Ask Your Slide · a partir do SlideScope 1.23.0

Conte células e pontue a IHQ fazendo perguntas à sua lâmina

Digite uma pergunta sobre a imagem que você tem aberta, como “Qual a porcentagem de núcleos Ki67 positivos nesta região?”. Um assistente de IA planeja as etapas, e o SlideScope executa no seu computador as próprias ferramentas de contagem, pontuação de IHQ e medição. Cada número da resposta vem de uma dessas ferramentas, com as evidências para conferi-lo e um botão que executa as etapas de novo sem IA. Apenas para pesquisa.

Cada número vem de uma ferramenta local Modo No images: a imagem fica no seu computador Evidências, recálculo e exportação

Como o Ask Your Slide funciona

  1. Abra a imagem no SlideScope, no Windows ou no macOS: uma lâmina inteira, um stack confocal, uma imagem de fluorescência ou qualquer um dos formatos que o SlideScope abre.
  2. Pergunte em linguagem natural. Se a pergunta for sobre uma área específica, desenhe antes uma região ou aplique zoom no campo. As respostas chegam em qualquer um de 14 idiomas.
  3. A IA planeja; as ferramentas locais fazem o trabalho. O assistente escolhe as etapas (contar núcleos, pontuar DAB, medir uma região, encontrar hotspots), e o SlideScope executa cada uma no seu computador. Você acompanha cada ação na imagem, e cada uma pode ser desfeita.
  4. Leia a resposta com as evidências. A resposta cita as visualizações exatas que usou como [R1], [R2] e assim por diante: clique em uma para voltar àquela visualização. As evidências listam cada etapa com a área em pixels, o plano, os parâmetros e os resultados, e a resposta mostra o que foi enviado.
  5. Confira, recalcule e exporte. Re-run without AI recalcula localmente as mesmas etapas e confere se os números são idênticos. Exporte a resposta, o registro da análise e um parágrafo de Métodos, ou crie uma figura com barra de escala.

Assista a uma demonstração de 62 segundos gravada no SlideScope 1.23 com imagens de amostra públicas (IHQ para BrdU da EPFL, CC BY 4.0; DAPI/GFP do czitools). Sem som.

Perguntas que você pode fazer e as ferramentas que as respondem

O Ask Your Slide trabalha com as próprias ferramentas do SlideScope: contagem de núcleos, células ou partículas (segmentação por aprendizado profundo com InstanSeg ou um método clássico), pontuação de IHQ para DAB, estatísticas de região, medições calibradas, estatísticas de saturação por canal, um localizador de hotspots, contornos de regiões, notas e controles de visualização. Alguns exemplos:

Você perguntaFerramentas que o SlideScope executaO que você recebe
“Qual a porcentagem de núcleos Ki67 positivos nesta região?”Contar núcleos (InstanSeg) e depois pontuação de IHQ para DABPorcentagem de positivos com o número de núcleos contados, e os contornos na imagem
“Me dê o H-score e o escore de Allred da área que eu contornei.”Contar núcleos, pontuação de IHQ com definições compatíveis com o QuPathH-score, escore de Allred e porcentagem de positivos dessa região
“Encontre as três áreas mais densas e pontue o Ki67 em cada uma.”Localizador de hotspots, contorno de regiões, contagem e pontuação por regiãoTrês hotspots contornados com densidade por mm², um z-score e uma porcentagem de Ki67 para cada um
“Quantas células há neste campo e qual o tamanho delas?”Contar células (InstanSeg ou método clássico)Uma contagem e as áreas dos objetos, exportáveis em CSV e GeoJSON
“Compare a densidade de DAPI nestas duas regiões.”Estatísticas de região e contagem de núcleos para cada regiãoÁrea, contagem e densidade por mm², lado a lado
“Qual canal é o mais brilhante aqui, e há algo saturado?”Estatísticas de região, estatísticas de saturação por canalIntensidade média por canal e a fração saturada de cada um
“Me leve à área de GFP mais brilhante.”Localizador de hotspots no canal GFP e depois mover a visualizaçãoA visualização ampliada naquela área, com a região contornada
“Qual é a área desta região em µm² e quanto dela é DAB positivo?”Medição calibrada, estatísticas de regiãoÁrea em µm² e a porcentagem de área DAB positiva
“Vá para o plano Z 12 e conte os núcleos.”Mover a visualização (Z), contar núcleosA contagem naquele plano, com o plano registrado nas evidências
“Adicione uma nota com estes números.”Adicionar uma notaUma nota na lâmina que fica com a imagem

Por enquanto, o Ask Your Slide responde sobre a imagem que está aberta. Para comparar tratamentos em muitas imagens, use os Experimentos no SlideScope Plus: uma mesma receita de contagem em todas as imagens, comparadas com o teste estatístico adequado. Perguntar sobre um experimento inteiro está previsto para mais adiante.

Cada número vem de uma ferramenta

Os modelos de IA genéricos não foram feitos para contar objetos olhando uma imagem (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), por isso o Ask Your Slide nunca deixa o modelo estimar um número. O assistente só decide quais ferramentas executar; cada contagem, pontuação, área e intensidade da resposta é calculada pelo SlideScope no seu computador, e você pode conferir cada uma:

  • Citações das visualizações. Cada afirmação aponta para a visualização de onde veio ([R1], [R2]). Clique e o SlideScope volta exatamente àquela posição, zoom e plano.
  • Evidências. Cada etapa, com a área analisada em pixels, o plano, os parâmetros usados e os resultados.
  • Re-run without AI. Recalcula localmente as etapas registradas, sem nenhuma participação da IA, e confere se os números saem idênticos.
  • O que foi enviado. A resposta mostra exatamente o que saiu do seu computador para aquela pergunta.
  • Visível e reversível. Contornos, notas e mudanças de visualização aparecem na imagem à medida que acontecem, e cada um pode ser desfeito.
Resposta do Ask Your Slide no SlideScope em um corte corado com DAB: 15,4% de 577 núcleos DAB positivos, H-score 20,1, Allred 4, 910 núcleos positivos por milímetro quadrado com uma citação [R1], os núcleos pontuados contornados na imagem e as evidências com a etapa local de quantificação e links para Re-run without AI, Export e Make figure.
Uma resposta real do Ask Your Slide no SlideScope 1.23 para “Qual a % de núcleos DAB positivos aqui?” (15,4%) em um corte de duodeno de camundongo com IHQ para BrdU (EPFL, CC BY 4.0). Os núcleos estão contornados conforme o grau de DAB, a resposta cita como [R1] a visualização que usou, e as evidências mostram a etapa local que gerou cada número, com Re-run without AI, Export e Make figure.

Privacidade desde a concepção: o que é enviado, exatamente

A análise roda no seu computador. Um modelo de IA na nuvem planeja as etapas e redige a resposta, e uma chave no painel do Ask Your Slide, Send view images, decide se ele chega a ver alguma imagem.

Send view imagesO que é enviado à IA na nuvemO que nunca sai do seu computador
Desativado (“No images”)Sua pergunta, alguns detalhes técnicos (formato, dimensões, canais, tamanho do pixel) e os números calculados pelas ferramentas locaisA imagem e o arquivo
AtivadoO mesmo, mais as visualizações que a IA examina, cada uma mostrada antes na sua tela, comprimidaO arquivo e qualquer parte da imagem que a IA não examina

Suas perguntas e imagens não são usadas para treinar modelos de IA. Exames médicos como tomografia e ressonância magnética são recusados. O provedor de IA e os termos completos estão no aviso de privacidade, e a página de tratamento de dados explica o que o restante do SlideScope mantém no seu computador.

Exportações para o seu caderno, as suas figuras e os seus Métodos

  • answer.md: a resposta com as citações, pronta para colar em um caderno de laboratório.
  • analysis_record.json: o registro completo de etapas, parâmetros e resultados, o mesmo registro que o Re-run without AI usa.
  • Texto de Métodos: um parágrafo que descreve o que foi medido e como, para adaptar a um manuscrito.
  • Saídas do Quantify: a tabela de objetos em CSV, os contornos em GeoJSON (abrem no QuPath), máscaras e uma imagem anotada.
  • Make figure: uma figura da visualização com barra de escala calibrada.

As listas de verificação da comunidade QUAREP-LiMi pedem que os autores relatem os fluxos de análise de imagens e detalhes das figuras, como barras de escala (Schmied et al., Nature Methods 2023). O registro e o texto de Métodos trazem os parâmetros a relatar.

Qual é a precisão da pontuação automatizada de Ki67 e IHQ?

Pontuar o Ki67 a olho é difícil de reproduzir, e esse é o principal motivo para deixar uma ferramenta contar:

  • Quando o International Ki67 in Breast Cancer Working Group enviou os mesmos 30 cânceres de mama a 23 patologistas de 12 países, a concordância (CCI) foi de 0,87 com o método de contagem global e de 0,83 com a pontuação por hot-spot, que não atingiu o critério de sucesso do estudo. Os avaliadores nem sempre escolheram o mesmo hot-spot em uma lâmina (Leung et al., Histopathology 2019).
  • Seis patologistas especializados em mama, pontuando 57 lâminas de Ki-67, alcançaram apenas concordância moderada no ponto de corte de 20% (coeficientes de 0,44 e 0,48 em duas rodadas), e os autores concluíram que a análise digital de imagens é necessária para melhorá-la (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
  • A análise digital de imagens é mais consistente: quatro algoritmos do QuPath criados de forma independente por quatro patologistas, seguindo a diretriz do grupo de trabalho, concordaram com um algoritmo de referência com CCI de 0,938 em 157 cânceres de mama RE positivos (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Esses estudos descrevem a pontuação manual e automatizada de Ki67 em geral; eles não testaram o SlideScope. A pontuação de IHQ do SlideScope segue as definições do QuPath (limiares de densidade óptica de DAB de 0,2, 0,4 e 0,6 para 1+, 2+ e 3+), e a quantificação local foi conferida com o QuPath 0.7.0 nas mesmas lâminas. O localizador de hotspots é um cálculo da densidade de objetos com um z-score, não um julgamento, então a mesma região com as mesmas configurações gera os mesmos hotspots.

Como conferir uma resposta

  1. Observe os contornos na imagem: núcleos não detectados, vizinhos fundidos e detritos corados aparecem num relance.
  2. Clique em [R1] para voltar à visualização exata, aplique zoom e conte à mão um campo pequeno para comparar com o número informado.
  3. Abra as evidências e confirme que o plano, a área da região e os parâmetros são os que você pretendia.
  4. Verifique a saturação antes de confiar nas intensidades: pergunte quais canais estão saturados na mesma região.
  5. Clique em Re-run without AI e guarde o registro da análise junto com os seus dados.

Ask Your Slide, um chatbot genérico, scripts ou um copiloto corporativo

Ask Your SlideEnviar uma imagem a um chatbot genéricoEscrever scripts para QuPath ou FijiCopilotos corporativos de patologia
De onde vêm os númerosDas ferramentas locais do SlideScope, com os parâmetros à vistaDo modelo, ou do código que ele escreve durante o chatDo seu script, executado pelo QuPath ou pelo FijiDos modelos do fornecedor, na plataforma dele
Para onde vai a imagemFica no seu computador no modo No images; caso contrário, visualizações comprimidas que você vê antesÉ enviada aos servidores do chatbotFica no seu computadorFica na plataforma do fornecedor
Conferir e repetir um resultadoEvidências por etapa; o Re-run without AI confere se os números são idênticosPerguntar de novo pode dar outra respostaRepetível se você guardar o script e as versõesDepende da plataforma
ConfiguraçãoInstalar o SlideScope e perguntarNenhuma, mas antes você exporta uma imagem que o chatbot consiga lerAprender a API de scripts e depurar o código, inclusive o que um chatbot escreve para vocêUm contrato institucional e uma implantação
Formatos de lâmina inteira e de microscópioCZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM e cerca de 39 formatosNormalmente só formatos de imagem comunsAmplos, via Bio-Formats e OpenSlideOs formatos que a plataforma aceita
Melhor paraContagens padrão, pontuações de IHQ e números de regiões sem código, com um registro para apresentarUma descrição rápida de uma imagemPipelines personalizados e classificadores treinadosGrandes programas de pesquisa clínica

O QuPath e o Fiji são gratuitos e continuam sendo a escolha certa para análises personalizadas ou com scripts; veja como contar células no ImageJ, no QuPath ou no CellProfiler. Para descrever uma visualização em palavras em vez de medi-la, use o AI Analysis.

Formatos e idiomas

O Ask Your Slide funciona com as imagens que o SlideScope abre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, imagens DICOM de lâmina inteira e cerca de 39 formatos no total, de lâminas inteiras em campo claro a fluorescência multicanal com Z, tempo e cenas. A lista completa está na página de compatibilidade de arquivos. As respostas chegam em 14 idiomas, e a interface do aplicativo está disponível em 10.

Quem tem acesso ao Ask Your Slide

O Ask Your Slide faz parte do SlideScope a partir da versão 1.23.0, no Windows e no macOS. Ele está incluído nos planos pagos do SlideScope, dentro de limites de uso justo de IA; os planos Plus têm limites maiores. Comparar tratamentos em um experimento já é possível hoje no SlideScope Plus, com os Experimentos; perguntar sobre um experimento inteiro está previsto para mais adiante. Com uma conta gratuita do SlideScope, você pode testar o Ask Your Slide nas lâminas de amostra gratuitas, três perguntas por dia; perguntar sobre as suas próprias imagens exige uma assinatura. Os preços atuais estão na página de planos.

Perguntas sobre o Ask Your Slide

O ChatGPT consegue contar células em uma imagem de microscopia?

Sozinho, não de forma confiável. Um chatbot genérico responde a partir da imagem que você envia, ou de um código que escreve naquele chat, então o método pode mudar de um chat para outro, e uma captura de tela não traz o tamanho do pixel. Uma palestra de um workshop de 2024 sobre chatbots para análise de imagens observa que os modelos de linguagem não foram feitos para contar objetos em imagens. O Ask Your Slide funciona de outro jeito: a IA só planeja as etapas, as ferramentas de contagem do próprio SlideScope geram cada número no seu computador, e o Re-run without AI os recalcula.

Minhas imagens são enviadas para a nuvem?

Não com o Send view images desativado (No images): a imagem nunca sai do seu computador, e só a sua pergunta, alguns detalhes técnicos (formato, dimensões, canais, tamanho do pixel) e os números calculados são enviados à IA na nuvem. Com a chave ativada, as visualizações que a IA examina também são enviadas, comprimidas, e cada uma é mostrada antes na sua tela. Seus dados não são usados para treinar modelos de IA.

O Ask Your Slide é uma ferramenta de diagnóstico?

Não. O Ask Your Slide é apenas para pesquisa e não é um diagnóstico médico. Ele recusa exames médicos como tomografia e ressonância magnética, e as respostas informam medições, não diagnósticos nem graus.

Qual a precisão da pontuação automatizada de Ki67 em comparação com a manual?

A pontuação manual de Ki67 varia entre avaliadores: em um estudo internacional, 23 patologistas chegaram a um CCI de 0,87 com a pontuação global e de 0,83 com a pontuação por hot-spot. A análise digital de imagens é mais consistente: quatro algoritmos do QuPath criados de forma independente concordaram com uma referência com CCI de 0,938. Mesmo assim, as contagens automatizadas precisam ser conferidas: observe os contornos, compare um campo pequeno com uma contagem manual e guarde o registro de evidências.

O Ask Your Slide é um app gratuito para pontuar Ki67?

Não. O Ask Your Slide está incluído nos planos pagos do SlideScope, dentro de limites de uso justo de IA, com limites maiores no Plus. Com uma conta gratuita, você pode fazer três perguntas por dia sobre as lâminas de amostra incluídas, que também vêm com todas as ferramentas locais, e os preços atuais estão na página de planos.

Posso recalcular ou exportar o resultado?

Sim. O Re-run without AI recalcula no seu computador as etapas registradas e confere se os números são idênticos. A exportação salva answer.md, analysis_record.json e um parágrafo de Métodos, além do CSV de objetos, dos contornos em GeoJSON, das máscaras e de uma imagem anotada, e o Make figure adiciona uma barra de escala.

Com quais formatos de arquivo ele funciona?

Com os formatos que o SlideScope abre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, imagens DICOM de lâmina inteira e cerca de 39 formatos no total. Exames médicos como tomografia e ressonância magnética são recusados.

Qual a diferença em relação ao QuPath ou ao ImageJ?

O QuPath e o ImageJ são gratuitos, programáveis com scripts e as ferramentas certas para pipelines personalizados e classificadores treinados. O Ask Your Slide é para as perguntas padrão (contagens, porcentagem de positivos, H-score, Allred, estatísticas de região, hotspots) sem escrever um script, dentro do visualizador onde a imagem já está aberta. A pontuação de IHQ usa definições compatíveis com o QuPath, e os contornos em GeoJSON abrem no QuPath.

O Ask Your Slide funciona offline?

Perguntar exige conexão com a internet, porque uma IA na nuvem planeja as etapas e redige a resposta. A contagem, a pontuação e a medição em si rodam no seu computador.

Posso perguntar sobre um experimento inteiro?

Por meio de perguntas, ainda não: o Ask Your Slide responde sobre a imagem que está aberta. Para comparar tratamentos em muitas imagens hoje, use os Experimentos no SlideScope Plus, que aplicam uma mesma receita de contagem a todas as imagens e comparam os tratamentos com o teste estatístico adequado. Fazer perguntas sobre um experimento inteiro está previsto para o Plus mais adiante.

Fontes

Respostas rápidas

Indicado para: pesquisadores, centrais de microscopia e estudantes que precisam de contagens padrão, pontuações de Ki67 ou IHQ e medições de regiões em imagens de microscopia e de lâminas sem escrever scripts, com um registro que possam apresentar.

Principais pontos fortes: cada número vem de uma ferramenta local, citações que levam à visualização exata, Re-run without AI, um modo No images, exportações para o caderno e os Métodos, cerca de 39 formatos e respostas em 14 idiomas.

Limitação importante: apenas para pesquisa, não é um diagnóstico; responde sobre a imagem aberta, e perguntar exige conexão com a internet.

Última revisão: 6 de novembro de 2026.

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