Оценка ИГХ

Калькулятор H-score

Введите процент клеток с каждой интенсивностью окрашивания или число подсчитанных клеток и получите H-score по шкале от 0 до 300 вместе с процентом положительных клеток. Ниже — формула, разобранный пример, что это число может и чего не может сказать и как программы анализа изображений получают тот же балл.

Калькулятор H-score

По процентам

H-score—
Процент положительных (любая интенсивность)—
Процент отрицательных—

—

По числу клеток

H-score—
Процент положительных—
Клеток с каждой интенсивностью—
Балл Allred для тех же клеток—
Подсчитано клеток—

Как рассчитывается H-score

H-score (гистоскор) объединяет в одном числе две вещи: сколько клеток окрашено и насколько интенсивно. Каждой клетке оцениваемой популяции, обычно опухолевым клеткам, присваивается степень 0 (отрицательная), 1+ (слабое окрашивание), 2+ (умеренное) или 3+ (сильное). Процент клеток каждой степени умножается на эту степень, и три произведения складываются.

H-score = 1 × (% клеток 1+) + 2 × (% клеток 2+) + 3 × (% клеток 3+)

Разобранный пример: 30 % клеток окрашены слабо, 20 % — умеренно и 10 % — сильно; остальные 40 % отрицательны. H-score = 30 × 1 + 20 × 2 + 10 × 3 = 100, положительных клеток 60 %. По числу клеток сумма та же: из 400 клеток 120 слабых, 80 умеренных и 40 сильных дают (120 + 160 + 120) ÷ 400 × 100 = 100.

Балл был предложен для окрашивания рецептора эстрогена в 1980-х годах как оценка, которая «учитывала и интенсивность, и распределение окрашивания», а сейчас применяется ко многим ядерным, цитоплазматическим и мембранным маркерам.

Что это число может и чего не может сказать

  • Разные слайды, одинаковый балл: 100 % слабо окрашенных клеток и 33 % сильно окрашенных дают примерно 100. Указывайте рядом с H-score процент положительных клеток или процент клеток каждой интенсивности.
  • Универсального порога нет: какой балл считать «высоким» или «положительным», зависит от маркера, антитела, методики и исследования. Берите порог из статьи или руководства, которому следуете, и указывайте его.
  • Интенсивность на глаз субъективна: где кончается слабое окрашивание и начинается умеренное, разные наблюдатели решают по-разному. Оценивайте относительно контролей, окрашенных в той же серии, и попросите второго наблюдателя оценить часть слайдов.
  • Оценивайте нужные клетки: считайте только ту популяцию клеток, в которой читается маркер, и исключайте строму, лимфоциты, некроз и краевые артефакты, если ваш протокол не предписывает иное.
  • Подсчитывайте достаточно клеток: балл по нескольким десяткам клеток сильно меняется с каждой клеткой. Обычный минимум — несколько сотен клеток в репрезентативных полях.

Как получить тот же балл с помощью программы

Программы анализа изображений приходят к этим баллам с помощью той же арифметики, только вместо глаза работает измерение. Программа находит каждое ядро в области, отделяет коричневый краситель DAB от синего гематоксилина методом цветовой деконволюции, измеряет среднюю оптическую плотность DAB в каждом ядре и относит ядро к классу по заданным вами порогам: один порог делит ядра на положительные и отрицательные, три порога — на 1+, 2+ и 3+.

  • QuPath (бесплатная программа с открытым исходным кодом): Positive cell detection с одним порогом даёт процент положительных клеток, а с тремя порогами сообщает и H-score.
  • Fiji / ImageJ (бесплатно): Colour Deconvolution с векторами H DAB, затем порог и подсчёт; арифметику оценки вы выполняете сами.
  • SlideScope: подсчитывает ядра в выбранной вами области, относит каждое к степени окрашивания и сообщает процент положительных клеток, H-score и балл Allred вместе, по тем же определениям, что и QuPath. Можно также спросить обычными словами с помощью Ask Your Slide; каждое число получено локальным инструментом и сопровождается контурами для проверки. Только для исследовательских целей.

Какой бы инструмент вы ни выбрали, пороги — это ваш выбор: укажите их в разделе методов, сверьте контуры с изображением и не меняйте пороги между слайдами, которые сравниваете. Пошагово: как количественно оценить ИГХ-окрашивание.

Вопросы

Как рассчитать H-score?

Умножьте процент слабо окрашенных клеток на 1, умеренно окрашенных — на 2 и сильно окрашенных — на 3, затем сложите три значения. При 30 % слабых, 20 % умеренных и 10 % сильных H-score равен 30 + 40 + 30 = 100.

Каков диапазон H-score?

От 0 до 300. Балл 0 означает, что ни одна клетка не окрашена; 300 — что все клетки окрашены сильно (100 % × 3).

Какой H-score считается положительным?

Универсального порога нет. Порог зависит от маркера, антитела и методики, а также от исследования или руководства, которому вы следуете, поэтому берите его из этого источника и указывайте вместе с результатом.

Чем H-score отличается от балла Allred?

Оба сочетают число окрашенных клеток с силой окрашивания. H-score взвешивает процент клеток каждой интенсивности и принимает значения от 0 до 300. Балл Allred складывает балл доли (от 0 до 5) с одним средним баллом интенсивности (от 0 до 3) и принимает значения от 0 до 8.

Может ли программа рассчитать H-score?

Да. QuPath сообщает его, если задать три порога интенсивности в Positive cell detection, а SlideScope по тем же определениям сообщает для области процент положительных клеток, H-score и балл Allred. Обе программы оценивают каждое ядро по средней оптической плотности DAB, поэтому выбранные пороги нужно указать в разделе методов.

Этот калькулятор бесплатный?

Да. Он работает в вашем браузере и никуда ничего не отправляет. SlideScope, настольное приложение для микроскопии и патологии от той же команды, — платное приложение с бесплатной библиотекой образцов (все инструменты) и подпиской для работы с собственными изображениями.

Источники

Эти калькуляторы выполняют арифметические расчёты для исследований и обучения. Они не являются диагностическим инструментом: оценка для лечения пациентов основывается на валидированном тесте, действующих рекомендациях для данного маркера и суждении патолога.

Оценивайте слайд программой, а не подсчётом вручную

SlideScope подсчитывает ядра в области вашего слайда, относит каждое к степени по окрашиванию DAB и сообщает процент положительных клеток, H-score и балл Allred вместе с контурами для проверки — на вашем собственном компьютере. Или задайте вопрос: Ask Your Slide запускает те же инструменты и показывает доказательства. Только для исследовательских целей. Попробуйте все инструменты бесплатно на встроенных образцах; чтобы открывать собственные изображения, нужна подписка. Уже решили? Оформите подписку.

Скачать SlideScope