Zliczaj komórki i oceniaj IHC, zadając pytanie o preparat
Wpisz pytanie o otwarty obraz, na przykład „Jaki odsetek jąder w tym obszarze jest Ki67-dodatni?”. Asystent AI planuje kroki, a SlideScope uruchamia na Twoim komputerze własne narzędzia do zliczania, oceny IHC i pomiarów. Każda liczba w odpowiedzi pochodzi z jednego z tych narzędzi, wraz z dowodami pozwalającymi ją sprawdzić i przyciskiem, który powtarza kroki bez AI. Wyłącznie do zastosowań badawczych.
Każda liczba z lokalnego narzędziaTryb „No images”: obraz zostaje na Twoim komputerzeDowody, ponowne uruchomienie i eksport
Jak działa Ask Your Slide
Otwórz obraz w SlideScope na Windows lub macOS: cały preparat, stos konfokalny, obraz fluorescencyjny lub plik w dowolnym innym formacie obsługiwanym przez SlideScope.
Zapytaj zwykłym językiem. Jeśli pytanie dotyczy jednego miejsca, najpierw zaznacz obszar lub powiększ to pole. Odpowiedzi są dostępne w 14 językach.
AI planuje, lokalne narzędzia wykonują pracę. Asystent wybiera kroki (zliczanie jąder, ocena DAB, pomiar obszaru, wyszukiwanie hotspotów), a SlideScope wykonuje każdy z nich na Twoim komputerze. Każdą akcję widzisz na obrazie i każdą możesz cofnąć.
Przeczytaj odpowiedź wraz z dowodami. Odpowiedź wskazuje dokładne widoki, z których korzystała, jako [R1], [R2] itd.: kliknij odnośnik, aby wrócić do tego widoku. Dowody wymieniają każdy krok z powierzchnią w pikselach, płaszczyzną, parametrami i wynikami, a odpowiedź pokazuje, co zostało wysłane.
Sprawdź, powtórz i wyeksportuj. Re-run without AI przelicza te same kroki lokalnie i sprawdza, czy liczby są identyczne. Wyeksportuj odpowiedź, zapis analizy i akapit do sekcji Metody albo przygotuj rycinę z paskiem skali.
Obejrzyj 62-sekundowe demo nagrane w SlideScope 1.23 na publicznych obrazach przykładowych (EPFL BrdU IHC, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). Bez dźwięku.
Pytania, które możesz zadać, i narzędzia, które na nie odpowiadają
Ask Your Slide korzysta z własnych narzędzi SlideScope: zliczania jąder, komórek lub cząstek (segmentacja głębokim uczeniem InstanSeg lub metoda klasyczna), oceny IHC dla DAB, statystyk obszarów, skalibrowanych pomiarów, statystyk nasycenia kanałów, wyszukiwarki hotspotów, obrysów obszarów, notatek i sterowania widokiem. Kilka przykładów:
Twoje pytanie
Narzędzia uruchamiane przez SlideScope
Co otrzymujesz
„Jaki odsetek jąder w tym obszarze jest Ki67-dodatni?”
Zliczanie jąder (InstanSeg), następnie ocena IHC dla DAB
Odsetek dodatnich wraz z liczbą zliczonych jąder i obrysami na obrazie
„Podaj H-score i wynik Allreda dla obszaru obrysowanego przeze mnie.”
Zliczanie jąder, ocena IHC według definicji zgodnych z QuPath
H-score, wynik Allreda i odsetek dodatnich dla tego obszaru
„Znajdź trzy najgęstsze obszary i oceń Ki67 w każdym z nich.”
Wyszukiwarka hotspotów, obrysowanie obszarów, zliczanie i ocena w każdym obszarze
Trzy obrysowane hotspoty, każdy z gęstością na mm², wartością z i odsetkiem Ki67
„Ile komórek jest w tym polu i jakiej są wielkości?”
Zliczanie komórek (InstanSeg lub metodą klasyczną)
Liczba obiektów i ich powierzchnie, z eksportem do CSV i GeoJSON
„Porównaj gęstość DAPI w tych dwóch obszarach.”
Statystyki obszarów i liczba jąder w każdym obszarze
Powierzchnia, liczba i gęstość na mm² obok siebie
„Który kanał jest tu najjaśniejszy i czy coś jest nasycone?”
Statystyki obszarów, statystyki nasycenia kanałów
Średnia intensywność w każdym kanale i nasycony odsetek każdego z nich
„Przenieś mnie do najjaśniejszego obszaru GFP.”
Wyszukiwarka hotspotów w kanale GFP, następnie przesunięcie widoku
Widok powiększony na ten obszar, z obrysowanym regionem
„Jaka jest powierzchnia tego obszaru w µm² i jaka jej część jest DAB-dodatnia?”
Skalibrowany pomiar, statystyki obszarów
Powierzchnia w µm² i odsetek powierzchni DAB-dodatniej
„Przejdź do płaszczyzny Z 12 i policz jądra.”
Przesunięcie widoku (Z), zliczanie jąder
Liczba na tej płaszczyźnie, z płaszczyzną zapisaną w dowodach
„Dodaj notatkę z tymi liczbami.”
Dodanie notatki
Notatka na preparacie, która zostaje przy obrazie
Na razie Ask Your Slide odpowiada na pytania o otwarty obraz. Aby porównać grupy eksperymentalne na wielu obrazach, użyj funkcji Eksperymenty w SlideScope Plus: jedna receptura zliczania na każdym obrazie, porównanie właściwym testem statystycznym. Pytania o cały eksperyment są planowane na później.
Każda liczba pochodzi z narzędzia
Ogólne modele AI nie powstały po to, by liczyć obiekty, patrząc na obraz (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), dlatego Ask Your Slide nigdy nie pozwala modelowi szacować liczb. Asystent decyduje tylko, które narzędzia uruchomić; każdą liczbę obiektów, wynik, powierzchnię i intensywność w odpowiedzi oblicza SlideScope na Twoim komputerze, a Ty możesz sprawdzić każdą z nich:
Odnośniki do widoków. Każde stwierdzenie wskazuje widok, z którego pochodzi ([R1], [R2]). Kliknij, a SlideScope wróci dokładnie do tej pozycji, powiększenia i płaszczyzny.
Dowody. Każdy krok z analizowaną powierzchnią w pikselach, płaszczyzną, użytymi parametrami i wynikami.
Re-run without AI. Przelicza zapisane kroki lokalnie, bez udziału AI, i sprawdza, czy liczby wychodzą identyczne.
Co zostało wysłane. Odpowiedź pokazuje dokładnie, co przy tym pytaniu opuściło Twój komputer.
Widoczne i odwracalne. Obrysy, notatki i zmiany widoku pojawiają się na obrazie na bieżąco, a każdą z nich można cofnąć.
Prawdziwa odpowiedź Ask Your Slide w SlideScope 1.23 na pytanie „What % of nuclei are DAB-positive here?” (15,4%) na skrawku dwunastnicy myszy barwionym IHC BrdU (EPFL, CC BY 4.0). Jądra są obrysowane według stopnia DAB, odpowiedź wskazuje użyty widok jako [R1], a dowody pokazują lokalny krok, z którego pochodzi każda liczba, z przyciskami Re-run without AI, Export i Make figure.
Prywatność w założeniach: co dokładnie jest wysyłane
Analiza działa na Twoim komputerze. Planowaniem kroków i pisaniem odpowiedzi zajmuje się model AI w chmurze, a przełącznik w panelu Ask Your Slide, Send view images, decyduje, czy w ogóle zobaczy on jakikolwiek obraz.
Send view images
Co trafia do AI w chmurze
Co nigdy nie opuszcza Twojego komputera
Wyłączony („No images”)
Twoje pytanie, ograniczone dane techniczne (format, wymiary, kanały, rozmiar piksela) i liczby obliczone przez lokalne narzędzia
Obraz i plik
Włączony
To samo, a także widoki, na które patrzy AI, skompresowane i każdy najpierw pokazany na Twoim ekranie
Plik i każda część obrazu, na którą AI nie patrzy
Twoje pytania i obrazy nie są używane do trenowania modeli AI. Badania medyczne, takie jak TK i MRI, są odrzucane. Dostawcę AI i pełne warunki znajdziesz w informacji o prywatności, a strona o przetwarzaniu danych wyjaśnia, co pozostała część SlideScope przechowuje na Twoim komputerze.
Eksporty do notatnika laboratoryjnego, ryciny i sekcji Metody
answer.md: odpowiedź z odnośnikami, gotowa do wklejenia do notatnika laboratoryjnego.
analysis_record.json: pełny zapis kroków, parametrów i wyników, ten sam, z którego korzysta Re-run without AI.
Tekst do sekcji Metody: akapit opisujący, co i jak zmierzono, do dostosowania w manuskrypcie.
Wyniki Quantify: tabela obiektów w CSV, obrysy w GeoJSON (otwierają się w QuPath), maski i obraz z adnotacjami.
Make figure: rycina z widoku ze skalibrowanym paskiem skali.
Listy kontrolne społeczności QUAREP-LiMi wymagają od autorów opisu procedur analizy obrazu i szczegółów rycin, takich jak paski skali (Schmied et al., Nature Methods 2023). Zapis analizy i tekst do sekcji Metody dają Ci parametry do podania.
Jak dokładna jest automatyczna ocena Ki67 i IHC?
Ocena Ki67 na oko jest trudna do odtworzenia i to główny powód, by liczenie zostawić narzędziu:
Gdy International Ki67 in Breast Cancer Working Group wysłała te same 30 przypadków raka piersi do 23 patologów z 12 krajów, zgodność (ICC) wyniosła 0,87 dla metody globalnej i 0,83 dla oceny w hotspotach, co nie spełniło kryterium sukcesu badania. Oceniający nie zawsze wybierali na preparacie ten sam hotspot (Leung et al., Histopathology 2019).
Sześciu patologów wyspecjalizowanych w patologii piersi, oceniających 57 preparatów Ki-67, osiągnęło przy progu 20% jedynie umiarkowaną zgodność (współczynniki 0,44 i 0,48 w dwóch rundach), a autorzy stwierdzili, że do jej poprawy potrzebna jest cyfrowa analiza obrazu (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Cyfrowa analiza obrazu jest bardziej spójna: cztery algorytmy QuPath, zbudowane niezależnie przez czterech patologów zgodnie z wytycznymi grupy roboczej, osiągnęły ze wzorcowym algorytmem ICC 0,938 na 157 przypadkach ER-dodatniego raka piersi (Boyaci et al., Biomolecules 2021).
Te badania opisują ręczną i automatyczną ocenę Ki67 w ogóle; nie testowano w nich SlideScope. Ocena IHC w SlideScope stosuje definicje z QuPath (progi gęstości optycznej DAB 0,2; 0,4 i 0,6 dla 1+, 2+ i 3+), a lokalną kwantyfikację SlideScope porównano z QuPath 0.7.0 na tych samych preparatach. Wyszukiwarka hotspotów to obliczenie gęstości obiektów z wartością z, a nie subiektywna ocena, więc ten sam obszar i te same ustawienia dają te same hotspoty.
Jak wyrywkowo sprawdzić odpowiedź
Obejrzyj obrysy na obrazie: pominięte jądra, zlepione sąsiednie jądra i wybarwione zanieczyszczenia widać od razu.
Kliknij [R1], aby wrócić dokładnie do tego widoku, powiększ go i policz ręcznie małe pole, porównując wynik z podaną liczbą.
Otwórz dowody i upewnij się, że płaszczyzna, powierzchnia obszaru i parametry są zgodne z Twoim zamiarem.
Zanim zaufasz intensywnościom, sprawdź nasycenie: zapytaj, które kanały są nasycone w tym samym obszarze.
Kliknij Re-run without AI i przechowuj zapis analizy razem z danymi.
Ask Your Slide, ogólny chatbot, skrypty czy korporacyjny copilot
Ask Your Slide
Wysłanie obrazu do ogólnego chatbota
Pisanie skryptów w QuPath lub Fiji
Korporacyjne copiloty do patologii
Skąd pochodzą liczby
Z lokalnych narzędzi SlideScope, z widocznymi parametrami
Z modelu albo z kodu, który pisze podczas czatu
Z Twojego skryptu uruchamianego przez QuPath lub Fiji
Z modeli dostawcy na jego platformie
Dokąd trafia obraz
W trybie „No images” zostaje na Twoim komputerze; w przeciwnym razie skompresowane widoki, które najpierw widzisz
Jest wysyłany na serwery chatbota
Zostaje na Twoim komputerze
Jest przechowywany na platformie dostawcy
Sprawdzenie i powtórzenie wyniku
Dowody dla każdego kroku; Re-run without AI sprawdza, czy liczby są identyczne
Ponowne pytanie może dać inną odpowiedź
Powtarzalne, jeśli zachowasz skrypt i wersje
Zależy od platformy
Konfiguracja
Zainstaluj SlideScope i pytaj
Brak, ale najpierw eksportujesz obraz, który chatbot potrafi odczytać
Nauka API skryptów i debugowanie kodu, również kodu napisanego dla Ciebie przez chatbota
Umowa z instytucją i wdrożenie
Formaty całych preparatów i mikroskopowe
CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM i około 39 formatów
Zwykle tylko popularne formaty obrazów
Szeroka, dzięki Bio-Formats i OpenSlide
Formaty, które przyjmuje platforma
Najlepsze do
Standardowe zliczenia, wyniki IHC i wartości dla obszarów bez kodu, z zapisem, który można przedstawić
Szybki opis obrazu
Własne potoki przetwarzania i trenowane klasyfikatory
Ask Your Slide działa na obrazach, które otwiera SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, obrazach całych preparatów DICOM i łącznie około 39 formatach, od całych preparatów w jasnym polu po wielokanałową fluorescencję z osią Z, czasem i scenami. Pełna lista jest na stronie o zgodności plików. Odpowiedzi są dostępne w 14 językach, a interfejs aplikacji w 10.
Kto ma dostęp do Ask Your Slide
Ask Your Slide jest częścią SlideScope od wersji 1.23.0 na Windows i macOS. Jest zawarty w płatnych planach SlideScope w granicach uczciwego użytkowania AI; plany Plus mają wyższe limity. Porównywanie grup eksperymentalnych w całym eksperymencie jest już dostępne w SlideScope Plus, w funkcji Eksperymenty; pytania o cały eksperyment są planowane na później. Z bezpłatnym kontem SlideScope możesz wypróbować Ask Your Slide na bezpłatnych preparatach przykładowych, trzy pytania dziennie; pytania o własne obrazy wymagają subskrypcji. Aktualne ceny są na stronie z planami.
Pytania o Ask Your Slide
Czy ChatGPT potrafi policzyć komórki na obrazie mikroskopowym?
Samodzielnie nie w wiarygodny sposób. Ogólny chatbot odpowiada na podstawie przesłanego obrazu albo kodu, który pisze w danym czacie, więc metoda może się zmieniać z czatu na czat, a zrzut ekranu nie zawiera rozmiaru piksela. Wystąpienie warsztatowe z 2024 roku o chatbotach w analizie obrazu zauważa, że modele językowe nie powstały do liczenia obiektów na obrazach. Ask Your Slide działa inaczej: AI tylko planuje kroki, każdą liczbę wyznaczają na Twoim komputerze własne narzędzia SlideScope do zliczania, a Re-run without AI przelicza je ponownie.
Czy moje obrazy są wysyłane do chmury?
Nie, gdy Send view images jest wyłączone (No images): obraz nigdy nie opuszcza Twojego komputera, a do AI w chmurze trafiają tylko Twoje pytanie, ograniczone dane techniczne (format, wymiary, kanały, rozmiar piksela) i obliczone liczby. Po włączeniu przełącznika wysyłane są także widoki, na które patrzy AI, skompresowane, a każdy z nich najpierw pojawia się na Twoim ekranie. Twoje dane nie są używane do trenowania modeli AI.
Czy Ask Your Slide jest narzędziem diagnostycznym?
Nie. Ask Your Slide służy wyłącznie do zastosowań badawczych i nie jest diagnozą medyczną. Odrzuca badania medyczne, takie jak TK i MRI, a jego odpowiedzi podają pomiary, nie diagnozy ani stopnie złośliwości.
Jak dokładna jest automatyczna ocena Ki67 w porównaniu z ręczną?
Ręczna ocena Ki67 różni się między oceniającymi: w badaniu międzynarodowym 23 patologów osiągnęło ICC 0,87 przy ocenie globalnej i 0,83 przy ocenie w hotspotach. Cyfrowa analiza obrazu jest bardziej spójna: cztery niezależnie zbudowane algorytmy QuPath osiągnęły z algorytmem wzorcowym ICC 0,938. Automatyczne zliczenia także wymagają sprawdzenia, więc obejrzyj obrysy, porównaj małe pole z ręcznym zliczeniem i zachowaj zapis dowodów.
Czy Ask Your Slide to bezpłatna aplikacja do oceny Ki67?
Nie. Ask Your Slide jest zawarty w płatnych planach SlideScope w granicach uczciwego użytkowania AI, z wyższymi limitami w Plus. Z bezpłatnym kontem możesz zadać trzy pytania dziennie o wbudowane preparaty przykładowe, na których działają też wszystkie narzędzia lokalne, a aktualne ceny są na stronie z planami.
Czy mogę powtórzyć lub wyeksportować wynik?
Tak. Re-run without AI przelicza zapisane kroki na Twoim komputerze i sprawdza, czy liczby są identyczne. Export zapisuje answer.md, analysis_record.json i akapit do sekcji Metody, a także plik CSV z obiektami, obrysy GeoJSON, maski i obraz z adnotacjami, a Make figure dodaje pasek skali.
Z jakimi formatami plików działa?
Z formatami, które otwiera SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, obrazami całych preparatów DICOM i łącznie około 39 formatami. Badania medyczne, takie jak TK i MRI, są odrzucane.
Czym to się różni od QuPath lub ImageJ?
QuPath i ImageJ są bezpłatne, obsługują skrypty i są właściwymi narzędziami do własnych potoków przetwarzania i trenowanych klasyfikatorów. Ask Your Slide jest do standardowych pytań (zliczenia, odsetek dodatnich, H-score, Allred, statystyki obszarów, hotspoty) bez pisania skryptu, w przeglądarce, w której obraz jest już otwarty. Jego ocena IHC stosuje definicje zgodne z QuPath, a obrysy GeoJSON otwierają się w QuPath.
Czy Ask Your Slide działa offline?
Zadawanie pytań wymaga połączenia z internetem, ponieważ kroki planuje i odpowiedź pisze AI w chmurze. Samo zliczanie, ocena i pomiary działają na Twoim komputerze.
Czy mogę zapytać o cały eksperyment?
Za pomocą pytania jeszcze nie: Ask Your Slide odpowiada na pytania o otwarty obraz. Aby już dziś porównać grupy eksperymentalne na wielu obrazach, użyj funkcji Eksperymenty w SlideScope Plus, która uruchamia jedną recepturę zliczania na każdym obrazie i porównuje grupy właściwym testem statystycznym. Pytania o cały eksperyment są planowane w Plus na później.
Najlepsze dla: badaczy, pracowni core facility i studentów, którzy potrzebują standardowych zliczeń, wyników Ki67 lub IHC i pomiarów obszarów z obrazów mikroskopowych i preparatów bez pisania skryptów, wraz z zapisem, który można przedstawić.
Główne zalety: każda liczba z lokalnego narzędzia, odnośniki do dokładnego widoku, Re-run without AI, tryb „No images”, eksporty do notatnika i sekcji Metody, około 39 formatów i odpowiedzi w 14 językach.
Ważne ograniczenie: wyłącznie do zastosowań badawczych, to nie diagnoza; odpowiada na pytania o otwarty obraz, a zadawanie pytań wymaga połączenia z internetem.
Ostatnia weryfikacja: 6 listopada 2026.
Zadawaj pytania o własne preparaty
Pobierz SlideScope, poznaj bezpłatną bibliotekę przykładów i wykup subskrypcję (PayPal lub karta, płatność w chwili wykupienia, anulowanie w każdej chwili na koncie), aby korzystać z Ask Your Slide na własnych obrazach od wersji 1.23.0.
![Odpowiedź SlideScope Ask Your Slide na skrawku barwionym DAB: 15,4% z 577 jąder DAB-dodatnich, H-score 20,1, Allred 4, 910 dodatnich jąder na milimetr kwadratowy z odnośnikiem [R1], ocenione jądra obrysowane na obrazie oraz dowody z lokalnym krokiem Quantify i odnośnikami do Re-run without AI, Export i Make figure.](/assets/product-ask-your-slide.webp)