Без изображений» (No images): изображение остаётся на вашем компьютере Доказательства, повторный запуск и экспорт

Как работает Ask Your Slide

Откройте изображение в SlideScope в Windows или macOS: полнослайдовое изображение, конфокальный стек, флуоресцентное изображение или файл в любом из форматов, которые открывает SlideScope.
Спросите обычным языком. Если вопрос касается одного участка, сначала выделите область или увеличьте нужное поле. Ответ можно получить на любом из 14 языков.
ИИ планирует, локальные инструменты выполняют работу. Ассистент выбирает шаги (подсчитать ядра, оценить DAB, измерить область, найти горячие точки), а SlideScope выполняет каждый из них на вашем компьютере. Каждое действие видно на изображении, и любое из них можно отменить.
Прочитайте ответ вместе с доказательствами. Ответ ссылается на точные виды, которые он использовал, — [R1], [R2] и так далее: щёлкните по ссылке, чтобы вернуться к этому виду. В доказательствах перечислен каждый шаг с площадью в пикселях, плоскостью, параметрами и результатами, а в ответе показано, что было отправлено.
Проверьте, повторите и экспортируйте. «Повторить без ИИ» заново вычисляет те же шаги локально и проверяет, что числа совпадают. Экспортируйте ответ, запись анализа и абзац для раздела «Методы» или сделайте рисунок с масштабной линейкой.

Посмотрите 62-секундную демонстрацию, записанную в SlideScope 1.23 на общедоступных образцах (ИГХ на BrdU от EPFL, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). Без звука.

Какие вопросы можно задать и какие инструменты на них отвечают

Ask Your Slide работает с собственными инструментами SlideScope: подсчёт ядер, клеток или частиц (сегментация глубоким обучением InstanSeg или классический метод), оценка ИГХ по DAB, статистика по областям, калиброванные измерения, статистика насыщения каналов, поиск горячих точек, контуры областей, заметки и управление видом. Несколько примеров:

Вы спрашиваете	Какие инструменты запускает SlideScope	Что вы получаете
«Какой процент ядер в этой области Ki67-положителен?»	Подсчёт ядер (InstanSeg), затем оценка ИГХ по DAB	Процент положительных ядер с числом подсчитанных ядер и контуры на изображении
«Посчитай H-score и балл Allred для выделенной области.»	Подсчёт ядер, оценка ИГХ по определениям, совместимым с QuPath	H-score, балл Allred и процент положительных ядер для этой области
«Найди три самых плотных участка и оцени Ki67 в каждом.»	Поиск горячих точек, обводка областей, подсчёт и оценка в каждой области	Три обведённые горячие точки с плотностью на мм², z-оценкой и процентом Ki67 для каждой
«Сколько клеток в этом поле и какого они размера?»	Подсчёт клеток (InstanSeg или классический метод)	Число клеток и площади объектов с экспортом в CSV и GeoJSON
«Сравни плотность DAPI в этих двух областях.»	Статистика по областям и подсчёт ядер в каждой области	Площадь, число и плотность на мм² для обеих областей рядом
«Какой канал здесь самый яркий и есть ли насыщение?»	Статистика по областям, статистика насыщения каналов	Средняя интенсивность в каждом канале и доля насыщенных пикселей в каждом
«Покажи самый яркий участок GFP.»	Поиск горячих точек в канале GFP, затем перемещение вида	Вид, увеличенный на этот участок, с обведённой областью
«Какова площадь этой области в µm² и какая её часть DAB-положительна?»	Калиброванное измерение, статистика по областям	Площадь в µm² и процент DAB-положительной площади
«Перейди к Z-плоскости 12 и подсчитай ядра.»	Перемещение вида (Z), подсчёт ядер	Число ядер в этой плоскости; плоскость записана в доказательствах
«Добавь заметку с этими числами.»	Добавление заметки	Заметка на слайде, которая остаётся с изображением

Сейчас Ask Your Slide отвечает на вопросы об открытом изображении. Чтобы сравнить группы обработки на многих изображениях, используйте эксперименты в SlideScope Plus: один рецепт подсчёта для каждого изображения и сравнение подходящим статистическим тестом. Вопросы о целом эксперименте планируется добавить позже.

Каждое число получено инструментом

Универсальные модели ИИ не создавались для того, чтобы считать объекты, разглядывая картинку (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), поэтому Ask Your Slide никогда не позволяет модели оценивать число на глаз. Ассистент лишь решает, какие инструменты запустить; каждое число, оценку, площадь и интенсивность в ответе вычисляет SlideScope на вашем компьютере, и каждое из них можно проверить:

Ссылки на виды. Каждое утверждение указывает на вид, из которого оно получено ([R1], [R2]). Щёлкните по ссылке, и SlideScope вернётся точно к этому положению, увеличению и плоскости.
Доказательства. Каждый шаг с площадью анализа в пикселях, плоскостью, использованными параметрами и результатами.
Повторить без ИИ (Re-run without AI). Заново вычисляет записанные шаги локально, без участия ИИ, и проверяет, что числа получаются идентичными.
Что было отправлено. Ответ точно показывает, что покинуло ваш компьютер ради этого вопроса.
Всё на виду и всё отменяемо. Контуры, заметки и изменения вида появляются на изображении по ходу работы, и любое из них можно отменить.

Ответ Ask Your Slide в SlideScope на срезе, окрашенном DAB: 15,4% из 577 ядер DAB-положительны, H-score 20,1, Allred 4, 910 положительных ядер на квадратный миллиметр со ссылкой [R1], оценённые ядра обведены на изображении, а в доказательствах указан локальный шаг количественного анализа со ссылками «Повторить без ИИ», «Экспорт» и «Сделать рисунок». — Настоящий ответ Ask Your Slide в SlideScope 1.23 на вопрос «Какой % ядер здесь DAB-положителен?» (15,4%) на срезе двенадцатиперстной кишки мыши с ИГХ на BrdU (EPFL, CC BY 4.0). Ядра обведены по степени окрашивания DAB, ответ ссылается на использованный вид как [R1], а доказательства показывают локальный шаг, давший каждое число, с кнопками «Повторить без ИИ», «Экспорт» и «Сделать рисунок».

Конфиденциальность по умолчанию: что именно отправляется

Анализ выполняется на вашем компьютере. Шаги планирует и ответ пишет облачная модель ИИ, а переключатель на панели Ask Your Slide, Отправлять изображения вида (Send view images), определяет, увидит ли она вообще хоть одну картинку.

Отправлять изображения вида	Что отправляется облачному ИИ	Что никогда не покидает ваш компьютер
Выкл. («Без изображений»)	Ваш вопрос, ограниченные технические сведения (формат, размеры, каналы, размер пикселя) и числа, вычисленные локальными инструментами	Изображение и файл
Вкл.	То же самое плюс виды, которые просматривает ИИ: каждый сначала показывается на вашем экране и отправляется в сжатом виде	Файл и все части изображения, которые ИИ не просматривает

Ваши вопросы и изображения не используются для обучения моделей ИИ. Медицинские снимки, такие как КТ и МРТ, отклоняются. Поставщик ИИ и полные условия указаны в уведомлении о конфиденциальности, а страница об обработке данных объясняет, что остальные функции SlideScope хранят на вашем компьютере.

Экспорт для лабораторного журнала, рисунков и раздела «Методы»

answer.md: ответ со ссылками, готовый для вставки в лабораторный журнал.
analysis_record.json: полная запись шагов, параметров и результатов — та же, которую использует «Повторить без ИИ».
Текст методов: абзац о том, что и как измерялось, который можно адаптировать для рукописи.
Результаты Quantify: таблица объектов в CSV, контуры в GeoJSON (открываются в QuPath), маски и аннотированное изображение.
Сделать рисунок (Make figure): рисунок вида с калиброванной масштабной линейкой.

Чек-листы сообщества QUAREP-LiMi для публикаций просят авторов описывать процедуры анализа изображений и детали рисунков, например масштабные линейки (Schmied et al., Nature Methods 2023). Запись анализа и текст методов дают вам параметры, которые нужно указать.

Насколько точна автоматическая оценка Ki67 и ИГХ?

Оценку Ki67 на глаз трудно воспроизвести, и это главная причина доверить подсчёт инструменту:

Когда International Ki67 in Breast Cancer Working Group разослала одни и те же 30 случаев рака молочной железы 23 патологам из 12 стран, согласованность (ICC) составила 0,87 при глобальном методе подсчёта и 0,83 при оценке по горячим точкам, что не достигло критерия успеха исследования. Патологи не всегда выбирали на слайде одну и ту же горячую точку (Leung et al., Histopathology 2019).
Шесть узкоспециализированных патологов молочной железы, оценивших 57 слайдов Ki-67, достигли лишь умеренной согласованности при пороге 20% (коэффициенты 0,44 и 0,48 в двух раундах), и авторы заключили, что для её улучшения нужен цифровой анализ изображений (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Цифровой анализ изображений даёт более согласованные результаты: четыре алгоритма QuPath, независимо построенные четырьмя патологами по руководству рабочей группы, совпали с эталонным алгоритмом с ICC 0,938 на 157 ER-положительных случаях рака молочной железы (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Эти исследования описывают ручную и автоматическую оценку Ki67 в целом; SlideScope в них не проверялся. Оценка ИГХ в SlideScope следует определениям QuPath (пороги оптической плотности DAB 0,2, 0,4 и 0,6 для 1+, 2+ и 3+), а его локальный количественный анализ сверялся с QuPath 0.7.0 на тех же слайдах. Поиск горячих точек — это расчёт плотности объектов с z-оценкой, а не субъективное суждение, поэтому одна и та же область с теми же настройками даёт одни и те же горячие точки.

Как выборочно проверить ответ

Посмотрите на контуры на изображении: пропущенные ядра, слившиеся соседние ядра и окрашенный дебрис заметны сразу.
Щёлкните [R1], чтобы вернуться точно к этому виду, увеличьте изображение и вручную подсчитайте небольшое поле, сравнив результат с указанным числом.
Откройте доказательства и убедитесь, что плоскость, площадь области и параметры именно те, что вы имели в виду.
Прежде чем доверять интенсивностям, проверьте насыщение: спросите, какие каналы насыщены в той же области.
Нажмите «Повторить без ИИ» и храните запись анализа вместе с данными.

Ask Your Slide, универсальный чат-бот, скрипты или корпоративный копилот

	Ask Your Slide	Загрузка изображения в универсальный чат-бот	Написание скриптов для QuPath или Fiji	Корпоративные копилоты для патологии
Откуда берутся числа	Локальные инструменты SlideScope с указанием параметров	Модель или код, который она пишет во время чата	Ваш скрипт, выполняемый в QuPath или Fiji	Модели поставщика на его платформе
Куда попадает изображение	Остаётся на вашем компьютере в режиме «Без изображений»; иначе — сжатые виды, которые вы сначала видите сами	Загружается на серверы чат-бота	Остаётся на вашем компьютере	Хранится на платформе поставщика
Проверка и повторение результата	Доказательства по каждому шагу; «Повторить без ИИ» проверяет, что числа идентичны	Повторный вопрос может дать другой ответ	Воспроизводимо, если сохранить скрипт и версии	Зависит от платформы
Настройка	Установить SlideScope и спросить	Не нужна, но сначала нужно экспортировать изображение в формат, который чат-бот сможет прочитать	Изучение API для скриптов и отладка кода, в том числе кода, который пишет за вас чат-бот	Договор с учреждением и развёртывание
Полнослайдовые и микроскопические форматы	CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM и всего около 39 форматов	Обычно только распространённые форматы изображений	Широкая поддержка через Bio-Formats и OpenSlide	Форматы, которые принимает платформа
Лучше всего подходит для	Стандартные подсчёты, оценки ИГХ и показатели по областям без кода, с записью, которую можно предъявить	Быстрое описание картинки	Собственные конвейеры и обученные классификаторы	Крупные клинико-исследовательские программы

QuPath и Fiji бесплатны и остаются правильным выбором для нестандартного или скриптового анализа; см. как подсчитать клетки в ImageJ, QuPath или CellProfiler. Чтобы описать вид словами, а не измерять его, используйте AI Analysis.

Форматы и языки

Ask Your Slide работает с изображениями, которые открывает SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, полнослайдовые изображения DICOM и всего около 39 форматов — от полнослайдовых изображений в светлом поле до многоканальной флуоресценции с Z, временем и сценами. Полный список — на странице совместимости файлов. Ответы доступны на 14 языках, интерфейс приложения — на 10.

Кому доступен Ask Your Slide

Ask Your Slide входит в SlideScope начиная с версии 1.23.0 для Windows и macOS. Он включён в платные планы SlideScope в пределах лимитов добросовестного использования ИИ; в планах Plus лимиты выше. Сравнение групп обработки в рамках эксперимента уже сейчас доступно в SlideScope Plus через эксперименты; вопросы о целом эксперименте планируется добавить позже. С бесплатной учётной записью SlideScope можно попробовать Ask Your Slide на бесплатных образцах слайдов — три вопроса в день; для вопросов о собственных изображениях нужна подписка. Актуальные цены — на странице планов.

Вопросы об Ask Your Slide

Может ли ChatGPT подсчитать клетки на микроскопическом изображении?

Сам по себе — ненадёжно. Универсальный чат-бот отвечает по загруженной картинке или по коду, который он пишет в этом чате, поэтому метод может меняться от чата к чату, а снимок экрана не несёт информации о размере пикселя. В докладе 2024 года на семинаре о чат-ботах для анализа изображений отмечается, что языковые модели не создавались для подсчёта объектов на изображениях. Ask Your Slide работает иначе: ИИ лишь планирует шаги, каждое число на вашем компьютере дают собственные инструменты подсчёта SlideScope, а «Повторить без ИИ» вычисляет их заново.

Отправляются ли мои изображения в облако?

Нет, если переключатель «Отправлять изображения вида» выключен (режим «Без изображений»): изображение никогда не покидает ваш компьютер, а облачному ИИ отправляются только ваш вопрос, ограниченные технические сведения (формат, размеры, каналы, размер пикселя) и вычисленные числа. Если переключатель включён, отправляются также виды, которые просматривает ИИ, в сжатом виде, и каждый из них сначала показывается на вашем экране. Ваши данные не используются для обучения моделей ИИ.

Является ли Ask Your Slide инструментом диагностики?

Нет. Ask Your Slide предназначен только для исследований и не является медицинским диагнозом. Он отклоняет медицинские снимки, такие как КТ и МРТ, а его ответы содержат измерения, а не диагнозы или степени.

Насколько точна автоматическая оценка Ki67 по сравнению с ручной?

Ручная оценка Ki67 различается у разных экспертов: в международном исследовании 23 патолога достигли ICC 0,87 при глобальной оценке и 0,83 при оценке по горячим точкам. Цифровой анализ изображений даёт более согласованные результаты: четыре независимо построенных алгоритма QuPath совпали с эталоном с ICC 0,938. Автоматические подсчёты всё равно нужно проверять: смотрите на контуры, сравнивайте небольшое поле с ручным подсчётом и храните запись доказательств.

Ask Your Slide — бесплатное приложение для оценки Ki67?

Нет. Ask Your Slide входит в платные планы SlideScope в пределах лимитов добросовестного использования ИИ, а в Plus лимиты выше. С бесплатной учётной записью можно задавать три вопроса в день о встроенных образцах слайдов, для которых также доступны все локальные инструменты; актуальные цены — на странице планов.

Можно ли повторить или экспортировать результат?

Да. «Повторить без ИИ» заново вычисляет записанные шаги на вашем компьютере и проверяет, что числа идентичны. Экспорт сохраняет answer.md, analysis_record.json и абзац для раздела «Методы», а также CSV с объектами, контуры в GeoJSON, маски и аннотированное изображение, а «Сделать рисунок» добавляет масштабную линейку.

С какими форматами файлов он работает?

С форматами, которые открывает SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, полнослайдовые изображения DICOM и всего около 39 форматов. Медицинские снимки, такие как КТ и МРТ, отклоняются.

Чем это отличается от QuPath или ImageJ?

QuPath и ImageJ бесплатны, поддерживают скрипты и подходят для собственных конвейеров и обученных классификаторов. Ask Your Slide предназначен для стандартных вопросов (подсчёты, процент положительных, H-score, Allred, статистика по областям, горячие точки) без написания скриптов, прямо в просмотрщике, где изображение уже открыто. Оценка ИГХ в нём использует определения, совместимые с QuPath, а его контуры в GeoJSON открываются в QuPath.

Работает ли Ask Your Slide офлайн?

Для вопросов нужно подключение к интернету, потому что шаги планирует и ответ пишет облачный ИИ. Сами подсчёт, оценка и измерения выполняются на вашем компьютере.

Можно ли спросить о целом эксперименте?

Пока нет: Ask Your Slide отвечает на вопросы об открытом изображении. Чтобы уже сейчас сравнить группы обработки на многих изображениях, используйте эксперименты в SlideScope Plus: один рецепт подсчёта применяется к каждому изображению, а группы сравниваются подходящим статистическим тестом. Вопросы о целом эксперименте планируется добавить в Plus позже.

Источники

Быстрые ответы

Кому подходит: исследователям, центрам коллективного пользования и студентам, которым нужны стандартные подсчёты, оценки Ki67 или ИГХ и измерения областей на микроскопических изображениях и слайдах без написания скриптов, с записью, которую можно предъявить.

Главные преимущества: каждое число от локального инструмента, ссылки на точный вид, «Повторить без ИИ», режим «Без изображений», экспорт для лабораторного журнала и раздела «Методы», около 39 форматов и ответы на 14 языках.

Важное ограничение: только для исследований, не диагноз; отвечает только об открытом изображении, а для вопросов нужно подключение к интернету.

Последняя проверка: 6 ноября 2026 г.

Задавайте вопросы своим слайдам

Скачайте SlideScope, изучите бесплатную библиотеку образцов и оформите подписку (PayPal или карта, оплата при оформлении, отмена в любой момент в учётной записи), чтобы использовать Ask Your Slide на собственных изображениях начиная с версии 1.23.0.

Скачать SlideScope