樣本上的像素尺寸如何計算
像素尺寸(µm/px)= 相機像素(µm)× 像素合併 ÷(物鏡 × 相機轉接鏡)
相機本身的像素(例如許多 sCMOS 相機為 6.5 µm,常見 CMOS 感測器為 3.45 µm)會經由物鏡及任何相機轉接鏡投影到標本上。2 × 2 像素合併會把四個像素併成一個,使像素尺寸加倍。顯微鏡的目鏡與此無關。
計算範例:6.5 µm 像素、60× 物鏡、1× 轉接鏡、不使用像素合併:6.5 ÷ 60 = 每像素 0.108 µm,即每 µm 9.2 個像素。請將此值與您物鏡的 Nyquist 像素尺寸比較,看看相機是否足以正確取樣光學系統。
以載物台測微尺校正
上述公式假設標稱放大倍率完全準確;實際上通常會有幾個百分點的誤差。若量測結果要發表,請為每個物鏡校正一次:拍攝載物台測微尺(一種刻有刻度的玻片,常見為 1 mm 分成 100 格、每格 10 µm),沿著盡可能多的刻度畫一條線,再將實際長度除以線段的像素長度。
計算範例:測微尺上的 100 µm 跨越 400 個像素:100 ÷ 400 = 每像素 0.25 µm。在 Fiji 中,Analyze › Set Scale 可達到相同效果;在 SlideScope 中,當檔案本身沒有像素尺寸時,View › Set Pixel Size… 會為該影像儲存此值。
全玻片影像中的每像素微米數(MPP)
切片掃描器會將基礎層級的像素尺寸記錄在檔案中(Aperio SVS 寫入「MPP」,其他格式則使用對等的標籤)。依慣例,40× 掃描約為每像素 0.25 µm,20× 掃描約為每像素 0.5 µm;確切數值取決於掃描器(OpenSlide 的 CMU-1 測試切片是以 20× 掃描的 Aperio 影像,記錄值為 0.499 µm/px)。每個金字塔層級的 MPP 等於基礎 MPP 乘以其降採樣倍數,因此一張 40× 切片中降採樣倍數為 16 的第 2 層級為每像素 4 µm,約相當於 2.5×。
在 Python 中可用 openslide.OpenSlide(path).properties["openslide.mpp-x"] 讀取(請參閱在 Python 中讀取 SVS 檔案)。桌面檢視器(包括 SlideScope)會自動讀取此值,並據以繪製比例尺。
常見問題
如何計算每像素微米數?
將相機像素尺寸除以標本與相機之間的總放大倍率(物鏡 × 相機轉接鏡),再乘以像素合併倍數。或者拍攝載物台測微尺,將已知長度除以其像素長度。
病理學中的 MPP 是什麼?
每像素微米數(Microns per pixel):全玻片影像中一個像素在標本上的寬度。依慣例,約 0.25 µm/px 稱為 40×,0.5 µm/px 稱為 20×。
為什麼我的影像顯示的比例尺不正確?
檔案缺少像素尺寸,或記錄了錯誤的值(有些 TIFF 匯出會儲存為每英吋 1 個像素)。請透過校正設定像素尺寸;在 Fiji 中使用 Analyze › Set Scale,在 SlideScope 中使用 View › Set Pixel Size…。
目鏡會改變像素尺寸嗎?
不會。相機看到的是物鏡(與轉接鏡)所形成的影像,而不是透過目鏡看到的影像。
這個計算器是免費的嗎?
是的。它在您的瀏覽器中執行,不會將任何資料傳送到任何地方。SlideScope 是同一團隊開發的桌面顯微影像應用程式,為付費應用程式,附有免費範例庫(所有工具皆可使用),開啟您自己的影像則需要訂閱。
資料來源
結果為理論值或算術結果;用於臨床或受法規管制的工作之前,請先與儀器的說明文件核對。
在您的真實影像上量測
SlideScope 可開啟 34 種顯微鏡與玻片掃描器格式,包括 CZI、ND2、SVS 與 LIF,並沿用檔案本身的校正資訊,因此長度、面積、細胞計數與比例尺都直接以 µm 呈現,無需任何設定。可在內建範例上免費試用所有工具;開啟您自己的影像需要訂閱。已經決定了嗎?立即訂閱。