Kalkulačka H-score
Zadejte procento buněk obarvených při každé intenzitě, nebo počet buněk, které jste napočítali, a získáte H-score na škále 0 až 300 spolu s procentem pozitivních buněk. Níže najdete vzorec, řešený příklad, co číslo může a nemůže říct a jak ke stejnému skóre dospěje software pro analýzu obrazu.
Jak se H-score počítá
H-score (histoskóre) spojuje do jednoho čísla dvě věci: kolik buněk je obarveno a jak silně. Každá buňka hodnocené populace, obvykle nádorové buňky, dostane stupeň 0 (negativní), 1+ (slabé), 2+ (střední) nebo 3+ (silné). Procento buněk v každém stupni se vynásobí tímto stupněm a tři součiny se sečtou.
H-score = 1 × (% buněk 1+) + 2 × (% buněk 2+) + 3 × (% buněk 3+)
Řešený příklad: 30 % buněk se barví slabě, 20 % středně a 10 % silně; zbylých 40 % je negativních. H-score = 30 × 1 + 20 × 2 + 10 × 3 = 100, přičemž pozitivních je 60 % buněk. Z počtů jde o stejný součet: ze 400 buněk dává 120 slabých, 80 středních a 40 silných (120 + 160 + 120) ÷ 400 × 100 = 100.
Skóre bylo zavedeno v 80. letech 20. století pro barvení estrogenového receptoru jako hodnocení, které „zahrnovalo intenzitu i distribuci barvení“, a dnes se používá pro mnoho jaderných, cytoplazmatických i membránových markerů.
Co číslo může a nemůže říct
- Různé preparáty, stejné skóre: 100 % slabě obarvených buněk i 33 % silně obarvených buněk dají přibližně 100. Vedle H-score proto uvádějte procento pozitivních buněk nebo procento při každé intenzitě.
- Žádná univerzální hranice: skóre, které se považuje za „vysoké“ nebo „pozitivní“, závisí na markeru, protilátce, testu a studii. Hranici převezměte z článku nebo doporučení, kterým se řídíte, a uveďte ji.
- Hodnocení intenzity okem je subjektivní: kde končí slabé a začíná střední barvení, se mezi hodnotiteli liší. Hodnoťte proti kontrolám obarveným ve stejné sérii a část preparátů nechte ohodnotit druhého hodnotitele.
- Hodnoťte správné buňky: počítejte jen populaci buněk, v níž se marker odečítá, a vynechte stroma, lymfocyty, nekrózu a artefakty na okrajích, pokud váš protokol neurčuje jinak.
- Napočítejte dost buněk: skóre z několika desítek buněk se s každou buňkou výrazně mění. Běžným minimem je několik set buněk z reprezentativních polí.
Stejné skóre pomocí softwaru
Software pro analýzu obrazu dospívá k těmto skóre stejným výpočtem, jen oko nahrazuje měření. Najde každé jádro v oblasti, barevnou dekonvolucí oddělí hnědé barvivo DAB od modrého hematoxylinu, změří průměrnou optickou denzitu DAB každého jádra a ohodnotí ho podle prahů, které nastavíte: jeden práh pro pozitivní či negativní, tři pro 1+, 2+ a 3+.
- QuPath (zdarma, open source): Positive cell detection s jedním prahem dává procento pozitivních; se třemi prahy uvádí také H-score.
- Fiji / ImageJ (zdarma): Colour Deconvolution s vektory H DAB, pak prahování a počítání; výpočet skóre je na vás.
- SlideScope: spočítá jádra v oblasti, kterou zvolíte, každé ohodnotí a uvede procento pozitivních, H-score a skóre Allred najednou, podle stejných definic jako QuPath. Můžete se také zeptat běžným jazykem pomocí Ask Your Slide; každé číslo pochází z místního nástroje, s obrysy ke kontrole. Pouze pro výzkumné účely.
Ať použijete cokoli, prahy jsou vaše volba: zapište je do metod, porovnejte obrysy se snímkem a u preparátů, které srovnáváte, je ponechte stejné. Krok za krokem: jak kvantifikovat barvení IHC.
Otázky
Jak vypočítat H-score?
Procento slabě obarvených buněk vynásobte 1, středně obarvených 2 a silně obarvených 3 a tři výsledky sečtěte. Při 30 % slabých, 20 % středních a 10 % silných je H-score 30 + 40 + 30 = 100.
Jaký je rozsah H-score?
0 až 300. Skóre 0 znamená, že žádná buňka není obarvená; 300 znamená, že všechny buňky jsou obarvené silně (100 % × 3).
Jaké H-score je pozitivní?
Univerzální hranice neexistuje. Hranice závisí na markeru, protilátce a testu a na studii nebo doporučení, kterým se řídíte, takže ji převezměte z tohoto zdroje a uveďte ji spolu s výsledkem.
Jaký je rozdíl mezi H-score a skóre Allred?
Obě spojují, kolik buněk se barví a jak silně. H-score váží procento při každé intenzitě a pohybuje se od 0 do 300. Skóre Allred sčítá skóre podílu (0 až 5) s jedním skóre průměrné intenzity (0 až 3) a pohybuje se od 0 do 8.
Umí H-score vypočítat software?
Ano. QuPath ho uvádí, když v Positive cell detection nastavíte tři prahy intenzity, a SlideScope pro oblast uvádí procento pozitivních, H-score a skóre Allred podle stejných definic. Oba hodnotí každé jádro podle jeho průměrné optické denzity DAB, takže zvolené prahy patří do vašich metod.
Je tato kalkulačka zdarma?
Ano. Běží ve vašem prohlížeči a nikam nic neposílá. SlideScope, desktopová aplikace pro mikroskopii a patologii od stejného týmu, je placená aplikace s bezplatnou knihovnou ukázek (všechny nástroje) a předplatným pro vlastní snímky.
Zdroje
- McCarty KS Jr et al. Use of a monoclonal anti-estrogen receptor antibody in the immunohistochemical evaluation of human tumors. Cancer Res 1986;46(8 Suppl):4244s-4248s (zavedení HSCORE)
- Wen Z et al. Deep learning-based H-score quantification of immunohistochemistry-stained images. Mod Pathol 2023 (vzorec a rozsah 0 až 300)
- Dokumentace QuPath: klasifikace buněk, prahy intenzity a H-score
Tyto kalkulačky provádějí výpočty pro výzkum a výuku. Nejsou diagnostickým nástrojem: hodnocení pro péči o pacienty se řídí validovaným testem, aktuálním doporučením pro daný marker a úsudkem patologa.
Ohodnoťte preparát místo ručního počítání
SlideScope spočítá jádra v oblasti vašeho preparátu, každé ohodnotí podle barvení DAB a ve vašem počítači uvede procento pozitivních, H-score a skóre Allred s obrysy ke kontrole. Nebo napište otázku: Ask Your Slide spustí tytéž nástroje a ukáže doklady. Pouze pro výzkumné účely. Vyzkoušejte všechny nástroje zdarma na vestavěných ukázkách; pro otevírání vlastních snímků potřebujete předplatné. Už máte jasno? Předplaťte si ho.