Ask Your Slide · a partir do SlideScope 1.23.0

Conte células e pontue a IHQ fazendo perguntas à sua lâmina

Escreva uma pergunta sobre a imagem que tem aberta, por exemplo «Que percentagem de núcleos é Ki67 positiva nesta região?». Um assistente de IA planeia os passos, e o SlideScope executa no seu computador as suas próprias ferramentas de contagem, pontuação de IHQ e medição. Cada número da resposta provém de uma dessas ferramentas, com as provas para o verificar e um botão que volta a executar os passos sem IA. Apenas para investigação.

Cada número provém de uma ferramenta local Modo No images: a imagem fica no seu computador Provas, recálculo e exportação

Como funciona o Ask Your Slide

  1. Abra a imagem no SlideScope, no Windows ou no macOS: uma lâmina inteira, um stack confocal, uma imagem de fluorescência ou qualquer um dos formatos que o SlideScope abre.
  2. Pergunte em linguagem corrente. Se a pergunta incidir sobre uma zona, desenhe primeiro uma região ou faça zoom até ao campo. As respostas chegam em qualquer uma de 14 idiomas.
  3. A IA planeia; as ferramentas locais fazem o trabalho. O assistente escolhe os passos (contar núcleos, pontuar DAB, medir uma região, encontrar hotspots) e o SlideScope executa cada um no seu computador. Vê cada ação na imagem, e cada uma pode ser anulada.
  4. Leia a resposta com as respetivas provas. A resposta cita as vistas exatas que usou como [R1], [R2] e assim sucessivamente: clique numa para voltar a essa vista. As provas listam cada passo com a área em píxeis, o plano, os parâmetros e os resultados, e a resposta mostra o que foi enviado.
  5. Verifique, recalcule e exporte. O Re-run without AI volta a calcular localmente os mesmos passos e verifica se os números são idênticos. Exporte a resposta, o registo da análise e um parágrafo de Métodos, ou crie uma figura com barra de escala.

Veja uma demonstração de 62 segundos gravada no SlideScope 1.23 com imagens de amostra públicas (IHQ BrdU da EPFL, CC BY 4.0; DAPI/GFP do czitools). Sem som.

Perguntas que pode fazer e as ferramentas que lhes respondem

O Ask Your Slide trabalha com as ferramentas do próprio SlideScope: contagem de núcleos, células ou partículas (segmentação por aprendizagem profunda com InstanSeg ou um método clássico), pontuação de IHQ para DAB, estatísticas de região, medições calibradas, estatísticas de saturação por canal, um localizador de hotspots, contornos de regiões, notas e controlos de vista. Alguns exemplos:

O que perguntaFerramentas que o SlideScope executaO que obtém
«Que percentagem de núcleos é Ki67 positiva nesta região?»Contar núcleos (InstanSeg) e depois pontuação de IHQ para DABPercentagem de positivos com o número de núcleos contados, e os contornos na imagem
«Dê-me o H-score e a pontuação de Allred da área que contornei.»Contar núcleos, pontuação de IHQ com definições compatíveis com o QuPathH-score, pontuação de Allred e percentagem de positivos dessa região
«Encontre as três zonas mais densas e pontue o Ki67 em cada uma.»Localizador de hotspots, contorno de regiões, contagem e pontuação por regiãoTrês hotspots contornados com densidade por mm², um z-score e uma percentagem de Ki67 para cada um
«Quantas células há neste campo e qual é o seu tamanho?»Contar células (InstanSeg ou método clássico)Uma contagem e as áreas dos objetos, exportáveis em CSV e GeoJSON
«Compare a densidade de DAPI nestas duas regiões.»Estatísticas de região e contagem de núcleos para cada regiãoÁrea, contagem e densidade por mm², lado a lado
«Que canal é o mais brilhante aqui, e há algo saturado?»Estatísticas de região, estatísticas de saturação por canalIntensidade média por canal e a fração saturada de cada um
«Leve-me à zona de GFP mais brilhante.»Localizador de hotspots no canal GFP e depois deslocar a vistaA vista ampliada nessa zona, com a região contornada
«Qual é a área desta região em µm² e que parte dela é DAB positiva?»Medição calibrada, estatísticas de regiãoÁrea em µm² e a percentagem de área DAB positiva
«Vá para o plano Z 12 e conte os núcleos.»Deslocar a vista (Z), contar núcleosA contagem nesse plano, com o plano registado nas provas
«Acrescente uma nota com estes números.»Acrescentar uma notaUma nota na lâmina que fica com a imagem

Por agora, o Ask Your Slide responde sobre a imagem que está aberta. Para comparar tratamentos em muitas imagens, use as Experiências no SlideScope Plus: a mesma receita de contagem em todas as imagens, comparadas com o teste estatístico adequado. Perguntar sobre uma experiência inteira está previsto para mais tarde.

Cada número provém de uma ferramenta

Os modelos de IA genéricos não foram concebidos para contar objetos olhando para uma imagem (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), por isso o Ask Your Slide nunca deixa o modelo estimar um número. O assistente apenas decide que ferramentas executar; cada contagem, pontuação, área e intensidade da resposta é calculada pelo SlideScope no seu computador, e pode verificar cada uma:

  • Citações das vistas. Cada afirmação remete para a vista de onde veio ([R1], [R2]). Clique e o SlideScope regressa exatamente a essa posição, zoom e plano.
  • Provas. Cada passo, com a área analisada em píxeis, o plano, os parâmetros usados e os resultados.
  • Re-run without AI. Volta a calcular localmente os passos registados, sem qualquer intervenção de IA, e verifica se os números saem idênticos.
  • O que foi enviado. A resposta mostra exatamente o que saiu do seu computador para essa pergunta.
  • Visível e reversível. Os contornos, as notas e as mudanças de vista surgem na imagem à medida que acontecem, e cada um pode ser anulado.
Resposta do Ask Your Slide no SlideScope num corte corado com DAB: 15,4% de 577 núcleos DAB positivos, H-score 20,1, Allred 4, 910 núcleos positivos por milímetro quadrado com uma citação [R1], os núcleos pontuados contornados na imagem e as provas com o passo local de quantificação e ligações para Re-run without AI, Export e Make figure.
Uma resposta real do Ask Your Slide no SlideScope 1.23 a «Que % de núcleos é DAB positiva aqui?» (15,4%) num corte de duodeno de ratinho com IHQ BrdU (EPFL, CC BY 4.0). Os núcleos estão contornados de acordo com o grau de DAB, a resposta cita como [R1] a vista que usou, e as provas mostram o passo local que produziu cada número, com Re-run without AI, Export e Make figure.

Privacidade desde a conceção: o que é enviado, exatamente

A análise corre no seu computador. Um modelo de IA na cloud planeia os passos e redige a resposta, e um interruptor no painel do Ask Your Slide, Send view images, decide se alguma vez vê uma imagem.

Send view imagesO que é enviado para a IA na cloudO que nunca sai do seu computador
Desativado («No images»)A sua pergunta, alguns dados técnicos (formato, dimensões, canais, tamanho de píxel) e os números calculados pelas ferramentas locaisA imagem e o ficheiro
AtivadoO mesmo, mais as vistas que a IA observa, cada uma mostrada primeiro no seu ecrã, comprimidaO ficheiro e qualquer parte da imagem que a IA não observa

As suas perguntas e imagens não são usadas para treinar modelos de IA. Os exames médicos como TAC e ressonância magnética são recusados. O fornecedor de IA e os termos completos constam do aviso de privacidade, e a página de tratamento de dados explica o que o resto do SlideScope mantém no seu computador.

Exportações para o seu caderno, as suas figuras e os seus Métodos

  • answer.md: a resposta com as citações, pronta a colar num caderno de laboratório.
  • analysis_record.json: o registo completo de passos, parâmetros e resultados, o mesmo registo que o Re-run without AI usa.
  • Texto de Métodos: um parágrafo que descreve o que foi medido e como, para adaptar a um manuscrito.
  • Resultados do Quantify: a tabela de objetos em CSV, os contornos em GeoJSON (abrem no QuPath), máscaras e uma imagem anotada.
  • Make figure: uma figura da vista com uma barra de escala calibrada.

As listas de verificação da comunidade QUAREP-LiMi pedem aos autores que descrevam os fluxos de análise de imagem e pormenores das figuras, como as barras de escala (Schmied et al., Nature Methods 2023). O registo e o texto de Métodos dão-lhe os parâmetros a reportar.

Qual é a exatidão da pontuação automatizada de Ki67 e de IHQ?

Pontuar o Ki67 a olho é difícil de reproduzir, e essa é a principal razão para deixar uma ferramenta contar:

  • Quando o International Ki67 in Breast Cancer Working Group enviou os mesmos 30 cancros da mama a 23 patologistas de 12 países, a concordância (CCI) foi de 0,87 com o método de contagem global e de 0,83 com a pontuação por hot-spot, que ficou aquém do critério de sucesso do estudo. Os observadores nem sempre escolheram o mesmo hot-spot numa lâmina (Leung et al., Histopathology 2019).
  • Seis patologistas subespecializados em mama, ao pontuarem 57 lâminas de Ki-67, chegaram apenas a uma concordância moderada no ponto de corte de 20% (coeficientes de 0,44 e 0,48 em duas rondas), e os autores concluíram que é necessária a análise digital de imagem para a melhorar (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
  • A análise digital de imagem é mais consistente: quatro algoritmos do QuPath criados de forma independente por quatro patologistas, seguindo a orientação do grupo de trabalho, concordaram com um algoritmo de referência com um CCI de 0,938 em 157 cancros da mama RE positivos (Boyaci et al., Biomolecules 2021).

Estes estudos descrevem a pontuação manual e automatizada do Ki67 em geral; não testaram o SlideScope. A pontuação de IHQ do SlideScope segue as definições do QuPath (limiares de densidade ótica de DAB de 0,2, 0,4 e 0,6 para 1+, 2+ e 3+), e a sua quantificação local foi comparada com o QuPath 0.7.0 nas mesmas lâminas. O localizador de hotspots é um cálculo da densidade de objetos com um z-score, não um juízo, pelo que a mesma região com as mesmas definições dá os mesmos hotspots.

Como verificar uma resposta

  1. Observe os contornos na imagem: núcleos falhados, vizinhos fundidos e detritos corados saltam à vista.
  2. Clique em [R1] para regressar à vista exata, faça zoom e conte à mão um campo pequeno para comparar com o número indicado.
  3. Abra as provas e confirme que o plano, a área da região e os parâmetros são os que pretendia.
  4. Verifique a saturação antes de confiar nas intensidades: pergunte que canais estão saturados na mesma região.
  5. Prima Re-run without AI e guarde o registo da análise juntamente com os seus dados.

Ask Your Slide, um chatbot genérico, scripts ou um copiloto empresarial

Ask Your SlideCarregar uma imagem num chatbot genéricoEscrever scripts para QuPath ou FijiCopilotos empresariais de patologia
De onde vêm os númerosDas ferramentas locais do SlideScope, com os parâmetros à vistaDo modelo, ou do código que ele escreve durante a conversaDo seu script, executado pelo QuPath ou pelo FijiDos modelos do fornecedor, na plataforma deste
Para onde vai a imagemFica no seu computador no modo No images; caso contrário, vistas comprimidas que vê primeiroÉ carregada nos servidores do chatbotFica no seu computadorFica alojada na plataforma do fornecedor
Verificar e repetir um resultadoProvas por passo; o Re-run without AI verifica se os números são idênticosPerguntar outra vez pode dar uma resposta diferenteRepetível se guardar o script e as versõesDepende da plataforma
ConfiguraçãoInstalar o SlideScope e perguntarNenhuma, mas antes tem de exportar uma imagem que o chatbot consiga lerAprender a API de scripting e depurar o código, incluindo o código que um chatbot escreve por siUm contrato institucional e uma implementação
Formatos de lâmina inteira e de microscópioCZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM e cerca de 39 formatosNormalmente só formatos de imagem comunsAmplos, através do Bio-Formats e do OpenSlideOs formatos que a plataforma aceita
Ideal paraContagens padrão, pontuações de IHQ e valores de regiões sem código, com um registo para apresentarUma descrição rápida de uma imagemPipelines personalizados e classificadores treinadosGrandes programas de investigação clínica

O QuPath e o Fiji são gratuitos e continuam a ser a escolha certa para análises personalizadas ou com scripts; veja como contar células no ImageJ, no QuPath ou no CellProfiler. Para descrever uma vista por palavras em vez de a medir, use o AI Analysis.

Formatos e idiomas

O Ask Your Slide funciona com as imagens que o SlideScope abre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, imagens DICOM de lâmina inteira e cerca de 39 formatos no total, desde lâminas inteiras em campo claro até fluorescência multicanal com Z, tempo e cenas. A lista completa está na página de compatibilidade de ficheiros. As respostas chegam em 14 idiomas, e a interface da aplicação está disponível em 10.

Quem tem acesso ao Ask Your Slide

O Ask Your Slide faz parte do SlideScope a partir da versão 1.23.0, no Windows e no macOS. Está incluído nos planos pagos do SlideScope, dentro de limites de utilização razoável de IA; os planos Plus têm limites mais elevados. Comparar tratamentos ao longo de uma experiência já é possível hoje no SlideScope Plus, através das Experiências; perguntar sobre uma experiência inteira está previsto para mais tarde. Com uma conta gratuita do SlideScope, pode experimentar o Ask Your Slide nas lâminas de amostra gratuitas, com três perguntas por dia; perguntar sobre as suas próprias imagens requer uma subscrição. Os preços atuais estão na página de planos.

Perguntas sobre o Ask Your Slide

O ChatGPT consegue contar células numa imagem de microscopia?

Sozinho, não de forma fiável. Um chatbot genérico responde a partir da imagem que carrega, ou de código que escreve nessa conversa, pelo que o método pode mudar de uma conversa para outra, e uma captura de ecrã não traz o tamanho de píxel. Uma apresentação num workshop de 2024 sobre chatbots para análise de imagem nota que os modelos de linguagem não foram concebidos para contar objetos em imagens. O Ask Your Slide funciona de outra forma: a IA apenas planeia os passos, as ferramentas de contagem do próprio SlideScope produzem cada número no seu computador, e o Re-run without AI volta a calculá-los.

As minhas imagens são enviadas para a cloud?

Não, com o Send view images desativado (No images): a imagem nunca sai do seu computador, e só a sua pergunta, alguns dados técnicos (formato, dimensões, canais, tamanho de píxel) e os números calculados são enviados para a IA na cloud. Com o interruptor ativado, as vistas que a IA observa também são enviadas, comprimidas, e cada uma é mostrada primeiro no seu ecrã. Os seus dados não são usados para treinar modelos de IA.

O Ask Your Slide é uma ferramenta de diagnóstico?

Não. O Ask Your Slide destina-se apenas a investigação e não é um diagnóstico médico. Recusa exames médicos como TAC e ressonância magnética, e as suas respostas indicam medições, não diagnósticos nem graus.

Qual é a exatidão da pontuação automatizada do Ki67 face à pontuação manual?

A pontuação manual do Ki67 varia entre observadores: num estudo internacional, 23 patologistas atingiram um CCI de 0,87 com a pontuação global e de 0,83 com a pontuação por hot-spot. A análise digital de imagem é mais consistente: quatro algoritmos do QuPath criados de forma independente concordaram com uma referência com um CCI de 0,938. As contagens automatizadas continuam a precisar de verificação: observe os contornos, compare um campo pequeno com uma contagem manual e guarde o registo das provas.

O Ask Your Slide é uma aplicação gratuita de pontuação do Ki67?

Não. O Ask Your Slide está incluído nos planos pagos do SlideScope, dentro de limites de utilização razoável de IA, com limites mais elevados no Plus. Com uma conta gratuita pode fazer três perguntas por dia sobre as lâminas de amostra incluídas, que também vêm com todas as ferramentas locais, e os preços atuais estão na página de planos.

Posso recalcular ou exportar o resultado?

Sim. O Re-run without AI volta a calcular no seu computador os passos registados e verifica se os números são idênticos. A exportação guarda answer.md, analysis_record.json e um parágrafo de Métodos, além do CSV de objetos, dos contornos GeoJSON, das máscaras e de uma imagem anotada, e o Make figure acrescenta uma barra de escala.

Com que formatos de ficheiro funciona?

Com os formatos que o SlideScope abre: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, imagens DICOM de lâmina inteira e cerca de 39 formatos no total. Os exames médicos como TAC e ressonância magnética são recusados.

Em que difere do QuPath ou do ImageJ?

O QuPath e o ImageJ são gratuitos, programáveis por scripts e as ferramentas certas para pipelines personalizados e classificadores treinados. O Ask Your Slide destina-se às perguntas padrão (contagens, percentagem de positivos, H-score, Allred, estatísticas de região, hotspots) sem escrever um script, dentro do visualizador onde a imagem já está aberta. A sua pontuação de IHQ usa definições compatíveis com o QuPath, e os seus contornos GeoJSON abrem no QuPath.

O Ask Your Slide funciona offline?

Perguntar requer uma ligação à internet, porque uma IA na cloud planeia os passos e redige a resposta. A contagem, a pontuação e a medição propriamente ditas correm no seu computador.

Posso perguntar sobre uma experiência inteira?

Através de perguntas, ainda não: o Ask Your Slide responde sobre a imagem que está aberta. Para comparar hoje tratamentos em muitas imagens, use as Experiências no SlideScope Plus, que aplicam a mesma receita de contagem a todas as imagens e comparam os tratamentos com o teste estatístico adequado. Fazer perguntas sobre uma experiência inteira está previsto para o Plus mais tarde.

Fontes

Respostas rápidas

Mais indicado para: investigadores, plataformas de imagem e estudantes que precisam de contagens padrão, pontuações de Ki67 ou de IHQ e medições de regiões em imagens de microscopia e de lâminas sem escrever scripts, com um registo que possam apresentar.

Principais pontos fortes: cada número provém de uma ferramenta local, citações que levam à vista exata, Re-run without AI, um modo No images, exportações para o caderno e os Métodos, cerca de 39 formatos e respostas em 14 idiomas.

Limitação importante: apenas para investigação, não é um diagnóstico; responde sobre a imagem aberta, e perguntar requer uma ligação à internet.

Última revisão: 6 de novembro de 2026.

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