Ask Your Slide · з версії SlideScope 1.23.0

Підраховуйте клітини й оцінюйте ІГХ, ставлячи запитання своєму слайду

Поставте запитання про відкрите зображення, наприклад: «Який відсоток ядер у цій ділянці Ki67-позитивний?» ШІ-асистент планує кроки, а SlideScope виконує на вашому комп’ютері власні інструменти підрахунку, оцінки ІГХ і вимірювання. Кожне число у відповіді отримано одним із цих інструментів; до нього додаються докази для перевірки та кнопка, яка повторює кроки без ШІ. Лише для дослідницьких цілей.

Завантажити SlideScope Переглянути плани

Кожне число — від локального інструмента Режим «Без зображень» (No images): зображення залишається на вашому комп’ютері Докази, повторний запуск і експорт

Як працює Ask Your Slide

Відкрийте зображення в SlideScope у Windows або macOS: повнослайдове зображення, конфокальний стек, флуоресцентне зображення або файл у будь-якому з форматів, які відкриває SlideScope.
Запитайте звичайною мовою. Якщо запитання стосується однієї ділянки, спершу виділіть її або наблизьте потрібне поле. Відповідь можна отримати будь-якою з 14 мов.
ШІ планує, локальні інструменти виконують роботу. Асистент обирає кроки (підрахувати ядра, оцінити DAB, виміряти ділянку, знайти гарячі точки), а SlideScope виконує кожен із них на вашому комп’ютері. Кожну дію видно на зображенні, і будь-яку з них можна скасувати.
Прочитайте відповідь разом із доказами. Відповідь посилається на точні вигляди, які вона використала, — [R1], [R2] і так далі: клацніть посилання, щоб повернутися до цього вигляду. У доказах наведено кожен крок із площею в пікселях, площиною, параметрами та результатами, а у відповіді показано, що було надіслано.
Перевірте, повторіть і експортуйте. «Повторити без ШІ» заново обчислює ті самі кроки локально й перевіряє, що числа збігаються. Експортуйте відповідь, запис аналізу та абзац для розділу «Методи» або зробіть рисунок із масштабною лінійкою.

Перегляньте 62-секундну демонстрацію, записану в SlideScope 1.23 на загальнодоступних зразках (ІГХ на BrdU від EPFL, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). Без звуку.

Які запитання можна ставити і які інструменти на них відповідають

Ask Your Slide працює з власними інструментами SlideScope: підрахунок ядер, клітин або частинок (сегментація глибоким навчанням InstanSeg або класичний метод), оцінка ІГХ за DAB, статистика ділянок, калібровані вимірювання, статистика насичення каналів, пошук гарячих точок, контури ділянок, нотатки й керування виглядом. Кілька прикладів:

Ви запитуєте	Які інструменти запускає SlideScope	Що ви отримуєте
«Який відсоток ядер у цій ділянці Ki67-позитивний?»	Підрахунок ядер (InstanSeg), потім оцінка ІГХ за DAB	Відсоток позитивних ядер із кількістю підрахованих ядер і контури на зображенні
«Порахуй H-score і бал Allred для виділеної ділянки.»	Підрахунок ядер, оцінка ІГХ за визначеннями, сумісними з QuPath	H-score, бал Allred і відсоток позитивних ядер для цієї ділянки
«Знайди три найщільніші ділянки й оціни Ki67 у кожній.»	Пошук гарячих точок, обведення ділянок, підрахунок і оцінка в кожній ділянці	Три обведені гарячі точки з щільністю на мм², z-оцінкою та відсотком Ki67 для кожної
«Скільки клітин у цьому полі і якого вони розміру?»	Підрахунок клітин (InstanSeg або класичний метод)	Кількість клітин і площі об’єктів з експортом у CSV та GeoJSON
«Порівняй щільність DAPI у цих двох ділянках.»	Статистика ділянок і підрахунок ядер у кожній ділянці	Площа, кількість і щільність на мм² для обох ділянок поруч
«Який канал тут найяскравіший і чи є насичення?»	Статистика ділянок, статистика насичення каналів	Середня інтенсивність у кожному каналі та частка насичених пікселів у кожному
«Покажи найяскравішу ділянку GFP.»	Пошук гарячих точок у каналі GFP, потім переміщення вигляду	Вигляд, наближений до цієї ділянки, з обведеною ділянкою
«Яка площа цієї ділянки в µm² і яка її частка DAB-позитивна?»	Каліброване вимірювання, статистика ділянок	Площа в µm² і відсоток DAB-позитивної площі
«Перейди до Z-площини 12 і підрахуй ядра.»	Переміщення вигляду (Z), підрахунок ядер	Кількість ядер у цій площині; площину записано в доказах
«Додай нотатку з цими числами.»	Додавання нотатки	Нотатка на слайді, яка залишається із зображенням

Наразі Ask Your Slide відповідає на запитання про відкрите зображення. Щоб порівняти групи обробки на багатьох зображеннях, скористайтеся експериментами в SlideScope Plus: один рецепт підрахунку для кожного зображення й порівняння відповідним статистичним тестом. Запитання про цілий експеримент планується додати пізніше.

Кожне число отримано інструментом

Універсальні моделі ШІ не створювалися для того, щоб рахувати об’єкти, розглядаючи картинку (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), тому Ask Your Slide ніколи не дозволяє моделі оцінювати число на око. Асистент лише вирішує, які інструменти запустити; кожне число, оцінку, площу та інтенсивність у відповіді обчислює SlideScope на вашому комп’ютері, і кожне з них можна перевірити:

Посилання на вигляди. Кожне твердження вказує на вигляд, з якого воно отримане ([R1], [R2]). Клацніть посилання, і SlideScope повернеться точно до цього положення, масштабу та площини.
Докази. Кожен крок із площею аналізу в пікселях, площиною, використаними параметрами та результатами.
Повторити без ШІ (Re-run without AI). Заново обчислює записані кроки локально, без участі ШІ, і перевіряє, що числа виходять ідентичними.
Що було надіслано. Відповідь точно показує, що залишило ваш комп’ютер для цього запитання.
Усе на виду й усе можна скасувати. Контури, нотатки та зміни вигляду з’являються на зображенні в міру виконання, і будь-яку з них можна скасувати.

Відповідь Ask Your Slide у SlideScope на зрізі, забарвленому DAB: 15.4% із 577 ядер DAB-позитивні, H-score 20.1, Allred 4, 910 позитивних ядер на квадратний міліметр із посиланням [R1], оцінені ядра обведено на зображенні, а в доказах наведено локальний крок кількісного аналізу з посиланнями «Повторити без ШІ», «Експорт» і «Створити рисунок». — Справжня відповідь Ask Your Slide у SlideScope 1.23 на запитання «Який % ядер тут DAB-позитивний?» (15.4%) на зрізі дванадцятипалої кишки миші з ІГХ на BrdU (EPFL, CC BY 4.0). Ядра обведено за ступенем забарвлення DAB, відповідь посилається на використаний вигляд як [R1], а докази показують локальний крок, який дав кожне число, з кнопками «Повторити без ШІ», «Експорт» і «Створити рисунок».

Конфіденційність за замовчуванням: що саме надсилається

Аналіз виконується на вашому комп’ютері. Кроки планує і відповідь пише хмарна модель ШІ, а перемикач на панелі Ask Your Slide, Надсилати зображення вигляду (Send view images), визначає, чи побачить вона взагалі хоч одну картинку.

Надсилати зображення вигляду	Що надсилається хмарному ШІ	Що ніколи не залишає ваш комп’ютер
Вимк. («Без зображень»)	Ваше запитання, обмежені технічні відомості (формат, розміри, канали, розмір пікселя) і числа, обчислені локальними інструментами	Зображення та файл
Увімк.	Те саме плюс вигляди, які переглядає ШІ: кожен спершу показується на вашому екрані й надсилається у стисненому вигляді	Файл і всі частини зображення, які ШІ не переглядає

Ваші запитання та зображення не використовуються для навчання моделей ШІ. Медичні знімки, як-от КТ і МРТ, відхиляються. Постачальника ШІ та повні умови наведено в повідомленні про конфіденційність, а сторінка про обробку даних пояснює, що решта функцій SlideScope зберігає на вашому комп’ютері.

Експорт для лабораторного журналу, рисунків і розділу «Методи»

answer.md: відповідь із посиланнями, готова для вставлення в лабораторний журнал.
analysis_record.json: повний запис кроків, параметрів і результатів — той самий, який використовує «Повторити без ШІ».
Текст методів: абзац про те, що і як вимірювалося, який можна адаптувати для рукопису.
Результати Quantify: таблиця об’єктів у CSV, контури в GeoJSON (відкриваються в QuPath), маски та анотоване зображення.
Створити рисунок (Make figure): рисунок вигляду з каліброваною масштабною лінійкою.

Контрольні списки спільноти QUAREP-LiMi для публікацій вимагають від авторів описувати процедури аналізу зображень і деталі рисунків, як-от масштабні лінійки (Schmied et al., Nature Methods 2023). Запис аналізу й текст методів дають вам параметри, які потрібно зазначити.

Наскільки точна автоматична оцінка Ki67 та ІГХ?

Оцінку Ki67 на око важко відтворити, і це головна причина довірити підрахунок інструменту:

Коли International Ki67 in Breast Cancer Working Group розіслала ті самі 30 випадків раку молочної залози 23 патологам із 12 країн, узгодженість (ICC) становила 0.87 за глобального методу підрахунку та 0.83 за оцінки в гарячих точках, що не досягло критерію успіху дослідження. Патологи не завжди обирали на слайді ту саму гарячу точку (Leung et al., Histopathology 2019).
Шість вузькоспеціалізованих патологів молочної залози, які оцінили 57 слайдів Ki-67, досягли лише помірної узгодженості за порогу 20% (коефіцієнти 0.44 та 0.48 у двох раундах), і автори дійшли висновку, що для її покращення потрібен цифровий аналіз зображень (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Цифровий аналіз зображень дає узгодженіші результати: чотири алгоритми QuPath, незалежно створені чотирма патологами за настановою робочої групи, збіглися з еталонним алгоритмом з ICC 0.938 на 157 ER-позитивних випадках раку молочної залози (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Ці дослідження описують ручну й автоматичну оцінку Ki67 загалом; SlideScope у них не перевірявся. Оцінка ІГХ у SlideScope дотримується визначень QuPath (пороги оптичної густини DAB 0.2, 0.4 та 0.6 для 1+, 2+ і 3+), а його локальний кількісний аналіз звіряли з QuPath 0.7.0 на тих самих слайдах. Пошук гарячих точок — це розрахунок щільності об’єктів із z-оцінкою, а не суб’єктивне судження, тож та сама ділянка з тими самими налаштуваннями дає ті самі гарячі точки.

Як вибірково перевірити відповідь

Подивіться на контури на зображенні: пропущені ядра, злиті сусідні ядра та забарвлений дебрис помітно одразу.
Клацніть [R1], щоб повернутися точно до цього вигляду, наблизьте зображення й вручну підрахуйте невелике поле, порівнявши результат із наведеним числом.
Відкрийте докази й переконайтеся, що площина, площа ділянки та параметри саме ті, які ви мали на увазі.
Перш ніж довіряти інтенсивностям, перевірте насичення: запитайте, які канали насичені в тій самій ділянці.
Натисніть «Повторити без ШІ» і зберігайте запис аналізу разом із даними.

Ask Your Slide, універсальний чат-бот, скрипти чи корпоративний копілот

	Ask Your Slide	Завантаження зображення в універсальний чат-бот	Написання скриптів для QuPath або Fiji	Корпоративні копілоти для патології
Звідки беруться числа	Локальні інструменти SlideScope із зазначеними параметрами	Модель або код, який вона пише під час чату	Ваш скрипт, який виконує QuPath або Fiji	Моделі постачальника на його платформі
Куди потрапляє зображення	Залишається на вашому комп’ютері в режимі «Без зображень»; інакше — стиснені вигляди, які ви спершу бачите самі	Завантажується на сервери чат-бота	Залишається на вашому комп’ютері	Зберігається на платформі постачальника
Перевірка та повторення результату	Докази для кожного кроку; «Повторити без ШІ» перевіряє, що числа ідентичні	Повторне запитання може дати іншу відповідь	Відтворювано, якщо зберегти скрипт і версії	Залежить від платформи
Налаштування	Установити SlideScope і запитати	Не потрібне, але спершу треба експортувати зображення у формат, який чат-бот зможе прочитати	Вивчення API для скриптів і налагодження коду, зокрема коду, який пише за вас чат-бот	Договір з установою та розгортання
Повнослайдові та мікроскопічні формати	CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM і загалом близько 39 форматів	Зазвичай лише поширені формати зображень	Широка підтримка через Bio-Formats і OpenSlide	Формати, які приймає платформа
Найкраще для	Стандартні підрахунки, оцінки ІГХ і показники ділянок без коду, із записом, який можна показати	Швидкий опис картинки	Власні конвеєри та навчені класифікатори	Великі клініко-дослідницькі програми

QuPath і Fiji безкоштовні й залишаються правильним вибором для нестандартного або скриптового аналізу; див. як підрахувати клітини в ImageJ, QuPath або CellProfiler. Щоб описати вигляд словами, а не вимірювати його, скористайтеся AI Analysis.

Формати та мови

Ask Your Slide працює із зображеннями, які відкриває SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, повнослайдові зображення DICOM і загалом близько 39 форматів — від повнослайдових зображень у світлому полі до багатоканальної флуоресценції із Z, часом і сценами. Повний список — на сторінці сумісності файлів. Відповіді доступні 14 мовами, інтерфейс застосунку — 10.

Хто отримує Ask Your Slide

Ask Your Slide входить до SlideScope починаючи з версії 1.23.0 для Windows і macOS. Він включений у платні плани SlideScope в межах лімітів добросовісного використання ШІ; у планах Plus ліміти вищі. Порівняння груп обробки в межах експерименту вже зараз доступне в SlideScope Plus через експерименти; запитання про цілий експеримент планується додати пізніше. З безкоштовним обліковим записом SlideScope можна спробувати Ask Your Slide на безкоштовних зразках слайдів — три запитання на день; для запитань про власні зображення потрібна передплата. Актуальні ціни — на сторінці планів.

Запитання про Ask Your Slide

Чи може ChatGPT підрахувати клітини на мікроскопічному зображенні?

Сам по собі — ненадійно. Універсальний чат-бот відповідає за завантаженою картинкою або за кодом, який він пише в цьому чаті, тож метод може змінюватися від чату до чату, а знімок екрана не містить розміру пікселя. У доповіді 2024 року на семінарі про чат-боти для аналізу зображень зазначено, що мовні моделі не створювалися для підрахунку об’єктів на зображеннях. Ask Your Slide працює інакше: ШІ лише планує кроки, кожне число на вашому комп’ютері дають власні інструменти підрахунку SlideScope, а «Повторити без ШІ» обчислює їх заново.

Чи надсилаються мої зображення в хмару?

Ні, якщо перемикач «Надсилати зображення вигляду» вимкнено (режим «Без зображень»): зображення ніколи не залишає ваш комп’ютер, а хмарному ШІ надсилаються лише ваше запитання, обмежені технічні відомості (формат, розміри, канали, розмір пікселя) і обчислені числа. Якщо перемикач увімкнено, надсилаються також вигляди, які переглядає ШІ, у стисненому вигляді, і кожен із них спершу показується на вашому екрані. Ваші дані не використовуються для навчання моделей ШІ.

Чи є Ask Your Slide інструментом діагностики?

Ні. Ask Your Slide призначено лише для досліджень, і він не є медичним діагнозом. Він відхиляє медичні знімки, як-от КТ і МРТ, а його відповіді містять вимірювання, а не діагнози чи ступені.

Наскільки точна автоматична оцінка Ki67 порівняно з ручною?

Ручна оцінка Ki67 різниться між експертами: у міжнародному дослідженні 23 патологи досягли ICC 0.87 за глобальної оцінки та 0.83 за оцінки в гарячих точках. Цифровий аналіз зображень дає узгодженіші результати: чотири незалежно створені алгоритми QuPath збіглися з еталоном з ICC 0.938. Автоматичні підрахунки все одно потрібно перевіряти: дивіться на контури, порівнюйте невелике поле з ручним підрахунком і зберігайте запис доказів.

Ask Your Slide — безкоштовний застосунок для оцінки Ki67?

Ні. Ask Your Slide входить до платних планів SlideScope в межах лімітів добросовісного використання ШІ, а в Plus ліміти вищі. З безкоштовним обліковим записом можна ставити три запитання на день про вбудовані зразки слайдів, для яких також доступні всі локальні інструменти; актуальні ціни — на сторінці планів.

Чи можна повторити або експортувати результат?

Так. «Повторити без ШІ» заново обчислює записані кроки на вашому комп’ютері й перевіряє, що числа ідентичні. Експорт зберігає answer.md, analysis_record.json і абзац для розділу «Методи», а також CSV з об’єктами, контури в GeoJSON, маски й анотоване зображення, а «Створити рисунок» додає масштабну лінійку.

З якими форматами файлів він працює?

З форматами, які відкриває SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, повнослайдові зображення DICOM і загалом близько 39 форматів. Медичні знімки, як-от КТ і МРТ, відхиляються.

Чим це відрізняється від QuPath або ImageJ?

QuPath і ImageJ безкоштовні, підтримують скрипти й підходять для власних конвеєрів і навчених класифікаторів. Ask Your Slide призначено для стандартних запитань (підрахунки, відсоток позитивних, H-score, Allred, статистика ділянок, гарячі точки) без написання скриптів, просто в переглядачі, де зображення вже відкрите. Оцінка ІГХ у ньому використовує визначення, сумісні з QuPath, а його контури в GeoJSON відкриваються в QuPath.

Чи працює Ask Your Slide офлайн?

Для запитань потрібне підключення до інтернету, адже кроки планує і відповідь пише хмарний ШІ. Сам підрахунок, оцінка та вимірювання виконуються на вашому комп’ютері.

Чи можна запитати про цілий експеримент?

Поки що ні: Ask Your Slide відповідає на запитання про відкрите зображення. Щоб уже зараз порівняти групи обробки на багатьох зображеннях, скористайтеся експериментами в SlideScope Plus: один рецепт підрахунку застосовується до кожного зображення, а групи порівнюються відповідним статистичним тестом. Запитання про цілий експеримент планується додати в Plus пізніше.

Джерела

Швидкі відповіді

Найкраще підходить: дослідникам, центрам колективного користування та студентам, яким потрібні стандартні підрахунки, оцінки Ki67 або ІГХ і вимірювання ділянок на мікроскопічних зображеннях і слайдах без написання скриптів, із записом, який можна показати.

Ключові переваги: кожне число від локального інструмента, посилання на точний вигляд, «Повторити без ШІ», режим «Без зображень», експорт для лабораторного журналу та розділу «Методи», близько 39 форматів і відповіді 14 мовами.

Важливе обмеження: лише для досліджень, не діагноз; відповідає лише про відкрите зображення, а для запитань потрібне підключення до інтернету.

Востаннє переглянуто: 6 листопада 2026 р.

Ставте запитання своїм слайдам

Завантажте SlideScope, ознайомтеся з безкоштовною бібліотекою зразків і оформіть передплату (PayPal або картка, оплата під час оформлення, скасування в будь-який момент у вашому обліковому записі), щоб використовувати Ask Your Slide на власних зображеннях починаючи з версії 1.23.0.

Завантажити SlideScope