Оцінка ІГХ

Калькулятор H-score

Введіть відсоток клітин із кожною інтенсивністю забарвлення або кількість порахованих клітин і отримайте H-score за шкалою від 0 до 300 разом із відсотком позитивних клітин. Нижче — формула, розібраний приклад, що це число може і чого не може сказати та як програми аналізу зображень отримують той самий бал.

Калькулятор H-score

За відсотками

H-score—
Відсоток позитивних (будь-яка інтенсивність)—
Відсоток негативних—

—

За кількістю клітин

H-score—
Відсоток позитивних—
Клітин із кожною інтенсивністю—
Бал Allred для тих самих клітин—
Пораховано клітин—

Як розраховується H-score

H-score (гістоскор) поєднує в одному числі дві речі: скільки клітин забарвлено і наскільки інтенсивно. Кожній клітині оцінюваної популяції, зазвичай пухлинним клітинам, присвоюють ступінь 0 (негативна), 1+ (слабке забарвлення), 2+ (помірне) або 3+ (сильне). Відсоток клітин кожного ступеня множать на цей ступінь, а три добутки додають.

H-score = 1 × (% клітин 1+) + 2 × (% клітин 2+) + 3 × (% клітин 3+)

Розібраний приклад: 30 % клітин забарвлені слабко, 20 % — помірно і 10 % — сильно; решта 40 % негативні. H-score = 30 × 1 + 20 × 2 + 10 × 3 = 100, позитивних клітин 60 %. За кількістю клітин сума та сама: із 400 клітин 120 слабких, 80 помірних і 40 сильних дають (120 + 160 + 120) ÷ 400 × 100 = 100.

Бал запропонували для забарвлення рецептора естрогену в 1980-х роках як оцінку, що «враховувала і інтенсивність, і розподіл забарвлення», а нині його застосовують до багатьох ядерних, цитоплазматичних і мембранних маркерів.

Що це число може і чого не може сказати

  • Різні слайди, однаковий бал: 100 % слабко забарвлених клітин і 33 % сильно забарвлених дають приблизно 100. Зазначайте поруч із H-score відсоток позитивних клітин або відсоток клітин кожної інтенсивності.
  • Універсального порогу немає: який бал вважати «високим» або «позитивним», залежить від маркера, антитіла, методики та дослідження. Беріть поріг зі статті або настанови, якої дотримуєтеся, і зазначайте його.
  • Інтенсивність на око суб’єктивна: де закінчується слабке забарвлення і починається помірне, різні спостерігачі визначають по-різному. Оцінюйте відносно контролів, забарвлених у тій самій серії, і попросіть другого спостерігача оцінити частину слайдів.
  • Оцінюйте потрібні клітини: рахуйте лише ту популяцію клітин, у якій читається маркер, і виключайте строму, лімфоцити, некроз і крайові артефакти, якщо ваш протокол не передбачає іншого.
  • Рахуйте достатньо клітин: бал за кількома десятками клітин сильно змінюється з кожною клітиною. Звичайний мінімум — кілька сотень клітин у репрезентативних полях.

Як отримати той самий бал за допомогою програми

Програми аналізу зображень доходять до цих балів тією самою арифметикою, лише замість ока працює вимірювання. Програма знаходить кожне ядро в ділянці, відокремлює коричневий барвник DAB від синього гематоксиліну методом колірної деконволюції, вимірює середню оптичну густину DAB у кожному ядрі й відносить ядро до класу за заданими вами порогами: один поріг ділить ядра на позитивні й негативні, три пороги — на 1+, 2+ і 3+.

  • QuPath (безкоштовна програма з відкритим кодом): Positive cell detection з одним порогом дає відсоток позитивних клітин, а з трьома порогами повідомляє також H-score.
  • Fiji / ImageJ (безкоштовно): Colour Deconvolution з векторами H DAB, потім поріг і підрахунок; арифметику оцінки ви виконуєте самі.
  • SlideScope: рахує ядра в обраній вами ділянці, відносить кожне до ступеня забарвлення й повідомляє відсоток позитивних клітин, H-score і бал Allred разом, за тими самими визначеннями, що й QuPath. Можна також запитати звичайними словами за допомогою Ask Your Slide; кожне число отримано локальним інструментом і супроводжується контурами для перевірки. Лише для дослідницьких цілей.

Хоч би який інструмент ви обрали, пороги — це ваш вибір: зазначте їх у розділі методів, звірте контури із зображенням і не змінюйте пороги між слайдами, які порівнюєте. Покроково: як кількісно оцінити ІГХ-забарвлення.

Запитання

Як розрахувати H-score?

Помножте відсоток слабко забарвлених клітин на 1, помірно забарвлених — на 2 і сильно забарвлених — на 3, потім додайте три значення. За 30 % слабких, 20 % помірних і 10 % сильних H-score дорівнює 30 + 40 + 30 = 100.

Який діапазон H-score?

Від 0 до 300. Бал 0 означає, що жодна клітина не забарвлена; 300 — що всі клітини забарвлені сильно (100 % × 3).

Який H-score вважається позитивним?

Універсального порогу немає. Поріг залежить від маркера, антитіла й методики, а також від дослідження чи настанови, якої ви дотримуєтеся, тому беріть його з цього джерела й зазначайте разом із результатом.

Чим H-score відрізняється від бала Allred?

Обидва поєднують кількість забарвлених клітин із силою забарвлення. H-score зважує відсоток клітин кожної інтенсивності й набуває значень від 0 до 300. Бал Allred додає бал частки (від 0 до 5) до одного середнього бала інтенсивності (від 0 до 3) і набуває значень від 0 до 8.

Чи може програма розрахувати H-score?

Так. QuPath повідомляє його, якщо задати три пороги інтенсивності в Positive cell detection, а SlideScope за тими самими визначеннями повідомляє для ділянки відсоток позитивних клітин, H-score і бал Allred. Обидві програми оцінюють кожне ядро за середньою оптичною густиною DAB, тому обрані пороги слід зазначити в розділі методів.

Чи цей калькулятор безкоштовний?

Так. Він працює у вашому браузері й нікуди нічого не надсилає. SlideScope, настільна програма для мікроскопії та патології від тієї самої команди, — платна програма з безкоштовною бібліотекою зразків (усі інструменти) і передплатою для ваших власних зображень.

Джерела

Ці калькулятори виконують арифметичні розрахунки для досліджень і навчання. Вони не є діагностичним інструментом: оцінка для лікування пацієнтів ґрунтується на валідованому тесті, чинних рекомендаціях для цього маркера та судженні патолога.

Оцінюйте слайд програмою, а не рахуйте вручну

SlideScope рахує ядра в ділянці вашого слайда, відносить кожне до ступеня за забарвленням DAB і повідомляє відсоток позитивних клітин, H-score і бал Allred разом із контурами для перевірки — на вашому власному комп’ютері. Або поставте запитання: Ask Your Slide запускає ті самі інструменти й показує докази. Лише для дослідницьких цілей. Спробуйте всі інструменти безкоштовно на вбудованих зразках; щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата. Уже вирішили? Оформити передплату зараз.

Завантажити SlideScope