Allred skoru hesaplayıcı

Allred skoru hesaplayıcı

Allred skor tablosu

Allred skoru, meme kanserinde östrojen ve progesteron reseptörü boyaması için tanımlanmıştır. Tümör hücresi çekirdeklerine verilen iki skoru toplar.

Allred toplam skoru = oran skoru + yoğunluk skoru (0 ya da 2-8)

Çözümlü örnek: Tümör çekirdeklerinin %40’ı pozitif ve ortalama boyanma ara düzeyde. %40, üçte bir ile üçte iki arasında kaldığından oran skoru 4’tür; ara düzey yoğunluk 2’dir; toplam 4 + 2 = 6 olur.

Yayımlanmış tablolar bant sınırlarını biraz farklı yazar (%10 hem 2’nin hem 3’ün altında görünür). Bu hesaplayıcı tam sınıra denk gelen bir değeri üst banda koyar: %1 skoru 2, %10 skoru 3, üçte bir skoru 4, üçte iki skoru 5 yapar; QuPath ve SlideScope da aynı şekilde hesaplar.

Yayımlanmış eşik değerler ve kılavuzların bugün kullandıkları

• Özgün eşik değer: 1998’deki tanımda 0 veya 2 toplam skoru negatif, 3-8 ise pozitif olarak okunuyordu. 3 toplamı için hücrelerin en az %1’inin zayıf boyanması gerekir.
• Güncel meme kılavuzları yüzde bildirir: östrojen ve progesteron reseptörü testine ilişkin 2020 ASCO/CAP güncellemesi, tümör çekirdeklerinin %1 ile %100’ünü pozitif, %1’in altını negatif olarak okur ve %1 ile %10’u “ER Low Positive” olarak bildirir. Birçok rapor yüzdeyi ve yoğunluğu, Allred skoru veya H-score ile ya da bunlar olmadan verir.
• Tüm tümör için tek bir yoğunluk: yoğunluk skoru bir ortalamadır; bu yüzden zayıf ve güçlü hücrelerin karışımı “ara düzey” olur. Yoğunlukların dağılımı önemliyse H-score kullanın.
• Diğer belirteçler: skor araştırmalarda bazen başka nükleer belirteçler için ödünç alınır. Bunu yaptığınızı ve hangi eşik değeri kullandığınızı belirtin.

Aynı skoru yazılımla elde etmek

Görüntü analizi yazılımları bu skorlara aynı aritmetikle ulaşır; yalnızca gözün yerini ölçüm alır. Yazılım bölgedeki her çekirdeği bulur, kahverengi DAB boyasını mavi hematoksilenden renk dekonvolüsyonuyla ayırır, her çekirdeğin ortalama DAB optik yoğunluğunu ölçer ve çekirdeği sizin belirlediğiniz eşiklere göre derecelendirir: pozitif ya da negatif için bir eşik, 1+, 2+ ve 3+ için üç eşik.

• QuPath (ücretsiz, açık kaynak): Positive cell detection tek eşikle pozitif yüzdesini verir; üç eşikle H-score’u da bildirir.
• Fiji / ImageJ (ücretsiz): H DAB vektörleriyle Colour Deconvolution, ardından eşikleme ve sayım; skorlama aritmetiğini kendiniz yaparsınız.
• SlideScope: seçtiğiniz bölgedeki çekirdekleri sayar, her birini derecelendirir ve pozitif yüzdesini, H-score’u ve Allred skorunu QuPath ile aynı tanımları kullanarak birlikte bildirir. Ask Your Slide ile gündelik dilde de sorabilirsiniz; her sayı yerel araçtan gelir ve kontrol edebileceğiniz dış hatlarla birlikte sunulur. Yalnızca araştırma amaçlıdır.

Hangisini kullanırsanız kullanın, eşikler sizin seçiminizdir: yöntemler bölümünüze yazın, dış hatları görüntüyle karşılaştırın ve karşılaştırdığınız slaytlar boyunca eşikleri sabit tutun. Adım adım: IHC boyaması nasıl nicelenir.

Sorular

Kaynaklar

• Allred DC, Harvey JM, Berardo M, Clark GM. Prognostic and predictive factors in breast cancer by immunohistochemical analysis. Mod Pathol 1998;11(2):155-168
• Allison KH et al. Estrogen and progesterone receptor testing in breast cancer: ASCO/CAP guideline update. Arch Pathol Lab Med 2020;144(5):545-563
• QuPath belgeleri: hücre sınıflandırması ve yoğunluk eşikleri

Bu hesaplayıcılar araştırma ve eğitim için aritmetik yapar. Tanı aracı değildir: hasta bakımına yönelik skorlama, valide edilmiş testi, o belirteç için güncel kılavuzu ve bir patoloğun değerlendirmesini izler.