Cellen tellen en IHC scoren door je coupe een vraag te stellen
Typ een vraag over het beeld dat je open hebt, zoals ‘Welk percentage van de kernen is Ki67-positief in deze regio?’ Een AI-assistent plant de stappen, en SlideScope voert zijn eigen tools voor tellen, IHC-scoring en meten uit op je computer. Elk getal in het antwoord komt uit een van die tools, met het bewijs om het te controleren en een knop die de stappen zonder AI opnieuw uitvoert. Uitsluitend voor onderzoek.
Elk getal uit een lokale toolModus ‘No images’: het beeld blijft op je computerBewijs, opnieuw uitvoeren en exporteren
Zo werkt Ask Your Slide
Open het beeld in SlideScope op Windows of macOS: een hele coupe, een confocale stack, een fluorescentiebeeld of een bestand in een van de andere formaten die SlideScope opent.
Vraag het in gewone taal. Gaat de vraag over één gebied, teken dan eerst een regio of zoom in op het veld. Antwoorden komen terug in 14 talen.
De AI plant, lokale tools doen het werk. De assistent kiest de stappen (kernen tellen, DAB scoren, een regio meten, hotspots zoeken), en SlideScope voert elke stap uit op je computer. Je ziet elke actie op het beeld gebeuren, en elke actie kun je ongedaan maken.
Lees het antwoord met het bewijs. Het antwoord verwijst met [R1], [R2] enzovoort naar de precieze weergaven die het gebruikte: klik erop om terug te springen naar die weergave. Het bewijs toont elke stap met het oppervlak in pixels, het vlak, de parameters en de resultaten, en het antwoord laat zien wat er is verstuurd.
Controleer, voer opnieuw uit en exporteer. Re-run without AI berekent dezelfde stappen lokaal opnieuw en controleert of de getallen identiek zijn. Exporteer het antwoord, het analyseverslag en een alinea voor de methodesectie, of maak een figuur met een schaalbalk.
Bekijk een demo van 62 seconden, opgenomen in SlideScope 1.23 met openbare voorbeeldbeelden (EPFL BrdU IHC, CC BY 4.0; czitools DAPI/GFP). Zonder geluid.
Vragen die je kunt stellen, en de tools die ze beantwoorden
Ask Your Slide werkt met de eigen tools van SlideScope: kernen, cellen of deeltjes tellen (deeplearningsegmentatie met InstanSeg of een klassieke methode), IHC-scoring voor DAB, regiostatistieken, gekalibreerde metingen, statistieken over kanaalverzadiging, een hotspotzoeker, regiocontouren, notities en weergavebediening. Een paar voorbeelden:
Jouw vraag
Tools die SlideScope uitvoert
Wat je krijgt
‘Welk percentage van de kernen is Ki67-positief in deze regio?’
Kernen tellen (InstanSeg), daarna IHC-scoring voor DAB
Percentage positief met het aantal getelde kernen, en contouren op het beeld
‘Wat zijn de H-score en de Allred-score voor het gebied dat ik heb omlijnd?’
Kernen tellen, IHC-scoring met QuPath-compatibele definities
H-score, Allred-score en percentage positief voor die regio
‘Zoek de drie drukste gebieden en scoor in elk Ki67.’
Hotspotzoeker, regio's omlijnen, tellen en scoren per regio
Drie omlijnde hotspots, elk met dichtheid per mm², een z-score en een Ki67-percentage
‘Hoeveel cellen zitten er in dit veld, en hoe groot zijn ze?’
Cellen tellen (InstanSeg of klassiek)
Een telling en objectoppervlakken, te exporteren als CSV en GeoJSON
‘Vergelijk de DAPI-dichtheid in deze twee regio's.’
Regiostatistieken en kerntellingen voor elke regio
Oppervlak, aantal en dichtheid per mm² naast elkaar
‘Welk kanaal is hier het helderst, en is er iets verzadigd?’
Regiostatistieken, statistieken over kanaalverzadiging
Gemiddelde intensiteit per kanaal en de verzadigde fractie van elk kanaal
‘Breng me naar het helderste GFP-gebied.’
Hotspotzoeker op het GFP-kanaal, daarna de weergave verplaatsen
De weergave ingezoomd op dat gebied, met de regio omlijnd
‘Wat is het oppervlak van deze regio in µm², en welk deel daarvan is DAB-positief?’
Gekalibreerde meting, regiostatistieken
Oppervlak in µm² en het percentage DAB-positief oppervlak
‘Ga naar Z-vlak 12 en tel de kernen.’
Weergave verplaatsen (Z), kernen tellen
De telling op dat vlak, met het vlak vastgelegd in het bewijs
‘Voeg een notitie toe met deze getallen.’
Notitie toevoegen
Een notitie op de coupe die bij het beeld blijft
Op dit moment beantwoordt Ask Your Slide vragen over het beeld dat open is. Om behandelingen over veel beelden te vergelijken, gebruik je Experimenten in SlideScope Plus: één telrecept op elk beeld, vergeleken met de juiste statistische toets. Vragen over een heel experiment staan voor later gepland.
Elk getal komt uit een tool
Algemene AI-modellen zijn niet gemaakt om objecten te tellen door naar een afbeelding te kijken (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), dus Ask Your Slide laat het model nooit een getal schatten. De assistent beslist alleen welke tools er draaien; elke telling, score, oppervlakte en intensiteit in het antwoord wordt door SlideScope op je computer berekend, en je kunt ze allemaal controleren:
Verwijzingen naar weergaven. Elke uitspraak verwijst naar de weergave waar ze vandaan komt ([R1], [R2]). Klik erop en SlideScope keert terug naar precies die positie, dat zoomniveau en dat vlak.
Bewijs. Elke stap, met het geanalyseerde oppervlak in pixels, het vlak, de gebruikte parameters en de resultaten.
Re-run without AI. Berekent de vastgelegde stappen lokaal opnieuw, zonder enige AI, en controleert of de getallen identiek uitkomen.
Wat er is verstuurd. Het antwoord laat precies zien wat er voor die vraag je computer heeft verlaten.
Zichtbaar en ongedaan te maken. Contouren, notities en wijzigingen van de weergave verschijnen op het beeld terwijl ze gebeuren, en elke wijziging kun je ongedaan maken.
Een echt antwoord van Ask Your Slide in SlideScope 1.23 op ‘What % of nuclei are DAB-positive here?’ (15,4%) op een BrdU-IHC-coupe van muizenduodenum (EPFL, CC BY 4.0). De kernen zijn omlijnd naar hun DAB-graad, het antwoord verwijst met [R1] naar de gebruikte weergave, en het bewijs toont de lokale stap die elk getal opleverde, met Re-run without AI, Export en Make figure.
Privacy by design: wat er precies wordt verstuurd
De analyse draait op je computer. Het plannen van de stappen en het schrijven van het antwoord doet een AI-model in de cloud, en een schakelaar in het Ask Your Slide-paneel, Send view images, bepaalt of het ooit een afbeelding te zien krijgt.
Send view images
Wat naar de cloud-AI gaat
Wat je computer nooit verlaat
Uit (‘No images’)
Je vraag, beperkte technische gegevens (formaat, afmetingen, kanalen, pixelgrootte) en de getallen die de lokale tools hebben berekend
Het beeld en het bestand
Aan
Hetzelfde, plus de weergaven waar de AI naar kijkt, gecomprimeerd en elk eerst op je scherm getoond
Het bestand en elk deel van het beeld waar de AI niet naar kijkt
Je vragen en beelden worden niet gebruikt om AI-modellen te trainen. Medische scans zoals CT en MRI worden geweigerd. De AI-aanbieder en de volledige voorwaarden staan in de privacyverklaring, en de pagina over gegevensverwerking legt uit wat de rest van SlideScope op je computer bewaart.
Exports voor je labjournaal, figuur en methodesectie
answer.md: het antwoord met de verwijzingen, klaar om in een labjournaal te plakken.
analysis_record.json: het volledige verslag van stappen, parameters en resultaten, hetzelfde verslag dat Re-run without AI gebruikt.
Methodetekst: een alinea die beschrijft wat er gemeten is en hoe, om aan te passen voor een manuscript.
Quantify-output: de objecttabel als CSV, contouren als GeoJSON (die openen in QuPath), maskers en een geannoteerd beeld.
Make figure: een figuur van de weergave met een gekalibreerde schaalbalk.
Rapportagechecklists van de QUAREP-LiMi-community vragen auteurs om beeldanalyseworkflows en details van figuren, zoals schaalbalken, te vermelden (Schmied et al., Nature Methods 2023). Het verslag en de methodetekst geven je de parameters om te rapporteren.
Hoe nauwkeurig is geautomatiseerde Ki67- en IHC-scoring?
Ki67 op het oog scoren is moeilijk reproduceerbaar, en dat is de belangrijkste reden om een tool te laten tellen:
Toen de International Ki67 in Breast Cancer Working Group dezelfde 30 borsttumoren naar 23 pathologen in 12 landen stuurde, was de overeenstemming (ICC) 0,87 met de globale telmethode en 0,83 met hotspotscoring, waarmee die laatste het succescriterium van de studie niet haalde. Beoordelaars kozen op een coupe niet altijd dezelfde hotspot (Leung et al., Histopathology 2019).
Zes gespecialiseerde mammapathologen die 57 Ki-67-coupes scoorden, bereikten bij het afkappunt van 20% slechts matige overeenstemming (coëfficiënten van 0,44 en 0,48 in twee rondes), en de auteurs concludeerden dat digitale beeldanalyse nodig is om die te verbeteren (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Digitale beeldanalyse is consistenter: vier QuPath-algoritmen die vier pathologen onafhankelijk van elkaar volgens de richtlijn van de werkgroep hadden gebouwd, kwamen bij 157 ER-positieve borsttumoren met een ICC van 0,938 overeen met een referentiealgoritme (Boyaci et al., Biomolecules 2021).
Deze studies beschrijven handmatige en geautomatiseerde Ki67-scoring in het algemeen; SlideScope is daarin niet getest. De IHC-scoring van SlideScope volgt de definities van QuPath (afkappunten voor de optische dichtheid van DAB van 0,2; 0,4 en 0,6 voor 1+, 2+ en 3+), en de lokale kwantificatie is op dezelfde coupes vergeleken met QuPath 0.7.0. De hotspotzoeker is een berekening van objectdichtheid met een z-score, geen oordeel: dezelfde regio en instellingen geven dezelfde hotspots.
Zo controleer je een antwoord steekproefsgewijs
Bekijk de contouren op het beeld: gemiste kernen, samengevoegde buren en gekleurd debris zie je in één oogopslag.
Klik op [R1] om terug te gaan naar precies die weergave, zoom in en tel een klein veld met de hand om het te vergelijken met het gerapporteerde getal.
Open het bewijs en controleer of het vlak, het oppervlak van de regio en de parameters zijn wat je bedoelde.
Controleer de verzadiging voordat je op intensiteiten vertrouwt: vraag welke kanalen in dezelfde regio verzadigd zijn.
Klik op Re-run without AI en bewaar het analyseverslag bij je data.
Ask Your Slide, een algemene chatbot, scripts of een enterprise-copilot
Ask Your Slide
Een beeld uploaden naar een algemene chatbot
Scripts schrijven voor QuPath of Fiji
Pathologie-copilots voor grote organisaties
Waar de getallen vandaan komen
De lokale tools van SlideScope, met de parameters zichtbaar
Het model, of code die het tijdens de chat schrijft
Je script, uitgevoerd door QuPath of Fiji
De modellen van de leverancier op diens platform
Waar het beeld naartoe gaat
Blijft op je computer in de modus ‘No images’; anders gecomprimeerde weergaven die je eerst te zien krijgt
Geüpload naar de servers van de chatbot
Blijft op je computer
Opgeslagen op het platform van de leverancier
Een resultaat controleren en herhalen
Bewijs per stap; Re-run without AI controleert of de getallen identiek zijn
Opnieuw vragen kan een ander antwoord geven
Herhaalbaar als je het script en de versies bewaart
Hangt af van het platform
Opzet
SlideScope installeren en vragen
Geen, maar je exporteert eerst een afbeelding die de chatbot kan lezen
De script-API leren en de code debuggen, ook code die een chatbot voor je schrijft
Een contract met de instelling en een implementatie
Standaardtellingen, IHC-scores en waarden per regio zonder code, met een verslag om te laten zien
Een snelle beschrijving van een afbeelding
Eigen pipelines en getrainde classificatoren
Grote klinische onderzoeksprogramma's
QuPath en Fiji zijn gratis en blijven de juiste keuze voor maatwerk- of gescripte analyse; zie cellen tellen in ImageJ, QuPath of CellProfiler. Wil je een weergave in woorden beschrijven in plaats van meten, gebruik dan AI Analysis.
Formaten en talen
Ask Your Slide werkt met de beelden die SlideScope opent: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM-whole-slide-beelden en in totaal zo'n 39 formaten, van helderveldcoupes tot meerkanaalsfluorescentie met Z, tijd en scènes. De volledige lijst staat op de pagina over bestandscompatibiliteit. Antwoorden zijn beschikbaar in 14 talen, de interface van de app in 10.
Wie krijgt Ask Your Slide
Ask Your Slide maakt deel uit van SlideScope vanaf versie 1.23.0 op Windows en macOS. Het zit in de betaalde SlideScope-abonnementen, binnen de grenzen van redelijk AI-gebruik; Plus-abonnementen hebben hogere limieten. Behandelingen over een heel experiment vergelijken doe je vandaag met Experimenten in SlideScope Plus; vragen over een heel experiment staan voor later gepland. Met een gratis SlideScope-account kun je Ask Your Slide uitproberen op de gratis voorbeeldcoupes, drie vragen per dag; voor vragen over je eigen beelden heb je een abonnement nodig. De actuele prijzen staan op de abonnementenpagina.
Vragen over Ask Your Slide
Kan ChatGPT cellen tellen in een microscopiebeeld?
Op zichzelf niet betrouwbaar. Een algemene chatbot antwoordt op basis van de afbeelding die je uploadt, of met code die hij in die chat schrijft, dus de methode kan per chat verschillen, en een screenshot bevat geen pixelgrootte. Een workshoppresentatie uit 2024 over chatbots voor beeldanalyse merkt op dat taalmodellen niet gebouwd zijn om objecten in afbeeldingen te tellen. Ask Your Slide werkt anders: de AI plant alleen de stappen, de eigen teltools van SlideScope leveren elk getal op je computer, en Re-run without AI berekent ze opnieuw.
Worden mijn beelden naar de cloud gestuurd?
Niet als Send view images uit staat (No images): het beeld verlaat je computer nooit, en alleen je vraag, beperkte technische gegevens (formaat, afmetingen, kanalen, pixelgrootte) en de berekende getallen gaan naar de cloud-AI. Staat de schakelaar aan, dan worden ook de weergaven waar de AI naar kijkt verstuurd, gecomprimeerd, en elke weergave wordt eerst op je scherm getoond. Je gegevens worden niet gebruikt om AI-modellen te trainen.
Is Ask Your Slide een diagnostisch hulpmiddel?
Nee. Ask Your Slide is uitsluitend bedoeld voor onderzoek en is geen medische diagnose. Het weigert medische scans zoals CT en MRI, en de antwoorden geven metingen, geen diagnoses of gradering.
Hoe nauwkeurig is geautomatiseerde Ki67-scoring vergeleken met handmatige scoring?
Handmatige Ki67-scoring verschilt per beoordelaar: in een internationale studie haalden 23 pathologen een ICC van 0,87 met globale scoring en 0,83 met hotspotscoring. Digitale beeldanalyse is consistenter: vier onafhankelijk gebouwde QuPath-algoritmen kwamen met een ICC van 0,938 overeen met een referentie. Ook geautomatiseerde tellingen moet je controleren: bekijk de contouren, vergelijk een klein veld met een handmatige telling en bewaar het bewijsverslag.
Is Ask Your Slide een gratis app voor Ki67-scoring?
Nee. Ask Your Slide zit in de betaalde SlideScope-abonnementen, binnen de grenzen van redelijk AI-gebruik, met hogere limieten in Plus. Met een gratis account kun je drie vragen per dag stellen over de ingebouwde voorbeeldcoupes, die ook alle lokale tools bevatten, en de actuele prijzen staan op de abonnementenpagina.
Kan ik het resultaat opnieuw uitvoeren of exporteren?
Ja. Re-run without AI berekent de vastgelegde stappen opnieuw op je computer en controleert of de getallen identiek zijn. Export slaat answer.md, analysis_record.json en een alinea voor de methodesectie op, plus de object-CSV, GeoJSON-contouren, maskers en een geannoteerd beeld, en Make figure voegt een schaalbalk toe.
Met welke bestandsformaten werkt het?
De formaten die SlideScope opent: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM-whole-slide-beelden en in totaal zo'n 39 formaten. Medische scans zoals CT en MRI worden geweigerd.
Wat is het verschil met QuPath of ImageJ?
QuPath en ImageJ zijn gratis, scriptbaar en de juiste tools voor eigen pipelines en getrainde classificatoren. Ask Your Slide is bedoeld voor de standaardvragen (tellingen, percentage positief, H-score, Allred, regiostatistieken, hotspots) zonder een script te schrijven, in de viewer waarin het beeld al open is. De IHC-scoring gebruikt QuPath-compatibele definities, en de GeoJSON-contouren openen in QuPath.
Werkt Ask Your Slide offline?
Voor het vragen heb je een internetverbinding nodig, omdat een AI in de cloud de stappen plant en het antwoord schrijft. Het tellen, scoren en meten zelf draait op je computer.
Kan ik vragen stellen over een heel experiment?
Via een vraag nog niet: Ask Your Slide beantwoordt vragen over het beeld dat open is. Om nu behandelingen over veel beelden te vergelijken, gebruik je Experimenten in SlideScope Plus, dat één telrecept op elk beeld uitvoert en behandelingen vergelijkt met de juiste statistische toets. Vragen over een heel experiment staan voor later gepland in Plus.
Het meest geschikt voor: onderzoekers, core facilities en studenten die standaardtellingen, Ki67- of IHC-scores en metingen per regio nodig hebben uit microscopie- en coupebeelden, zonder scripts te schrijven, met een verslag dat ze kunnen laten zien.
Belangrijkste sterke punten: elk getal uit een lokale tool, verwijzingen terug naar de precieze weergave, Re-run without AI, een modus ‘No images’, exports voor labjournaal en methodesectie, zo'n 39 formaten en antwoorden in 14 talen.
Belangrijke beperking: uitsluitend voor onderzoek, geen diagnose; het beantwoordt vragen over het beeld dat open is, en vragen stellen vereist een internetverbinding.
Laatst gecontroleerd: 6 november 2026.
Stel vragen over je eigen coupes
Download SlideScope, verken de gratis voorbeeldbibliotheek, en neem een abonnement (PayPal of kaart, gefactureerd wanneer je je abonneert, altijd opzegbaar via je account) om Ask Your Slide vanaf versie 1.23.0 op je eigen beelden te gebruiken.
![Antwoord van SlideScope Ask Your Slide op een DAB-gekleurde coupe: 15,4% van 577 kernen DAB-positief, H-score 20,1, Allred 4, 910 positieve kernen per vierkante millimeter met een verwijzing [R1], de gescoorde kernen omlijnd op het beeld, en het bewijs met de lokale Quantify-stap en links naar Re-run without AI, Export en Make figure.](/assets/product-ask-your-slide.webp)