Kalkulator wyniku Allreda

Kalkulator wyniku Allreda

Tabela punktacji Allreda

Wynik Allreda opisano dla barwienia receptorów estrogenowych i progesteronowych w raku piersi. Sumuje on dwie oceny przyznawane jądrom komórek nowotworowych.

Łączny wynik Allreda = ocena odsetka + ocena intensywności (0 albo od 2 do 8)

Przykład obliczenia: 40% jąder komórek nowotworowych jest dodatnich, średnio z pośrednią intensywnością barwienia. 40% mieści się między jedną trzecią a dwiema trzecimi, więc ocena odsetka wynosi 4; pośrednia intensywność to 2; suma wynosi 4 + 2 = 6.

Opublikowane tabele podają granice przedziałów nieco inaczej (10% pojawia się zarówno przy 2, jak i przy 3). Ten kalkulator przypisuje wartość leżącą dokładnie na granicy do wyższego przedziału: 1% daje 2, 10% daje 3, jedna trzecia daje 4, a dwie trzecie dają 5. Tak samo liczą QuPath i SlideScope.

Opublikowane punkty odcięcia i to, czego używają obecne wytyczne

• Pierwotny punkt odcięcia: w opisie z 1998 roku łączny wynik 0 lub 2 odczytywano jako ujemny, a od 3 do 8 jako dodatni. Suma 3 wymaga co najmniej 1% komórek wybarwionych słabo.
• Obecne wytyczne dotyczące raka piersi podają odsetki: aktualizacja ASCO/CAP z 2020 roku dotycząca oznaczania receptorów estrogenowych i progesteronowych uznaje od 1% do 100% dodatnich jąder komórek nowotworowych za wynik dodatni, poniżej 1% za ujemny, a od 1% do 10% raportuje jako „ER Low Positive”. Wiele raportów podaje odsetek i intensywność, z wynikiem Allreda lub H-score albo bez nich.
• Jedna intensywność dla całego guza: ocena intensywności jest średnią, więc mieszanina komórek słabo i silnie wybarwionych staje się „pośrednia”. Użyj H-score, gdy liczy się rozkład intensywności.
• Inne markery: w badaniach naukowych wynik bywa przenoszony na inne markery jądrowe. Zaznacz, że tak zrobiłeś, i podaj, jakiego punktu odcięcia użyłeś.

Ten sam wynik z oprogramowania

Oprogramowanie do analizy obrazu dochodzi do tych wyników tą samą arytmetyką, tylko oko zastępuje pomiar. Znajduje każde jądro w obszarze, oddziela brązowe barwienie DAB od niebieskiej hematoksyliny metodą dekonwolucji barw, mierzy średnią gęstość optyczną DAB każdego jądra i klasyfikuje je według ustawionych przez Ciebie progów: jednego dla podziału na dodatnie i ujemne, trzech dla 1+, 2+ i 3+.

• QuPath (bezpłatny, open source): Positive cell detection z jednym progiem daje odsetek dodatnich; z trzema progami podaje też H-score.
• Fiji / ImageJ (bezpłatne): Colour Deconvolution z wektorami H DAB, potem progowanie i zliczanie; obliczenie wyniku należy do Ciebie.
• SlideScope: liczy jądra w wybranym przez Ciebie obszarze, klasyfikuje każde z nich i podaje jednocześnie odsetek dodatnich, H-score i wynik Allreda, według tych samych definicji co QuPath. Możesz też zapytać zwykłym językiem za pomocą Ask Your Slide; każda liczba pochodzi z lokalnego narzędzia, z obrysami do sprawdzenia. Wyłącznie do zastosowań badawczych.

Niezależnie od narzędzia progi są wyborem: opisz je w metodach, porównaj obrysy z obrazem i nie zmieniaj ich między preparatami, które porównujesz. Krok po kroku: jak kwantyfikować barwienie IHC.

Pytania

Źródła

• Allred DC, Harvey JM, Berardo M, Clark GM. Prognostic and predictive factors in breast cancer by immunohistochemical analysis. Mod Pathol 1998;11(2):155-168
• Allison KH et al. Estrogen and progesterone receptor testing in breast cancer: ASCO/CAP guideline update. Arch Pathol Lab Med 2020;144(5):545-563
• Dokumentacja QuPath: klasyfikacja komórek i progi intensywności

Te kalkulatory wykonują obliczenia na potrzeby badań naukowych i dydaktyki. Nie są narzędziem diagnostycznym: ocena na potrzeby opieki nad pacjentem odbywa się według zwalidowanego testu, aktualnych wytycznych dla danego markera i oceny patologa.