Ask Your Slide · SlideScope 1.23.0 以降

スライドに質問するだけで、細胞を数え IHC をスコアリング

開いている画像について、「この領域で Ki67 陽性の核は何パーセント?」のように質問を入力します。AI アシスタントが手順を計画し、SlideScope が独自の計数、IHC スコアリング、計測ツールをお使いのコンピューター上で実行します。回答に含まれる数値はすべてこれらのツールのいずれかが算出したもので、確認するための根拠と、AI を使わずに手順を再実行するボタンが付いています。研究用途に限ります。

すべての数値はローカルツールから 「画像なし」モード:画像はお使いのコンピューターから出ません 根拠、再計算、書き出し

Ask Your Slide のしくみ

  1. Windows または macOS の SlideScope で画像を開きます:全スライド画像、共焦点スタック、蛍光画像のほか、SlideScope が開ける形式の画像であれば使えます。
  2. 普段の言葉で質問します。特定の領域についての質問なら、先に領域を描くか、その視野までズームしてください。回答は 14 言語のいずれかで返ってきます。
  3. AI が計画し、ローカルツールが処理します。アシスタントが手順(核の計数、DAB のスコアリング、領域の計測、ホットスポットの検出)を選び、SlideScope がそれぞれをお使いのコンピューター上で実行します。すべての操作は画像上で確認でき、どれも元に戻せます。
  4. 回答を根拠とともに読みます。回答は使用したビューを [R1]、[R2] のように引用しており、クリックするとそのビューに戻れます。「根拠」には各手順が、ピクセル単位の領域面積、プレーン、パラメーター、結果とともに一覧表示され、回答には送信された内容も示されます。
  5. 確認し、再計算し、書き出します。「AIなしで再計算」は同じ手順をローカルで計算し直し、数値が一致することを確かめます。回答、解析記録、方法(Methods)の段落を書き出したり、スケールバー付きの図を作成したりできます。

公開サンプル画像(EPFL BrdU IHC、CC BY 4.0、czitools DAPI/GFP)を使い、SlideScope 1.23 で収録した 62 秒のデモをご覧ください。音声はありません。

質問の例と、それに答えるツール

Ask Your Slide は SlideScope 独自のツールで動作します:核・細胞・粒子の計数(InstanSeg の深層学習セグメンテーションまたは古典的手法)、DAB の IHC スコアリング、領域統計、校正済みの計測、チャンネルの飽和統計、ホットスポット検出、領域の輪郭、メモ、表示操作です。いくつか例を挙げます:

質問SlideScope が実行するツール得られるもの
「この領域で Ki67 陽性の核は何パーセント?」核を計数(InstanSeg)し、DAB の IHC スコアリング陽性率と計数した核の数、画像上の輪郭
「囲んだ領域の H-score と Allred スコアを出して」核の計数、QuPath 互換の定義による IHC スコアリングその領域の H-score、Allred スコア、陽性率
「最も密集した 3 か所を見つけて、それぞれ Ki67 をスコアリングして」ホットスポット検出、領域の輪郭描画、領域ごとの計数とスコアリング輪郭で示された 3 つのホットスポットと、それぞれの mm² あたり密度、z スコア、Ki67 陽性率
「この視野に細胞はいくつあって、大きさはどのくらい?」細胞の計数(InstanSeg または古典的手法)個数とオブジェクトの面積。CSV と GeoJSON で書き出し可能
「この 2 つの領域で DAPI の密度を比べて」各領域の領域統計と核の数面積、個数、mm² あたり密度を並べて表示
「ここで一番明るいチャンネルはどれ?飽和しているものはある?」領域統計、チャンネルの飽和統計チャンネルごとの平均輝度と、それぞれの飽和画素の割合
「GFP が一番明るい領域に移動して」GFP チャンネルでホットスポットを検出し、表示を移動その領域までズームしたビューと、領域の輪郭
「この領域の面積は何 µm²?そのうち DAB 陽性はどれくらい?」校正済みの計測、領域統計µm² 単位の面積と DAB 陽性面積率
「Z プレーン 12 に移動して、核を数えて」表示の移動(Z)、核の計数そのプレーンでの個数。プレーンは根拠に記録されます
「この数値をメモに追加して」メモを追加画像とともに保存されるスライド上のメモ

現在の Ask Your Slide は、開いている画像について答えます。多くの画像にわたって処理群を比較するには、SlideScope Plus の実験機能をお使いください。すべての画像に同じ計数レシピを適用し、適切な統計検定で比較します。実験全体についての質問は今後対応予定です。

すべての数値はツールが算出

汎用の AI モデルは、画像を見て物体を数えるようには作られていません(Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024)。そのため Ask Your Slide は、モデルに数値を推定させることはありません。アシスタントが決めるのは実行するツールだけで、回答に含まれる個数、スコア、面積、輝度はすべて SlideScope がお使いのコンピューター上で計算し、一つひとつ確認できます:

  • ビューへの引用。各記述は、それが得られたビューを指し示します([R1]、[R2])。クリックすると、SlideScope はその位置、ズーム、プレーンに正確に戻ります。
  • 根拠。すべての手順を、解析したピクセル単位の面積、プレーン、使用したパラメーター、結果とともに記録します。
  • AIなしで再計算。記録された手順を AI を一切使わずにローカルで計算し直し、数値が一致することを確認します。
  • 送信された内容。その質問のためにお使いのコンピューターから何が送られたかを、回答が正確に示します。
  • 見える、元に戻せる。輪郭、メモ、表示の変更は実行と同時に画像上に表示され、どれも元に戻せます。
DAB 染色切片での SlideScope Ask Your Slide の回答:577 個の核のうち 15.4% が DAB 陽性、H-score 20.1、Allred 4、平方ミリメートルあたり 910 個の陽性核、[R1] の引用付き。スコアリングされた核が画像上に輪郭表示され、「根拠」にはローカルの Quantify の手順と、「AIなしで再計算」「書き出す」「図を作成」へのリンクが表示されています。
マウス十二指腸の BrdU IHC 切片(EPFL、CC BY 4.0)で「ここで DAB 陽性の核は何 %?」と質問したときの、SlideScope 1.23 の Ask Your Slide による実際の回答(15.4%)。核は DAB グレードごとに輪郭表示され、回答は使用したビューを [R1] として引用し、「根拠」にはすべての数値を算出したローカルの手順が、「AIなしで再計算」「書き出す」「図を作成」とともに表示されています。

設計段階からのプライバシー:送信される内容を正確に

解析はお使いのコンピューター上で実行されます。手順の計画と回答の作成はクラウドの AI モデルが行い、AI が画像を見るかどうかは、Ask Your Slide パネルのスイッチ「表示の画像を送信」で決まります。

表示の画像を送信クラウドの AI に送信されるものお使いのコンピューターから出ないもの
オフ(「画像なし」)質問、限られた技術情報(形式、サイズ、チャンネル、ピクセルサイズ)、ローカルツールが計算した数値画像とファイル
オン上記に加え、AI が見るビュー(いずれも先に画面に表示され、圧縮して送信)ファイルと、AI が見ない画像の部分すべて

ご質問や画像が AI モデルの学習に使われることはありません。CT や MRI などの医用画像は受け付けません。AI プロバイダーと詳しい条件はプライバシーに関する通知に、SlideScope のその他の機能がお使いのコンピューターに何を保持するかはデータの取り扱いのページに記載しています。

ラボノート、図、方法セクションのための書き出し

  • answer.md:引用付きの回答。ラボノートにそのまま貼り付けられます。
  • analysis_record.json:手順、パラメーター、結果の完全な記録。「AIなしで再計算」が使うのと同じ記録です。
  • 方法のテキスト:何をどのように計測したかを説明する段落。原稿に合わせて手直しできます。
  • Quantify の出力:CSV のオブジェクト表、GeoJSON の輪郭(QuPath で開けます)、マスク、注釈付き画像。
  • 図を作成:校正済みスケールバー付きのビューの図。

QUAREP-LiMi コミュニティのレポーティングチェックリストは、画像解析のワークフローや、スケールバーなどの図の詳細を報告するよう著者に求めています(Schmied et al., Nature Methods 2023)。記録と方法のテキストから、報告すべきパラメーターが得られます。

Ki67 と IHC の自動スコアリングはどれくらい正確か

目視による Ki67 のスコアリングは再現が難しく、それこそがツールに計数を任せる最大の理由です:

  • International Ki67 in Breast Cancer Working Group が同じ 30 例の乳がんを 12 か国の 23 人の病理医に送ったところ、一致度(ICC)はグローバル法で 0.87、ホットスポット法で 0.83 となり、後者は研究の成功基準に届きませんでした。読み手が同じスライドで同じホットスポットを選ぶとは限りませんでした(Leung et al., Histopathology 2019)。
  • 乳腺を専門とする 6 人の病理医が 57 枚の Ki-67 スライドをスコアリングしたところ、20% のカットオフでの一致は中程度にとどまり(2 回のラウンドで係数 0.44 と 0.48)、著者らは改善にはデジタル画像解析が必要だと結論づけました(Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024)。
  • デジタル画像解析のほうが一貫しています。ワーキンググループのガイドラインに従って 4 人の病理医がそれぞれ独立に構築した 4 つの QuPath アルゴリズムは、ER 陽性乳がん 157 例で、参照アルゴリズムと ICC 0.938 で一致しました(Boyaci et al., Biomolecules 2021)。

これらの研究は手動と自動の Ki67 スコアリング全般を扱ったもので、SlideScope を検証したものではありません。SlideScope の IHC スコアリングは QuPath の定義(1+、2+、3+ に対する DAB 光学濃度のカットオフ 0.2、0.4、0.6)に従っており、ローカルの定量結果は同じスライドで QuPath 0.7.0 と照合済みです。ホットスポット検出は判断ではなく、z スコアによるオブジェクト密度の計算なので、同じ領域と設定なら同じホットスポットが得られます。

回答を抜き取りで確認する方法

  1. 画像上の輪郭を見てください。見落とされた核、くっついた隣接核、染色されたデブリはひと目でわかります。
  2. [R1] をクリックしてそのビューに正確に戻り、ズームインして小さな視野を手で数え、報告された数値と比べます。
  3. 「根拠」を開き、プレーン、領域の面積、パラメーターが意図したとおりか確認します。
  4. 輝度を信頼する前に飽和を確認します。同じ領域でどのチャンネルが飽和しているか質問してください。
  5. 「AIなしで再計算」を押し、解析記録をデータとともに保管します。

Ask Your Slide、汎用チャットボット、スクリプト、企業向けコパイロットの比較

Ask Your Slide汎用チャットボットに画像をアップロードQuPath や Fiji のスクリプトを書く企業向けの病理コパイロット
数値の出どころSlideScope のローカルツール(パラメーターを表示)モデル、またはチャット中にモデルが書いたコード自分のスクリプトを QuPath や Fiji で実行ベンダーのプラットフォーム上のモデル
画像の行き先「画像なし」モードではコンピューター内にとどまり、それ以外では事前に確認できる圧縮ビューのみチャットボットのサーバーにアップロードコンピューターの外に出ませんベンダーのプラットフォーム上に保管
結果の確認と再現手順ごとの根拠。「AIなしで再計算」で数値の一致を確認聞き直すと答えが変わることがあるスクリプトとバージョンを保管すれば再現可能プラットフォームによる
セットアップSlideScope をインストールして質問するだけ不要。ただし、チャットボットが読める画像を先に書き出す必要ありスクリプト API の習得とコードのデバッグ(チャットボットが書いたコードを含む)機関としての契約と導入
全スライド形式と顕微鏡形式CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM など約 39 形式通常は一般的な画像形式のみBio-Formats と OpenSlide により幅広く対応プラットフォームが取り込める形式
最適な用途コード不要で標準的な計数、IHC スコア、領域の数値を、示せる記録付きで画像の簡単な説明独自のパイプラインと学習済み分類器大規模な臨床研究プログラム

QuPath と Fiji は無料で、独自の解析やスクリプトによる解析には今も最適な選択肢です。ImageJ、QuPath、CellProfiler で細胞を数える方法をご覧ください。ビューを計測するのではなく言葉で説明させたい場合は、AI Analysis をお使いください。

対応形式と言語

Ask Your Slide は、SlideScope が開ける画像で動作します:CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM の全スライド画像など合計約 39 形式で、明視野の全スライド画像から、Z・時間・シーンを含む多チャンネル蛍光画像まで対応します。全一覧はファイル互換性のページにあります。回答は 14 言語、アプリの表示言語は 10 言語に対応しています。

Ask Your Slide を利用できる方

Ask Your Slide は、Windows と macOS の SlideScope バージョン 1.23.0 以降に搭載されています。有料の SlideScope プランに AI のフェアユース上限の範囲内で含まれ、Plus プランでは上限が高くなります。実験全体での処理群の比較は、現在 SlideScope Plus の実験機能で行えます。実験全体についての質問は今後対応予定です。無料の SlideScope アカウントでは、無料のサンプルスライドで Ask Your Slide を 1 日 3 問まで試せます。ご自身の画像について質問するにはサブスクリプションが必要です。現在の価格はプランのページに掲載しています。

Ask Your Slide に関するよくある質問

ChatGPT で顕微鏡画像の細胞を数えられますか?

単独では信頼できません。汎用チャットボットは、アップロードされた画像か、そのチャットで書いたコードから答えるため、チャットごとに方法が変わることがあり、スクリーンショットにはピクセルサイズの情報もありません。画像解析へのチャットボット活用に関する 2024 年のワークショップ講演でも、言語モデルは画像内の物体を数えるようには作られていないと指摘されています。Ask Your Slide のしくみは異なります。AI は手順を計画するだけで、すべての数値は SlideScope 独自の計数ツールがお使いのコンピューター上で算出し、「AIなしで再計算」で計算し直せます。

画像はクラウドに送信されますか?

「表示の画像を送信」がオフ(画像なし)なら送信されません。画像はお使いのコンピューターから出ず、クラウドの AI に送られるのは、質問、限られた技術情報(形式、サイズ、チャンネル、ピクセルサイズ)、計算された数値だけです。スイッチをオンにすると、AI が見るビューも圧縮して送信され、どのビューも事前に画面に表示されます。お客様のデータが AI モデルの学習に使われることはありません。

Ask Your Slide は診断ツールですか?

いいえ。Ask Your Slide は研究用途に限られ、医学的診断ではありません。CT や MRI などの医用画像は受け付けず、回答が示すのは計測値であって、診断やグレードではありません。

Ki67 の自動スコアリングは手動と比べてどれくらい正確ですか?

手動の Ki67 スコアリングは読み手によってばらつきます。国際的な研究では、23 人の病理医の ICC はグローバル法で 0.87、ホットスポット法で 0.83 でした。デジタル画像解析のほうが一貫しており、独立に構築された 4 つの QuPath アルゴリズムは参照と ICC 0.938 で一致しました。それでも自動計数には確認が必要です。輪郭を見て、小さな視野を手で数えた結果と比べ、根拠の記録を保管してください。

Ask Your Slide は無料の Ki67 スコアリングアプリですか?

いいえ。Ask Your Slide は有料の SlideScope プランに AI のフェアユース上限の範囲内で含まれ、Plus では上限が高くなります。無料アカウントでは、内蔵のサンプルスライドについて 1 日 3 問まで質問でき、サンプルスライドではすべてのローカルツールも使えます。現在の価格はプランのページに掲載しています。

結果を再計算したり書き出したりできますか?

はい。「AIなしで再計算」は記録された手順をお使いのコンピューター上で計算し直し、数値が一致することを確認します。書き出しでは answer.md、analysis_record.json、方法の段落に加え、オブジェクトの CSV、GeoJSON の輪郭、マスク、注釈付き画像を保存でき、「図を作成」ではスケールバーを追加できます。

どのファイル形式で使えますか?

SlideScope が開ける形式です:CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM の全スライド画像など、合計約 39 形式。CT や MRI などの医用画像は受け付けません。

QuPath や ImageJ とはどう違いますか?

QuPath と ImageJ は無料でスクリプトに対応し、独自のパイプラインや学習済み分類器に適したツールです。Ask Your Slide は、標準的な質問(個数、陽性率、H-score、Allred、領域統計、ホットスポット)に、スクリプトを書かずに、画像をすでに開いているビューアの中で答えるためのものです。IHC スコアリングには QuPath 互換の定義を使い、GeoJSON の輪郭は QuPath で開けます。

Ask Your Slide はオフラインで使えますか?

質問にはインターネット接続が必要です。クラウドの AI が手順を計画し、回答を作成するためです。計数、スコアリング、計測そのものはお使いのコンピューター上で実行されます。

実験全体について質問できますか?

質問ではまだできません。Ask Your Slide が答えるのは開いている画像についてです。現在、多くの画像にわたって処理群を比較するには、SlideScope Plus の実験機能をお使いください。すべての画像に同じ計数レシピを実行し、適切な統計検定で処理群を比較します。実験全体についての質問は、今後 Plus で対応予定です。

出典

簡単な回答

最適な利用者:スクリプトを書かずに、顕微鏡画像やスライド画像から標準的な計数、Ki67 や IHC のスコア、領域の計測値を、示せる記録付きで得たい研究者、コアファシリティ、学生。

主な強み:すべての数値がローカルツールから、正確なビューへの引用、「AIなしで再計算」、「画像なし」モード、ラボノートと方法セクション向けの書き出し、約 39 形式、14 の回答言語。

重要な制限:研究用途に限られ、診断ではありません。答えるのは開いている画像についてで、質問にはインターネット接続が必要です。

最終確認日:2026 年 11 月 6 日。

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